Solitalea lacus: L2B55_06005
Help
Entry
L2B55_06005 CDS
T09884
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
slas
Solitalea lacus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
slas00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
slas02000
]
L2B55_06005
Transporters [BR:
slas02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
L2B55_06005
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
EMC7_beta-sandw
fn3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKJ08720
LinkDB
All DBs
Position
complement(1419298..1421748)
Genome browser
AA seq
816 aa
AA seq
DB search
MYNNNYKSTSLSYIVGFIMLFFSFGAKAQTKNGSISGTVKTSDGNPAATVNIILKEVNKG
TIANDSGSFLLKGIKEGSYTLLVTFVGLNPQEKTVNVIAGQTASVEITLTESSSKLAEVV
VTGSRGANKKLVSVGKTDIAPMDLPQAVAIVDSKVIEEQQVNKLSDAIKNVNGVSLGSTR
GTTSETFFARGYNLGANNIMKNGARSNSSVIPEASILERVEVLKGSAALLYGNVTSGAVI
NMVTKQPKFNFGGEVSMRTGSYDFYKPILDVYGPISNKVAFRVIGTYENAKSFRNSVESK
RIYVNPSVLYKINTKTELLIQGDYLNADLTPDFGVGTLSDTKTSSIPTTIDRASSFNTPW
AYNKAKQGTANAILNHNFNNNWKLNSQVSFQNFDRNYFSTERIQADSAGNWGRKLTRTKT
NENYYTGQLNLTGDFSTGKLGHKVLIGADAERYFNITNGFSIASLSKDGVYDSINVLNPS
KFIVRIDEPLATNTTRTEAPTNRFGVFVQDLISVSEQIKVLAGLRWSYISNPVPQVYDLV
KGTNARTTTPYKYDNAFSPRLGLVYQPTKNSSLFASYSNNFVPNSGTDIYFNNLDASIID
QFEVGVKNDFFQGRLSVNLSVYKIINSNQTKTAEFDKDGKQNSNTNLKEFSGQTTSNGFE
VDVNGTIAKGLNFIAGYSYNDMRYTKSIGTKNSSIEGERLVSMPANTANGTVFYTFSNPS
LNGLRIGFSGFYTGERNAGWNNTVGYVPSKGQPQNRLFAVSGFTTFDLSLGYTYKKFSIL
GKVSNITNELNYIVHENYSVNPIPPRQFTTTLAYKF
NT seq
2451 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataataacaactacaaatctacctctctttcctatatagtaggttttataatgctc
ttttttagttttggtgcaaaagctcagactaaaaatggaagcatttcaggaactgttaaa
accagcgatggcaatccagcggcaacggtaaacattatccttaaagaggttaacaaagga
acaatcgccaatgattcaggttcttttttgttgaaaggtataaaagagggttcctacaca
ctattagtaacttttgttggtcttaatccacaggaaaaaacagtaaatgtaattgcaggg
caaacggcatccgtcgagatcactctaactgaatcttcaagcaaattagcagaagtagtg
gtgactggttcaagaggagcaaataaaaaacttgtatcggttggtaaaactgacattgca
ccaatggatttacctcaggcagtagccattgttgacagtaaggttatcgaagagcaacag
gtaaataaattaagcgatgccattaaaaatgtgaatggggtatcattgggctcaactaga
ggtacaacttcggaaacatttttcgctcgcgggtataatttaggcgcaaataatattatg
aaaaatggtgctcgctcaaattcaagcgtaattcctgaagcaagtatcttagagcgagtt
gaagttttaaaaggtagtgcagcgcttttatatggaaatgtaacttcaggagctgtaata
aacatggttacaaaacaaccgaaattcaattttgggggtgaagtttcaatgcgtactggt
agctacgatttctacaaacctatactagatgtatatggcccaatcagcaataaagtggct
ttccgggtaattggcacttatgaaaacgccaaaagcttcagaaattcagttgaatcaaaa
cgtatttatgttaacccttcggtattatataaaatcaatactaaaacagagttattaata
caaggagattatttgaatgctgatttaacccctgattttggagttggtacattaagtgat
acaaaaacaagtagcatacccactactattgatcgcgccagttcatttaataccccctgg
gcatacaacaaagcaaaacaaggtactgcaaatgcaatcctaaatcataactttaataat
aactggaaattaaactcacaggtatcttttcaaaactttgaccggaattatttctcaacc
gaacgtattcaggctgattcagcgggaaattggggacgtaagttaacacgaacaaaaacg
aatgaaaattattacactggacagctaaacctaactggagatttcagcacaggtaaatta
ggccataaagtgttaattggagcagatgctgaacgttattttaacattaccaacggtttc
tcaattgcttcactttctaaagatggcgtttatgattcaattaacgttctcaatccttca
aaattcatcgttcgtattgatgagcccttagcaacaaatacaacaagaacggaagctcca
accaaccgtttcggagtattcgttcaggatttgattagcgtttcggaacaaattaaagta
ttggcaggtttaagatggtcatatatcagcaatccagtaccacaggtatacgatttggta
aaaggaactaatgctcgtacaacaacaccttataaatatgacaacgcattttcacctcgt
ttaggtcttgtgtatcaacctactaaaaactcgtcattatttgcaagctattcaaacaat
ttcgttcctaactctggcacagatatttatttcaacaatttagatgcctctatcatagat
caatttgaagtaggtgtaaaaaatgatttcttccaaggccgactctcagtaaatctttca
gtgtacaaaatcattaatagcaatcaaacaaaaacagcagagtttgacaaagatggtaaa
caaaactctaatactaatttaaaagagtttagtggacaaacaaccagtaatggatttgaa
gtggatgtaaatggaacgatagctaaaggattaaacttcatagctggttatagctataac
gatatgcgttataccaaatccattggcactaaaaatagtagtattgaaggagaacgttta
gttagcatgcctgctaatacagccaatggcacagttttctacacattctccaatccatca
ttaaacggtttaagaattggtttctcaggtttttacactggtgaacgtaacgccggttgg
aataacacagttggttatgtgccgtccaaaggtcagcctcaaaaccgtttattcgcagtg
agcggctttactacctttgatctatcgttaggttatacctataaaaaattctcaatttta
ggtaaagtatcaaacattacgaatgagttgaattatattgttcacgagaattacagtgtg
aatccaattcctccacgtcaatttactacaactttggcatacaaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system