Saccoglossus kowalevskii (acorn worm): 100371750
Help
Entry
100371750 CDS
T04123
Name
(RefSeq) laminin subunit beta-1-like
KO
K06243
laminin, beta 2
Organism
sko
Saccoglossus kowalevskii (acorn worm)
Pathway
sko04512
ECM-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sko00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
100371750
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_EGF
Laminin_N
LAMININ_IV_B
Tropomyosin
F5_F8_type_C
Laminin_II
HAMP
Cauli_AT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100371750
NCBI-ProteinID:
XP_006825989
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
1770 aa
AA seq
DB search
MLQKMAWCYFLCLLACYGASVLGQEPSCEGGGCYPATGDLLIGRKEQLSSSSTCGLERPE
RFCIVSHLTDITKCFYCDSRNSFKKGVHVLSHRIENVVTSFDENRKETWWQSENGREDVF
IQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMFVERSSDFGRTWKIYRYFAYNCEESFPGIKHGHQ
EDISETICESRYSAVEPSTEGEVIFRVLPPNLQVNDPYAADVQDLLRVTNLRINFTKLHT
LGDNLLDNREEIKEKYYYALYDMVVRGSCQCYGHASRCIPLEGMSHESGMVYGNCDCTHN
TKGLNCEQCEDFYNDLPWRPAAGGETNACKRCNCNNHASRCHFDPAVYEQTGQISGGVCD
NCQHNTLGRNCEQCRPFFYMDPSKDIRDPNVCVPCNCDPSGAVNGGECESREDRENGLVA
GRCICKRFVEGDRCDVCRDGYWNLEYNNPEGCQPCSCALQGTVGNQGCHKRTGQCVCKRL
VTGRDCNECLDGYWGLSDDPDGCKPCDCDIGGSYDNLCEKSDGQCRCKRNIIGRRCDMAE
PGFFVPGLDMITYEAELNRGIGPTTVEIREQPDGTVVTWTGPGFMRIREGGSVEFIVDNI
PTSMEYDVMLRYEPQMPETWEDVRVTVTRPTDIPTSSVCGNTIPQDDLLATSLLPGQRHR
ILSRPVCLERGTRYTIRVDFNRYHNGSPTPAAQILFDSLVLVPTHSSLPMFQGPGPAEER
REQYERYRCQETQMSVLKPPMPEICEDLIFSMSASMYDGAVPCNCDQTGSVSSVCGAIGG
QCECKSNVIGRRCDRCSPGTYGFGPQGCQLCDCNQIGSRSLLCDVNSGQCPCNLNTYGRQ
CDLCERGYWNFPNCQPCQCNGHADTCDSRTGTCEDCRDNTAGQFCQICALGFYGDPREGS
GQVCQPCMCPGGAGSGFQFADSCYLDPRSQTVICECKEGYTGIRCDQCDNNFFGNPLIPG
GGCQNCSCNGNIDPSVPGNCDARTGECLRCLYNTEGTYCENCKPGFYGDALNKDCKKCVC
NILGTDRSVCDNMNNCGICDSNTGQCPCLPNVEGRNCDRCTDDYWKLASGTGCELCNCCS
YGSVSSQCNEFDGQCQCRPGFGGRQCCDCEADFWGDPLVECKACNCDPDGSESLQCDRDT
GVCLCKEGVTGDKCDRCDRGTSGDLPNCEPCGECFDDWDDIIQDLKNQTDYEIDRAQNIK
HTGAPGAYDDEFQEMEDKLDKIKKLLVAPNVTEAEVEDLQKDLADIRDGLTGYEKQLDEI
EDDLPKIEDRKLDADDELDRLEKAAGNLAKKAKDLEDNVTDISLSDVEGAFNSIKESQNK
SQMAQDKVDATEPIIEESEEIRDELNKLIKDRQDELDQNQKDNEDALNDLDNQLAGLEAK
LKDVNEMVCGAPGDECSTCGGAGCGECGGLGCAGAVPVAEQALTRAQDADDKLREKEKEA
NDMLDEVQMAEDDANDAKDKAQMAYDAALQAKTEAEGAQTNLTDLLDAITDFLHSEGAKP
SDIRRIAEKVLAMKISLTPDEIRELAKEINETIQNLENVDDILDATKDDLDRAKKLKEDA
EKTKDFADGVLDKARNVVEALDDADKAQQVAEDAIDKADDDIKAAEEALLQIESETSAAL
EKARDSLNKVEDMDDQLDDVKRKFTDNEINIDNAAEAAKQADELADDAQDDADNLQNKYT
DAAKEIDDKISESNDALERAEKLKDDATALESETRDKLQELDDIKGDFDNNEDRLGNLAD
ELGDLNDEMSKLLADIERKAQFYRTCQPGT
NT seq
5313 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctacagaaaatggcgtggtgctactttttatgccttttagcctgttatggtgcttca
gtattgggtcaagaaccttcttgtgaagggggtggatgttaccctgccaccggtgacctt
