Spiroplasma kunkelii: SKUN_001259
Help
Entry
SKUN_001259 CDS
T04056
Symbol
aarS
Name
(GenBank) alanyl-tRNA synthetase
KO
K01872
alanyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.7
]
Organism
skn
Spiroplasma kunkelii
Pathway
skn00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
skn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
SKUN_001259 (aarS)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
skn01007
]
SKUN_001259 (aarS)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
skn03016
]
SKUN_001259 (aarS)
Enzymes [BR:
skn01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.7 alanine---tRNA ligase
SKUN_001259 (aarS)
Amino acid related enzymes [BR:
skn01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class II (C/G)
SKUN_001259 (aarS)
Transfer RNA biogenesis [BR:
skn03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
SKUN_001259 (aarS)
Prokaryotic type
SKUN_001259 (aarS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_2c
tRNA_SAD
DHHA1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALA98134
UniProt:
A0A0K2JHR1
LinkDB
All DBs
Position
complement(1056826..1059582)
Genome browser
AA seq
918 aa
AA seq
DB search
MTKFTANAIRRMWLDFFRSKDHYELPSVSLIPVDDPSLLWINSGVATLKPYFDGRKTPSS
PRLINSQKSIRTNDIENVGYTARHHTLFEMLGNFSIGDYFKKEAIMYAWEFLTDKKWIGF
DPAKLYVTIYKDDKEAYEIWRNVIGLSDERIIKGDKDTNFWEIGTGPCGPNTEIFYDRGE
KYDPEQLGLKLLQDDLENDRYLEVWNIVFSQYNNNGDGTYTDLPRKNIDTGAGLERITSI
IQETPTNFETDLFMPIIKAIEKLVNGKYHYDETALFNNDSEQLKINTAFKVIADHIRAVT
FAIADGAFPGNKDRGYVIRRLIRRASLYGKKIDLTEPFLFKLVGTVVNIMQEYYSYLVEK
QPIVEQVVLDEENKFLRTLEQGNKLFNEVKTKYGTISKEHAFRLFESYGFPIELIEEEAH
ESGISVDRVGFDELLENAKTISRTNQKDIKAIHLQSELFTKLDVASQFVGYEDEQVNNTE
IVFMFADDKPVTKLTNTTGYIILKETPFYAEKGGQAADHGLILKDNTTAYVIDVKQGPNK
QHLHFVKVEGTLKIGDFVNASIDSDRRFYTRKNHSGTHLIHAALREVLGNHVMQTGSYND
DERLRIDITHNQAITPAEIIDVEVSVTKAIKAAIPCEVIYTDMQTALDVHHALAFFTEKY
DAEVRIVKFGTYSCELCGGTHVTNSQDIEDLLVTGLESKGVGTFRINAITSNKTIASYLN
EQFLKEKTEAINYFDKYNQGKKALLDQRLEQTWEQISNLTVSKTNWKQLKELVAQFKEDF
KHWQKKYDNILIQQFVKQYNTLLPQTKNGINVLTHQFTAKVDINALKVLIDDYKVRYQNL
LFFFVDVSDEKQSTLIVGVSDDLHDRYQAGKIIQQLNSLLGGKGGGNNSVAQSGFNNKDK
TLLVKLFADPLEFLKHHG
NT seq
2757 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaatttacagcaaatgcaattcgaagaatgtggttagatttttttcgcagtaag
gatcattatgaattaccttcagtatcattaattcctgttgatgatccgtcattattatga
attaactctggtgtggcgacgttaaagccatattttgatgggcgaaaaacaccatcatca
ccacgcttgataaattcacaaaaatcaattcgaactaatgatattgaaaatgttggttat
acagcacgtcatcatactttgtttgaaatgcttggtaatttttcaattggtgattacttt
aaaaaagaagcaattatgtatgcttgagaatttttaactgataaaaaatgaattgggttt
