KEGG   Shewanella loihica: Shew_1106
Entry
Shew_1106         CDS       T00489                                 
Name
(GenBank) type IV pilin biogenesis protein, putative
  KO
K02674  type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
slo  Shewanella loihica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:slo00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:slo02044]
    Shew_1106
   02035 Bacterial motility proteins [BR:slo02035]
    Shew_1106
Secretion system [BR:slo02044]
 Type II secretion system
  Pilin secretion/fimbrial assembly protein
   Shew_1106
Bacterial motility proteins [BR:slo02035]
 Pilus system
  Pilus assembly proteins
   Shew_1106
SSDB
Motif
Pfam: T4P_PilY1
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABO22977
UniProt: A3QBX9
LinkDB
Position
1273979..1277527
AA seq 1182 aa
MFKKLLCSTVMALVVVSGMTIADDTELYLIDSNVRSGKRPQVLFVFDNSGSMSTEDQNAT
SSYCSADDKANGICDYADGFGDYLAGYSGYINEKGIYWNAGGIDNTSNMPTPDEPKDSRR
FYAANNNCHKAAIALQERGRYTGYLREFKSSGNTGKWYPLADNEGFNRGQVVDCHQDILD
SDPENPGLEKVGGSSVPFDPGYPIDSKKMYTDSTDSSARDYSLENTEFGKGTPVTLYTAH
YLVWYQWVTTTEEGQNSGGTGTRLEVAKDALTTALTSLSIPIDAGLAVFNLNYPDEGDAD
GGRIVYDIKEMTSTNQNSLISLINGMPAQTNTPLCETLYEAYQYFSGGPVTFGNDDKNAQ
GSYKIDGYIPNSPPSILTGGNYTTPFKKCPDTAYIIYITDGAPTIDSNADSAIISLASSA
ENTANYSGFDFVNSWGDTETSYLPALAAYMYNNDMVKGVKDANGIDNKQNVRLFTIGFSE
GADVAAKLLEEAAFRGGNPRDDSGVSKGYYVAKNGLDLVAAMDDALKSILSIDSSFTSPS
IASNNFDKTQTYNSAYFAMFLPGKGPRWSGNLKKLKVNSSGEIVGPGGSSKAIDSNGNIA
ASTCTYWNTCPANNIDGNKVNSGGVLPILRSTLKSRNIRTNVGTSIVGIQFSGFASAYSQ
EDLDWLYGVDVDDDDNDGNIYDAREDIMGDPLHSKPLAINFGEKPNADGTENLDVRVIVG
TNQGLVHMFKDSDSGSNDYSVGSVTETWAFIPQELWHNVPTLRKNYSTGSHSVYGMDLSP
VAYTETDSSGKVNKAWVFLGMRRGGTSYYALDITNPDAPSFKWKIDSNSTGFEELGQSWS
EPVVTFVPGIDDPVLVIGGGMASSEGTGEAVYIVNAKSGAFIKKFSATGMASVPNKVAVL
DSNNDGITDRIYAADIGGNIWRMDMPESTQSTWSTFKFASIATSTSPNDRMFFAEPSVAQ
TQFNNIHDNSGELTYQSVPYDAVTIGTGNRTHPLDINTNDMFYVFQDRNVVTKTFTSTDA
PAALTISELYDVTTAAPSSQSDNVTFGTKRGWFYDYSVAGEKTLSASLIFDGKVYFTSFI
PPTRTDVDLDAGICGFAGQGRLYVFDLHKGTRSYSETYYEIGERVPDTPQIVIPKPEEGE
DSTAYIIGVGKGECEDGECKGTVSLGSGLSTNRIYYHLDEKN
NT seq 3549 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttaagaaattactatgcagcacagttatggctttggtcgtagtttctggaatgact
atagctgatgatacagaactctatttgattgactcgaatgtgcgctcgggaaaaaggccc
caagttttatttgtatttgataattcaggaagtatgtcaactgaggaccagaatgcgact
agttcctactgttcagctgatgataaagcaaatggtatttgtgattatgccgatggtttc
ggtgattatttagctggctattctggttatataaacgagaaaggaatttattggaatgct
ggcggaatagataataccagtaacatgcctactcccgatgagccgaaagattcgcgacgc
ttttatgccgctaataataactgtcataaagctgctattgcattgcaagaaagaggacgc
tatacgggatatttacgagaatttaagtccagtggcaatacggggaaatggtatcccttg
gcagataacgaagggtttaatcgtgggcaagttgttgattgtcaccaagatattctggat
agtgatccagagaatccagggttggaaaaggtaggaggaagctctgtaccatttgatcct
ggttaccctatagattcaaagaaaatgtacaccgactcaacagattcaagcgctcgtgat
tatagccttgaaaacacagagtttggtaaaggtacaccagtgaccctttatacagcacac
tacctagtttggtatcagtgggttactaccacagaggaagggcaaaatagtggtgggaca
