KEGG   Saccharomycodes ludwigii: SCDLUD_002324
Entry
SCDLUD_002324     CDS       T08289                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K04646  clathrin heavy chain
Organism
slud  Saccharomycodes ludwigii
Pathway
slud04142  Lysosome
slud04144  Endocytosis
slud05100  Bacterial invasion of epithelial cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:slud00001]
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04144 Endocytosis
    SCDLUD_002324
   04142 Lysosome
    SCDLUD_002324
 09160 Human Diseases
  09171 Infectious disease: bacterial
   05100 Bacterial invasion of epithelial cells
    SCDLUD_002324
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:slud04131]
    SCDLUD_002324
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome [BR:slud04147]
    SCDLUD_002324
Membrane trafficking [BR:slud04131]
 Endocytosis
  Clathrin-mediated endocytosis
   Clathrin
    SCDLUD_002324
Exosome [BR:slud04147]
 Exosomal proteins
  Proteins found in most exosomes
   SCDLUD_002324
SSDB
Motif
Pfam: Clathrin Clathrin_H_link Clathrin_propel TPR_COPA_B Clathrin-link TPR_7
Other DBs
NCBI-GeneID: 70107641
NCBI-ProteinID: XP_045934801
LinkDB
Position
III:174089..179053
AA seq 1654 aa
MSGDLPIDFTEQADLPSLGISPQFLDFRSTTFESDNYVCVRETINNQNTVSIVDLKNNNQ
VTKKNMGGDNAIMHPSKNVISVRANGTLVQIFDLTSKAKLKSFTMEEPILFWKWLNDEYL
GFVTTNSIFISNCFDGQVSLPPAKLTLRHGNLNNTQIIDFTANVNMDWFAVVGILQENGR
IAGRIQLYSKSRNISQAIDGHVAEFTTISLNGNSKPTQLFVTGNRNPVTGNGELRVIEIE
HDATSCPVAYPKKLVDIFFPPDATNDFPISVKISVKYGIIYLLTKYGFIHLYELETCTNL
FVNRITAESVFNSAYYDNKNGIACINKKGQVLSVEISTSQIVPYILNKLSNVSLALTVAT
RGGLPGADELITKQFDTLMAQGDYQGAAKAAASSAQLRTPATINKLKNIQAAPGAISPIL
LYFSTLLDKGKLNKYETIELAKPVLQQDRKQLFEKWLKEDKLECSEELGDTVKPFDTTLA
LACYLRANVHNKVVTSLAELQQFDKILPYCAKVNYQPNFTVLISSLLRSSPDKASEFAIS
LLQNPATSGSIDIEKTADIFFSQNYIQQGTSFLLDALKGDTPDQGRLQTRVLEVNLLHAP
QVADAILGNNMFSHYDKTSIASLAEKAGLYQRALENYTDIKDIKRCIVHTTALPVDWLVS
FFGKLNVEQSLACLRALMDNNLQANIQIIVQIATKYSDLLGSSVLIKLFEEYKATDGLYY
YLASLVNLTDDKDVVFKYIQSAAKIGQYKEVERVVRENNVYDPEKVKNFLKDASLPDQLP
LVIVCDRFGFIHEMILYLYKQQNFKFIEIYVQQVNPSKTAQVVAGLLDVDCDEKVIQNLL
KGVVGQVPIGELCDEVEKRNKLKILLPFLQESLDHGIEEQAIYNALAKIYIDSNNSPEKF
LKENDKYDTLNVGRYCEKRDPYLAYIAYDKGENDDDLVRITNDNSMYKYQARYLLKRSDV
ALWAKVLAEDNVHRRQLVDAVVSIGIPELTDPEPISITVQAFMQAGLKLELIELLEKIIL
EPSPFNENSALQGLLMLSAIRYEPTKVANYIEKLDKYDPTEIAPMCVENGLNEEAFEIYD
KYELYSKAMKVLVEDIMSLDRGVQYAEKIDEPGLWSQLGEAQLNGLRIPEAISSYIQAND
PSNYINVIDIAEHAGKLEELVPYLKMARQTLKEPKIDSTLILCYAELGKLHEIETLLDNS
NVADLEEVGDKLYAKSDYKAAKLCFVSISNYSKLASTLVHLGDYQAAVDIARKASNIKVW
KQVDDACIKKKEFRLAQICGLNLIVHAEELEELVETYESLGYFDELISLFEAGLGLERAH
MGMFTELAVLYVKYKPTKAYEHLKLFWSRINIPKVIRACETAHMWEELIFLYAHYDEWDN
AALTVIEKSTTKFDHEYFKEIIVKVTNLEIYYKAINFYVSEHPTLLVDLLVALTPRLDIT
