KEGG   Saccharomycodes ludwigii: SCDLUD_001468
Entry
SCDLUD_001468     CDS       T08289                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K26122  E3 ubiquitin-protein ligase substrate receptor MMS22
Organism
slud  Saccharomycodes ludwigii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:slud00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04121 Ubiquitin system [BR:slud04121]
    SCDLUD_001468
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:slud03400]
    SCDLUD_001468
Ubiquitin system [BR:slud04121]
 Ubiquitin ligases (E3)
  Multi subunit type E3
   Cul8 complex
    Target recognizing subunit
     SCDLUD_001468
DNA repair and recombination proteins [BR:slud03400]
 Eukaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    Other HR factors
     SCDLUD_001468
SSDB
Motif
Pfam: Mus7
Other DBs
NCBI-GeneID: 70106790
NCBI-ProteinID: XP_045935630
LinkDB
Position
II:complement(390029..394834)
AA seq 1601 aa
MTSGLKNELTIVPDSEGESQEIVFWYPSDTSNGKNFQLCSTSSTNIIPDNNSEFSTSDTE
DAFNCNANLSNNKISSNNASFDLNTNIEHPDSVIRHSLDIPIMNKQKEAESTEQLYNQHN
NILDKQERPLRWSLRKRKAIQKMPYSLDRLKHKQLLKGYEVLNFDSINVNDLPEISLSFG
EKNHNKFTNKQQHTQHPLLSTQDDFWQDSDDDYDFEIQRNISFQNSATHTDSSDNRSTDS
EESIILPRKLAKQGILEEGNSDNNMTLLSCSNTNSDENDVSTSKISQLSEDTSKKETDNI
IFRGRVISLKNGYKGVLPKAIWEKQIKATEGTVVPNGGKKTRGYINNTVPHKGVAKRKIT
RNPRNNQYQELLNDILASDDEEPSETNNANSNISTNSSDSIMLHTINAGIEDAKAAAEIN
EYFEKKYNEFYTSDYLSLSSNDKSIAQQKQSSTDLSNQNLRRHSSGAENISVHTFKNNID
SSDDSINIKKMEGSIIDLHDYPQIDYMLSKRSKIRGSSSNTINNGTSKRKKNVTRRTRIL
RDKRQTRNFNAPKFFKIGRNISKNNDLSSIGHAAPSIVESIAETSAFGNNVEYAQSGSVK
RIGNGRSGNGINVFAKTTTPETKDTHKLNKTKNNNKENDKKGKRKIGLYTTDMLLGDDIE
LNRKINAFTTIVEAPGNKYVLNKVKRKPAVPAGGHTDVSDSSAERIATNKSVLLDTPIFK
ALSTNSLFQAPDTISYFIAQEKITLSSFSNEFLKQLAASFDKIVRVGITDVELLDFLGKL
IEFCYHRNNSDILPILDSFQTSFRSKLRQVAQRAKPIHFFTLSVCLLIEFEVSNYSSITS
SFRSNIESKILRDSEKYFELLSNMSVTVSRFGQTDFLAESHFIVSFLINKLNMKDKFWAE
ISSKRCLSPKILNTVLYLFPTKTPYWNIISLENQDFPLVSASINFIQFAINDYDWIITKE
LVLKLHLLFKSRSFTNFEQECNNKDGVCRIVNKNFGIEPDTIFNFYLTVLNNFVITDSLI
EKITPLGSITTMDGSQIPNRINLLLTLTLKSDFLFEKKYEQLITSALSGFPDIGVFNYKY
MLEGLLSLFEVSNQKNQTINGNCILIFYEYQKNKPNVKGSYSEVWCDFIGHLCKILPNFG
TNKQHLLYSLRHVASQMAKDGNYDSVVLIMILGLVTKNLKLLPPRWVESNLYQLLSTVCF
QNFKLFKIYCDVVKYLIQSHILTLWSVLSYNSSVAKLPVEQQCYYYESLLEVCNEESSFL
LIKPAVMKIILSNIFNDKFDLKFLKLVKSFFDKDPSIKTPFRVLALHSTFTSIKQILLGF
DEAHNLGFFNEFLKLLKAKYLNKVKVELCREITIFINASLNNLVRSNQIFEFLKKEFKIS
NFETEKSAFKQKYITLSNIQDKVNLILLEILQVLENKLDIEETKLKIESLFALKKKDYAD
EFNLLLKIILCCIYGNSALSFYISTILFAIISNVLEQKMMVTTNNEFLILLKFLHNISNN
IRFKKNLTALLPFYYCLSCFYLDLKYIGSGFKESEIIEESIDKFMGRCKESSRIEDLKLD
