KEGG   Spiroplasma kunkelii: SKUN_00151
Entry
SKUN_00151        CDS       T04056                                 
Symbol
uvrA
Name
(GenBank) excinuclease ABC subunit A
  KO
K03701  excinuclease ABC subunit A
Organism
skn  Spiroplasma kunkelii
Pathway
skn03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:skn00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    SKUN_00151 (uvrA)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:skn03400]
    SKUN_00151 (uvrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:skn03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     SKUN_00151 (uvrA)
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
     Supressor
      SKUN_00151 (uvrA)
SSDB
Motif
Pfam: UvrA_inter UvrA_DNA-bind ABC_tran SMC_N RsgA_GTPase AAA_29 nSTAND3 nSTAND1 AAA_21 AAA_16 APS_kinase AAA_22 AAA_23 AAA_18 AAA_14 ATPase NACHT ATPase_2 AAA_24 NB-ARC DnaJ_CXXCXGXG cobW
Other DBs
NCBI-ProteinID: ALA97075
UniProt: A0A0K2JEQ9
LinkDB
Position
138434..141286
AA seq 950 aa
MGKDWIVVKGARENNLKNIDVKVPKDKLVVFTGLSGSGKSSLAFNTIYAEGRRRYIESLS
SYARQFLGGNEKPDVDAIEGLSPAISIDQKTTSHNPRSTVGTVTEIYDYLRLLYARVGTP
YCINGHGVIKSVTVKEIINNLKQLLTEGEKFMILSPVVRYKKGSFKDLFARLKQESFIRV
KVNDEIKTLDEEIELDKNKQQNIDIIIDRLVYKESADLLSRIHDAIEVALKYGNALVKID
FADQKKEMLFSTNYSCSICGFVIPELEPRLFSFNSPSGACSECKGLGVKLEVDEDLLIPN
RSLSILQGAIIYLKNIVNTTNIEWQKFKVLANYYHIVLEQPVSDLTKEQLEYLIRGSDEP
IEYNLKTASGNIMRGYDYIEGIGQLIERRYTETSSESQREYYKQFMTDKKCGTCLGKRLN
EIPLSVKINNISISEFTDLSVEDELKEVLNLKLTESQQEIARLIINELVNRLDFLSRVGL
GYLTLSRNASTLSGGEAQRIRLATQIGSQLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDKLIETLKNLR
DLGNTLIVVEHDEDTIRASDYIIDIGPRAGINGGQVVAAGSIDDIQQNPNSITAKYLTGE
LAIDVPKKRRGGNGLVLEIKGARENNLKNINVTIPLNKFVCLTGVSGSGKSTLMNEILWK
GIKKNLGLATERPGAHDKILGIDNIDKVINISQDPIGKTPRSNPATYTSVFDDIRDLFAD
TNEAKARGYLKGRFSFNVPGGRCEHCQGDGIIKISMHFLPTVYVSCEVCEGKRYNDETLL
VKFKDKNIYDVLEMTVDQACDFFATQPKISQKLGTMQEVGLGYIKLGQSATELSGGEAQR
VKLSTFLLKRTTGKTLFLLDEPTTGLHVDDVNRLLVVLNKIVDNGDTVITIEHNLDVIKM
ADYIIDLGPEGGVGGGMIVATGTPEQLVLKSGTSYTAQYLKPLLKSKRLE
NT seq 2853 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggaaaagattgaatcgttgttaaaggagctcgagagaataatttaaagaatattgat
gttaaggtacctaaagataaattagttgtttttactggtttatcaggaagcggaaaatca
tcattagcttttaataccatttatgcagaaggaagacgccgttatatcgaaagtctatca
agttatgctcgccaatttttaggtggaaatgaaaaacctgatgttgatgcaattgaaggt
ttgtcaccagcgatttctattgatcaaaaaacaactagtcataatcctcgcagtactgtt
ggaacagttactgaaatttatgattatttacgtttattatatgctcgcgttgggacacca
tattgtattaatggtcatggggttattaaatcagtaacagttaaagaaataataaataat
