Sugiyamaella lignohabitans: AWJ20_1031
Help
Entry
AWJ20_1031 CDS
T05270
Name
(RefSeq) filamentous hemagglutinin family outer membrane protein
Organism
slb
Sugiyamaella lignohabitans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
30032789
NCBI-ProteinID:
XP_018735238
UniProt:
A0A167DCI1
LinkDB
All DBs
Position
A:3286168..3289005
Genome browser
AA seq
945 aa
AA seq
DB search
MKFTNSVILLQALVSASLALPIENSNGAKPLNSTASPIGLMAINPERDDVHQRSVIAKSD
GSLWLRKGTGSDAVGSVDRDMAVQPMAGGRRLTVGQDGSLQLAEKVDTSNSEEFSIDVKD
YVLHLTTKDAMACPVDDQYKVFWGANVRCEGGIPVKLQSINLEASNSNNTSANKLLKRQN
YGGAYIWHEPFFDCQGQYHEGVHSCDEAYICDRQYFDNRWHDGQWRNGVWHEGNWGSDGI
WHDSVYDGRFTPERDGRYGPYGRHHGGYENGGCGREECGREECGHEGSCGREREREREEC
SREESCGREESCGREESCGCGNEGCGCDGRYDGRYEGHHGRHHEGYHDGRYDGRYDGRYD
GRYDGRYDGRYEGRYEGAPYDGRHHEGRYECEEERGCGYEHHPSNQGCNEYGGYGRYGYH
ELVKTEEAVPATEEMEAQAVETPAEATVAVADAVVPAEEEEQSAVAPVVSLAKRLFGLCG
GSSNKGCDSGCDSGCDSGGGSSGCSLCGLCGGGGGGSSCGSSCGSGCGSGCGSSCGSGCG
GGCGSSCGGCGSCGGGCGGSGCGGGGGGCDDDCYDDSYDCGSSGCFGIFNKRDAVVPTEV
ATEQDLTNNLCCPCCCKCGCCLAKRDESAVATEEDINSAFFCPSSCCGGCCCGGSSSDDD
DEDDCGSSSSSSSCGSSSGSSCCGSSSGSSSSSGCGKSSGSSCGSSGSSAPNCAPEPAPA
PVPAPIPAPAPAPAPVYPAPAPAPVPVSPAPAPAPVAPAPAPVCPAPAPAPAPAPAPVPA
PVPAPPAPVCPAPAPAPAPPPPPPPPPPPVCPAPAPAPAPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPA
PVCAPPPPPPPPAPAPAPVCAPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPAE
PCEPEPAPAPEPEPVWSEPCAEEPEPVPVPAPSECESAENSEEAN
NT seq
2838 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagttcactaattctgtgattcttctccaagcgttggtatcagcctctttggccctg
ccaattgaaaacagcaatggtgccaagcctttgaattcgactgccagtccaattggtttg
atggctattaatcctgaacgagatgatgttcaccaacgctcagtcattgccaagtcggat
ggttctctttggctccgtaagggtaccggctctgatgccgtgggctccgtcgaccgtgat
atggctgtccagcccatggctggcggtcgtagacttacagttggtcaggatggatctctt
caacttgctgagaaagtagatacctctaacagcgaagaattttctattgatgttaaggac
tatgttcttcacttgactactaaggatgctatggcctgtcctgttgacgatcaatataaa
gtgttctggggagccaatgtccgttgcgaaggtggtattcctgtcaagctgcaatcaata
aatttggaagccagtaacagcaacaacaccagtgccaacaaacttttgaaacgtcagaat
tacggtggtgcctacatctggcacgaaccgttctttgattgccagggtcaataccatgag
ggtgttcactcatgcgacgaagcttatatttgtgaccgacaatactttgacaatagatgg
catgatggccaatggagaaatggtgtctggcatgagggcaattggggttctgatggtatc
tggcacgactcagtttatgatggcagattcactcctgaaagagatggtcgttatggacct
tatggccgtcaccatggtgggtatgagaacggcggttgtggtcgtgaagaatgtggccgt
gaagagtgtggccatgaaggatcctgtggacgtgaacgcgaacgcgaacgtgaggagtgt
agtcgtgaagagtcatgcggtcgtgaagaaagctgcggcagagaagaatcctgtggttgt
ggaaatgaaggctgtggttgtgacggtcgctatgatggccgttatgagggtcaccacgga
cgacaccacgaggggtatcacgatggtcgctacgatggtcgttatgatggacgctacgat
ggtcgctatgatggccgttatgatggtcgttatgagggccgttatgagggtgctccctac
gacggacgtcaccatgaaggtcgctacgaatgtgaagaggaacgtggttgcggctatgag
caccacccttctaaccaaggctgtaatgaatatggcggttatggccgatatggatatcac
gagctagtcaagactgaggaagcagttccagctaccgaagaaatggaagctcaagctgtc
gaaacccctgctgaagccactgtagcagttgctgatgccgttgtgcctgctgaagaagaa
gaacaatcagctgtagctccagtagtttcacttgccaagcgtctttttggactctgtgga
ggcagtagcaacaagggatgtgattccggatgcgacagtggatgtgatagcggtggtgga
agctctggatgtagcctttgcggactctgtggcggaggtggcggtggcagcagctgtgga
agcagttgcggaagtggttgcggaagtggttgtggaagcagttgcggaagtggttgcgga
ggtggctgcggtagcagctgtggtggatgtggcagttgcggtggtggctgcggtggtagt
ggctgtggcggcggcggtggcggctgcgatgacgactgctatgacgatagctacgactgt
ggttcctctggttgttttggtatcttcaacaaacgagatgctgttgtacctactgaagtg
gccactgaacaagacttgacaaacaacctatgttgcccatgctgctgcaaatgtggatgc
tgtcttgccaagagagacgaatctgcagttgctactgaagaagatatcaattctgctttt
ttctgtcccagcagctgctgcggaggatgctgctgtggaggtagtagcagtgatgatgat
gacgaagacgactgtggttcaagttccagttctagttcctgtggatccagctcgggttct
agttgttgtggatcaagttctggatctagctccagttcaggctgtggaaaatcatctggt
tctagctgtggatcaagtggatcttcagcccccaattgtgctccagaacccgctccagca
cccgtacccgcaccaatcccagctccagcaccagcaccagctcctgtctatccagcaccc
gcacctgctcctgttcctgtgtcacctgctcctgctcctgctcccgtggcaccagctcca
gctccagtttgcccggcaccagcaccagcccctgctcctgctcctgctcctgttcctgct
cctgttcccgctccgccagctcccgtgtgtccagctcctgcccctgcaccagctcctcct
cctccgcctccacctccaccacctcctgtctgccctgctccggcaccagctccagcaccc
cctccaccccctcctcctccacctccacctccacctccacctccacctccacctccagct
cccgtatgtgctccaccaccaccacctcctccaccagcaccagcaccagctcccgtgtgt
gctccaccacctccacctccacctcctcctccaccacctccacctcctcctccacctcct
cctcctccaccacctccacctcctcctccaccacctccaccaccacctcctccagctgag
ccctgtgagccagaacctgctcctgctccagagcccgagccagtctggtcagagccctgt
gctgaggagcccgagcccgttcccgttcccgcacccagcgagtgcgaaagcgccgagaac
agcgaggaggccaactaa
DBGET
integrated database retrieval system