NIVSHQVLELIKKFESTIEIEKFYEEKDYEMFSSKIEDICL
NT seq 4806 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgactagtggattgaaaaatgagctaacaatagtccctgattcagaaggagaatctcaa
gaaattgtattttggtatcccagcgatactagcaatggaaagaatttccaactatgttct
acatcatctacaaatatcattcctgataataatagcgaattttcaacttcagatacagaa
gatgcttttaattgtaacgctaacctttctaataacaaaatttcatcaaacaatgcttca
tttgatttaaacacaaacatcgagcatccggatagtgttatacggcattctttagacatc
cctataatgaataagcagaaagaagctgaatcaaccgagcaattatacaatcaacataat
aatattcttgacaaacaagaaagacctttaagatggtcactacgtaaacgtaaagctatc
caaaaaatgccctacagtttagatagattaaaacataaacagttgttaaaagggtacgaa
gtccttaactttgacagtattaatgtaaacgatttacctgagatttcactttcctttgga
gaaaaaaaccataacaaatttacaaataaacaacaacatacacaacatcctctactatca
acccaggatgatttctggcaggatagcgatgatgactatgatttcgaaatccaaagaaat
atttcttttcagaatagcgctacacatacagatagtagcgataatagatctactgattct
gaagagagcattattttaccaagaaaattggcaaaacagggcattcttgaggaaggaaat
agtgacaacaatatgactttattaagctgttccaatacaaactctgatgaaaatgatgtt
tcaacatcaaaaatctcccaattatctgaagatacttcaaaaaaggagacagataatatt
atatttagagggagagtgattagcttgaaaaacggatataaaggtgtattgcctaaggca
atttgggaaaaacaaattaaagctaccgagggaacagttgttccaaatggtgggaaaaaa
actagaggctatataaataacacagtaccacataagggtgttgctaaaaggaaaataaca
cgcaatccccgaaacaatcaataccaagaattattgaatgacatactggcctctgatgac
gaagagccttcggaaacaaataacgctaatagtaacattagcactaattccagcgatagc
ataatgttacatactatcaatgctggaattgaagatgcaaaagcagctgcagaaattaat
gaatattttgaaaagaaatataatgaattttatacaagcgattatttatctttgtcttca
aatgataagtcaattgctcaacagaaacagagctccactgatttatcaaatcaaaattta
aggagacattcatctggcgctgaaaatatttctgttcatacttttaaaaacaatatcgat
agttcggatgattctattaacataaagaaaatggaaggtagtataattgatttgcacgat
tatcctcagatagattatatgctgagtaaacgttccaaaataaggggatccagcagcaat
actattaataacggtacatctaaaagaaagaagaatgttacaaggagaacccgaattctt
agagataaaagacaaacacggaatttcaatgccccaaaattttttaaaattgggaggaat
atttcaaaaaataatgatttaagttcaattggacatgctgctccttcaattgtggaaagt
atcgctgaaactagtgcttttggtaataatgttgaatatgcccagtctggttcggttaaa
agaattgggaatggcagatcaggaaatggtataaacgtttttgcaaaaacaacaacacca
gaaacaaaggatacacacaaactgaataagacaaaaaataataataaagaaaatgataaa
aaaggaaaaaggaaaattgggttatatacaacagatatgctacttggcgatgatatagaa
ttaaataggaaaataaatgcatttaccacaattgtagaagctcctgggaataagtacgta
ttaaacaaagtgaaaagaaaacctgctgttcctgctggaggccacacagacgtttcagat
agttcagctgagagaatagcaaccaataaaagtgtactacttgacacccccatttttaaa
gctttatcaacaaattcacttttccaggcccctgatacaatttcatatttcatagcacag
gaaaaaataactttgtcttcattttctaatgaattcctgaagcaattagctgcctccttt
gataaaattgtaagagtaggtataactgatgtggaattattagattttctaggcaaattg
