Saccoglossus kowalevskii (acorn worm): 100303513
Help
Entry
100303513 CDS
T04123
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC100303513
KO
K19719
collagen type II alpha
Organism
sko
Saccoglossus kowalevskii (acorn worm)
Pathway
sko04512
ECM-receptor interaction
sko04518
Integrin signaling
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sko00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
100303513
04518 Integrin signaling
100303513
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sko00536
]
100303513
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sko00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
100303513
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
COLFI
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100303513
NCBI-ProteinID:
XP_077864293
UniProt:
A0ACM8CD43
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1185 aa
AA seq
DB search
MAQNHYLRMFDLCSVQKGGHGPPGSSGQTGPPGPRGARGADGPPGQSGPPGSPGQAGQPG
FPGMAGAKGESGKPGPRGPTGQQGARGEAGSPGATGKSGQRGPPGLSGSPGSKGSSGAAG
LPGPQGFPGPRGAPGPQGSNGATGPKGSQGNPGVAGMKGAQGPTGLTGDSGPRGLPGPAG
EDGRRGERGEPGSQGTPGPQGEMGAAGVRGFPGPSGPAGAKGESGEPGRPGPIGSKGSSG
DPGRAGQQGMPGARGLTGSPGKEGPSGRPGTPVSLNQFLLLYKICYMPDLSTFLSAKVNI
CHLSQNNTKDHQGEPGKDGDPGPAGARGARGESGKDGDAGPVGPTGPRGPAGERGATGAT
GSPGFVGQTGQPGLPGEPGQPGEQGVQGEAGPAGQIGPRGERGHPGERGTPGPNGKKGDR
GFQGAAGSDGAKGSSGPKGVRGEGGPQGLQGLPGPAGLTGATGAKGDRGETGERGVTGAP
GKPGDRGSPGPMGISGPQGSQGEKGQTGAPGPLGQSGPRGDTGETGPAGRPGPQGLAGPQ
GRPGSTGRAGRDGKPGAKGDSGDPGEQGDRGDPGPLGPRGIPGAKGDRGPAGRPGPQGLA
GAGGRPGATGTTGPAGAKGAAGAPGTAGAKGEPGESGEQGRPGDQGLEGPEGPYGPKGDA
GKDGKDGEPGLPGPQGAQGSRGSMGMPGQKGESGPRGAPGPQGEDGKTGLPGISGERGPV
GPSGPLGPQGPRGDQGPEGVSGKDGIPGVQGRPGIKGDRGNTGSPGPAGMSGPMGAPGPS
GEAGPQGPTGDPGPSGPVGPEGARGSRGPSGEPGIAGAPGDAGIQGARGAKGHRGFPGLQ
GIPGSMGVPGEDGMTGPPGPNGPRGATGPRGSPGLNGKDGPMGQPGPEGPRGSRGDRGDS
GTSGPPGPPGPPGPPGDAQGFDAAAFSSMFASFSQPGMKGPQGDEPEPYQGDAIAQKVRD
VEVMASLQSLNEQIQNIQTPTGSKKNPARTCRDLALCHPDWPSGEYWVDPNQGCALDAIK
VYCDFKTYESCIFPEKTEAPKMNYYQGPNKHVWFGDSMKNGFKFNYDVELVQLTFLRLLS
VHGRQNVTYHCKNSVAYFDAETGNFKKAAKLLADTEVELVAQGKTRFQYSVFEDGCTLRN
DKWGQTVFEYDTKKTSRLPIQDFAPFDIGGDDQEFGLTIGPVCFS
NT seq
3558 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctcaaaatcactatttacgaatgtttgacctgtgttctgtacaaaagggaggccat
ggcccaccagggtcatcaggtcaaactggaccccctggaccaaggggtgcaagaggagct
gatggaccacccggacaatctggaccacctggctcacctggtcaagctggacaacctgga
tttcctggaatggctggtgctaaaggagaaagtggtaaacctggtccccgtggtcctact
ggccaacaaggtgcaagaggtgaagcaggaagccctggtgcaacaggaaagtctggtcaa
agaggtccccctggacttagcggtagccctggatcaaaaggctcaagtggtgccgctggt
ttaccaggtccacaaggattcccaggcccaagaggagctccaggtccacaaggaagtaat
ggtgctactggtcctaaaggaagtcagggtaacccaggtgtagctggaatgaaaggagca
caaggtccaactggtctaacaggtgattctggtccaaggggtttgcctggacctgctggt
gaagatggacgacgaggtgaacgtggagagcccggttcacaaggaactccaggaccccag
ggagaaatgggagcagctggtgttcgtggatttcctggtccatctggtccggctggtgct
aagggagaatcgggtgaaccaggtcgtccaggtccaattggttccaaaggatcctcaggt