gatcctgccaaattatatgtcacaatttataaagatgataaagaagcttatgaaatttga
cgcaatgtaattggtttaagtgatgaacgaattattaaaggtgataaggatactaatttt
tgagaaattgggaccggaccgtgcggacctaataccgaaattttttatgatcgtggggaa
aaatatgatcctgagcaattaggattaaagttattacaagatgatttagaaaatgatcgt
tatttggaagtttgaaatattgttttttcacaatataataataatggtgatggaacatat
actgacttaccacgaaaaaatattgatactggtgctggattagaacgaattacttcaatt
attcaagaaacaccaactaattttgaaactgatttgtttatgccaattattaaagcgatt
gaaaaattagtaaatggaaaatatcattatgatgaaacagcattgtttaacaatgattca
gaacaattaaaaattaatactgcatttaaagtaattgctgatcatattcgggcagttact
tttgcaattgctgatggtgcttttccgggaaataaagatcgcggttatgttattcggcgt
ttaattcgtcgtgctagtttatatgggaaaaaaattgatttaacagaaccatttttattt
aaattagtgggaacagtagttaacattatgcaagaatattattcttatttagttgaaaaa
caaccaattgttgaacaagttgtgttagatgaagaaaataaatttttaagaacgttagaa
caaggaaacaaactttttaatgaagttaaaacaaaatatggtactatttcaaaagaacat
gcctttcgtttatttgaaagttatggttttccaattgaattaattgaagaagaagcacac
gaatcagggattagtgttgatcgtgttggttttgatgaattattagaaaatgcgaaaaca
atttcacgtactaatcaaaaagatattaaagcaattcatttacaaagcgaactttttacc
aagttagatgttgctagtcaatttgttggttatgaagatgaacaagttaataatacagaa
attgtctttatgtttgctgatgataaaccagtcacaaaattaactaacacaacaggatat
atcattttaaaagagacaccattttatgctgaaaaaggcggacaagctgctgatcacgga
ttaattttaaaagacaatacgacagcttatgttattgatgtaaaacaagggccaaataaa
cagcatttacattttgtcaaagttgaagggacacttaagattggagattttgtcaatgcg
tcaattgacagtgatcgtcgtttttatacgcggaaaaatcattcaggaacacatttaatt
catgctgctttacgagaagtgttaggaaaccatgttatgcaaactggttcttataacgat
gatgaacgtttacgaattgacattacacataatcaagcaattacaccagcggaaattata
gatgtagaagtttctgttacaaaagcaattaaggctgcaattccttgtgaagttatttat
actgatatgcaaacagcattagatgtgcatcatgctttagctttttttacagaaaaatat
gatgctgaggttcgaattgttaaatttggtacttattcttgtgaactttgtggaggaacc
catgtgactaattcacaagatattgaagatttactagtaactggtttggaatcaaaagga
gttggaacatttcgaattaatgctattacctcaaataaaacaattgctagttatctaaat
gaacaatttttaaaagaaaaaactgaagcaattaattattttgataagtataatcaaggt
aagaaagcattacttgaccaacgtttagagcaaacttgagaacaaattagtaatttaact
gtttcaaaaacaaactgaaaacagttaaaagagttagtagcacaatttaaagaagatttt
aaacattgacaaaaaaaatatgataatattttaattcaacaatttgtcaaacaatataat
accttgttaccacaaactaaaaatggaattaatgttttaactcatcaatttacagcaaaa
gttgatattaatgctttaaaagtgttaattgatgattataaggttcgatatcaaaactta
ctattttttttcgttgatgttagtgatgaaaaacaatccacattaattgttggtgttagt
gatgatttacacgatcgttatcaagctggaaaaattattcaacaattaaattcattatta
ggtggtaaaggtggcggcaataatagtgttgctcaaagtggttttaacaataaagacaaa
actttacttgttaaattatttgctgaccctctagaatttttaaaacatcatggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
