KEGG   Saccharomycodes ludwigii: SCDLUD_000012
Entry
SCDLUD_000012     CDS       T08289                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K12600  superkiller protein 3
Organism
slud  Saccharomycodes ludwigii
Pathway
slud03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:slud00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    SCDLUD_000012
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:slud03019]
    SCDLUD_000012
Messenger RNA biogenesis [BR:slud03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ski complex
     SCDLUD_000012
SSDB
Motif
Pfam: TPR_22 TPR_2 TPR_19 TPR_CcmH_CycH TPR_11 TPR_16 TPR_1 TPR_6 TPR_17 TPR_7 TPR_8 CFAP70_mid_TPR TPR_12 COG4_N ANAPC3 Coatomer_E Fis1_TPR_C ARM_TT21_C TPR_Psidin_N HIR3_bundle DUF7693 ARM_TT21
Other DBs
NCBI-GeneID: 70105334
NCBI-ProteinID: XP_045936363
LinkDB
Position
I:<49830..>53981
AA seq 1383 aa
MASQVKIYLKNAKQALQAQNYELAADFCHDVLEEDPNNYFAHLFSGKCYDILNLKDKGLK
HYLKAIEIDKNNVLGWKGLFLLLKTHYDRNVLNYNKLFELCYQYYEILVTQNSSIQPLID
FVRDFKKSHGDCEKTFLQNMVPGQHFAETLGAYLMKPQDALQKLLNIALHEENSKVSTVK
AKRAMGLSPNDPQYQEKLNEIVWDIYKDSEVKVLYSKLINLIDDDDERKKLEEENFFYKL
KVLKTMPQDIKWVHFKELKETVEDMVLLNHNSDIVWNYYFEWQDYNSLDDFDCSIISRFI
KKFPSDPLGNIFFGYISSSFSKYNKQEFYKLNSKDENETIEADEDEDDDSDFTLTEDDIF
SLLLDSVAKTQKSILSHRILSAYCIQSLKYKDALKFIQKGIQLSYFAKRDFGIQLENTKN
DLTLNLALAYTHVDSPKNHSAALQLYNKYLSQFPDDTKAEVGKSLIFIEQKNWTEAAALL
KHVIKTDPEDMTALSDFCWAQMHLGEVDMAIEKFKVVLKNISGTDILSLRNISTNLWRLA
VCYIEKYKTKQTTENMDYINMAFKHLIGSIKVSVDFAPGFSTLGKVYNEYYHDKSRAFKC
YFKAFEINPGDIIAAKYMVGFFTDNKDWENAAKICQRLVDAELAKRELQMVNWPYRVLGV
SCLESRDSNGSIGWFQSALRVDSSDIESWIGLGQAYLYCGRIEASYKAFLKATELDCNHN
YAFYFLGISLSKLYRYDEAVDVFEKLLRTDPSNVCFITTFAHILSEYSSIVYTTGGLSRS
IDLAVYCIEQIENAVCIYSVNSYILWNTLANCLKIFILLQTKLSLLPIERLVNVFEKQQE
MTKNSENSFEFKHNLTVESLFENVDNIKIAANCLLLSSQCAFYVEEYKNLNRTLRAYLWY
NLGCSELLVYQILKDIEYEQQAILAFKESIKFQSNVVDAWIGLGLATLYLNYKVSQHCFI
KALTISPKNYEVWCCLSLLALKNNDVAFALETSRKAQTMNPESYKPWFYMALALEKSGDN
ERGNKLLRHINTLSKDNARIIPLFYAKAVLEQRIGNGSSEKDIELQQDFTSILHGLEQYL
KKIPDDIFAIQCSLLAYERLHDYTKANVLCDKLTSIIEQSFEQSKNDTDLFHYAVIKSQF
SRIKLGMGSYDEAIEDAELSTGILLDHEHSKSLLLSNYCCLGLSNYFKNDFDSTLQYFQL
ILDSSEVCKELILLISKVLYNVDSDETKELSMQELADYASAHSGDMEVSLTMAAISLIEK
YNVDDLNTILKEITSLPLSVLCRDYKKNVPFLIEELNKRIGTSENKLAQIWQKSTFFFPN
SRQSWEKLDDKIAYQVGCNEPNRMNTCEKTEQLIRLKNKRMIQRGLFLTPWNENAINALK
ECF
NT seq 4152 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcatcacaggtgaaaatatacttgaaaaatgctaaacaggctttgcaagcacaaaac
tatgaattagccgctgatttctgtcacgatgttttagaagaagatcctaataactatttt
gcgcatttattttcaggtaaatgttatgatatattaaatttgaaagacaaggggttaaaa
cattatttgaaggcaattgaaatagacaaaaataatgttttaggttggaaggggttattt
ttattattgaaaactcactatgatcgaaatgttttaaactataataagctttttgaacta
tgctatcaatattatgaaattttagtaactcaaaatagttcaatccagccactaattgat
tttgtaagagattttaaaaaatctcatggtgattgtgagaaaacatttttacagaacatg
gtacctggtcagcatttcgctgaaactttgggagcgtatttgatgaaaccacaagatgct
ttacaaaaactattgaatatagcattgcatgaagaaaatagcaaagttagcacagttaag
gcgaaaagggcgatgggactaagtccaaatgatcctcaataccaagagaaattaaatgaa
attgtttgggatatttacaaagattcagaggtcaaagttttatattccaaactgattaat
ttgattgatgacgatgatgaaagaaaaaaattagaagaagaaaactttttttataaactt
aaagttttaaaaaccatgccacaagacattaaatgggtccatttcaaagagttgaaggaa
accgtagaagatatggttctacttaatcataattcagatatcgtttggaattattatttt
gaatggcaagattacaatagtttagatgactttgattgctccatcatatcccgctttatc
aaaaaatttccgtccgatccattgggaaatattttttttggctacatttcgtcatccttt
