Saccoglossus kowalevskii (acorn worm): 102806714
Help
Entry
102806714 CDS
T04123
Name
(RefSeq) laminin subunit alpha-like
KO
K06240
laminin, alpha 3/5
Organism
sko
Saccoglossus kowalevskii (acorn worm)
Pathway
sko04512
ECM-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sko00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
102806714
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_laminin
Laminin_N
Laminin_B
EGF_LMN_ATRN
Muted
Laminin_I
DUF2671
GAS
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102806714
NCBI-ProteinID:
XP_006819813
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
2251 aa
AA seq
DB search
MAGSKFLVACLIVSTIDIFSGIVNGQVLQPPYFNIATGKNISATSTCGEEVGEELFCKLT
GNTATDVIYNSDVNLIQGQICDTCDPKNPLTSHPAYHAIDGTKQWWQSPPLSRGLEYNEV
NVTIDFGQQFHVAYVIVKFANSPRPALWVLERSTDYGQTFTPWQYFASTDSDCNTYFGMQ
SLEAITRDDQVICSTEYSKIVPLENGEIVVSLVNNRPSANNFSYAAVLQEWTKATTVRLR
LIRTNTLLSHLLALARQDPTVTRRYYYSIKDVSIGGRCVCNGHADKCDTPVPGGNRFQLQ
CTCRHNTCGEQCEICCPGFEQKKWRPATVDSANECEPCNCHGHSNECVYDEEIAEKKLSL
DIHGNYEGGGVCQRCQHNTQGINCEECKAGYYRPRGVPLDSPEVCQPCDCNFFYSTGSCS
AETGQCECRPEYAGLNCDECAVGYYGYPTCRPCDCHRNGTEGGVCEVGGRQCPCKPNYIG
LNCDRCSVGYYDFPACLPCDCDHLGSRDYVCSPLDGQCQCRINYGGRACDECKDGYYNYP
ACQACSCDAFGTAEEICDKDTGACICKEKYGGPRCSNCDVSYYSYPNCYDCDCDTAGSAH
DGCRDSGQCPCLPNFSGKKCDMCASAYFKYPECTPCNCHRTGSFSISCDQITGQCNCRSN
FQGVTCSECAEGFYNFPACEVYLCIAFKSVYPECKCDPAGVVFVPGEPLAGCGAATQGLC
QCKEKVGGRTCNLCDPLYWNLQFSNPVGCEECHCYKPGTVSGIAVCDVVSGQCTCKEYVD
GRRCDQCEDGAFDLQTRNVFGCQACGCDLGGARDENCDKSTGQCVCKPRVSGRTCDRPLD
VHFFHNLYHIKYEIEDGRAPRNKPVRFAFRESDFPGYSWRGYAVMSAVQPEVLIPVEIRN
PSLYRLVFRYVSQNNEPVNGEVTVTPRTQSELAIEQTSSVVFNPGTSPQLVTVSGNGVIM
PFVMDPGQWIISVKSPENILLDYLVLLPSAYYEAPLLQVTVNDACKAGSYQEACNEYAFP
SVATYPTIEAEHGYYQDSGQRYPTQTFRDRSILQDLNVDAMAQLDEQQPTLGLSLPVPRP
GKYVMIIQYFDGGPNAHRLDVSLLDSRTEQDGHSNIYDCQHLCRAVVLDSENKVKEFDIK
QSRVTIYLEQEQPYDLAIDSVTLIPVEEWNEDFVNQALECVLRKPSDICVGSPYLTPPGT
QKWEVESLAYLPSSSLVHTGVTPNVDDPNTALYTLDGPGGVPSVEMRDILPDNGRYVFVV
HYYQPTSVSYDVNFDIRGRPSQSGTFNAKFCPHVSGCRSVVTTHDGDVAFEISPFAPDLV
ITIPDDKTLWLDYVMAIPEETYSSDVLEPLPIDRAGEFIRECGQNDFYISSETTGFCRDS
VFSLTTDYNNGAVKCDCNYAGSTSFSCDPLGGQCPCKPNVIGRTCDRCKTGYYAFPNCIP
CGCVTGVCDDNTGACICPPNVGGPNCDQCLPRTFGYDPFIGCEECDCDPKGVLGDLNCDL
VNGQCNCLPNVGGRQCDVCKAGYFNHPRCVPCTCDLRGTTSDVCDQRSSACLCKENVEGV
RCDKCKVGTFYLEERNPKGCTSCFCFGITQECKSSSRVFDPITTMNDWTATNFADGRVTV
RNNVINIQVLGSGDDPAQAIYFVAPKDYRGNKVSSYGGVLEYSITYRNLRNDVSVRPMRR
PDVIFSGNNFELVYSAPSQPVAGVTLTVVVDILESSFQHSIGGGQVSREELMMTLADLTK
LHIRAQYMTNIQEASLSFVSFDVAMKKKGTKRPAETVEQCRCPANYKGLSCEKCEDGYYR
