Silene latifolia (white campion): 141622581
Help
Entry
141622581 CDS
T11116
Name
(RefSeq) callose synthase 10-like
KO
K11000
callose synthase [EC:2.4.1.-]
Organism
slaf Silene latifolia (white campion)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
slaf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
slaf01003
]
141622581
Glycosyltransferases [BR:
slaf01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
141622581
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glucan_synthase
FKS1_dom1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
141622581
NCBI-ProteinID:
XP_074294709
LinkDB
All DBs
Position
X:complement(6401051..6432178)
Genome browser
AA seq
1891 aa
AA seq
DB search
MATVEDNWERLVRAASRRNSTAVYGDDRRPSSLAAAVPISLGHSSNIDAILQAADEIQDY
DPTIARILCEQAYSMAQDLDPSSDGRGVLQFKTGLMSVIKQKLSKRDGAQIDRSRDVERL
WKFYQRYKQRNRVDDIRREEQKSLETGVFSTNVGELGERRKVFATLRALVEVMKALSNDA
SPEMRQLISEELRGVELSDATLSGAMTPYNIIPLEAPSLTNAIGVFPEVRGAISAIMYAE
NFPRLPVSFKISGKRNADMFDLLEYVFGFQRDNVRNQRENVILAIANAQSRLGVPDDRDP
KIDENAIDEVFNKVLDNYIKWCKYLRIRVAWNSSDAITRERKLFMISLYFLIWGEAANVR
FLPECICYIFHNMGMELDSILNNREANFAGSCKTEHDAVSYLEQVICPIYEILAAESSRN
DNGKAAHSSWRNYDDFNEYFWSPACFKLGWPMKRDSAFLRKPKKWKRTAKSSFVEHRTFV
HLYRSFHRMWIFLFIMFQGLTIIAFSGKLNMNTFKILLSVGPTFAIMNFAESSLDILLMF
GAYTKSRGMAISRLVLRFFWWCLYSIAVIYFYLRVLQDWNKHQSNSLSFRIYMLILGAYA
GSRVLFALIFTIPACHAFSQRSDQAFFQFFKWLYQERYFVGRGLFEKPLDYARYALFWLV
IFAFKFTFAYYLQIRPLVRPTKIIVNIKDVRYSWHSFVSKRNYNALTIASLWAPVVAIYI
MDMHIWYTLLSALIGGVMGARQRLGEIRSIEMVHERFESFPEAFVKNMSSPRMKRMPIDP
ENSQNAQETNKSYASMFAPFWNEIIKSLREEDYIGNREEQLLSMPSNAGTLPLVQWPLFL
LSNKIVMATDLALDCKDTQADLWNRICRDDYMAYAVQECYYSIEKILHAVLDDKGSRWVE
RVYREINNSIIEGSLHLTLSLKKLRLVQSRFTALTGLLTNNETSGKALYDFYDVVTHDLL
STDLREQIDTWNILAEARNTRVLGCKNDWQKDPEIEELVKRLHLLLTVKDTPANIPKNLE
ARRRLEFFTNSLFMDMPLAKPVCEMMPFCVFTPYYSETVLYSSKELREENEDGVSTLFYL
QKIFPDEWVNFLERIKKGESSGEVDFAEDSSDNLELRFWVSYRGQTLARTVRGMMYYRRA
LMLQSFLERRGLIGNDEKSQANPMSSHGFELSSEARAQADLKFTYIVSCQIYGQQKQNKT
PQAADIGLLLQRNEALRVAFIHLEESAAADGKVLNYYSKLVKADVQGKDQEIYSIKLPGD
PKLGEGKPENQNHAIVFTRGEAIQTIDMNQDNYLEEAMKMRNLLQEFHEKHGIRPPTILG
VREHVFTGSVSSLAWFMSNQETSFVTLGQRVLAKPLKVRMHYGHPDVFDRIFHITRGGIS
KASRVINISEDIFAGFNSTLRQGNITHHEYIQVGKGRDVGLNQIAVFEGKVAGGNGEQVL
SRDVYRLGQLLDFFRMLSFYYTTVGFYVCTMMVVLTVYIFLYGRVYMALSGLDAEIEKAG
RLLGNTSLNAVLTPQFLVQIGIFTAIPMIMGFILELGLLQAVFSFLIMQLQLCSVFFTFS
LGTRTHYFGRTILHGGAKYRATGRGFVVQHIKFAENYRLYSRSHFIKAFEVALLLTVYIA
YGYSKGGAVSFVLLTLSSWFLVISWLFAPYIFNPSGFEWQKTVDDFDDWVNWLLYKGGVG
IKGEKSWESWWEEEQAHIRTWRSRILETILSLRFFMFQYGIVFKLHIVASSRSLAVYGVS
WIVLVVTVIIFKIFSFSPKKYDRFQLWLRFFQGLTGLAVLAGVVLVTVLTQLTFPDLFAI
FLAFTATGWGLLSLAITWRKVVRTIGLWDSVREFARIYDAAMGVIIFAPVAFLSWFPFIS
TFQSRLLFNQAFSRGLEISKILAGNKANVQM
NT seq
5676 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgacagtcgaagataattgggaacgcctcgttcgcgctgcgagccgtcgcaactcc
accgccgtctatggcgatgatcgccgtccgagttcactcgctgctgctgtaccgatttca