RTVKLFKNSDNLPLIKPFLINVLPKNNTAVNEAYHELLIEEGDYKSLQVTVDSYDRFDQL
ELAKRLEDNELIFFKQIAANLYRRNKKWARSLAILKEEKLWKDAIETATISQSTEIAEDL
LSYFVDTGNREAFVALLYSAYALLRYDYVLELSWMNKLDDFIRPYEISVKKEQTDKIKEL
SEKLANTKVTDEQTDGQTLLLTNGSLGSQATGFF
NT seq 4965 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagtggtgatttaccaattgatttcactgaacaggctgacttgcctagtttggggatc
tctcctcaatttctagattttagatcaacaacttttgaaagcgacaactatgtatgtgtt
cgtgaaaccataaataaccaaaatactgtttctattgttgacttgaaaaataacaaccag
gtcaccaaaaaaaacatgggtggtgataacgccataatgcatccttccaaaaacgttatt
agtgttagagccaacggcactttggttcaaatctttgatttaacttctaaagctaaatta
aagtcttttaccatggaagaacccatcctattttggaaatggttgaatgatgaatatcta
ggtttcgttaccactaattccatttttatttccaattgttttgatggtcaggttagctta
cctcctgcaaaattaaccttgagacacggtaatttaaataatactcaaatcatcgatttt
actgcaaatgtaaatatggattggtttgctgttgtcggtattcttcaagaaaatggccgt
attgctggtagaattcaattgtattctaaaagcagaaatatctcccaagcaattgacggc
catgttgctgagttcaccacaatttctttgaacggtaacagtaaaccaacacaattgttt
gttactggtaacagaaatcccgttacaggcaatggtgaattacgtgttattgaaattgaa
catgatgcaacctcttgtcccgttgcttacccaaaaaaattagtcgacattttctttcca
ccagatgccactaatgattttccaataagtgtcaaaatatctgtaaaatacggtatcatt
tatttattaacaaaatatgggttcatccatttatatgaattagaaacctgtactaatttg
tttgtcaatagaattactgctgaatccgtcttcaactctgcctattatgacaacaagaat
ggtattgcctgtattaataaaaagggacaagttttatctgtggaaatctccacttctcag
atagttccctacattttaaacaaactatctaatgtttctctagctctaactgtagcaact
agagggggtttgccgggcgctgatgaattaattactaaacaattcgatacattgatggca
cagggcgattaccaaggtgctgccaaggccgctgcttcctctgctcaattgagaacacca
gccactattaacaaattaaaaaatatccaggctgctccgggtgccatttcgcccatttta
ctgtacttctccactttactagataaggggaaactaaacaagtacgagacaattgagttg
gctaagcctgtcttgcagcaagatagaaaacaattgtttgaaaaatggttgaaggaagat
aagttggagtgttctgaggaattgggtgacactgtcaaaccattcgatactacattggcc
ttggcctgctacttgagagccaacgtccacaataaagttgttacgtccttggcagaacta
cagcagtttgataagatattaccgtattgtgctaaagtcaattatcagccaaatttcact
gttttgatctccagtttattgagatcctcaccagataaggcttctgaatttgccatctct
ttattacaaaaccctgctacatcaggttctattgatattgaaaaaactgcagatatattt
ttcagtcaaaactatattcaacaggggacttcatttttgttggatgctttgaaaggcgat
actccagatcaaggtcgtttgcaaacccgtgttttagaggttaatttgctacatgctcca
caagttgccgacgccattttaggtaataacatgttttctcattacgacaagacatctatt
gcttcattggctgaaaaggctggtttgtaccaaagagccttggaaaattatactgacatc
aaggacattaagagatgtattgttcacactactgctttgccagtcgattggctagtttca
ttttttggcaagttaaatgtcgaacaaagcttagcctgcttaagagctttgatggataac
aatttgcaagctaatattcaaatcattgtccaaatcgctactaaatattcagatttactt
ggttccagtgttttaattaaattatttgaggaatacaaagctaccgatggtttatattac
tacttggcctctttggttaacttaacggatgataaggatgttgtttttaaatatatccaa
tctgctgccaaaattggacaatataaagaggtggaaagagttgtcagagagaataacgtt
tacgatcctgaaaaagtcaagaatttcttaaaagacgcctctttacccgatcaactacct
