Saccharomycodes ludwigii: SCDLUD_001747
Help
Entry
SCDLUD_001747 CDS
T08289
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K26680
protein dopey
Organism
slud
Saccharomycodes ludwigii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
slud00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
slud04131
]
SCDLUD_001747
Membrane trafficking [BR:
slud04131
]
Endosome - Golgi transport
Others
Others
SCDLUD_001747
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DOP1_C
Dopey_N
TPR_DOP1_M
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
70107069
NCBI-ProteinID:
XP_045935894
LinkDB
All DBs
Position
II:complement(1080118..1085214)
Genome browser
AA seq
1698 aa
AA seq
DB search
MSLPLLPIVTDKNNTTSKNNLDHKEKQFRSSVEKALQQFDYVDDWADYISRLGKLLKALT
SWTPKFANVRYYVPHPYHVARRLSSSLSPDLPSGVHSKTLEVYTIIFSKIGLDTLNQQCN
IWVPGILPLMNYASISIKPQLIDLYENYLLNLSSSTLEILAKPMIASLLPGIDDESSEFQ
PMILNLLETLKTNLNNDNLFWQSFFLIMIQSKEHRLGGLVWLTKQMPSLNAVPHLVNKSI
ADGADNKAPIKVSSREAMEKYALSLLLPTAAPLVTLEAGLLIRCFTNCLHDDDGILIQRG
ILDLLLQRLHLDSPIFIYIASENDKSLMIMSLCELLLKKDMSLNRRIWSWFLKSNTATGV
TNTVNTNDTGDVNAISPQQLYFETNGLNTLLQGLENLAENGNLIKALKITQSLMDRWEMG
CLVTDKMFLKLMKCVIANRDDQKVVTCASQFFDNVDTFIIWGNVSKTLIFGQSSVSEFNN
LRDTPTPDYLVLEFILENFHIDNDQEIIIRHLPLILLLLLHISPKNYKLCDSLVRIIPER
AFLPIQHSKITKIPSIKEIVAQIVHYYGIGEQGEDANKTSSTTSDIFLPYSPEDLSKIII
MSIYDLLLEAFKTPDNNLNKISTIFVQLYAKIPELSSSDLVIDADILATKIMELKPSVET
GAPFVFGIIDLFIHCLLSKLDKISISKNLRVIIKYLWTYLINQNRQLEAMNHLRTLIRNI
DRQYLESSLSAVFIEEAQIYNRLTVLTCLWNLVDESSAMGVVSKPLELVLDELFDKQSSN
YLPVSKWVVNVLSVSKSSNQLLEYLTTCLLSFQFINKKSFYQFDDIEIFTYYTQTLINVL
TTDEVVGLNVLNTEATSQRCIELFGITKTLDLSTYKNIIVEIFLNFLDVKSNSNSKSVRT
VLSFFKLVLNGTEYNFKNIVTKFLDLSSEYIMSSSSNMEEELITVSLLDILSNVLALSHS
KNIELDIFDNSDAHLKYVDFLVTSISFINSPSIISSYVKLLTESILYFQKGVFNIILPLA
TAMIQGAKTLFDKEYFSKNEYSNYEQFACILDGIEELIQVSHSYLAAEENSNLLSIRSSD
FLQNVVSNVFSSDKGTEDEAKKLLIRRQVVLQSFDTIVKYCYNIWNSTVDTTTLATKVDD
DPFAESKYHQACKYKYKSRKLMENLFNLEPIEVLVCLIEENNNDSSIFKVVHALDGNRPM
LTLPHLFKMIVFRCNPTSNYLDEHSKTIISSTNISFKLVNIIEFVLKYIATLEYSAIEDF
YKEFLSFIKDVVNNSHFYDMISIKILQIIALVCEKIKHSKFGIDKKVRKEYSDLFNKYIL
SVETEPRIIKNRKTFEALKFVVQRMEYIVCDENSSDKFNATLSALIATYVTPFFKNPTEL
PSYIVEFLVVLAPYAAKIKSWKLLLTDLFMNNKMFFTFSRENSKCWQKIIFEWSQYSENK
TKIIDELLVTVSTSSANPFNSWSKSEVGSKGRAYFKMCYLLLISPQDQYMLKFLDLVSEV
ERCCLSDNIEPIVKSMGFLLLRCIFLKFQPMHFLNSWSTITFILQSNFQKIYDQGVKNND
KDLQLFFQMCKTLDTLLVLNNEEFNSTQEWIFVIDTINCIYKTEPFVALMDTLAEKLDCD
DKEKEDKINSNENSIEYNENKVPMLVGIHKIASFSDLNKFCSKISCATYKSLYGSIDKVE
EEEIIQDSINDLFEYCDL
NT seq
5097 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcattacccttattgcctatagtaactgataaaaataatactactagtaaaaataat