ttaaaacaacttttaacagaaggtgaaaaatttatgattttgtcgccagtagttcgttat
aagaaaggtagttttaaagatttatttgcacgtttaaaacaagaaagttttattcgtgtt
aaggttaatgatgaaatcaaaactttagatgaagaaattgaattagataaaaataaacaa
caaaatattgatattattattgaccgcttggtttataaagaatcagcagatttattaagt
cgaattcatgatgcaattgaagtagcgttaaaatatggtaatgcattagtaaaaattgat
tttgctgatcaaaaaaaggaaatgcttttttcaactaattattcatgtagtatttgcggt
tttgttattccggaattagaaccacgattattttcatttaattcaccctcaggagcttgt
agtgaatgtaaaggattgggagtaaaattagaagttgatgaagatttattgatacctaat
cggtcattatcaattttacaaggggcaattatttatttaaaaaatattgttaatacaaca
aatattgaatggcaaaagtttaaagttttagctaattattatcatattgtgttagaacaa
cccgtcagtgatttgacaaaagagcaactagaatatttgattcgtggtagtgatgaacca
attgaatataatttaaaaacagctagcgggaacattatgcggggatacgattatattgaa
ggaattgggcagttaattgaacgtcgctatacggaaacatcaagtgaatcacaacgtgaa
tattataaacaatttatgacagataaaaaatgtggaacttgcttaggaaagcgattaaat
gaaattcctttatcagttaagattaataatattagtatttctgaatttactgatttatct
gttgaagatgaattaaaagaagttttgaatttaaaattaacagaatcacaacaagaaatt
gcacgattaattattaatgaattagttaatcgtttggattttttaagtcgtgttggatta
ggttatttaacgttatcacgtaatgcttcaacattatcaggtggagaagctcaacgaatt
cgattagcaacgcaaattggtagtcaattaacgggggttttgtatgttcttgatgaacct
tcaattggattacaccaacgagataatgataaattaattgaaacattaaaaaatttacgt
gatttaggaaatactttaattgttgttgagcacgatgaagatacgattcgtgctagtgat
tatattattgacattggtccacgtgcaggaattaatggggggcaagttgttgctgcggga
agtattgatgatattcaacaaaacccaaattcaattactgctaaatatttaactggtgaa
ttagcaattgatgtgccaaaaaaacggcgtggtggtaatggcttagtattagaaattaaa
ggagcacgagaaaacaatttaaaaaatattaatgttacaattcctttaaataaatttgtt
tgtttaacaggtgtttcaggaagtggtaaatcaactttaatgaatgaaattttatgaaag
ggtattaagaaaaatttagggttagcaactgaacgaccaggggcacatgataaaatactt
gggattgataacattgataaagtaattaatatttcccaagatccaattgggaaaacacca
cggagtaatccagcaacttatacatcagtttttgatgatattcgtgatttatttgccgat
acaaatgaagctaaagcacgaggatatttgaagggtcgtttttcgtttaatgtgccaggt
ggacgttgtgaacattgtcaaggtgatggaattattaagatttcaatgcactttctacca
acggtttatgtttcttgcgaagtttgtgaaggtaaacgttataatgatgaaacattatta
gttaaattcaaagataaaaatatttatgatgttttagaaatgacagttgatcaagcttgt
gatttttttgcgacacaaccaaaaattagtcagaagttaggaacaatgcaagaggttggg
ttaggttatattaaattaggccaatcagcaacagaattgtctggtggagaagcccaacgg
gttaagttatcaacctttttgttaaaacggacaacgggaaaaactttatttttattagat
gaaccaacaacgggattacatgttgatgatgttaacagattgttagtagttttgaataaa
attgttgataatggtgatactgttattacgattgaacataatttagatgttattaaaatg
gctgattatattattgatttaggaccagaaggtggcgttggtggtggcatgattgttgca
acaggaacaccagaacaacttgttttaaaaagtggcactagttatacagcgcaatattta
aaacctttattaaaaagtaaaaggttagaataa

DBGET integrated database retrieval system