Saccharomycodes ludwigii: SCDLUD_004422
Help
Entry
SCDLUD_004422 CDS
T08289
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K20222
importin-5
Organism
slud
Saccharomycodes ludwigii
Pathway
slud03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
slud00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
SCDLUD_004422
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
slud03009
]
SCDLUD_004422
Ribosome biogenesis [BR:
slud03009
]
Eukaryotic type
Pre-40S particles
Export and cytoplasmic maturation factors
SCDLUD_004422
Pre-60S particles
SCDLUD_004422
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Importin_rep_6
Importin_rep_4
HEAT_EZ
HEAT
Importin_rep_5
HEAT_2
HEAT_EF3_N
TOR1L1_N
RIX1
MMS19_C
Vac14_Fab1_bd
mTOR_dom
Arm
CLASP_N
HEAT_ECM29
V-ATPase_H_N
DNA_alkylation
ARM_ARMC5
Nab2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
70109739
NCBI-ProteinID:
XP_045932934
LinkDB
All DBs
Position
VI:complement(66656..69937)
Genome browser
AA seq
1093 aa
AA seq
DB search
MSALPEDINTTLISILQGFASPDNTIRAQAELALQNTWITPENIEVLLIFLSEQASFSSD
ATTSALSAVLFRKLALRAPPSSKTVIIAKNITSISNAALQQIRATLLKGFFTQQNVSIRH
KLSDAIAVCALDDMDKWTQLLECVFQAMKSDDPTYRESSFRILTTVPYLINNVDSNLVLS
VFEAGFTDANDDVKVSAVSAFVGYFRQLPKSNWAKLGVLLPSLLNSLPKFLEDAKDYALS
AAFEPLIELIELAPKLFKDMFNQIIQFVDIVIKTKDLDASTRTSALELLTVFSENAPQMC
KSNPNYGNTVVMDTLMMMTEVSEDDDNAIEWQNSDDTDDNEEEVTYDHARQALDRVALKL
NGKYLAPFLFQYLEPMMQSSEWRERFAALMALSSAAEGCRDVLISKIGKILDMVIPLVND
PHPRVQYGACNALGQISTDFAPLIQRVSHERIVPALISRLSNDCCSRVQTHGAAALVNFS
EEASQSILEPYLDSLLSNLLTLLQSDKTYVQEQALTTIAFIAEAAEKKFIKYYDTLMPQL
IHVLKTDTGDENRVLKGKCMECSTLIALAVGREKFGAYSQELLECFVHYQKQDIKDDDPI
KSYLEYGWSRICRIMREEFVPFLPLVLPPLLLTAKATQDVSLIEEEEAESFQQYNEWDVV
QIQGKHIAIHTSILDDKVTAMDLINVYASILKSSFVYYANEILLEIAIPSIDFYLHDGVR
ATGAKLISVLLGCLISANGVDDKVFALWKLACDKLLVGMNSEPMPEILQIYHKVFVDCLD
ITEVDCLSEEQVGEYTKATFVNLTDVYTRVKTRHGEDDEYNEDVDDEADDYTDEDLLDEI
NKSLASIFKLKTTAFLPHFESLWNLITTSYLQQDSEIILSLFALVAIADMVQYCGESTAP
LKVSFGSKVQEYLTSPEPSIRQAAAYVVGSCAIYAPQSYSDLCNSSLPILVKVIVIPDAR
SDENITSTENANAAIAKILHTFGPSIPQFNDYVSLWLKSFPVIQDEEAANYSYKFLGELI
NSNNPAVQGLDNISNIVKYVVEALYQKSLSSSASESIIASTKSLLDTVPQDQVMSLFGNY
PEPVMNEIKKWFS
NT seq
3282 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagccttaccagaagatatcaataccacactaattagcattttacaaggctttgct
tctccagataataccatccgtgcacaggcagaacttgctttgcaaaatacatggatcaca
ccagaaaatattgaggttttattaatttttttatcagaacaagcatctttttcatcagat
gctaccaccagtgcattatctgctgttttatttagaaaattagccctaagagcacctcct
tcttctaaaacagttattattgccaaaaacatcacgagtattagtaatgctgctttgcaa
caaataagggctactttattgaaaggttttttcactcaacaaaatgtatccattaggcat
aaattatcagatgccattgcagtttgtgctttggatgatatggataaatggacacaatta
ttggaatgtgtattccaagctatgaaatcagatgatccaacttacagagaatcgagtttt
agaattctaacaaccgtcccgtacttaataaacaatgtggatagtaacctagttctatct
gtatttgaagcagggtttactgatgctaatgatgatgtaaaagtgtctgctgtttctgca