ttagatcacaaagaaaaacaattcagatctagcgtagaaaaggctttgcaacaatttgat
tatgttgatgattgggcagattatatttctagattgggtaagttgttaaaagctttaacg
agctggacaccaaaatttgcaaatgttaggtattatgttcctcacccatatcatgttgcc
aggagactatcttcctctctatctccagatttaccctcaggtgttcattccaaaacatta
gaagtttacactattattttttcgaaaataggcctggacactttgaaccaacaatgtaat
atttgggtgccagggatcctacctctaatgaattatgcatccatctctattaaacctcaa
ttaattgatttgtatgaaaattacttactaaatttaagttcttcaacgcttgagatttta
gcaaagccaatgattgccagcttattacctggtatagatgatgaaagtagtgaatttcaa
ccaatgattctcaatttgttagaaactttaaagactaatttaaataacgataatttattt
tggcaaagtttttttcttatcatgattcaaagtaaggaacacaggttaggcggtttggtg
tggctaacaaaacaaatgccatctttaaatgcggttccccatttggttaataaaagcatt
gctgatggtgcagataataaagcaccaatcaaagtttcttctagggaggcaatggaaaaa
tacgcattaagtttgcttctccccactgcagctcctttggttacattagaggctggttta
ttaattagatgctttactaattgtttacacgatgatgatggaatattaattcaaagaggg
atactagatttattgttgcaaagattgcatttggattctccgatatttatttatatcgct
tctgaaaatgataaaagccttatgattatgagtttatgtgaattattgttaaaaaaagat
atgtcattgaacagaagaatatggagctggtttttaaagtctaacactgctacaggtgta
acaaacactgtaaataccaatgacactggagatgtcaatgcaatttctcctcaacagcta
tatttcgaaacaaatggattgaatactttacttcaaggtctagaaaatcttgccgaaaat
ggaaatctaattaaagccttgaagatcacgcaaagtttaatggataggtgggaaatggga
tgcttggttactgataaaatgtttttaaaattgatgaaatgcgttattgcaaatagggat
gaccaaaaggttgtcacttgcgcctctcaatttttcgataatgtagatacttttattata
tggggtaatgtttcaaaaaccttgatttttggacaaagttctgtatccgagtttaataat
ttacgggatacaccaactcctgattatttggtattagagtttatcttggaaaatttccat
atcgataatgaccaagaaataattataagacatttgccgttgatattactacttttattg
catattagcccaaaaaattacaaattatgcgactctttagtgaggattatcccagaaaga
gcattcttacccatccagcattctaaaataactaaaatcccatctattaaagaaattgtc
gcacaaatagttcattattatggcataggagaacaaggagaagatgctaataagaccagt
tccactacatcagatatttttttaccgtatagcccagaggatttaagcaagatcattatt
atgtcaatttatgacctattactcgaagcttttaaaacaccagataataatttgaataaa
atttccactatttttgtccaattatatgcgaaaattcctgaactgagttcttctgatttg
gtgattgatgctgatattttggcaactaaaattatggaactcaaaccatctgtagaaact
ggagctccatttgtgtttggtataattgatttatttattcactgccttttgtcaaaattg
gataaaatttccatatctaaaaatttacgagttataataaaatatttatggacatatcta
attaatcaaaatagacagttggaggctatgaaccatttaagaacgttgattagaaacata
gacagacaatatttggaaagttctttgtctgctgtttttattgaagaagctcaaatctat
aatagattgaccgttctaacatgtttatggaatttggtcgatgaaagctctgctatgggt
gttgtttcgaaaccgttagagttagttttggatgagctatttgataaacaatcttcaaat
tatttgccagtgtcaaagtgggttgttaatgtattatcggtatctaaatcaagtaatcag
ttattagaatatttaacaacctgtctattgagttttcagtttatcaataagaaatcattt
tatcaatttgatgatattgagattttcacttattacactcaaactttaattaatgtgttg
acaaccgatgaggttgttggtttaaatgttttaaatacagaagccacctcacaaagatgt
attgaactatttggaatcaccaagactttagatttgtctacctacaagaatattattgtt