tctaaatataacaagcaagaattctataaattgaactcaaaagacgaaaatgaaacaatt
gaggcggacgaagacgaagatgatgattcagattttactttgaccgaagatgatatattc
agcttgttattagacagtgttgccaagacacaaaaaagcattttgtcacaccgtatatta
tcagcatattgtattcaatcactaaagtacaaagatgcattgaagtttatacaaaaggga
attcaattatcttatttcgccaaaagagattttggtattcaactggagaatacaaaaaat
gacttgaccttaaatttagctctagcttacacacatgtagattcccctaaaaaccatagt
gctgcattgcaattatacaataaatatctatcacaatttccagatgatacaaaggctgag
gttggaaaaagtttaatttttattgaacaaaagaattggacagaagctgcggcgctatta
aagcatgtaattaaaacagatccagaagatatgaccgccttatctgatttctgctgggcc
caaatgcatcttggcgaggtggacatggccatcgaaaaatttaaagttgtgttaaaaaac
atttctggtacagatattttgtcgctgagaaacatttcaacaaacctgtggagattagca
gtatgctatattgaaaaatacaaaacaaagcagacaactgaaaacatggactatataaat
atggctttcaagcatttaataggttcgattaaagtttctgtggattttgctcctggattt
tcaacgttgggtaaagtttataatgaatattatcatgacaaaagcagggcttttaaatgt
tattttaaagcctttgaaataaacccgggtgatattattgccgcaaaatatatggttgga
tttttcaccgataataaagactgggagaatgcggctaaaatatgccagaggttggttgat
gctgaacttgccaagagggaattgcaaatggtgaattggccataccgggttttgggtgta
tcctgtttagaaagtcgagatagtaacggttccattggatggtttcaatctgctttgaga
gtagacagttcagatattgaatcatggattggtttaggccaagcttatttgtattgtggc
cgtattgaagcctcatataaagcatttttaaaggcaactgagttggactgcaatcataat
tatgcgttttatttcttgggtatctctttgtctaaattatacagatatgatgaagctgtt
gatgtttttgaaaaattactacgtacagacccatctaacgtttgttttattactactttt
gcacatattttgagtgaatactcatctattgtgtacacgactggtggtttgtctaggtct
attgacttggccgtttattgtattgagcaaattgaaaatgccgtttgtatttatagcgta
aacagttatatcctatggaacacgttggctaactgtttaaaaatttttattttactacag
acaaaactatctctgttgcccattgagagacttgtaaatgtttttgaaaagcaacaagag
atgaccaagaacagtgaaaactcgtttgaattcaaacataacctaactgtagaaagctta
tttgaaaatgttgacaatattaaaatagcagccaattgtttattgttgtcttctcaatgt
gccttttacgttgaggagtacaaaaatttgaatagaacacttagagcctatttatggtat
aatttagggtgttctgaattgctggtttatcaaattctgaaagatatagaatatgaacag
caagctattttggctttcaaagaatccattaaatttcagtcaaatgttgtagatgcctgg
attggtttaggattagccacattatatcttaactataaagtgtcccaacattgttttatt
aaagcattgactatttctccaaaaaattacgaagtgtggtgctgtttgtcattattggct
ttaaaaaacaatgatgttgcctttgccttggagacatcacgtaaagcacaaacaatgaat
cctgaatcttataaaccttggttttatatggcactagctttggaaaaaagcggcgataat
gagcgcggtaataaacttttaaggcacattaacactttatctaaggacaatgcaagaatc
atcccattgttttatgctaaggcagtcttggaacaaaggattggaaatggttcaagtgaa
aaagatattgaattacaacaagatttcacatctatattgcatggcttggaacaatacttg
aagaaaatccctgatgacattttcgctatacaatgttctttgttggcatatgaaaggctg
catgattacacaaaagccaatgtattgtgtgataaattaacttctattattgaacaaagt
tttgaacaaagcaagaatgacacagatttgtttcattatgcggtgattaaatcacaattt
tctcgtattaaattaggtatggggtcctatgatgaggctattgaagatgctgaattatcg
acgggtattctgcttgatcatgaacatagcaagtctttattactttctaattactgttgt
ttgggtttaagcaattattttaaaaacgattttgattctacattacaatatttccagttg
atcttagatagttcggaagtttgcaaagaattgatattgctaatttctaaagttttatac
aacgttgacagtgatgaaaccaaagaactttcgatgcaagagttggctgattatgcaagc
gcgcatagcggtgatatggaagtttcgctaactatggcagcaattagtttgattgaaaaa
tataatgttgacgatttaaacacaattctaaaagagattactagcctacctttaagcgtt
ttgtgcagagattacaaaaagaacgttccctttttgattgaagaattgaacaaaagaatt
ggcacctcagaaaataagcttgcacaaatatggcaaaaaagcacattttttttcccaaat
tccagacaatcatgggaaaagttagatgataagattgcgtaccaggtcggatgcaacgag
cccaatagaatgaacacttgtgaaaagacagaacaattgataagattgaagaacaaaagg
atgatacaaagaggtttgtttttaacaccgtggaacgaaaacgcaatcaatgcattaaaa
gaatgtttttaa

DBGET integrated database retrieval system