VSSGAYLGVCVQCECNGHSDICDQETGTCLDCQDNTAGPNCGECKTGYVGDATNGTPYDC
QICSCPYPTEINNYASTCVLGSGGETLSCECLPGYTGERCTSCAEGYYGDPTIIGGEGCR
PCECNNNELVDPSDGGRQCDAFTGQCLRCRPGTAGHNCERCADGYYGDAIVAKDCKECDC
DECGTESCHPETGVCLCKLGVTGSRCHKCPRNYYGFNTCNGCQSCECKSGSEYSQCDDDT
GQCDCKPGVGGRDCGECLPGYWNYQLNGCERCDCGENLRCHPTTGDCVCLPGAKGPKCDQ
CEERYVLTEQGCQECDSCVTLLLDEMDVMDYNVSDAIDDLTGVSVGVDAVKRLMKINDTA
YELWAKLPGVKNGYSGNLQPILDDISELKDDANDIEARSRKAKKDAKPIAKEAEDTDKRA
AEVEDLVNKAARKARGILKIHCKHFMRESLI
NT seq
6756 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgggtagcaagtttctcgtcgcttgcttgatagtttcaactattgacattttttca
gggattgtcaatggccaagttctgcagcctccttattttaacatcgctaccggtaagaac
atctccgcgacatcgacttgtggcgaggaagttggagaggaacttttttgcaaactgact
ggaaacaccgctaccgatgtcatatacaattctgatgttaacttgatccagggacaaata
tgtgatacctgtgacccgaagaatcccctgacatcccacccagcctaccatgctatagac
gggacaaaacaatggtggcaaagcccgccactttcacgtgggctcgagtacaacgaagtc
aacgttaccatcgattttggtcagcaattccatgtcgcatacgtcatcgtgaaatttgcc
aattcacctagaccagcgttatgggtattggagcgatctaccgactacggccaaacattc
acaccttggcagtattttgcaagcactgacagtgattgtaatacgtactttggtatgcag
tctttagaagctattaccagagatgaccaggtgatctgtagtacagagtattcaaagatt
gttccattagagaatggggagattgttgtctctcttgtcaataatcgtccaagtgctaac
aacttctcgtatgctgccgttttacaagaatggaccaaagcaacgactgtcaggctacgt
cttatacgaacaaacactttgttgagtcatcttttggcgttggcaagacaggatccaaca
gtaactagaaggtattattacagtataaaggacgtgtctattggtggtcgatgcgtttgt
aacgggcatgccgataagtgtgatacaccagtaccgggcggtaatcggtttcaactccag
tgtacatgtcgacacaatacatgcggtgaacaatgtgaaatttgctgccctgggtttgaa
caaaaaaaatggaggccagccactgttgacagcgcaaatgagtgtgaaccctgcaactgt
catggtcatagtaatgagtgtgtgtatgatgaggaaatagctgaaaaaaaattatctctg
gatatccatggcaactatgaaggaggtggagtttgtcaacgttgtcagcataatacacaa
ggtatcaactgtgaagagtgtaaagcaggatattatcgtccacgtggtgtgcctcttgat
agtccagaagtatgtcaaccctgtgattgtaactttttctactccactgggtcgtgttca
gctgagactgggcagtgtgaatgtagacctgaatatgctggtttgaattgtgatgaatgt
gcagttggttactatggttaccctacttgcagaccttgtgattgtcatcgtaatggtaca
gaaggaggtgtatgtgaagttggcggtagacaatgtccttgtaagccaaattacattggt
ttgaattgtgatcgatgcagtgttggctattacgactttcctgcatgtcttccttgtgat
tgtgatcatctcggttccagagattatgtttgtagtcctcttgatggtcaatgtcagtgt
cgtattaactacggcggtcgagcatgtgatgaatgcaaagatggttattataactaccct
gcttgccaagcttgttcttgtgatgcgtttggaactgctgaagaaatatgtgacaaagac
actggtgcctgtatttgcaaagagaaatatggtggaccaagatgtagcaattgtgatgtt
agttactatagttaccccaattgttatgactgtgactgtgataccgctggttctgcccac
gatggctgtcgtgattctggacagtgtccatgtttaccaaattttagtggcaagaaatgt
gacatgtgtgcatcagcatatttcaaatacccagaatgcactccttgtaactgtcatcgt
