Saccoglossus kowalevskii (acorn worm): 100303513 Help Entry 100303513         CDS       T04123                                  Name (RefSeq) fibrillar collagen   KO K19719   collagen type II alpha Organism sko  Saccoglossus kowalevskii (acorn worm) Pathway sko04512   ECM-receptor interaction Brite KEGG Orthology (KO) [BR:sko00001]  09130 Environmental Information Processing   09133 Signaling molecules and interaction    04512 ECM-receptor interaction     100303513  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:sko00536]     100303513 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:sko00536]  Heparan sulfate / Heparin   Extracellular matrix molecules    100303513 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Collagen COLFI Motif Other DBs NCBI-GeneID:  100303513 NCBI-ProteinID:  XP_006814954 LinkDB All DBs Position Un AA seq 1173 aa AA seqDB search MQDWEEATCDMKETKGEKGESGEESSGFPTFPPGSYGPPGVPGAPGGHGPPGSSGQTGPP GPRGARGADGPPGQSGPPGSPGQAGQPGFPGMAGAKGESGKPGPRGPTGQQGARGEAGSP GATGKSGQRGPPGLSGSPGSKGSSGAAGLPGPQGFPGPRGAPGPQGSNGATGPKGSQGNP GVAGMKGAQGPTGLTGDSGPRGLPGPAGEDGRRGERGEPGSQGTPGPQGEMGAAGVRGFP GPSGPAGAKGESGEPGRPGPIGSKGSSGDPGRAGQQGMPGARGLTGSPGKEGPSGRPGTP GEPGKDGDPGPAGARGARGESGKDGDAGPVGPTGPRGPAGERGATGATGSPGFVGQTGQP GLPGEPGQPGEQGVQGEAGPAGQIGPRGERGHPGERGTPGPNGKKGDRGFQGAAGSDGAK GSSGPKGVRGEGGPQGLQGLPGPAGLTGATGAKGDRGETGERGVTGAPGKPGDRGSPGPM GISGPQGSQGEKGQTGAPGPLGQSGPRGDTGETGPAGRPGPQGLAGPQGRPGSTGRAGRD GKPGAKGDSGDPGEQGDRGDPGPLGPRGIPGAKGDRGPAGRPGPQGLAGAGGRPGATGTT GPAGAKGAAGAPGTAGAKGEPGESGEQGRPGDQGLEGPEGPYGPKGDAGKDGKDGEPGLP GPQGAQGSRGSMGMPGQKGESGPRGAPGPQGEDGKTGLPGISGERGPVGPSGPLGPQGPR GDQGPEGVSGKDGIPGVQGRPGIKGDRGNTGSPGPAGMSGPMGAPGPSGEAGPQGPTGDP GPSGPVGPEGARGSRGPSGEPGIAGAPGDAGIQGARGAKGHRGFPGLQGIPGSMGVPGED GMTGPPGPNGPRGATGPRGSPGLNGKDGPMGQPGPEGPRGSRGDRGDSGTSGPPGPPGPP GPPGDAQGFDAAAFSSMFASFSQPGMKGPQGDEPEPYQGDAIAQKVRDVEVMASLQSLNE QIQNIQTPTGSKKNPARTCRDLALCHPDWPSGEYWVDPNQGCALDAIKVYCDFKTYESCI FPEKTEAPKMNYYQGPNKHVWFGDSMKNGFKFNYDVELVQLTFLRLLSVHGRQNVTYHCK NSVAYFDAETGNFKKAAKLLADTEVELVAQGKTRFQYSVFEDGCTLRNDKWGQTVFEYDT KKTSRLPIQDFAPFDIGGDDQEFGLTIGPVCFS NT seq 3522 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgcaagattgggaagaggctacatgcgatatgaaggagacaaaaggtgagaaaggagaa tcaggagaagaatcaagtggcttcccaactttccctccaggttcatatggccctccagga gttccaggagcaccgggaggccatggcccaccagggtcatcaggtcaaactggaccccct ggaccaaggggtgcaagaggagctgatggaccacccggacaatctggaccacctggctca cctggtcaagctggacaacctggatttcctggaatggctggtgctaaaggagaaagtggt aaacctggtccccgtggtcctactggccaacaaggtgcaagaggtgaagcaggaagccct ggtgcaacaggaaagtctggtcaaagaggtccccctggacttagcggtagccctggatca aaaggctcaagtggtgccgctggtttaccaggtccacaaggattcccaggcccaagagga gctccaggtccacaaggaagtaatggtgctactggtcctaaaggaagtcagggtaaccca ggtgtagctggaatgaaaggagcacaaggtccaactggtctaacaggtgattctggtcca aggggtttgcctggacctgctggtgaagatggacgacgaggtgaacgtggagagcccggt tcacaaggaactccaggaccccagggagaaatgggagcagctggtgttcgtggatttcct