Simiduia litorea: R50072_31740
Help
Entry
R50072_31740 CDS
T10759
Symbol
pilQ
Name
(GenBank) type 4a pilus secretin PilQ
KO
K02666
type IV pilus assembly protein PilQ
Organism
slio Simiduia litorea
Brite
Secretion system [BR:
slio02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
R50072_31740 (pilQ)
Bacterial motility proteins [BR:
slio02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
R50072_31740 (pilQ)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BFM13021
LinkDB
All DBs
Position
complement(3591464..3593647)
Genome browser
AA seq
727 aa
AA seq
DB search
MSNLIRSLTCLGLRVVAIATLIFSAGAVQANTIQDIKFAELPGQRFEVHLQFSDAPATPD
GYTIDKPARIVLDFPETDNALSQKKYALSFENAKDAAIVSAGGRTRLIISLDDLQPYSTR
TEGNQFILAVGGTNVGDSMAKANVGSSATLSQQTSVSKSLNEKPSNSRVSVADVDFKRNA
QGAGELYFTLSDAHLEVDVDEVSSGVRVTFINTFLEQELRRRLDVTDFATPVTQVNMNYD
GRNTVVDIAAPGQFDYIAYQADNSYVISVKPLNKQELEAKNAAFAFVGDKLSLNFQDIEV
RSVLQLIADFTELNLVASDTVSGRITLRLDNVPWDQALDLVLKTKGLDKRQIGNVLMVAP
AAEIAERERQELETKKQLEELAPLRTEYIRVRYANAKELFELFKGKRESGGSSRDFGGAS
GGSGGDRNSTGSLLSERGRAIVDERTNSIILTDTEEKITEFKKVIAEVDIPIRQVMIEAR
IVIANTDFREELGVRWGGLGFSNGDNGQGRFTGSLETLDYDEDDTGKIEFDLNDSMMIDL
GVANPAGAITAAFVDDNTYLALELSALEDSGHAEVVSQPKVITGDKQKATIMSGTEIPYQ
EASSSGATTTSFKEAVLKLDVTPQITPDNHIIMELQIHKDSVGEITPTGIPAIDVTQLNT
KVLAADGETIVLGGIFQTEQVKGVTKVPFFGDIPYLGRAFRQDVTRENKTELLIFITPRI
MADNFAQ
NT seq
2184 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaatttaataagatcactgacctgtttggggttaagagtggttgcgattgcgacc
ttgatttttagtgctggtgcagttcaagctaataccattcaggatattaagtttgctgaa
ttgcctggtcaacgttttgaagtgcacttgcagtttagcgacgcacccgcaacccctgac
ggctacaccatcgataaaccggcgagaattgttctcgattttccggagacagataatgcg
ctgagccagaaaaagtatgcactatcttttgaaaatgctaaggatgcagccattgttagt
gccggcgggcgtactcgcttaattatttctcttgatgatttgcagccctattcaactcgg
accgaagggaaccagtttatccttgcagttggtggtactaatgttggcgactccatggct
aaagcgaacgttggtagtagtgcgacattatcccagcaaaccagtgtgtcgaagagttta
aatgagaaaccttcaaatagccgagtcagtgttgcagatgttgattttaaacgaaatgcg
caaggtgctggtgaattgtactttacgctctctgatgcacacctagaggtggatgttgac
gaggtgagcagtggtgttcgagttacctttataaacacatttttagagcaagagttacgt
cgccgtttggatgtaactgacttcgcaacgccggtcactcaagtcaatatgaattatgac
ggtcgtaatacggtggttgatatcgcagcccccggtcagtttgattatattgcttaccaa
gctgacaatagctacgttattagtgttaagccgctaaataagcaagagttagaagctaag
aacgcggcctttgcctttgttggtgacaagctatcattgaatttccaagatattgaagtg
cgatcggtgttgcagttaattgctgattttactgaattgaatcttgttgcttccgatacc
gttagtggtcgcattactttgcgattagataatgtgccttgggatcaggctttggatttg
gtattaaaaactaagggcttggataagcgtcaaattggtaatgttttgatggttgcacct
gcagctgaaattgctgaacgcgaacgccaagagcttgagaccaaaaagcaactagaagag
ttggcacctttacgtacagaatatattcgcgtgcgttacgccaatgctaaagagttgttt
gagttatttaagggtaagcgagaaagtggcgggagtagcagagatttcggaggtgccagt
ggcggtagtggcggcgacagaaattccaccggatcacttctgtctgagcgtgggcgcgct
attgttgatgagcgcactaattcgattattttgactgacactgaagaaaaaattactgag
ttcaagaaagttattgccgaagtggatattcctattaggcaagtcatgattgaagcgcgc
attgttattgccaataccgatttccgcgaagagttgggtgttcgttggggtggattgggt
ttcagtaatggtgataatgggcaaggccggtttaccggctcgttagagaccttagattat
gatgaggacgatacgggcaagatagagtttgatctgaatgactctatgatgattgacctc
ggtgttgctaaccctgccggtgctattactgccgcttttgttgatgataatacctatttg
gcgttggagctgtctgctctagaggactcgggccacgcagaagtagtgtctcagccaaaa
gtgattactggcgataaacagaaagccacgatcatgtcgggtacagaaatcccctaccag
gaagcttcgtctagcggtgctacgactacctcctttaaagaggccgtcttgaaactggat
gtaactccacagattacgcctgataaccacattattatggagcttcagatccataaagac
agcgtaggtgagattacgccaacgggtattccggcaattgatgtcactcagttgaatacc
aaagtacttgctgcggacggcgaaaccattgtgcttggtggaatttttcagactgagcaa
gttaagggtgttaccaaggttcctttctttggcgatattccttatttaggtcgcgccttc
cgtcaggatgttactagagagaacaaaaccgagttgttgatctttattacacctcgcatt
atggcggacaactttgctcaatga
DBGET
integrated database retrieval system
