Spiroplasma kunkelii: SKUN_0070
Help
Entry
SKUN_0070 CDS
T04056
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I
KO
K02335
DNA polymerase I [EC:
2.7.7.7
]
Organism
skn
Spiroplasma kunkelii
Pathway
skn03030
DNA replication
skn03410
Base excision repair
skn03420
Nucleotide excision repair
skn03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
skn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SKUN_0070 (polA)
03410 Base excision repair
SKUN_0070 (polA)
03420 Nucleotide excision repair
SKUN_0070 (polA)
03440 Homologous recombination
SKUN_0070 (polA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
skn03032
]
SKUN_0070 (polA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
skn03400
]
SKUN_0070 (polA)
Enzymes [BR:
skn01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SKUN_0070 (polA)
DNA replication proteins [BR:
skn03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
Other elongation factors
SKUN_0070 (polA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
skn03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
BER (base exicision repair)
DNA polymerase I
SKUN_0070 (polA)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
SKUN_0070 (polA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
DNA_polI_exo1
5_3_exonuc
HHH_2
HHH_5
Tcp10_C
BT_3987-like_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALA96995
UniProt:
A0A0K2JEH9
LinkDB
All DBs
Position
63070..65679
Genome browser
AA seq
869 aa
AA seq
DB search
MKKVLLIDGNSLLFRAFYATAYNGEMLKSFDGTPTNAVYAFANMLNKILKTNNYYSVVVA
FDKGKKNFRHDLLFDYKDGRSKTPNELIVQFPIVKEFLDSYQIPYLEQEGYEADDLLGCL
AVLAEKEDFYVDIFSSDKDLYQLITNKTNILVPRQGDSADVIDETALITKWGITPLQVPD
LKGLMGDPSDNLKGVPKVGKKTAIKLIKEYHSIENLYDNIEQIKGALRQNLLNHKESALL
CKKIATIFCDINLEHFTFTHFSPNQEKLMQFYLKYNMNSFVTKLFNNQDNSTENSNITVK
IIEEWCSEFNENNTTVYLELLDENYHTAEIIGFGIVNSKNVFYFDYIHAKHDKLWHQFLN
DTKYQKLTYHSKSLIVALARDNIFVQNIEYDMMLAGYVYNSNAKNSLDTYINLFEKKQIL
TDELFYGKGVKKQIPDDVIKLSHFIGEKAAYIHKLRQKIIELLKSNQQYDLYYKIELPTA
FALARMEINGVKVNQDELTTQTLRIEKIVQELNNEINDIAQKEINPNSPKQISELLFQDL
SLPDRKKGSTAQEALEKIKNNHVIIPNILDHRKYKKLYSTYLKGMEKYIFADGKVHTIYK
QTLTNTGRLSSVEPNMQNISIRDDVQKEVRKIFVVSSPNNVLLSCDYSQIELRILAHMSK
DQDLIAAFNKNEDIHTNTAMKIFNLSKNEITPNIRRSAKAVNFGIIYGISDFGLATDLNI
SVAKAKAIINNYYQQFPTIKVFIDKQVEFCKQNGYVTTIFNRKRYVPEINDRNYMQREFG
KRIAINMPIQGSAADIIKIALKNIDQEFLKLNLKAKIIAQIHDELIFEIPQVELIQVQKI
VKTLMEDSTKLDVKLIVDMKTGLSWYDLK
NT seq
2610 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaagtattgttaattgatggaaattctttgctttttagagcattttatgccaca
gcgtataatggcgagatgttaaagagtttcgatggaacaccaacaaatgctgtttatgca
tttgccaatatgttgaataaaatattaaaaacaaataactactatagtgttgttgttgct
tttgataaaggaaaaaagaattttcgtcatgatttattatttgactacaaagatggtcgg
agtaaaacgccaaatgaattaattgtacaatttccaattgtaaaagaatttttagatagt
tatcaaattccatatttagagcaagaaggatatgaagctgatgatttattaggatgttta
gcagttctggctgaaaaagaagatttttatgttgatattttttcaagtgataaagattta
tatcaattaattactaataaaacaaatattttagtgccacgtcaaggcgacagtgctgat
gttattgatgaaacagctttaataacaaaatggggaattacaccattacaagttcctgat
ttaaaagggctaatgggtgatccttctgataatttaaagggtgttccaaaggttggtaaa
aaaacagcaataaaattaattaaggaatatcattcaattgaaaatttatatgataatatt
gagcagattaagggtgcattacgacaaaatttattaaatcataaggaaagtgcattatta
tgcaaaaagatagctactattttttgcgatattaatttagaacattttacttttactcat
ttttcaccaaatcaagaaaaattaatgcaattttatttaaaatataatatgaattcattt
gtaacaaagttgtttaataatcaagataatagtaccgaaaactcaaatataacagtaaaa
attattgaagaatgatgttccgaatttaatgaaaataacactactgtttatttagaatta
ttagatgaaaattatcatactgcagaaattattgggtttggaattgttaattcgaaaaat
gttttttattttgattatattcatgcaaagcatgataaactatgacatcaatttttaaat
gatactaaatatcaaaagttaacttatcattcaaagagtttaattgttgctttagctcgt
gataatatttttgttcaaaatattgaatatgatatgatgctagctggttatgtttataat
tcaaatgcaaaaaatagtttagatacttatattaatttatttgaaaaaaaacaaattttg
actgatgaattattttatggtaaaggggttaaaaaacaaattcctgatgatgtaattaaa
ttaagtcattttattggtgaaaaagcagcgtacattcataaattaagacaaaaaattatt
gagttattaaaatctaatcagcaatatgatttatattataagattgagttaccaaccgct
tttgcattagcacgaatggaaattaatggtgttaaagttaaccaagatgaattaacaaca
caaacattacgaattgaaaaaattgtgcaagaattaaataatgaaattaatgatattgca
caaaaagaaattaatcctaattcaccaaaacaaatttcagaattattatttcaagatctt
tcattacctgataggaaaaaagggtcaacagcacaagaagcattagaaaaaataaaaaat
aaccatgtgattattccaaatatattagatcatcgaaagtataaaaaattatattcaact
tatttaaaagggatggaaaaatatatttttgctgatgggaaagttcatacaatttataaa
caaaccttaacaaatactggtcggctttcatctgtggaacctaatatgcaaaatattagt
attcgtgatgatgttcaaaaagaggtacgaaaaatttttgttgtttcatcgccaaataat
gttttattatcttgtgattattcacaaattgaattacgaattttagcacatatgtcaaaa
gaccaagatttaattgctgcttttaataagaatgaagatattcatactaatactgcaatg
aaaatttttaatttatcaaaaaatgaaattacaccaaatattcgtcgtagtgcgaaagct
gttaattttgggattatttatggaattagtgattttggtttagcaactgatttaaatatt
tctgttgcaaaagcaaaagcaataattaataattattatcaacaatttccaacaattaag
gtttttattgataaacaagttgagttttgtaaacaaaatggttatgttacaacaattttt
aatcggaaacgttatgtcccagaaattaatgaccgtaattatatgcaacgtgaatttgga
aagcggattgcaattaatatgccaattcaaggtagtgcagcggatattattaaaattgct
ttaaaaaatattgaccaagaatttttaaaattaaatttaaaagcaaaaattattgcacaa
attcatgatgaattaatttttgaaattccgcaagttgaattaattcaagtgcaaaaaatt
gttaaaacattgatggaagattctactaaattagatgtaaagttaatagttgatatgaaa
actggtttaagttgatatgatttaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system