ggtccatctggtccggctggtgctaagggagaatcgggtgaaccaggtcgtccaggtcca attggttccaaaggatcctcaggtgacccaggtagagcaggacagcaaggtatgccagga gcaaggggtttaacaggctcaccaggaaaagaaggtccatcaggaagacccggtactcca ggtgaaccaggtaaagacggtgatccaggtccagccggtgcaagaggtgctcggggtgaa agtggtaaagatggtgatgccggtcctgttggacctactggtccgcgtggtcccgctggt gagagaggtgctacaggagctacaggctctccaggttttgtaggacaaacaggtcagcct ggtctgccaggagaacctggacaacccggtgaacagggtgtacaaggcgaggcaggtcct gctggacaaattggaccaaggggagagagaggtcatcctggcgagcgtggtacgccgggt cccaacggaaagaaaggagatcgtggcttccaaggcgctgccggttcagatggtgcaaag ggttctagcggtccaaaaggtgtgagaggagaaggcggtccacaaggcttacagggttta ccaggtccagcaggtttaactggtgcgactggtgctaaaggtgatcgtggtgaaactggt gagaggggagtaacaggtgctcctggtaaacctggagataggggaagcccgggtccaatg ggtatttctggtccacaaggttcacaaggagaaaaaggacaaactggtgcccctggccca ttgggtcaaagtggacccagaggagatactggtgaaactggtcctgcaggccgaccaggt cctcaaggtctagctggtccacagggtcgtccaggttctacaggtcgtgcaggtagagat ggtaaaccaggagctaagggtgattctggagatcctggtgaacaaggtgatcgtggtgat cccggtcctcttggtcccagaggtattcctggtgcaaaaggagacagaggtcccgctggg cgacctggtccacaaggtttggctggtgcaggcggaagacctggtgcaactggaacgact ggtcctgctggtgctaagggtgctgctggtgctccaggtactgctggtgcaaagggtgaa cctggtgaaagtggtgaacaaggaagacctggtgatcagggtctcgaaggtccagaaggt ccatatggtccaaaaggtgatgcaggaaaagatggaaaagatggtgaaccaggtctacca ggtccacaaggcgcacagggttccagaggttcaatgggtatgccaggacaaaaaggtgaa tcaggtccaagaggtgcaccaggtccacagggtgaagatggaaaaactggcctgcctgga atttctggagagagaggtccagttggtccatctggtcctttgggtccacaaggtccaagg ggagatcaaggtccagagggtgtgagtggtaaagatggtattccaggtgtccaaggacgt ccaggtattaaaggtgatcgtggtaatacgggtagtcctggtcctgctggtatgtctggt ccaatgggagctcctggtccatctggagaagctggtcctcaaggccctactggtgatcct ggtccatccggaccagttggtccagaaggtgcaagaggttcaagaggtccaagcggagaa ccaggtattgctggcgctcctggagatgctggtatccagggagcaaggggtgcaaaagga catcgtggattccctggtctacaaggtattcccggtagtatgggtgttccaggtgaagat ggtatgacaggacctcctggtccaaatggtccaagaggtgcaactggtcctagaggctcg ccaggtttgaatggaaaagatggtccaatgggtcaacccggtccagagggtccaagaggt tctcggggtgacaggggagatagcggtacctccggtcctcccggtccacctggtccacct ggtcccccaggtgatgctcaaggatttgatgctgcagctttttcatctatgtttgcttca ttctcacaaccaggcatgaaaggaccacaaggagatgaacccgaaccataccaaggagat gctatcgcccagaaagtcagagatgttgaagttatggcatcgctgcaatcactcaatgaa caaatacagaatatacaaacacctactggttcaaagaaaaatccagcaagaacttgtcgt gacctggctctttgccatccagattggcccagtggtgaatactgggtggatcctaatcaa ggctgtgctttagatgccattaaagtctactgcgatttcaaaacatatgaatcatgtata ttcccagaaaagactgaggctccaaagatgaactactaccaaggtccaaacaaacatgtc tggtttggtgatagcatgaagaatgggtttaagttcaattatgatgtggaacttgtacaa ttgacattcctccgacttctaagtgttcatggtcgtcagaacgtcacctatcactgcaag aactcagttgcttactttgatgcagaaacgggtaatttcaagaaggctgccaagttattg gccgacaccgaagtagaattggtggctcagggcaaaacgcgattccagtattcagtattt gaagatggttgtactttacgaaatgataaatggggacagaccgtgttcgaatacgatacc aagaaaacctctcgtctacccattcaagactttgctccatttgatatcggtggtgatgac caagagttcggtttgactataggaccagtctgtttttcataa

DBGET integrated database retrieval system