KEGG   Spiroplasma kunkelii: SKUN_0070
Entry
SKUN_0070         CDS       T04056                                 
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I
  KO
K02335  DNA polymerase I [EC:2.7.7.7]
Organism
skn  Spiroplasma kunkelii
Pathway
skn03030  DNA replication
skn03410  Base excision repair
skn03420  Nucleotide excision repair
skn03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:skn00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    SKUN_0070 (polA)
   03410 Base excision repair
    SKUN_0070 (polA)
   03420 Nucleotide excision repair
    SKUN_0070 (polA)
   03440 Homologous recombination
    SKUN_0070 (polA)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:skn03032]
    SKUN_0070 (polA)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:skn03400]
    SKUN_0070 (polA)
Enzymes [BR:skn01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     SKUN_0070 (polA)
DNA replication proteins [BR:skn03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    Other elongation factors
     SKUN_0070 (polA)
DNA repair and recombination proteins [BR:skn03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    DNA polymerase I
     SKUN_0070 (polA)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     SKUN_0070 (polA)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol_A 5_3_exonuc_N DNA_polI_exo1 5_3_exonuc HHH_2 HHH_5 Tcp10_C BT_3987-like_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: ALA96995
UniProt: A0A0K2JEH9
LinkDB
Position
63070..65679
AA seq 869 aa
MKKVLLIDGNSLLFRAFYATAYNGEMLKSFDGTPTNAVYAFANMLNKILKTNNYYSVVVA
FDKGKKNFRHDLLFDYKDGRSKTPNELIVQFPIVKEFLDSYQIPYLEQEGYEADDLLGCL
AVLAEKEDFYVDIFSSDKDLYQLITNKTNILVPRQGDSADVIDETALITKWGITPLQVPD
LKGLMGDPSDNLKGVPKVGKKTAIKLIKEYHSIENLYDNIEQIKGALRQNLLNHKESALL
CKKIATIFCDINLEHFTFTHFSPNQEKLMQFYLKYNMNSFVTKLFNNQDNSTENSNITVK
IIEEWCSEFNENNTTVYLELLDENYHTAEIIGFGIVNSKNVFYFDYIHAKHDKLWHQFLN
DTKYQKLTYHSKSLIVALARDNIFVQNIEYDMMLAGYVYNSNAKNSLDTYINLFEKKQIL
TDELFYGKGVKKQIPDDVIKLSHFIGEKAAYIHKLRQKIIELLKSNQQYDLYYKIELPTA
FALARMEINGVKVNQDELTTQTLRIEKIVQELNNEINDIAQKEINPNSPKQISELLFQDL
SLPDRKKGSTAQEALEKIKNNHVIIPNILDHRKYKKLYSTYLKGMEKYIFADGKVHTIYK
QTLTNTGRLSSVEPNMQNISIRDDVQKEVRKIFVVSSPNNVLLSCDYSQIELRILAHMSK
DQDLIAAFNKNEDIHTNTAMKIFNLSKNEITPNIRRSAKAVNFGIIYGISDFGLATDLNI
SVAKAKAIINNYYQQFPTIKVFIDKQVEFCKQNGYVTTIFNRKRYVPEINDRNYMQREFG
KRIAINMPIQGSAADIIKIALKNIDQEFLKLNLKAKIIAQIHDELIFEIPQVELIQVQKI
VKTLMEDSTKLDVKLIVDMKTGLSWYDLK
NT seq 2610 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaagtattgttaattgatggaaattctttgctttttagagcattttatgccaca
gcgtataatggcgagatgttaaagagtttcgatggaacaccaacaaatgctgtttatgca
tttgccaatatgttgaataaaatattaaaaacaaataactactatagtgttgttgttgct
tttgataaaggaaaaaagaattttcgtcatgatttattatttgactacaaagatggtcgg
agtaaaacgccaaatgaattaattgtacaatttccaattgtaaaagaatttttagatagt
tatcaaattccatatttagagcaagaaggatatgaagctgatgatttattaggatgttta
gcagttctggctgaaaaagaagatttttatgttgatattttttcaagtgataaagattta
tatcaattaattactaataaaacaaatattttagtgccacgtcaaggcgacagtgctgat
gttattgatgaaacagctttaataacaaaatggggaattacaccattacaagttcctgat
ttaaaagggctaatgggtgatccttctgataatttaaagggtgttccaaaggttggtaaa
aaaacagcaataaaattaattaaggaatatcattcaattgaaaatttatatgataatatt
gagcagattaagggtgcattacgacaaaatttattaaatcataaggaaagtgcattatta
tgcaaaaagatagctactattttttgcgatattaatttagaacattttacttttactcat
ttttcaccaaatcaagaaaaattaatgcaattttatttaaaatataatatgaattcattt
gtaacaaagttgtttaataatcaagataatagtaccgaaaactcaaatataacagtaaaa
attattgaagaatgatgttccgaatttaatgaaaataacactactgtttatttagaatta
ttagatgaaaattatcatactgcagaaattattgggtttggaattgttaattcgaaaaat
gttttttattttgattatattcatgcaaagcatgataaactatgacatcaatttttaaat
gatactaaatatcaaaagttaacttatcattcaaagagtttaattgttgctttagctcgt
gataatatttttgttcaaaatattgaatatgatatgatgctagctggttatgtttataat
tcaaatgcaaaaaatagtttagatacttatattaatttatttgaaaaaaaacaaattttg
actgatgaattattttatggtaaaggggttaaaaaacaaattcctgatgatgtaattaaa
ttaagtcattttattggtgaaaaagcagcgtacattcataaattaagacaaaaaattatt
gagttattaaaatctaatcagcaatatgatttatattataagattgagttaccaaccgct
tttgcattagcacgaatggaaattaatggtgttaaagttaaccaagatgaattaacaaca
caaacattacgaattgaaaaaattgtgcaagaattaaataatgaaattaatgatattgca
caaaaagaaattaatcctaattcaccaaaacaaatttcagaattattatttcaagatctt
tcattacctgataggaaaaaagggtcaacagcacaagaagcattagaaaaaataaaaaat
aaccatgtgattattccaaatatattagatcatcgaaagtataaaaaattatattcaact
tatttaaaagggatggaaaaatatatttttgctgatgggaaagttcatacaatttataaa
caaaccttaacaaatactggtcggctttcatctgtggaacctaatatgcaaaatattagt
attcgtgatgatgttcaaaaagaggtacgaaaaatttttgttgtttcatcgccaaataat
gttttattatcttgtgattattcacaaattgaattacgaattttagcacatatgtcaaaa
gaccaagatttaattgctgcttttaataagaatgaagatattcatactaatactgcaatg
aaaatttttaatttatcaaaaaatgaaattacaccaaatattcgtcgtagtgcgaaagct
gttaattttgggattatttatggaattagtgattttggtttagcaactgatttaaatatt
tctgttgcaaaagcaaaagcaataattaataattattatcaacaatttccaacaattaag
gtttttattgataaacaagttgagttttgtaaacaaaatggttatgttacaacaattttt
aatcggaaacgttatgtcccagaaattaatgaccgtaattatatgcaacgtgaatttgga
aagcggattgcaattaatatgccaattcaaggtagtgcagcggatattattaaaattgct
ttaaaaaatattgaccaagaatttttaaaattaaatttaaaagcaaaaattattgcacaa
attcatgatgaattaatttttgaaattccgcaagttgaattaattcaagtgcaaaaaatt
gttaaaacattgatggaagattctactaaattagatgtaaagttaatagttgatatgaaa
actggtttaagttgatatgatttaaaataa

DBGET integrated database retrieval system