tttgtgggttattttagacagttgcccaaatcgaattgggcaaaattgggtgttctattg
cctagtttactgaatagcttgcctaaatttttagaagatgcaaaagattacgcattgtct
gctgcttttgaaccattaatcgaattgatagaattggctcccaaattgtttaaagacatg
tttaatcaaattattcaattcgttgatatagtgattaaaacaaaagatttggatgcttcc
acaagaaccagcgcactagaacttttaactgttttcagtgaaaatgccccccaaatgtgt
aaaagtaatcccaactatggtaataccgttgttatggacacgttgatgatgatgacagaa
gtctctgaagatgacgacaatgctattgaatggcaaaattcagatgataccgatgacaac
gaagaagaagtaacttatgatcacgctcgtcaagctttggatagagtcgccttaaaatta
aacggcaagtatttggcgccatttttatttcaatatttagaaccaatgatgcaatcaagt
gaatggagggaaagatttgctgcattgatggctttatcgtctgcagccgaaggttgtcgt
gatgttttaattagcaagattggtaaaatattagatatggttatccctcttgttaacgat
cctcaccctagggttcagtatggagcatgtaatgcattgggtcaaatttctactgatttt
gcaccattgattcaaagggtttcccatgagcgtattgttccagctttaattagtagattg
agcaacgactgttgttctcgtgttcaaacacatggggcagcagctttggttaatttttcg
gaggaagcttcacagagcattttagaaccttatttggacagtttattgtctaatttgtta
accctgttgcaaagtgacaaaacctatgtacaggagcaagctttgactactatagcattt
attgcagaggcagccgagaaaaagtttattaaatattatgatacgctaatgccacagcta
atacatgttttaaaaactgacactggcgacgaaaatagggtattaaaggggaagtgtatg
gaatgttcgacattaatcgctttggcggtaggaagagaaaaattcggtgcctattcacag
gaattgttggaatgttttgttcactaccaaaagcaggatattaaggatgacgatccaata
aaatcttatttagaatatggttggagtagaatttgcagaattatgcgtgaagagtttgtt
ccatttttaccacttgttttaccaccattattactgacggccaaggcaacacaagatgtt
agtctaattgaggaagaggaagcggaaagttttcaacagtataacgaatgggacgttgtt
caaattcaaggtaaacatatagctatacacacatctattttagacgacaaagtaactgct
atggatttgattaatgtttatgcaagcattttgaaatcttcgtttgtgtattatgctaat
gaaattttattggaaatcgctattccttccattgatttctacttgcatgatggtgttagg
gctactggtgctaagttgatctccgttttattaggctgtttaatatctgcaaatggcgtt
gacgacaaagtctttgcgctatggaaacttgcttgtgacaagttattggtgggtatgaac
tccgagccaatgcctgaaatacttcaaatatatcacaaagtgtttgtggattgtttagat
atcacggaagttgattgtttatctgaggaacaagtgggagaatatacaaaggctacattt
gttaatttaaccgatgtttatacaagagtcaaaacacgccatggcgaagatgatgagtac
aatgaagatgttgatgatgaagcagatgattacacagacgaggatttattggatgaaatc
aacaaatctttagcatcgatttttaagttgaagactactgcattcttgccacactttgaa
agtctatggaatttaataaccacttcctatttgcaacaagactctgaaattatattgtct
ttgtttgcgttggttgcaattgctgatatggttcaatattgcggtgaaagcactgcgcca
ttgaaggtcagctttggttccaaagttcaggaatatttaacttctccggagccatctatt
cgccaagctgcagcttatgtggtggggagctgtgccatttatgctcctcagtcatattct
gatttgtgtaacagtagtttgccaatattagttaaagttattgttatccccgatgctaga
tcagatgaaaatatcacctccactgagaatgctaatgcagccatagctaagatcttgcat
acatttgggccaagtataccccagtttaacgattacgtatctttgtggttaaaatctttt
cctgttattcaagatgaggaggccgctaattacagttataaatttttaggtgaactaata
aatagtaataatccagcagttcaaggtttagacaatatttcaaacattgtaaaatatgtt
gtggaggctttatatcaaaagtcgttatcttcaagtgcttcagaatctataattgcatcg
actaagtcattattggacacagtgcctcaagatcaagtgatgtctttgtttggtaattac
cctgaacctgtaatgaacgaaattaaaaaatggttctcatag
DBGET
integrated database retrieval system