ctcggtcactcctctaatattgatgctattttacaagctgctgatgaaattcaagactat
gatcctaccattgctcgcattctgtgtgagcaggcgtattctatggcgcaagatttagat
ccgagtagtgatggtagaggtgttcttcagttcaagactggtttaatgtccgtcattaag
caaaaactttcaaaaagagatggagctcaaattgatcgtagtcgtgatgttgaacggtta
tggaagttttaccagagatacaagcaaagaaatagagttgatgatattcgacgtgaagag
caaaaatcgcttgagacaggagtgtttagtaccaatgttggagagttgggtgaaaggagg
aaagtatttgctacattaagggccttggtcgaggtgatgaaggctttgagcaatgatgca
tctcctgaaatgagacaattaatttcggaggaattgaggggagttgaactatcagatgct
actttgtctggggcgatgacaccttacaacatcattccgctggaagctccatctttgacc
aatgccatcggtgttttcccagaggttagaggtgctatatctgctattatgtatgccgaa
aactttcctagacttcccgtttctttcaaaatttctggcaagcggaatgcagacatgttt
gatcttctggaatatgtcttcggtttccagagggataatgtaagaaatcaacgcgaaaat
gtcattcttgctattgctaatgcacaatcccgccttggtgttccagatgaccgtgatcct
aaaatagacgaaaatgctatcgatgaggttttcaataaggtgctagacaattatattaaa
tggtgcaagtacttgcgtatacgggtggcatggaacagctctgatgcaatcactcgggag
aggaaactttttatgatttctctgtacttccttatttggggggaggctgcaaatgttcgt
tttctccctgaatgcatctgctacatattccacaatatggggatggagttagattcaatc
ctgaacaaccgagaagctaattttgctggaagctgtaaaactgaacacgatgcagtctct
tatctcgagcaagttatatgtcccatttatgagatactggctgcggaaagttcgagaaat
gacaatgggaaagctgcacattcatcctggaggaactatgatgattttaatgaatatttc
tggtctcctgcttgctttaagttgggatggccaatgaagagggactcagcatttttgaga
aagccaaaaaagtggaaaaggacagctaaaagcagttttgttgagcatcggacatttgtt
cacctgtatcgcagttttcatcgcatgtggatctttctattcattatgttccaggggtta
accatcatagcttttagtggtaagctcaatatgaatacatttaagatcctattgagcgtt
gggccaacatttgctatcatgaattttgcggaaagcagcttggatattctgcttatgttt
ggggcatatacaaagtcaagaggcatggctatttctaggctagttcttaggttcttttgg
tggtgtctatactctattgctgttatctatttttatctgagagtgctacaggattggaac
aagcatcagagtaattcattatcctttcgaatatacatgctaattctgggtgcttatgct
ggctcgcgtgtgctatttgctttaatatttacgatccctgcttgccatgctttctctcaa
aggtccgatcaggcattctttcaattctttaaatggctttatcaggagcgatactttgtt
ggccgcggtctctttgaaaagccgctcgactatgcaagatatgcactcttctggttggtc
atcttcgcattcaagtttacttttgcttactatttacagattaggccgttagtaaggcct
accaaaattattgttaacattaaagatgttcgctattcttggcatagttttgtctcgaag
cgcaattataatgcattaactatagcaagtttgtgggctccagttgttgccatatatata
atggatatgcacatatggtacacacttctatcagcccttattggcggtgtgatgggtgct
cggcagagactaggcgagatacgttcaatcgaaatggtgcatgaacgttttgaaagcttc
ccagaagcttttgtgaagaatatgtcatctccaagaatgaaaaggatgcctattgatcca
gaaaactctcagaacgctcaagagactaacaagagttatgcctccatgtttgctcctttc
tggaacgagatcatcaaaagtttgcgtgaagaagactacattggaaacagggaagaacaa
ttgctctccatgcccagcaatgctggcactctccctcttgttcaatggcctctttttctt
ctcagtaataagattgtgatggctactgacctggctttagactgcaaagacacacaagca
gatttgtggaatagaatatgcagagatgattacatggcttatgcagttcaagagtgctat
tacagtatagagaagatcttacatgcggtacttgatgacaaaggcagtcgctgggttgag
agagtctatcgggaaatcaataatagcataatagaaggttcacttcatttaacactgtcc
cttaaaaagctccgcttggtgcagtcaagatttacggcattgactggactattgacaaat
aatgaaacttctgggaaagccctatatgatttctatgacgtggtgacgcacgatttgtta
tcaactgatttgagggagcaaattgatacatggaatatacttgctgaagctagaaataca
