Shewanella livingstonensis: EGC82_20420
Help
Entry
EGC82_20420 CDS
T05875
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
slj
Shewanella livingstonensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
slj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
slj02000
]
EGC82_20420
Transporters [BR:
slj02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and toxin extrusion (MATE) family
EGC82_20420
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Holin_SPP1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZG74904
UniProt:
A0A3G8LZN5
LinkDB
All DBs
Position
4663562..4665028
Genome browser
AA seq
488 aa
AA seq
DB search
MKDRHGLLSAPIGRVLLNMTLPNLIGIMTILGGSLVDIFFISQLGTEALTAVSFTFPVTL
VISSIGIGIGAGVSTNLGRLMGSGHAPESRVFLYDTLCITLVIIWGLSILGCLFIDPIFS
LLGANSASLPLINDYMWYWYLGAPALVLLMVGNQALRATGDTRSPAKIMMLAAIVNLILD
PLLIFGIGPFPRLEIQGAAIATTISWVVAMSLSGHLIIVKRKLVQFADFDMGRLILHWKV
LSHIARPAALMNVINPIANGIIMAMLARIDHAGVAAFGAGIRLESVLLIVVMALSSSLMP
FIAQNLGAGQHDRAKTALLMSLRFAFVFQTLLFIPLYFYAESIAGLFTHDPLVIEWLSFY
IMVLPASYGPLAIVIMVATSLNAYHRPLSSLVINVCRLMLLMLPLAALGSYVGGVKGILL
ALPIANTLMGIACYYLATKISEPENIKHAVPCPDNSNNNNDNKTTPTDAAALHEQVDSTK
ATNHLREY
NT seq
1467 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagacagacacgggttgctcagcgcgccaattggtcgtgtgctgcttaacatgacc
ttacctaacctgattgggattatgaccattcttggcggcagtctagtagacatctttttt
atcagtcagttaggcacagaagcgctaaccgctgtgagctttacctttccggtgaccttg
gttatttctagtataggtattggtattggtgcaggcgtatcgaccaacctaggtcgctta
atgggttctgggcatgcgcccgaatcacgggtgtttttatatgacaccttatgcatcacc
ttagtgattatttggggcttatcgatactaggttgcctctttatcgaccctattttcagt
ttattgggtgctaacagtgccagtttgccattaattaatgactatatgtggtattggtat
ttaggcgcaccggcactggtgttattaatggtgggtaatcaagcattacgcgccaccggt
gatacgcgctcacctgctaaaattatgatgttagccgccattgttaatttaatcctcgac
ccactacttatctttggcattggcccttttccccgtttagaaatacaaggcgcagccatt
gcgacaactatttcctgggtggtggcgatgtcattgtctggtcacctcattatagtgaag
cgtaaactggtgcagtttgcagactttgacatgggtcggttaattttacattggaaagtg
ttgtctcatattgcccgcccggcagcattaatgaatgtgattaatcctattgccaatggc
attattatggcgatgttggctcgaattgatcatgctggggtagccgcatttggtgccggt
attcgcctggaatcggtattgttaattgtagtaatggcactgtcgtcaagtttaatgcca
tttattgcgcaaaacttaggtgctggccaacacgatcgcgctaaaacagccttattgatg
tcgttgcgatttgcgtttgtgtttcaaacgttattgtttattccgttatatttttatgcc
gaatcaattgccgggctgtttactcacgacccgctggttattgagtggttgagtttttat
attatggtgctgcctgcctcttatgggccacttgcgatagtgattatggttgccactagc
ttaaatgcttaccacaggccgctgagttcactggtaattaacgtgtgccgcttaatgtta
ttgatgttaccgctggcggcgctaggctcgtatgttggtggggtgaaagggattttattg
gcgttacccattgcgaacacattgatggggatagcttgctattatttggcgactaaaatt
agcgagccagaaaatattaagcatgccgtaccttgccctgacaatagcaataataacaat
gacaataaaaccacgcctacagatgccgctgcgctacacgagcaagtcgattcgacaaaa
gcaaccaatcacttacgtgaatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
