Sander lucioperca (pikeperch): 116059425
Help
Entry
116059425 CDS
T07345
Symbol
notch3
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 3
KO
K20995
Notch 3
Organism
sluc
Sander lucioperca (pikeperch)
Pathway
sluc04330
Notch signaling pathway
sluc04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sluc00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
116059425 (notch3)
04371 Apelin signaling pathway
116059425 (notch3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
NODP
Notch
NOD
EGF_3
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_Teneurin
EGF_DL_JAG
cEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116059425
NCBI-ProteinID:
XP_031168346
Ensembl:
ENSSLUG00000011272
LinkDB
All DBs
Position
21:6687283..6716820
Genome browser
AA seq
2477 aa
AA seq
DB search
MEGDIPWIILSFLLFMHICEGFRCVDKYRPCENGGTCLDSSSRCICRPGFIGPLCQHLDP
CHRSPCLNGAACKSQVVNGIPQYTCVCQRGFRGQDCSLIDACATSPCANGARCANWNNHY
NCSCPPGFQGKNCRNDIDECRKPGACLNGGLCINTHGSFHCQCQPGYSGRTCEVSTLPCA
PSQCLNGGTCRQTSDHSYECACLPGFEGHNCENNVDDCPGHKCMNGGICVDGVNTYNCQC
PPEWTGQYCAEDVNECLMQPNACHNGGTCFNTIGGHTCVCVNGWTGDDCSENIDDCAIAV
CFNGATCHDRVASFFCECPVGKTGLLCHLDDACVSNPCNEGAVCDTNPLNGRAICTCPAG
FVGGACNQDMDECSIGANPCEHFGKCVNTEGSFQCQCGRGYAGPRCEIDINECLSMPCQN
DATCLDRIGEFTCICMPGYMGTYCEVDVDDCESNPCVNDGICRDMVNGFTCTCQPGFTGT
MCQIDIDECASTPCQNGAKCYDRPNGFECRCAEGYEGILCESNINNCQPDPCHHGTCVDG
IASYTCNCDAGYTGYRCENQLNECHSNPCQNGGKCVDLVNKYICQCQHGTSGTNCEINFD
DCASNPCDYGICKDGINRYDCVCKPGFTGSKCNVEIDECASSPCRNGGTCVDEENGFHCQ
CPEGFKPPYCYSQVDECGSSPCVHGSCRDDINGYRCDCEPGWVGKNCDLDRNDCLPSPCQ
NAGTCIDQLNGFTCKCRQGFRGNLCQVNINECASSPCLNKGTCVDGVASFTCLCELPYSG
PTCADVLTPCSPNPCANHAICTHTPDYLGYQCNCQSGWQGQLCNVDVNECVSNPCKNRGT
CTNTLGGFVCSCRAGFTGLMCETDVNDCSPNPCLSGGSCTDGVNSFHCSCLAGFTGPRCA
LEINECQSSPCKNGATCTDYVNSYTCTCRPGFTGIHCETNIPDCTESSCFNGGTCTDKIN
GYSCTCRSGFTGSHCQYEVNECDSQPCLNGGICQDALESFRCSCPKGYTGTRCQTPVDWC
RRSSPCQNGGRCRQKDASFICDCTNGWSGRYCDISRVSCETAARHRGLQTDELCHHGGHC
VNSGNAHYCKCPADYTGSYCESQVDHCEDKPCRNGATCRGYVGGYQCDCMPGFTGQNCEI
EINECQSHPCQNGGTCIDLVGHYICSCPPGTLGVLCEINEDDCALPLRLRSAPPKCLNNG
TCVDRVGGYRCNCPPGFTGERCEGDINECLSNPCSPSNSLDCIQLPNDYQCICMPGFTGR
RCQSRFSVCESQPCQSGGVCSVFSGSALGYTCTCQLGYAGPNCERSMSCRELSCYNEGSC
TLTTRGARCTCQPGYGGPQCQHRSNEGCSSQPCRNGGLCTEETSFPFFHCQCPSGWTGKR
CEQSSRSLEVPTLSCPLADCHEKANDGVCNKECNTFLCRWDGGDCSLAVNPWARCADCWR
VFNNSQCDESCNNVDCLYDNFDCKSKEKVCNPIYEAYCIDHYADGKCDQGCNTEECGWDG
LDCAETVPEALADGVLVLVVLLPPEELLRTSTAFLQKLSAILHTALRFRLDTNGEAMIRP
YTRREARLKRELQPQQEVIGSIVYLEIDNRLCSQGSEDCFPTADSAADYLGALSAVEMLR
FPYPLKEVRGERLPTVINTIPQWGMLMLVGIASLFLLVILVLGMLIARRKREHSTLWFPE
GFFLKKEPSSNKNRREPVGQDALGMKHMPKTVEESLLGDHSDQWMESDCPEAKRLKVEEP
SMLSDSEDAVDSRQWTQHHLAAADIRVPPTMALTPPQGEFESDCMDVNVRGPDGFTPLML
ASFCGGGLEPEVAEEEENEECSANIISDLIYQGASLAAQTDRTGETALHLAARYARADAA
KRLLDAGADANAQDNTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDSRMYDGSTALILAAR
