Saccoglossus kowalevskii (acorn worm): 100377713
Help
Entry
100377713 CDS
T04123
Name
(RefSeq) peroxisomal sarcosine oxidase-like
KO
K00306
sarcosine oxidase / L-pipecolate oxidase [EC:
1.5.3.1
1.5.3.7
]
Organism
sko
Saccoglossus kowalevskii (acorn worm)
Pathway
sko00260
Glycine, serine and threonine metabolism
sko00310
Lysine degradation
sko01100
Metabolic pathways
sko04146
Peroxisome
Module
sko_M00974
Betaine metabolism, animals, betaine => glycine
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sko00001
]
09100 Metabolism
09105 Amino acid metabolism
00260 Glycine, serine and threonine metabolism
100377713
00310 Lysine degradation
100377713
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04146 Peroxisome
100377713
Enzymes [BR:
sko01000
]
1. Oxidoreductases
1.5 Acting on the CH-NH group of donors
1.5.3 With oxygen as acceptor
1.5.3.1 sarcosine oxidase (formaldehyde-forming)
100377713
1.5.3.7 L-pipecolate oxidase
100377713
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DAO
NAD_binding_8
GIDA
Thi4
DUF6944
FAD_binding_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100377713
NCBI-ProteinID:
XP_006813111
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
652 aa
AA seq
DB search
MNQDYIWDAVVVGAGVEGSSTAYNLSKNNQKTLLLEQFGLPHSRGSSHGQTRIIRYGYSE
PYYSAMMPECFRIWHDVEKQTGVTLITETKLLTLDIPPYTGLKNKKEVLTNLGIGLESFN
GRQLKEKYPMIECGPQYKAILENGAGVIRADKSLKALQELFVRNGGVIHDEEKYIDVFPG
DVLTIRTNKGSYKAKCLILTVGPWAGKLLNPLGVHVPLKASSYFSISVILLSYGATLLPY
GTTLLPYGATLLLYGATLLLYGATLLPYGATLLHYGATLLLYGATLLPYGATLLLYGATL
QPYGATLLLYGATLQPYGATLLPYGATLLLHGATLQSHGATLLPYGTTLLLYGATLLLYG
PTLLPCGATLLPYGATLLPYVATLLPYGATLLLYGATLLQCATLLTTGCYTATLWCYIAT
IGSYIATLWCYIATLWCYIATLWVLHCYSVLHCLPQGATQLPYGATLLPYRELHCYVMVL
HCYLMVLHCYLMVLHCYLMVLHCYLMVLHCYLKAQRINACYWREKSPGNCAGFPNFIDNS
HRTYGIQITEYPNTMKVIKTKLCYWKEKSSGSFSNFPCFVDYTGSLVYGACPLEYPNAMK
FPNVIIFFTGHGFKLAPVVGKVLSELAMKKTPSYDLSHFTIERFFKSQKSKL
NT seq
1959 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccaagactatatttgggatgctgttgtagttggggctggagttgaaggctcgtcg
acagcgtacaacctatcaaagaacaaccagaagacattgttgttggaacaatttggtcta
ccccactctcgaggcagctcccatggacagacgagaattattcgctatgggtattcagaa
ccatactacagtgctatgatgccagaatgtttcaggatatggcacgatgttgagaagcag
actggtgttactctcataacagagaccaagctgttaactcttgatattcccccatacacg
ggacttaaaaataaaaaggaagttctaacaaaccttggaattggcttagagtcatttaat
ggtcgtcaacttaaagagaaatatcctatgatagagtgcgggccacaatataaagcaata
cttgaaaatggtgctggggtcatcagagcagacaagtcactgaaagctttacaggaactt
tttgtgagaaatggtggagtaatacatgatgaggaaaagtatattgatgtcttccctggt
gatgttttaacaatacgtacaaataaaggaagttacaaagcaaaatgtttaatactaaca
gtaggaccctgggcaggaaaattgttaaacccccttggagttcatgtaccattaaaggca
agttcttatttttcaatcagtgtcatattgttatcatatggtgctacattgctaccttat
ggtactacattgctaccttatggtgctacattgttactttatggtgctacattgctactt
tatggtgctacattgttaccttatggtgctacattgctacattatggtgctacattgtta
ctttacggtgctacattgctaccttatggtgctacattgttactttatggtgctacattg
caaccttatggtgctacattgttactttatggtgctacattgcaaccttatggtgccaca
ttgctaccttatggtgctacattgctacttcatggtgctacattgcaatctcatggtgcc
acattgctaccttatggtactacattgttactttatggtgctacattgttactttatggt
cctacattgctaccttgtggtgctacattgctaccttatggtgctacattgctaccttat
gttgctacattgctaccttatggtgctacattgctactttatggtgctacattgctacag
tgtgctacattgcttactacagggtgctacacagctaccttatggtgctacattgctacc
atagggagttacattgctacgttatggtgctacattgctacgttatggtgctacattgct
accttatgggtgctacattgctacagcgtgctacattgcttaccacagggtgctacacag
ctaccttatggtgctacattgctaccatatagggagttacattgctacgttatggtgcta
cattgctaccttatggtgctacattgctaccttatggtgctacattgctaccttatggtg
ctacattgctaccttatggtgctacattgctatcttaaggctcaacgtattaatgcatgt
tactggagagaaaaaagtcctggtaattgtgctggtttcccaaattttattgataactcg
caccgtacatatgggatacaaatcaccgaataccctaacaccatgaaggttataaagaca
aaactgtgttattggaaagagaaatccagtggttcattctctaatttcccgtgttttgtg
gattacacgggtagtttggtgtatggtgcatgtccattggaatatcctaatgccatgaag
tttccaaatgttataatcttcttcacaggtcatggtttcaaattggcaccagtggtgggt
aaagttttgtctgaactcgccatgaaaaagacaccatcatatgatctttcgcacttcact
attgagagatttttcaaatcccaaaaatcaaagttataa
DBGET
integrated database retrieval system