atagagttttgctatcaccgcaataactctgatatattaccaatcttagattcctttcaa
acttcctttagatcaaaactaagacaggtggctcaaagagcaaaaccgatccattttttc
acactttccgtttgcttgttaattgaatttgaagtatccaattatagttctattacaagt
tcgtttaggtccaatattgagagcaaaattttaagggacagcgaaaagtattttgaacta
ttatctaacatgtcagttaccgtttctcgatttggacagacggattttttagctgaaagc
cattttattgtttcttttctcattaataagctgaatatgaaggataaattttgggcggaa
ataagctctaaacgctgcttatcacccaagattttaaatactgtgctctatctatttcca
actaaaaccccatattggaatattatttcattagaaaatcaagattttccacttgtatct
gcctcgattaatttcatccaatttgcaataaatgattatgactggataataacaaaggag
ttggtactaaaactacatttattatttaaaagcagatctttcacaaattttgaacaagaa
tgtaataataaagatggtgtttgcagaattgtaaataaaaattttggaattgaaccagat
acaatattcaatttttacttaactgttttgaacaattttgtaataacagactcattaata
gagaaaattacacccttggggagtatcaccaccatggacggatcccaaattccaaacaga
attaatttattgttaactttaacattaaagtcagactttttgtttgaaaaaaaatacgaa
caactaataacatcagctctaagcggtttccccgatataggtgtctttaactataaatat
atgctggagggtctactatcattattcgaagtaagtaatcaaaaaaaccagactatcaat
ggaaattgtattttaatcttttatgaataccaaaagaataaacccaatgtcaaaggaagt
tattctgaagtttggtgcgattttattggccatctatgtaagattttgcctaattttggc
acgaataagcaacatttactatattcattgcgccatgttgcatcgcagatggccaaggat
gggaactatgacagtgtagtgctcattatgatactggggttggttactaagaacctaaaa
ctgttaccaccgagatgggtagaatcaaatctttaccagttattatcaacggtttgtttt
caaaatttcaaacttttcaaaatatattgtgatgtagtcaagtatttgatccagagtcat
attctaacgctatggagtgttttatcttataatagcagtgttgcgaaactaccagtagaa
caacaatgctattattatgaaagtttgttagaagtatgcaacgaagaatcttcatttttg
ttaattaaacctgctgttatgaaaattatactttccaatatttttaacgataaatttgat
ttaaaatttttgaaactagtcaaatcctttttcgataaggatccatcaataaagactccg
tttcgagttttggccttgcattccacttttactagcatcaaacagatactattgggcttt
gatgaagcacataatctgggatttttcaacgagtttttaaagttgctaaaggccaagtat
ttaaataaagttaaagttgaattgtgtcgggaaataactattttcatcaacgcatcattg
aataatttggttagaagtaatcaaatttttgaatttttgaaaaaggagtttaaaatctca
aactttgagacagagaaaagtgcttttaaacaaaaatatattaccctatccaatattcag
gataaagtcaatttaattcttttggagatcttacaagtgttggaaaataaattagatatt
gaagagacaaaattaaaaatagaatcattatttgccttgaaaaaaaaagattacgcagat
gagtttaatttactattgaagataattttatgttgtatatatggaaatagtgcactatct
ttctatatttcaactatcttatttgcaataatttcaaatgtattggagcaaaaaatgatg
gttaccaccaataatgaatttttaattcttttaaagtttttgcataatatcagcaataat
attaggtttaaaaaaaatttgactgctttactgccattttattattgtttatcctgcttt
tatcttgatctgaaatatatcgggtctggatttaaagagtctgaaattatcgaagaaagt
atagataaatttatgggaagatgcaaagaatcatctagaatagaggatttgaaactagat
aatattgtatcgcatcaggtactggaattaattaaaaaattcgagtccaccattgaaatt
gagaaattttacgaagaaaaagattatgaaatgttttcatcgaaaatagaggatatttgt
ttatag

DBGET integrated database retrieval system