LAVEGMVEELITCHADVNAVDELGKSSLHWAAAVNNVDATIALLKNGANKDMQDLKEETP
LFLAAREGSCEAVKVLLAHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVQLLDEYNTVRSPQG
HGGPGHHLTGGHTLSPLMCPPSAFLPSLKNTPQGKKNRRPGAKGSSLGSQHANSLKESVK
ARNKKLTLDMQSALLESSVTLSPVDSLDSPHGGASNAGYITNPTSPVAMQSPGLFHSSMS
VPNTPMVHSSMLEGGGPFAVSLAQLNDLGAGGMSLQGRVSMASDVNHGYVLSSGQMGLNM
GLVSPVSVPFDWHSRMASSQCGQQVVNLVQSSQAGMHPQSPAMQQQNMLMHQQQLYRNAM
LQPTPVTSTPTISPVKLPSIAEQQQQQQQQQQQQQQLINHTITNQQSMARMSTSTPPTPQ
TSQPPPSFFQQQQMPQQPSQPQPPAQPPQAVTPAAQPTQALPSQPSGSTAGTEDYPTPPS
QHSYSSALDATPKHYLHLPSEHPYLTPSPESPEPWSSPSPHCVSDWSDSTPSPAVAGPAQ
TQITQIPEANGKMQVFA
NT seq
7434 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaggggatattccatggattattttgtcatttttattgtttatgcatatttgcgaa
gggttccgttgcgtggataaatacagaccttgtgaaaatggagggacatgcttagattca
tcctctcgatgcatatgtcgtccgggattcattggtcccctctgtcagcacctggatccc
tgtcatcgatcgccatgtctgaatggagcagcttgcaagagtcaggtggtcaatgggatc
ccacaatatacctgtgtgtgccagagagggttcagaggccaagactgctctctcattgat
gcctgtgccacaagtccctgtgccaatggagcccgttgtgccaattggaataaccactac
aactgttcctgcccacctggcttccagggaaagaactgccgcaatgacattgacgagtgc
cgcaagcctggcgcgtgcctcaatggtggcctctgcattaacacccatgggtccttccac
tgccagtgccaacctggatacagtgggcgaacatgtgaggtgtccacccttccctgtgcc
ccatctcagtgccttaatgggggcacctgtcgacagaccagcgaccattcctatgagtgt
gcttgcctaccagggtttgagggacacaactgtgagaataatgtggatgactgtccaggt
cacaagtgtatgaatggaggaatatgtgtggacggagtcaacacctacaattgccagtgc
ccaccagaatggacagggcaatactgtgctgaggatgtcaatgagtgtctcatgcaacca
aatgcctgccacaatgggggtacttgcttcaacaccatcggtggtcatacctgtgtctgc
gttaatggttggactggagatgactgcagtgagaacatcgatgactgtgccatagctgtt
tgcttcaatggtgccacctgccatgaccgtgtagcatccttcttctgcgagtgcccagtt
ggaaagacaggtttgctgtgccaccttgatgatgcatgtgtgagtaacccctgcaatgag
ggggcagtgtgcgataccaacccccttaacggccgtgccatttgcacctgtcctgctggc
tttgtaggaggtgcctgcaaccaggacatggatgagtgttcgattggtgccaacccatgt
gagcattttggaaaatgtgtgaacacagagggctcctttcagtgtcagtgtggtcgggga
tatgccggaccaagatgtgaaattgacataaacgaatgcctgtccatgccctgccagaat
gacgccacttgcctggaccgcattggagagttcacctgcatctgcatgccaggctacatg
gggacttactgtgaggttgacgtagatgactgtgagagcaacccatgtgtgaatgatggc
atctgtcgggacatggtcaatggctttacatgcacctgccagccagggtttactggcacc
atgtgtcagatcgacatagatgagtgcgccagcacgccctgccagaatggagcgaaatgc
tacgaccggccaaatgggttcgagtgccgctgtgctgaaggttatgaagggatactctgt
gagagtaatatcaacaactgtcagcccgacccatgccaccatggtacttgtgtagatggc
attgccagttacacctgtaactgtgatgctggctacacaggctatcgctgtgagaaccag
ctcaatgagtgccacagcaacccttgtcagaatgggggcaagtgtgtggacctggtcaac
aagtacatctgccagtgccaacatggaacctcaggcacaaactgtgaaataaactttgat
gattgtgccagtaacccatgtgactatggcatctgcaaagatggcattaaccgctatgac
tgtgtttgcaaacctggcttcactggttccaagtgtaatgtggagatagacgagtgtgca
tctagcccctgtagaaatggggggacatgtgtggatgaagagaatggatttcactgccag
tgtcctgagggctttaagcccccttactgttactcccaggtggacgagtgtggcagcagc