gacccaggtagagcaggacagcaaggtatgccaggagcaaggggtttaacaggctcacca
ggaaaagaaggtccatcaggaagacccggtactccagtaagtttgaatcaattcctatta
ctatataaaatttgttatatgcctgatctctcaacgtttttgagtgccaaagtcaacatt
tgtcacctttcacaaaataataccaaggaccaccagggtgaaccaggtaaagacggtgat
ccaggtccagccggtgcaagaggtgctcggggtgaaagtggtaaagatggtgatgccggt
cctgttggacctactggtccgcgtggtcccgctggtgagagaggtgctacaggagctaca
ggctctccaggttttgtaggacaaacaggtcagcctggtctgccaggagaacctggacaa
cccggtgaacagggtgtacaaggcgaggcaggtcctgctggacaaattggaccaagggga
gagagaggtcatcctggcgagcgtggtacgccgggtcccaacggaaagaaaggagatcgt
ggcttccaaggcgctgccggttcagatggtgcaaagggttctagcggtccaaaaggtgtg
agaggagaaggcggtccacaaggcttacagggtttaccaggtccagcaggtttaactggt
gcgactggtgctaaaggtgatcgtggtgaaactggtgagaggggagtaacaggtgctcct
ggtaaacctggagataggggaagcccgggtccaatgggtatttctggtccacaaggttca
caaggagaaaaaggacaaactggtgcccctggcccattgggtcaaagtggacccagagga
gatactggtgaaactggtcctgcaggccgaccaggtcctcaaggtctagctggtccacag
ggtcgtccaggttctacaggtcgtgcaggtagagatggtaaaccaggagctaagggtgat
tctggagatcctggtgaacaaggtgatcgtggtgatcccggtcctcttggtcccagaggt
attcctggtgcaaaaggagacagaggtcccgctgggcgacctggtccacaaggtttggct
ggtgcaggcggaagacctggtgcaactggaacgactggtcctgctggtgctaagggtgct
gctggtgctccaggtactgctggtgcaaagggtgaacctggtgaaagtggtgaacaagga
agacctggtgatcagggtctcgaaggtccagaaggtccatatggtccaaaaggtgatgca
ggaaaagatggaaaagatggtgaaccaggtctaccaggtccacaaggcgcacagggttcc
agaggttcaatgggtatgccaggacaaaaaggtgaatcaggtccaagaggtgcaccaggt
ccacagggtgaagatggaaaaactggcctgcctggaatttctggagagagaggtccagtt
ggtccatctggtcctttgggtccacaaggtccaaggggagatcaaggtccagagggtgtg
agtggtaaagatggtattccaggtgtccaaggacgtccaggtattaaaggtgatcgtggt
aatacgggtagtcctggtcctgctggtatgtctggtccaatgggagctcctggtccatct
ggagaagctggtcctcaaggccctactggtgatcctggtccatccggaccagttggtcca
gaaggtgcaagaggttcaagaggtccaagcggagaaccaggtattgctggcgctcctgga
gatgctggtatccagggagcaaggggtgcaaaaggacatcgtggattccctggtctacaa
ggtattcccggtagtatgggtgttccaggtgaagatggtatgacaggacctcctggtcca
aatggtccaagaggtgcaactggtcctagaggctcgccaggtttgaatggaaaagatggt
ccaatgggtcaacccggtccagagggtccaagaggttctcggggtgacaggggagatagc
ggtacctccggtcctcccggtccacctggtccacctggtcccccaggtgatgctcaagga
tttgatgctgcagctttttcatctatgtttgcttcattctcacaaccaggcatgaaagga
ccacaaggagatgaacccgaaccataccaaggagatgctatcgcccagaaagtcagagat
gttgaagttatggcatcgctgcaatcactcaatgaacaaatacagaatatacaaacacct
actggttcaaagaaaaatccagcaagaacttgtcgtgacctggctctttgccatccagat
tggcccagtggtgaatactgggtggatcctaatcaaggctgtgctttagatgccattaaa
gtctactgcgatttcaaaacatatgaatcatgtatattcccagaaaagactgaggctcca
aagatgaactactaccaaggtccaaacaaacatgtctggtttggtgatagcatgaagaat
gggtttaagttcaattatgatgtggaacttgtacaattgacattcctccgacttctaagt
gttcatggtcgtcagaacgtcacctatcactgcaagaactcagttgcttactttgatgca
gaaacgggtaatttcaagaaggctgccaagttattggccgacaccgaagtagaattggtg
gctcagggcaaaacgcgattccagtattcagtatttgaagatggttgtactttacgaaat
gataaatggggacagaccgtgttcgaatacgataccaagaaaacctctcgtctacccatt
caagactttgctccatttgatatcggtggtgatgaccaagagttcggtttgactatagga
ccagtctgtttttcataa
DBGET
integrated database retrieval system