ttaattggaagaaaagagcaactttcatcatcttcaacgtgtggtttagaaagaccggaa
cgtttctgtattgttagtcatttaacagacattactaagtgtttttattgtgactctcgg
aattcttttaagaagggtgtccatgtgttgagccacagaatagaaaatgttgttacatcg
tttgatgagaacaggaaagaaacttggtggcaatcagaaaatggaagagaggatgtcttt
attcagttggatttagaagctgaatttcatttcactcatcttataatgacttttaaaact
ttccggcctgctgccatgtttgtagagagatcatctgattttggtaggacgtggaagata
tatagatacttcgcttacaattgtgaggaatcctttccaggtatcaaacacggtcatcaa
gaagacatcagtgaaactatttgtgagtcacgatactcagctgtggaaccatcgactgag
ggtgaggtcattttcagagtcctgccaccaaatcttcaagttaatgatccatatgcagcc
gatgtacaggatctcttgagggtgactaatctccgtattaactttaccaagctgcatact
cttggtgacaaccttctagataacagagaggaaatcaaagaaaaatattactatgctttg
tatgatatggttgttagaggtagctgccagtgttatggtcatgcaagtagatgtattcca
ttggaaggaatgagccatgagtctggaatggtgtatggtaattgtgattgtacacataac
actaagggtttgaattgcgaacagtgtgaagatttctataatgatctgccatggagacct
gctgctgggggtgaaactaatgcttgtaaaagatgtaactgtaataatcatgcttcaaga
tgtcattttgatccagcggtttatgaacagactggtcagattagtggtggtgtatgtgat
aattgccaacataataccctgggtagaaactgtgaacagtgcagaccattcttttacatg
gatccaagtaaagatatcagagatccaaatgtttgtgttccctgtaattgtgatccctct
ggtgctgtaaatggtggcgagtgtgagagtcgggaagatagagaaaatggtttggttgct
ggcaggtgtatctgtaaaagatttgttgaaggtgaccgttgtgatgtttgtcgggatgga
tattggaatctagaatataacaatccagaaggatgtcaaccttgttcctgtgcattgcag
ggtactgttggcaatcagggttgtcataaaagaacaggacaatgtgtatgtaagagattg
gttacaggcagagactgcaatgagtgcttggatggttattggggattaagtgatgatcca
gatggatgtaaaccatgtgattgtgatataggtggttcatatgataatctatgtgagaaa
tctgatggacaatgtagatgtaaacgcaatatcattggtagacggtgtgatatggctgaa
ccaggcttctttgtaccaggcttagatatgataacttatgaagcagaacttaacagagga
attgggccaactactgttgaaattcgtgagcagccagatggtactgtggtcacatggact
ggtcctgggtttatgagaatccgagaaggtgggagtgtagaatttatagtggacaatata
cccacctccatggagtatgatgtcatgttaagatatgaaccacagatgccagagacttgg
gaagatgtgagagtgactgtaacaaggccaacagatataccaaccagtagtgtttgtggt
aacaccatccctcaggatgatttattagctacgtcattgttacctggacaaagacaccgt
attctgtcaagacctgtgtgtttagaacgtggaactcgttacactatcagggttgacttc
aacagatatcacaatggttcccctacaccagcggcacaaatactctttgattcgttggtt
ttggtaccaactcatagcagtttacccatgttccaaggaccaggtccagcagaagaaaga
cgagaacaatatgagagatatcgttgtcaggaaactcagatgtctgtattaaaaccacca
atgcctgaaatctgtgaagacctcatttttagtatgtcagcttccatgtatgacggtgct
gttccttgcaactgtgatcaaactggatctgttagttctgtgtgtggagctattggtggt
cagtgtgaatgtaaaagtaatgtaattggcagaagatgtgatcgatgctcacctggtact
tatggatttggacctcaaggctgtcaattgtgtgattgtaaccagattggttcaaggagc
ttattatgtgatgttaacagtggtcaatgtccatgtaatctcaatacctatggacgtcag
tgcgatctatgtgagagaggatattggaatttccctaactgtcaaccatgtcagtgtaat
ggtcatgctgatacttgcgattctaggactggtacttgtgaagattgtagagataataca
gctggtcaattctgtcaaatttgtgcacttggtttttacggtgatcctcgtgaaggaagt
ggacaggtatgccaaccgtgtatgtgtccaggtggtgctgggagtggatttcagtttgct