ccatgtgtccatggctcatgcagggatgacatcaacggttaccgttgtgactgtgagcct
ggatgggtggggaagaactgtgacctagacagaaacgactgtttgccgagtccctgccag
aatgctggcacgtgcattgaccagctcaatggcttcacctgcaagtgtcgccaaggcttc
agaggtaacctctgccaggtgaacatcaacgaatgtgcatccagtccctgtctgaacaag
ggcacctgtgtggacggtgtggcaagtttcacttgtctgtgtgagcttccttacagcgga
cccacttgtgctgatgtcctcaccccttgttcccctaacccctgtgccaatcatgccatc
tgcacacacaccccagactacttgggctatcaatgtaactgccagtcagggtggcaaggt
cagttgtgtaacgtagatgtgaatgaatgcgtctcaaacccctgcaagaaccgtgggacc
tgcactaacacacttggaggctttgtgtgctcctgcagagctggatttactgggctgatg
tgtgaaacagacgtcaatgactgttctcctaatccatgcctaagtggaggttcctgtaca
gatggtgtgaactccttccactgtagctgcctggcaggctttactgggccccgctgtgct
ttagagatcaatgaatgccaaagctccccctgcaaaaatggagccacatgcacagactat
gttaactcctacacctgcacctgtaggcctggttttactggcatccactgcgaaaccaac
atccctgattgcactgaaagctcttgctttaatggaggaacgtgcacagataaaatcaac
ggctattcctgtacctgccgttcaggcttcactggctcccactgccaatacgaggtcaat
gagtgtgactcccagccctgccttaatggaggcatctgtcaagatgccctcgagtccttc
cgttgctcctgccccaagggctacactggcacccgctgccagacaccagttgactggtgc
agacgctcatctccttgccaaaatggaggacgctgtcgccaaaaggatgcttcctttatc
tgtgactgtactaatggctggtctggacgttactgtgacatctccagggtttcttgtgag
acagctgctcgccatagagggctccagacagatgagctatgccaccacggtggtcactgt
gtcaacagtgggaatgcccactattgtaaatgccctgctgactacactggaagctattgc
gaaagccaagtggaccactgtgaagacaaaccctgccgcaatggcgccacctgcagggga
tatgtgggagggtaccagtgtgattgtatgccaggctttactggacagaactgcgagata
gagatcaatgagtgccagtctcatccttgccagaacggaggcacttgtattgatctggtg
ggacattacatctgctcctgtccccctggcacactgggtgttctctgtgagatcaatgaa
gatgactgtgctctacctctgaggctgcgcagtgctcctcctaagtgcctgaacaatggc
acctgtgtggacagagtgggtggataccgctgcaattgtccccctggattcacaggagag
agatgtgagggagacataaatgagtgtctctctaacccctgcagcccatccaacagtctt
gactgcatccagttgcccaatgactaccaatgtatctgcatgcctggcttcactggccgg
aggtgtcagagcaggttcagtgtgtgtgagtctcagccttgtcagagcggaggagtctgt
tctgtattcagcgggtctgcactgggatacacctgcacgtgtcagcttggttatgctggg
cccaattgtgaaagaagcatgtcctgtcgggagctgtcctgctacaatgaaggtagctgt
acacttaccacaaggggggcgcgttgcacctgccagccaggttatggcgggccccagtgt
cagcatcgcagtaacgaaggctgctcctcccagccctgccggaatggaggattgtgcacc
gaagagaccagcttcccattcttccactgccagtgtcccagtggctggacaggtaaacgg
tgcgagcagagcagcagatcccttgaggtcccaacactctcatgccctctagcagactgt
catgaaaaagcaaatgatggtgtttgcaacaaggaatgcaacacattcctatgtcgctgg
gatggtggcgactgttctctagcagtgaacccctgggctcgttgtgcagactgctggcgt
gtcttcaacaacagccagtgtgatgagtcctgcaataacgttgactgtctgtatgacaac
tttgactgcaaaagcaaggagaaagtttgcaatccaatatatgaagcctactgtatagac
cactatgctgatggaaagtgtgaccagggctgcaacacagaggaatgtggctgggatggc
ttggactgtgcagagacggttccagaagcccttgctgatggtgtcttggttttggtagtc
ctactgcctcctgaggagcttctccgcactagcacagcttttctgcagaaattaagtgct
atcctacacactgcactgcgcttccggctggacaccaatggagaagcaatgatccgcccc
tacacccgccgagaggcacgcctcaagcgggagctgcagcctcaacaggaggtcatcggt