gagatatttttgaactttttggatgtcaaatccaactcaaattctaaaagcgtaagaact
gttttaagttttttcaaactggttttgaatggaacagaatacaactttaaaaatatcgta
actaaatttttggatctatcgtccgaatatattatgtcctcctcatccaacatggaggaa
gaattaattactgtatccttgttggatatcttatcgaacgttttggcgttgtcacattca
aagaatattgaattggatatttttgacaattcagatgcgcatttgaaatatgttgatttt
ttggttacttccatatcctttattaattcaccatcaataatatcctcgtacgtcaaattg
ttaaccgaaagtattttatattttcaaaagggtgttttcaatattattttacctctggca
actgctatgatccaaggcgctaaaacgttatttgacaaagaatatttttcgaaaaatgaa
tacagcaactatgaacagtttgcatgtatcctggatggcatcgaggagttgatccaagtt
tcacatagctatctagctgcagaagaaaatagcaatttgttaagtattcgcagcagtgat
tttttgcaaaacgttgtatcaaatgttttttcttctgacaaaggcaccgaggatgaagct
aaaaaattactaattcgtagacaagttgttttgcagtcttttgacacaattgttaaatat
tgttataatatttggaatagtacggtggatacgactacccttgccactaaagttgatgat
gatccatttgcagaatcaaaatatcatcaggcctgcaagtataagtataagagcagaaaa
ttaatggaaaatttgttcaatttggagcccattgaagttttagtttgtttgattgaagaa
aataacaatgattcttccatttttaaagtggtccacgctttagatggcaacagaccaatg
ttaaccctaccacatttgttcaaaatgattgttttcagatgtaatccgacgtccaactat
ttagatgagcatagcaaaacgattatttcatctacgaatatttcgtttaaacttgttaat
ataattgaatttgttttaaaatatatcgccaccttggaatattctgccattgaagatttt
tataaagagtttttgtcttttattaaagatgttgttaacaatagccatttctacgacatg
atttcgattaagattttgcaaattattgcactagtatgtgaaaaaatcaagcattctaag
tttggtattgacaaaaaagttcgaaaagaatattctgatttatttaataagtatatttta
tctgtggaaactgaacctcgtattattaaaaacagaaaaacttttgaggccctaaaattt
gttgtccaaaggatggaatatattgtttgtgatgagaattcatcagacaaatttaacgcc
acactatctgccttaatagctacctatgttactccctttttcaaaaaccctacggagtta
ccctcgtatatagtagaatttctggtagttttggcaccatatgccgctaagatcaaaagc
tggaaattattattaaccgacttatttatgaacaataaaatgtttttcacttttagtaga
gagaacagcaaatgctggcaaaaaattatttttgaatggtcgcaatactctgaaaataag
accaaaataattgatgaattgttagtcacggtatcgacatcatctgccaatccattcaat
tcttggtcgaaatcagaggttggttcaaaaggtcgtgcttattttaaaatgtgttattta
ctattaatttcgccacaggatcaatacatgctaaaattcttggatctggttagtgaagtt
gaaagatgttgtttgagtgataatattgagcctatagttaagtccatgggatttcttttg
ttaagatgtatttttttaaagtttcaaccgatgcattttctaaacagttggagtacaatc
acttttattttacaaagtaacttccaaaaaatatacgatcagggtgttaaaaataatgat
aaagatttgcaattatttttccaaatgtgcaaaaccttagatactttgttggttttaaac
aatgaagaatttaattccactcaagaatggatatttgttatcgatacaataaactgtatt
tataaaactgaaccattcgtagcattaatggacactttggctgaaaaactagactgtgac
gacaaagaaaaggaagacaagataaacagcaatgaaaattcgattgaatataacgaaaat
aaagttcctatgttagttggaatccacaaaatcgctagtttttccgatctaaataagttc
tgttcaaaaataagctgtgctacatataaatctttgtatggatctattgataaagtagaa
gaagaagagattattcaagattcgattaatgatttatttgaatactgtgatttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system