Shewanella livingstonensis: EGC82_00995
Help
Entry
EGC82_00995 CDS
T05875
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
slj
Shewanella livingstonensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
slj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
slj02000
]
EGC82_00995
Transporters [BR:
slj02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EGC82_00995
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZG71467
UniProt:
A0A3G8LPZ3
LinkDB
All DBs
Position
complement(222826..224919)
Genome browser
AA seq
697 aa
AA seq
DB search
MVFKYSVIGLAVGSVLITMPVMAEVSSDTNIERINVMGRTFNDYKVGTASGAMRGDIDLM
DTPQSVNVIPDFVTDEQLATNLAEVLVNDSSVTAGTTRWNRQVFSIRGFELDSGNGYLIN
GHQQWSHYIQPIETLQQVEVLKGPSSMLYGQSGPGGLVNMVTKKPTYDSMLKVGVDTDGY
GSTRAQIDAGGSLNDAQSIRYRGVLVKQDTQYWREYSTTEENQERDRWLGYLNMEFDLTD
DVLLSVKYDHTQDKAGIDAGGWLDAQGDIIGNNKTVWDAPWAFTDNTVSNLGADLTWHIS
DEWKVKGGYNEQQFNRQRFDSAPQYTTDPFSNGYSIKPFDRYDDWQHKTAYIDFTGESDF
AGIQHQLLIGANYLDYFYQQQIQRGTSQTVIPGQSVIKPDLDYHQSSKGDPSEYKYYGFY
LQDLMTVNQQWKLLAGVRYDEQKKDGLGQNSYAVSPKFGAIYSPMENGSIYVNYSKSFTP
QGAVNNQFDVNDELDLKPEYGIQYEVGTKWELFNDSLLLTAAAFDITVENITISETLPTP
IDSYTDITTQGGEQKHRGFEVGAQGQLSDNWFMTSSMMYLDAEYHTGDEREGKTPIDAPE
WSANIWTRYEMTEDFAMNFGAIYVGERFANTDNSISKDDYVRFDIGAAYTMNIMGKDVSV
RANVRNLFDTDYIEGGQYNMVTIGQDRNFSVAVEAKF
NT seq
2094 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtatttaaatattcagttataggtttagcagttggttcagtattaatcacgatgccg
gtaatggctgaagtatctagtgatacaaacatagaacgtattaatgttatgggtcgaact
tttaacgattataaagtcggtacagcatctggtgctatgcgcggtgatatcgacctaatg
gataccccacaatcagtcaatgtgatccccgattttgttaccgatgaacaattggcaact
aaccttgctgaagtattagttaatgattcaagtgtaacggctgggactacacgctggaac
cgccaagttttcagtatccgtggctttgaattagattctggtaatggatatttaattaat
ggccaccagcagtggtctcactacatacagcctattgaaaccctgcaacaagttgaagtg
ctgaaaggtccttctagtatgctgtacggccaatccggtcctggtggtttggtcaatatg
gtcaccaaaaagccgacttatgattctatgcttaaggtaggtgtcgacaccgatggttac
ggatctacccgtgcgcagattgatgctggaggcagcttaaatgacgctcaaagtattcgc
tatcgcggcgtgttagttaagcaagatacacaatactggcgcgagtattctaccaccgaa
gaaaatcaagagcgcgaccgttggttaggctatcttaatatggaatttgatttaactgat
gatgtattgttgtcggttaaatacgatcatacccaagataaggccggtattgatgctggt
ggttggttagatgctcaaggtgatattattggtaataataaaaccgtttgggatgcgccc
tgggcttttactgacaataccgtttctaacttaggtgctgatttgacctggcacattagt
gatgagtggaaagtaaaagggggatataacgaacaacaatttaatcgtcaacgtttcgac
tctgcacctcaatatactacggatccttttagcaatggttacagcataaaaccatttgat
cgctatgacgactggcagcataaaaccgcttatatcgattttactggcgagtctgacttt
gcaggcattcaacatcagttattgatcggtgcaaactatctagattatttctatcaacaa
cagatccagcgtggaacaagccaaaccgttattcctgggcagtcagttattaagcctgat
cttgattatcaccaaagtagcaaaggcgatcccagcgaatacaaatattatggtttctat
ttacaagatttaatgacggtaaaccaacagtggaagttgctggctggggtgcgttatgac
gagcaaaagaaagacggtttaggtcagaacagttatgcggtatcgcctaagtttggggct
atttattcaccaatggaaaacggcagtatttacgttaactattcaaaaagttttactccg
caaggtgctgttaataatcaatttgacgttaacgatgaactggatttaaaacctgagtat
ggcattcagtacgaagtgggtactaaatgggaactgtttaacgatagcttattactcacc
gctgctgcttttgatatcactgttgaaaatattactatctctgagacattaccgactcca
atagattcttataccgatatcaccacccaaggtggtgagcagaaacatcgtggatttgaa
gtgggtgctcaaggtcagttaagtgataattggttcatgacatcttcaatgatgtactta
gatgctgaatatcacactggtgatgaacgtgaaggtaaaacacctattgatgcaccggaa
tggtcagctaatatctggactcgctatgaaatgaccgaagattttgcaatgaattttggt
gctatctatgttggtgagcgttttgctaataccgataacagtattagcaaagacgattat
gtccgctttgatattggtgctgcttatactatgaatattatggggaaagacgtcagcgtg
cgtgccaatgtcagaaatctattcgatactgattatattgaaggtggtcagtataatatg
gttaccattggccaagaccgtaatttcagtgttgccgtagaagctaagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system