Spiroplasma litorale: SLITO_v1c03930
Help
Entry
SLITO_v1c03930 CDS
T04047
Symbol
recD
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V subunit alpha
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
sll
Spiroplasma litorale
Pathway
sll03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sll00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
SLITO_v1c03930 (recD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sll03400
]
SLITO_v1c03930 (recD)
Enzymes [BR:
sll01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
SLITO_v1c03930 (recD)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sll03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
SLITO_v1c03930 (recD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
Viral_helicase1
UvrD_C_2
SH3_13
AAA_11
SLFN-g3_helicase
HHH_RecD2
AAA_12
AAA_22
nSTAND3
AAA_28
RsgA_GTPase
NPHP3_N
DEAD
ABC_tran
AAA
AAA_29
PIF1
OB_YrrC
NTPase_1
T2SSE
AAA_18
cobW
PhoH
AAA_16
AAA_14
AAA_17
NACHT
IstB_IS21
ATP-synt_ab
ABC_ATPase
TsaE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKX34046
UniProt:
A0A0K1W1I7
LinkDB
All DBs
Position
440322..442508
Genome browser
AA seq
728 aa
AA seq
DB search
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RKEINYKVNLIKNIKDFDDNETVIKYLSSPLFPTIGKKLAENIVNYFEKDIINNILKNKN
DLLNIKNMTNVKAEIIYNTVLELKNNFIDIFITKKLKKEFLYKLTKDFNDNKIIEDILNN
NFYNYAFENNLGPFEEVDKVALAFNADELGEVRISFLVYNIVKEILYQTKNTYTDIDTVK
KKINLNLTYNEVFNKLLYAKKEKLLYFKDKKIYTKESYEDEVFISKKLIEIKNKNNLQNF
EEAFIDEKIKLIEDEFSKSKKIDNFKFNKEQINSLKSFVHNNVLIITGGPGTGKTTLINA
IVRLYEIIYNKNEDDYSILAPTGRAASRIKEDFDNLKTSTIHRLLKYSGNDFYEINKNNM
LRKNMIVIDESSILGNHLFSNLLSGICDIEKLVLIGDINQLPSVDYGNLYEDLINSEFFK
TEYLILNNRQSEENDIPILANQIWSNSNNIQFDNFKNITFYHNDNIDEVFDKIKYYYNKY
SPLEIKDSINGIQVIAPMYKNMLGLENLNNYLQGFANLNPSIKLKKGSVVYKENDKVIFN
ENNIKLLLFNGDVGFIKKYVKNDEESKIYLDFYSRNIELPIEYLKNIDLNYACSIHKTQG
SEYENVILILDNTNSYTSRFVDKRMLYTAITRAKKNLVIISDKNLLLKCANYLSPSRKTT
LIECIKNN
NT seq
2187 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