accggttcattcagcataagctgtgatcagataactggacagtgtaattgtagaagtaat
ttccaaggagtcacatgcagtgagtgtgcagaagggttttataattttccagcctgtgaa
gtgtatttatgcattgcttttaaatctgtgtatccagaatgtaaatgtgatccagctgga
gttgtgtttgtgcctggtgaaccgttagcaggatgtggggcagctacacaggggttatgt
cagtgtaaagagaaagtgggtggaagaacctgcaacctatgtgatccactgtattggaat
ctgcagttcagtaatccggttggatgtgaagaatgtcattgttataaaccgggaactgtg
tctggaatagcagtctgtgatgtggtttctggtcagtgtacttgtaaagaatatgttgat
ggtagacgttgtgatcagtgtgaagatggagcatttgatttacaaacaagaaatgtattt
ggttgtcaagcatgtggatgtgatttgggaggtgccagagatgaaaactgtgataagtct
acgggtcaatgtgtctgcaagccaagagtgtctggaagaacatgtgacagacctctggat
gttcattttttccacaatctgtatcatatcaaatatgaaatagaagatggtcgtgctcca
agaaataaacctgtgagatttgcattccgggaatctgactttccaggatattcttggaga
ggatacgctgtcatgtcagcagtccagcctgaagtgcttataccagttgaaatcagaaac
ccaagtttgtatcgacttgtattccgatatgtaagtcaaaacaacgaaccagtgaatgga
gaggttacagtcactccaagaacgcagtctgaattagccattgaacagactagtagtgtt
gtgtttaatcctggtacaagtccacagctggtgacagtgtctggtaatggtgttataatg
ccgtttgttatggatcccggacaatggataatctctgtaaagtcaccagaaaatatacta
ttggattatttggtgttgttaccttccgcttactatgaagcgccattgctacaagtaaca
gtgaatgatgcttgtaaagctggcagctaccaagaagcatgtaatgaatatgcgttccca
agtgttgcaacatatccaactatagaggccgaacatggttactatcaagacagtggtcaa
cgatatccaacccaaacattcagagatcggtccattttgcaagatttgaatgttgatgcg
atggcacaacttgatgaacagcagccaacacttggactgtctttacccgtacccagacct
ggaaaatacgtgatgattatccagtattttgatggtggaccaaatgcacaccgtcttgat
gtatcattactggattcaaggactgaacaagatggtcattctaacatctatgattgtcaa
catttatgccgtgctgttgtcttggattctgaaaataaagtaaaggaatttgatatcaaa
caaagtagggttactatttacctcgaacaagaacaaccgtatgacttggcaattgattca
gtgaccttaatacctgttgaagaatggaatgaagattttgtgaatcaagcattggaatgt
gtcctcaggaaaccaagtgacatatgtgttggtagtccttacctgacacctccgggaaca
cagaaatgggaagtagagagtttagcatatcttccatcgtcttcccttgtgcatactggg
gtaactcctaatgttgatgatccaaatacggctctctatacattagatggaccgggtgga
gttccttcagttgagatgagagacatcttacctgacaacggtcgctatgtttttgttgtg
cattactatcaaccaacaagtgtgtcttatgatgtcaattttgatattcgaggaagaccc
agtcagagtggtacatttaatgctaagttctgtccacatgtatctggatgtcgttctgtt
gtgaccacgcatgatggtgatgtagctttcgagataagtccttttgcaccagatcttgtc
ataactattccagatgataaaacactgtggttggattatgtgatggcaataccagaggag
acgtacagctcagatgtcctggaaccactaccaatagaccgtgctggggaatttatcaga
gaatgcggacaaaatgatttctatatcagttcagagacgactggattctgccgtgacagt
gtattctccttgaccactgattataacaatggcgctgtcaaatgtgactgtaattatgcc
ggttctacaagtttttcatgtgaccctcttggaggccagtgcccatgtaaacccaatgtt
attggacgaacttgtgaccgctgtaaaactggctattatgcatttcctaactgtataccg
tgtggatgtgttactggtgtttgtgatgataacactggtgcctgtatttgtccacctaat