gattcttgttatttagatcccagatcccagactgttatatgtgaatgtaaagaaggatat
acaggtattcgttgtgatcagtgtgataataacttctttggtaatccattaatacccggt
ggtggttgtcagaactgcagttgtaatggtaacatagatccatctgtacctggtaattgt
gatgccaggactggtgaatgtctcagatgtttgtacaacactgaaggtacatattgtgaa
aactgcaaaccaggtttttatggtgatgctttaaacaaggactgtaaaaaatgcgtttgt
aacatccttggtactgaccgtagtgtttgcgataatatgaataattgtggtatatgcgat
agtaatactggccagtgtccatgcttacctaatgttgaaggacgaaactgtgatagatgt
actgatgattattggaagttagccagtggtactggttgcgaactctgcaactgttgttca
tatggatcagtatcatcacagtgcaatgagtttgatggacagtgccagtgtcgtccaggt
tttggtggaagacagtgttgtgactgtgaggctgatttctggggtgatcctcttgtagaa
tgcaaagcatgtaactgtgatcctgatggttctgagtccctacagtgtgatagagatact
ggtgtatgtctatgcaaagaaggcgttactggtgataaatgtgatcgctgtgatagaggt
acttcaggtgatctaccaaactgtgaaccatgtggtgaatgcttcgatgactgggatgat
attatacaggatttgaaaaatcagactgattatgaaattgaccgtgctcagaacatcaaa
catactggtgcacctggtgcatatgatgatgaattccaagaaatggaagataaactagac
aagatcaagaagcttcttgttgctcctaatgttactgaagctgaagtggaagacctacag
aaagacttagcagatattcgtgatggattgactggatatgagaaacaacttgatgaaatt
gaagatgatctaccaaaaatagaggacagaaaattagatgctgatgatgaactggataga
ttagaaaaagctgctggtaatttagccaaaaaagccaaagatctagaagataatgtgact
gatatcagtctctctgacgtagaaggagcttttaatagtatcaaagaaagtcagaataaa
tcccaaatggcccaagataaagtagacgccacagaaccaattattgaggagtcagaagaa
atccgagatgagctgaataaattgataaaagataggcaagatgaattggatcaaaatcaa
aaagacaatgaagatgccttgaatgatcttgataaccagttagctggcttagaagctaaa
ctgaaagatgtcaatgagatggtatgcggcgcaccaggtgatgagtgtagtacatgcggt
ggtgctggttgtggagaatgtggtggattgggatgcgctggtgcagttccggtggcagaa
caagcactcaccagagcacaggatgcagatgacaaacttagagagaaagagaaagaagca
aatgatatgttagatgaagtccagatggcagaagatgatgcaaatgatgccaaagacaaa
gctcagatggcatatgatgcagcattacaggctaagacagaagctgaaggtgcccagact
aatttgactgatttacttgatgcaataactgatttcctgcattcagaaggtgccaaaccc
tctgatatcagacgtatagcagaaaaggtattggctatgaaaatttccctcaccccagat
gagatcagagaacttgccaaagaaatcaatgaaactattcagaatttggagaatgtggat
gacatcttagatgctactaaagatgatttagacagagctaaaaaattaaaagaagatgca
gagaaaacaaaggattttgctgatggtgtacttgataaggcacgtaatgtagttgaagca
ttggacgatgctgacaaagcacaacaagtagctgaagatgccatagataaagcggatgat
gatatcaaagcagctgaggaagcactcttacagattgagtcagaaacaagtgctgcatta
gaaaaagcacgcgattctttaaataaagttgaagatatggatgatcagttagacgatgtg
aagagaaagtttacagataatgaaataaatattgacaatgctgcggaagctgcaaagcaa
gcagatgaactagctgatgatgcccaggatgatgctgataatctacagaataaatacacg
gatgcagcaaaagaaattgatgataagattagtgagagtaacgatgcacttgaacgagct
gagaaactgaaagatgatgccacagctttggaaagtgaaacacgagacaagttacaggaa
ttggatgatattaaaggtgattttgataacaatgaagacaggttgggaaatcttgcggat
gaacttggtgatttgaatgatgaaatgtccaaattacttgctgatattgagcgaaaagcc
cagttttacagaacttgccaacctggtacataa
DBGET
integrated database retrieval system