agggtattaggttgtaagaatgattggcagaaggaccctgaaatcgaggagctagtgaag
agacttcatctgctacttactgtgaaggatacaccagctaatataccaaaaaatctggaa
gcaaggaggagattggaattctttacgaattcattatttatggacatgcctcttgcgaaa
ccagtgtgtgaaatgatgcctttctgtgtattcactccttattacagtgaaactgtgctg
tatagttccaaggagcttcgagaagaaaacgaagatggagtatctacactgttctatctt
cagaagattttcccagatgaatgggtgaattttttggaacggatcaaaaaaggcgagtct
tctggagaagtagattttgcagaagattccagtgataacttagagctacggttttgggta
tcttatcgtggacaaaccctggctaggacagtgcgtgggatgatgtattacagacgagca
ttgatgcttcagagttttctagagagaagaggattgataggaaatgacgaaaagtcccaa
gcaaatcctatgtccagtcatggatttgaattgtcaagtgaggcacgagcacaagcggat
ctgaagtttacatatatcgtctcatgtcaaatctatggacagcaaaagcagaataaaact
ccgcaggcagcagacattggtctattgctacagaggaatgaggcccttcgagttgctttt
attcatcttgaagaaagtgctgcagctgatgggaaagttctaaattattactccaagctc
gtcaaagctgatgtgcagggaaaagatcaggaaatatattccattaagctacccggagat
ccaaaacttggtgaagggaagcctgaaaaccaaaatcatgcaattgtcttcactcgcggg
gaagccattcaaacgattgatatgaatcaagataattaccttgaggaggcaatgaaaatg
agaaatctccttcaagaatttcatgaaaagcatggcatccgccctcctacaattcttggt
gtaagggagcatgtcttcacgggaagtgtttcttctcttgcttggtttatgtccaaccag
gagacaagctttgtaacgttaggtcagcgagttctggcaaaacctctcaaagtgcgtatg
cattatggacatccagatgtatttgaccgtatttttcacataactcgtggtggtataagt
aaggcatcacgcgtcatcaacatcagcgaggatatttttgctggttttaactcaacctta
cggcagggaaatatcacacaccatgagtacatacaggttggaaaaggaagagatgttgga
ctgaatcaaattgctgtttttgagggaaaggttgctggtggcaatggagagcaggtcctg
agcagagatgtgtacaggcttggacagcttcttgactttttcaggatgctgtctttctac
tatacaactgtaggtttctatgtgtgcacaatgatggttgttctaaccgtatatattttc
ctgtatggacgggtgtacatggccttatctggacttgatgcagaaatagaaaaggcggga
agattgcttggaaatacgtctttaaatgcagttttaacaccgcagttcttggttcaaata
ggaatatttacagctatacctatgattatgggtttcatactagaacttggattgcttcag
gctgtcttcagttttcttatcatgcagctgcagttgtgctcagtgttctttacattctca
ttaggaacaaggacccattactttggacgtactatcctgcatggaggtgccaaatataga
gccaccggcagaggatttgttgtacagcacattaagtttgctgagaactataggctttac
tctagaagtcatttcatcaaggcatttgaagtagctttgctactcactgtgtacattgca
tatggctattcaaaaggtggcgctgtttctttcgtattgctgactcttagcagttggttc
cttgttatttcatggctctttgctccgtacatatttaatccctcaggctttgagtggcaa
aagacggttgatgattttgatgactgggtcaactggcttctatacaaaggtggggttggt
attaaaggagaaaagagctgggagtcctggtgggaagaagaacaggcacatatccgtact
tggagaagccggattctggaaacaattttgagcttgaggtttttcatgtttcagtatggt
attgtctttaagctccatatcgtggcatcaagtagatcacttgcggtatatggcgtgtcc
tggattgttttggtagtcactgtcattattttcaagatattcagtttcagtccaaagaag
tatgatcgcttccagctctggctgcgattttttcaggggctcactggcttagcagttttg
gcgggtgttgttcttgtcactgtcctcactcaattgacttttccagacttgtttgcaatt
ttccttgcattcactgccactggatggggactacttagtcttgcgattacatggaggaag
gtggtaagaactataggattatgggattcggtccgggagtttgctaggatatatgatgct
gccatgggtgtgattatctttgcaccagtggcattcttgtcatggttcccctttatttca
acattccaatctcggcttctcttcaaccaagctttcagtcgaggtcttgagatttcaaag
atcttggcggggaacaaagccaatgttcaaatgtga
DBGET
integrated database retrieval system