ttggttatcgtttgtgaccgttttggtttcatccacgaaatgattttgtacttgtacaaa
caacagaatttcaaatttattgaaatttatgtccaacaggtcaatccatccaaaacagca
caagttgttgctggtttattggatgttgactgtgatgagaaagttatccagaatttgttg
aaaggtgttgttggtcaagttcctattggtgagttgtgtgatgaagttgaaaaaaggaac
aaattaaaaattttgttaccatttttacaagagtctctagaccatggtattgaagaacaa
gctatttataatgcgttggccaagatctacattgactctaacaattctcctgagaaattt
ttgaaagaaaatgacaagtatgatactttgaatgttggtcgttattgtgagaagagagat
ccatatttagcctacatcgcctatgataaaggtgaaaacgatgatgatttagtcagaatt
acaaatgataacagcatgtataaataccaagcaagatatttgttgaagagaagcgatgtt
gctttatgggcaaaagttttggctgaagacaacgttcacagacgtcaattggttgatgcc
gtggttagtataggtattcctgagttaaccgatccagaaccaatttccattactgttcaa
gccttcatgcaggctggtttaaaacttgaattgatcgaattgttggaaaagattatctta
gaaccatctcccttcaacgaaaacagtgccttgcaaggtttgttaatgttatctgctatt
agatatgaaccaactaaagttgctaattatatcgaaaagttagacaaatatgatccaaca
gaaatagctccaatgtgtgttgaaaatggtttgaatgaggaagcttttgaaatttacgac
aagtacgaattatattccaaagccatgaaggtattagttgaagatattatgtccttggat
aggggtgtccaatatgctgaaaagattgatgaaccaggattatggtctcaattgggggaa
gctcaattgaatggtttacgtatcccagaggctatttcctcctatatccaagctaatgat
ccatctaactatattaacgttattgacattgcagaacatgctggtaagttggaagagtta
gttccatacttaaagatggctagacaaactttaaaagaaccaaagattgacagtactttg
attttatgttatgcagaattaggcaaattgcatgaaattgaaaccttgttggataattct
aatgttgctgacctagaagaagtgggtgataaattatatgccaagagtgattataaggcc
gctaaattatgttttgtttctatttctaattattctaaactagctagcactttagttcat
ttaggggattatcaagctgccgttgatattgcaagaaaggcatccaatatcaaagtttgg
aaacaggttgatgatgcctgtatcaaaaagaaggagtttagattggcccaaatttgtggt
ttgaatttgattgttcatgctgaagagttggaagaattagtcgagacatacgaatctcta
ggctactttgatgaattaatttctttatttgaagctgggttaggtttggaaagagcccat
atgggtatgtttaccgaattggctgtcttgtatgtcaaatataaaccaaccaaagcctat
gaacatttgaagttattctggtccagaattaacattcctaaagttataagagcttgtgaa
actgctcatatgtgggaagagttgattttcttgtacgcacattacgatgaatgggataat
gccgctttaactgttattgaaaaatccactaccaaatttgaccatgaatatttcaaagag
atcatcgttaaagttaccaacttggaaatatattacaaagccattaatttctatgttagt
gaacacccaacactgttggttgatttattagtcgctctaactcctagattagatatcact
aggactgtcaagttgtttaagaattccgataatttaccattaattaaaccattcttaatc
aatgtattacctaagaataatactgccgttaatgaagcctaccatgaattattaattgag
gagggtgactataagtcattgcaagtaactgttgattcttatgatagatttgatcaatta
gagttggctaaacgtttagaggataacgaattgattttctttaagcaaattgctgccaat
ctatatcgtagaaacaagaagtgggccagaagtttggctattttgaaggaagaaaagttg
tggaaggatgctatagagacagctactatttctcaaagtacagaaattgcagaggatttg
ttatcctattttgttgataccggtaatagggaggcatttgttgctttgttatacagtgcc
tatgctttgcttagatatgattatgttttggaattatcatggatgaataaattagatgat
tttatcaggccatatgaaatttctgttaaaaaagagcaaactgataaaattaaagaattg
agtgaaaaattagctaatactaaagtcactgatgaacaaactgatggtcaaacattgttg
ttaaccaatggtagtctgggttctcaagcaactggttttttttag

DBGET integrated database retrieval system