Spiroplasma kunkelii: SKUN_004
Help
Entry
SKUN_004 CDS
T04056
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
skn
Spiroplasma kunkelii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
skn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
skn03032
]
SKUN_004 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
skn03400
]
SKUN_004 (gyrA)
Enzymes [BR:
skn01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
SKUN_004 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
skn03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
SKUN_004 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
skn03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
SKUN_004 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
NTase_sub_bind
SIS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALA96930
UniProt:
A0A0K2JEB3
LinkDB
All DBs
Position
4801..7266
Genome browser
AA seq
821 aa
AA seq
DB search
MMKSENDGYDYDGKIRDIDIADEMKNGFLDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRIIYAMW
DLNMTYDKQHKKSARIVGEVIGKYHPHGDTAVYETMVRMAQDFSYRYPLIDGHGNFGSMD
GDAPAAMRYTEAKMSKIAGELIKDIEKETTIFIDNYDGSEEEPTFLPGYFPNLLVNGASG
IAVGMATNIPPHNLNEVIDGVIAVTKNPEITTVELMKIIKGPDFPTGALITAGNGLIKAY
ETGNGAITIRSKIDIEENNNKRRIIVSEIPYQINKAKLLERIAELIRDKIINGISDLRDE
SNMEGVRIVLELKRDAQENVILNKLYKLTPLQTNFSLNILALYKNQPRVMGLKQILKYFI
EHQIDIIIKRSQFELKKNCNRLIILEGLKIALDNIDEVITIIKQSQTIQIASNALINKFN
LVVEQAWAILEMRLQRLTGLEIEKIINEIKNIKIAITELKEIINNSEKQIDIMITELTKI
KKKYGDERRSHIIKEELTEIDPEELIRREDILIMLTQDGYVKRVADDTFKLQNRGGKGII
GLANIEDSLKKIISANSIDSLLIFSNFGKVYKLRAYQIETYSRHARGLPIINLIAIDKTE
NIQTIIAIDESISTEDNLFFVTKKGLIKKTKISEFNQIRQTGKVAIELKDNDELVSVIIT
KGHDDVIIGNNIGKVIRFNEEEIRPMIRQSVGVKGIANNAVGETIGVSSGRSGKYVLSVT
ENGYAKKTAIENYRLTGRNTNGVKSINLTDKTGYLKFVQAVNGDEDILVGTKKGNIIRFS
LEQIPLFGRTTSGVKIMRLEQDDKLEVIEILKNKISIEGEK
NT seq
2466 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaatcagaaaatgatggatatgattatgatggtaaaattcgtgatattgatatt
gctgatgaaatgaaaaatggctttttagattatgcaatgtcagttattgtttcacgtgca
attcctgatgttcgtgatggattaaaaccagttcatcgccgtattatttatgcaatgtga
gatttaaatatgacttatgataaacaacataagaaatcagctcgaattgttggtgaagta
attgggaaatatcatccccatggtgatactgctgtttatgaaacaatggttcggatggca
caagatttttcttatcgttatcctttaattgatgggcatggaaattttggttcaatggat
ggtgatgctccagctgcaatgcgatatacggaagcaaaaatgagtaaaattgctggtgaa
ctaatcaaagatattgaaaaagaaacaacaatttttattgacaattatgatggcagtgaa
gaagaaccgacttttttaccaggatattttccaaatttattagttaatggtgctagcgga
attgctgttggaatggcaactaatattccacctcataatttgaatgaagtaattgatggt
gttattgcggtaacaaaaaatcctgaaataacaactgttgaattaatgaaaattattaaa
ggacctgattttccaacgggagcattaattacggctggaaacggcttaattaaagcttat
gaaacaggaaatggagcaattacaattcgttcaaaaattgatattgaagaaaataataat
aaaagacgaattattgtgtcagagattccatatcaaattaataaagcaaaattgttggaa
cgaattgcagaattaattcgcgacaaaattattaatggaattagtgatcttcgtgatgaa
tcaaacatggaaggggttcgtattgttttagaattaaaacgtgatgctcaagaaaatgtt
attttaaataagttatataaattaacaccacttcaaactaatttttcgttaaatatttta
gcattatacaaaaaccaaccaagagtaatgggtttaaaacaaattttaaaatattttatt
gaacatcaaattgatattattattaaacgtagtcagtttgaattaaagaaaaattgtaat
cgtttaataattttagaaggattaaaaattgcgcttgataatattgatgaagtaattaca
attattaaacaatcacaaacaatacagattgcatcaaatgctttaattaataaatttaat
ttagtagttgaacaagcatgagcaattttagaaatgcgcttacaaagattaactggatta
gaaattgaaaaaattattaatgaaattaaaaatattaaaatagcaataactgaattaaaa
gagattattaataatagtgaaaaacaaattgatattatgattacggaattaacaaaaatc
aagaaaaaatatggtgatgagcggcgtagtcacattattaaggaagagttaacagaaatt
gatccagaagaattaattcgccgggaagatattttaattatgttaacacaagatggttat
gttaaacgagtagctgatgatacttttaaattacaaaatcgtggtggaaaagggattatt
ggtttagcaaatattgaagatagtttaaagaaaattattagtgctaatagtattgactca
ttattaattttttcaaattttggaaaagtgtataaattacgagcttatcaaattgaaaca
tattcacgacatgcacgggggttaccaattattaatttaatcgcaattgataaaacagaa
aacattcaaacaattattgctatagatgagtcaatttcaacagaggataatttatttttt
gtgacaaaaaaaggtcttattaaaaaaacaaagataagtgaatttaatcaaattcgtcaa
acaggaaaagtagcaattgagttaaaagataatgatgaattagtaagcgtgattattaca
aaaggacatgatgatgttattattggaaataatattggaaaagtaattcgatttaatgaa
gaagaaattaggccaatgatacgacaatcagtaggggttaaaggaattgctaataatgct
gttggagaaaccattggggttagttcaggacggtctgggaaatatgttttatcagtaact
gaaaatggttatgcaaaaaaaacagcaattgaaaattatcgtttgacaggacgaaatact
aatggtgttaagtcaattaacttaacagataaaacaggatatttaaaatttgttcaagct
gtaaatggtgatgaagatattttagtaggaacaaaaaaaggaaatattattcgtttttcg
ctagaacaaattccattatttggtcgaacaacatcgggtgttaaaattatgcgattagaa
caagatgataaattagaagttattgaaattttaaaaaataaaattagcattgaaggagaa
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system