tccatagtgtacctggaaatagacaaccgtctgtgctctcagggctctgaggactgtttc
cctacagctgacagtgctgcagactacctgggagccctgtcagctgtagaaatgctccgc
tttccttaccccctcaaggaagtccgtggtgaaaggttgcctactgtgattaacaccata
cctcaatggggcatgctgatgctggtggggatagcttctcttttccttttggtcatcctt
gtgttaggaatgttgattgctcgtagaaagagagaacacagtaccctttggttccctgag
ggcttcttcctcaagaaggaacccagcagcaacaagaaccgcagggaacccgtgggccag
gatgctctgggaatgaaacacatgccaaaaactgtggaggaatctctccttggagatcac
agtgaccagtggatggagtcggactgcccagaggccaaaaggctcaaggttgaggagccg
agtatgctttcagacagtgaagatgcagtggacagcaggcagtggacacagcatcatctt
gcagccgcagacattcgcgtgcctcccactatggccctcacaccacctcaaggagagttt
gaaagcgactgcatggatgttaatgtccgaggcccagatggttttacacctctgatgctg
gcatcattctgtggaggtggcttagagcctgaggtagcagaggaggaggagaatgaggag
tgttcagccaacattatctctgacctaatctaccagggagcatcccttgctgcccaaaca
gaccgcactggtgagacagcgctccacctggctgctcgctacgcccgtgctgatgctgct
aagaggctgctggatgccggggcagatgccaacgctcaggataacacaggacgtacaccg
ctacatgctgcagtggctgcagatgcacagggtgtcttccagattctgatccgaaatcgg
gctacagatcttgactcccgtatgtatgatggctccaccgcgctgatcctggcagcacgg
ctggcagtagagggcatggtagaggaactcatcacttgtcatgctgatgtcaatgcagtt
gatgaattgggtaaatcttccttgcactgggctgctgctgttaataatgtggatgccact
attgccctgctgaagaatggtgcaaacaaagatatgcaagatctcaaggaggagacccct
ctgttccttgcagcccgtgagggcagctgtgaggctgtgaaagtgctgctggctcatttt
gcaaacagagagatcacagaccatatggacaggttgccaagggacattgctcaagagcgt
atgcaccacgacattgtgcaacttcttgatgagtacaacacagtaaggagtccccagggt
catggagggcctggacaccacctcactggggggcacactctgtctcctctcatgtgccct
cccagtgccttcctgcctagtctgaagaacaccccacagggcaagaagaaccgtcggcct
ggggccaagggttctagcctgggaagccaacatgctaacagtctgaaggagtcggtcaag
gcccgtaataagaagctgaccttggacatgcagagtgccttactggagagctcagttacc
ctgtccccagtcgactcactggactcaccccatgggggagctagcaatgctggctacatc
accaaccccacttcccctgtggccatgcagtcaccagggctctttcactcctccatgtct
gtcccaaacaccccaatggtacatagtagcatgttggagggaggtggcccctttgctgtg
tctcttgcccaactaaatgacctgggagctggaggaatgtccttgcagggacgcgtttcc
atggcttcagatgttaaccatggatatgtgctgagttcaggccagatggggctcaacatg
ggcttggtcagtcctgtcagtgtgccctttgactggcacagccggatggcctcctcccag
tgtggtcagcaggtggtgaatcttgtgcagagtagccaggcaggcatgcacccccagagc
ccagccatgcagcagcaaaacatgctgatgcaccaacagcagctctaccgtaatgccatg
ctgcagcccacacctgttacctccacgcccactatcagcccagtcaagctgccctccatt
gctgagcagcagcagcagcagcaacaacagcagcagcagcagcagcagctcatcaaccac
accatcaccaaccagcagagcatggcccgcatgagtacctccaccccaccaacaccccag
acctcccagcccccaccatccttcttccagcagcagcagatgcctcagcaaccttctcag
ccccagcctcctgctcagcccccacaggcggtcacgccagcagcccagcccactcaggct
ctgccctcccagcctagtggcagcactgcaggaacagaggattacccaactcctccctct
cagcacagctactcatctgcactagatgccacgcccaagcattacctccatttgcccagt
gagcacccctacctgaccccctccccagagtctccggagccctggtccagcccctcccct
cactgcgtctctgattggtcagattccacacccagcccagcagttgctggccctgcccag
acccaaattactcaaatcccagaggccaatggcaaaatgcaggtgtttgcgtga
DBGET
integrated database retrieval system