gttggtggaccaaactgtgatcagtgtttgccaagaacatttggatatgatccatttatt
ggctgtgaggagtgtgactgtgacccaaaaggtgtacttggtgatttgaactgtgacctc
gtgaatggacaatgcaattgtcttccgaatgtcggcggtcgtcaatgtgacgtatgcaaa
gcaggttatttcaaccatcctaggtgtgtaccatgtacatgcgatctcaggggaacaacc
tcagatgtttgcgatcaacggtcatcagcctgtctgtgtaaggagaatgttgaaggtgta
cgatgtgacaaatgtaaagttggaacattttatttagaagaacgcaatccaaagggatgt
accagctgtttttgtttcggcatcacgcaggaatgtaaaagttcatcaagagtgtttgat
cctataacaacaatgaatgattggacagcaaccaactttgctgatgggcgagtgactgtg
aggaataatgtcattaatattcaagttcttggttcaggagatgatcctgctcaggcaatc
tattttgttgcaccaaaggattatcgtggaaacaaggtatcttcatacggtggtgttctg
gaatactcgataacttatcgtaatttgaggaatgacgtctcagtacggcctatgaggaga
ccagatgttatattctcgggtaataactttgaacttgtatattctgcaccatctcaacct
gtagcaggagtgacattgacagtggttgtggacatccttgagagtagcttccagcatagt
attggtggtggtcaagttagtcgtgaggaattaatgatgaccttagctgacctcactaaa
ttacacataagagcgcaatatatgacaaatatccaagaagcaagtttgagttttgtttcc
ttcgatgttgctatgaaaaaaaaaggaacaaagcgtccagcagaaacagttgaacagtgc
agatgtcctgccaactataagggactctcatgtgagaaatgtgaggatggatactacaga
gtcagtagtggtgcgtatcttggcgtatgtgtacaatgtgagtgcaatggccattctgat
atctgtgatcaagagactggtacttgcttggattgtcaagacaatacagcaggtccaaat
tgtggggaatgtaaaactggttatgttggtgatgctacgaatggtactccatatgactgc
caaatatgttcatgtccatatccaacagaaattaacaattatgcgtctacttgtgtactt
ggttcaggtggggagacactaagctgtgagtgtttaccaggatacactggtgaaagatgt
acaagctgtgctgaaggttactatggagacccaaccattatcggtggtgaaggatgtcgt
ccatgtgaatgtaacaacaacgagttggtagatcctagtgatggcggaaggcagtgcgac
gccttcacgggtcagtgtctgcgttgcagaccgggcactgcaggacataattgtgaaagg
tgtgctgatggttactatggtgatgcaattgttgctaaggattgtaaagaatgtgactgt
gatgaatgtggcacagaaagttgtcatcctgaaactggtgtctgtctttgcaagcttggt
gtcactggaagtcggtgccacaaatgtccaagaaactactatggcttcaatacatgcaat
ggatgtcaatcatgtgaatgcaaatcaggatctgaatactcacaatgtgacgatgataca
ggacagtgtgattgcaagcctggagtcggcggcagagactgcggtgaatgtctacctggt
tactggaattatcaactaaatggctgtgagcgatgtgactgtggtgagaatctacgatgt
catcccactactggtgactgtgtctgtttacctggtgcaaagggacctaaatgtgatcaa
tgcgaagaaagatatgttttaacagaacaagggtgccaagaatgtgattcctgcgtaact
ttacttttggatgagatggatgtaatggactataatgtctcagatgctattgatgatctc
acaggtgtctctgttggtgttgatgcagtcaagagactcatgaagataaacgacacagca
tatgaactatgggccaagttgccaggtgttaaaaatggttatagtggcaatttacaacca
atactggatgatatcagtgaattgaaagatgatgctaatgacattgaagcaaggtctcgt
aaagccaagaaagatgctaagccaatagctaaagaggcagaagacactgataaacgagct
gcagaagtggaagatcttgttaataaagctgctcggaaagcaagaggtattttaaaaatc
cactgtaaacatttcatgagagaatcgttaatatga
DBGET
integrated database retrieval system