ggtactcgtttagaagttgcaaaagatgcattgacaacagccttgacgtcattatctatt
ccaatcgatgctgggttagctgtatttaacttgaattatccagatgaaggcgacgcagat
ggcgggcgtattgtttatgacattaaggagatgacctctacaaatcagaattctttgatt
tctttgattaatggtatgccagctcaaactaacacccctttatgtgagactctttatgag
gcttaccagtactttagcggcgggcctgttacctttggtaatgacgataagaatgctcag
ggtagttataaaatcgatggttatattcctaactctcctccaagtattcttactggcggg
aattatactacgccatttaaaaaatgccctgatacggcctatattatttatattactgat
ggcgcaccgacaatagatagtaatgcagatagtgcgatcatctctttagccagctcagct
gagaatactgcaaactattcaggatttgactttgtcaattcttggggggatacggaaact
agttatctgccagccttagctgcttatatgtataacaatgatatggttaagggagtcaaa
gatgctaatggcattgataataaacagaatgttagattatttacgataggtttttccgaa
ggagctgacgttgcggccaagttattggaagaggctgcttttagaggtggaaaccctaga
gatgattcgggtgtatctaaaggttattacgttgctaagaatggtcttgatctggtggcg
gcaatggatgatgccttaaagtctattttatcaattgactcatcatttacctctccaagt
attgccagtaataatttcgataaaacacagacttataattcagcttactttgcaatgttc
ttacccggtaaggggcctagatggagtggaaatcttaagaagttaaaggtcaattcttca
ggagagattgttggtccaggaggaagttccaaggcaattgattctaatggtaatattgcc
gcttctacctgtacctattggaatacatgtcctgctaataatatcgatggtaataaggtt
aactctggaggggtactgcccattttaagatcaacattaaaaagtcgaaacattaggacg
aatgtcggtactagtattgtgggcattcaattctcaggtttcgcgtcagcctattctcaa
gaggatttagattggttgtatggtgttgatgtcgatgatgatgataacgatggtaatata
tatgatgccagagaagatattatgggcgatcctctgcattcaaaacccctggctattaac
tttggtgagaaacctaatgcggatggaacagaaaatctagatgttagagttatagtggga
actaatcaggggttagttcacatgtttaaagattccgattctggaagtaatgattattca
gttggttctgtaacggaaacctgggcatttattcctcaggagttgtggcataacgttcct
acgcttagaaagaattattctactggaagccatagcgtgtatggtatggatttgtcgcca
gttgcctatacggaaacggattctagtgggaaagtcaataaggcttgggtgttccttggt
atgcgaagaggtggtacttcctattatgccttggatatcactaatccggacgcaccaagt
tttaaatggaaaatagattcaaattcgactggatttgaagagctggggcagtcttggtca
gagcctgttgtcacctttgtaccaggtattgatgatcctgtgttagttattggtggtggc
atggcctcaagtgaaggtactggagaggcggtttatattgttaatgctaaatcaggtgca
tttatcaagaagttttcagcgacaggtatggcaagtgtgcctaataaagttgccgtttta
gacagcaataatgatggtataaccgatagaatctatgctgcggatattggggggaatatt
tggcgaatggatatgccagaatcgactcaatcgacttggtctacgttcaagtttgcgtct
attgcgacatctacttctccaaatgacaggatgttttttgcagagccatcagtagcacag
actcaatttaataatattcatgacaatagtggtgaacttacctatcagagtgttccatat
gacgctgtcactataggtacaggaaatcgaactcaccctcttgatataaatacgaatgac
atgttttatgtttttcaagatcgtaatgtggtaactaaaacctttacgagtaccgatgca
ccagctgcgttaaccattagtgaattgtatgatgtcaccacagctgcgccatcatctcag
agtgataatgttacttttggaaccaaacgtggttggttttacgactatagtgttgctgga
gaaaagactttatcagcgtcactgatatttgacggaaaagtttattttacttcatttatt
cctccgactcgaacagatgtcgatttggatgccggaatatgtggcttcgcaggacaggga
cgtttatacgtatttgacctgcataagggaaccagatcttacagcgaaacctactatgaa
attggtgaaagggtaccagatacgccacagattgtaatacctaaacctgaagagggtgaa
gattctactgcctatatcattggtgtgggcaaaggcgagtgtgaagatggagagtgtaaa
ggcactgtgtctttaggcagtggtttaagtaccaatagaatttattatcatttggatgag
aagaattaa

DBGET integrated database retrieval system