Saccharomycodes ludwigii: SCDLUD_004887
Help
Entry
SCDLUD_004887 CDS
T08289
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K11661
helicase SRCAP/SWR1 [EC:5.6.2.-]
Organism
slud
Saccharomycodes ludwigii
Pathway
slud03082
ATP-dependent chromatin remodeling
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
slud00001
]
09120 Genetic Information Processing
09126 Chromosome
03082 ATP-dependent chromatin remodeling
SCDLUD_004887
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
slud03036
]
SCDLUD_004887
Chromosome and associated proteins [BR:
slud03036
]
Eukaryotic type
Chromatin remodeling factors
SRCAP complex
SCDLUD_004887
SWR1 complex
SCDLUD_004887
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
HSA
DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
70110204
NCBI-ProteinID:
XP_045933377
LinkDB
All DBs
Position
VI:complement(1107554..1112359)
Genome browser
AA seq
1601 aa
AA seq
DB search
MTNSNTHNNSPILNNINSDSSTNDKKNDIDLLADLKFQYEVLTNELFHLYNFTNIDEFDP
LFREKRESLVFSDFLKEHGLNLESTDKDATNTNHNITGPDNLISDNNDLPASRRIRSRRR
RGRRIDGGETKATDTLTATKYNSDGITSNINNTLDELVNAKYGHLRKILDETYKNTILNT
DSLKNEEPKENNRINDRANNKRSNTLEDNKIKYQHRNPLKKQKKSNMLSEPYLMLNVNDE
KQKVEDPFYFTPSSSSSSPSPSPSSSESQDEKYNSSKLKFKFYVNLPKPTVTNPENVTKP
KFNNLSAYLTSFRSLDEDVDEQEYENFISKQKKVFQDIRKGVEKGVLEVNLENQLLKEIT
LKDVNSSQNTISNNILRKPEPITFIYKQQNQFPIQDHLMNQGIKLSKIFHNSTRARIARA
KKVSQMVEQHFKHISGAEERMKKQHEKNIRALARTAAQAVRKRWSLAEKAYRVLKKDEEE
ELKKIQGKKHLSEMLEKSTKLLGAQLNKKSLELSDDDLSLSSDFSTNDDKKLSSVDDMNI
DTTSDEDREGAGSQYLTGTIKDANVSLDENRERKGEYDDSKLSVEQLKEKYAKLDEVNIL
QDTDISIGPQPLVNENSVNIGALVSKSAKEEINYNASQSDVDSESDSITTEYSSSSSSSS
SSSASSSSEGEEEEEEEENIQGKPKTQLGLLLNNNELEIEEKDTSFDADYEEGNVTSNYS
DEKGDFIENKEEYEGEQLKVVDVPVPPLLKGTLRSYQKQGLNWLASLYNNNTNGILADEM
GLGKTIQTISLLCWLACEKQNWGPHLIVVPTSVLLNWEMEFKRFAPGFKVLAYYGSPQER
KRKRKGWNNPNSFHVCITSYQLVVTDQHSFKRKTWQYMILDEAHNIKNFRSTRWQALLNF
NTERRLLLTGTPLQNNLAELWSLLYFLMPKTIMTDGTVKGFADLEAFQNWFGNPVNKIME
LGTKNNDSGDKYNLLNSTDEETQKTVDKLHQVLRPYLLRRLKADVEKQMPAKYEHIIYCK
LSKRQRYLYDDFMARAQTKETLASGNFMSIINCLMQLRKVCNHPDLFEVRPVVTSFAISK
SIYHDYLYLANKMIISDSNNKLDLNFLNLKFLDINNEQKNTSLKYAEISKLSVLDSFVKE
VAKLRKEADRDNSMTTMFDFQDIEEYYKRYNRLQIVSEINKLQLLNYINQHRCKQGKPKF
GLNLIKLLKVPSSSSVLSTKLVKSYDDFILKEKGIIKKFAFLTPKIVVLENKEIFMGIDP
ISVYLKGYEKKIIRDQLLLNDNVNKNPVVAFNHFVQTKLSIEFPDKSLLQYDCGKLQKLT
TLLADLKKNGHRVLIFTQMTKVLDILEQFLNYHGYLYLRLDGATKIEDRQILTERFNNDS
KITVFILSSRSGGLGINLTGADTVIFYDSDWNPAMDKQCQDRCHRIGQTRDVHIYRFVSE
HTIESNILDKANQKRRLDNVVIQQGDFTTDYFSKLTVKDLLGSEAPVELKDDRLLIEDSS
ENKKINISNVNDSGNENVKKSGNFSKLLSQVEDEDDARAAKMALQEEENVDTEDFKEYSV
DNNSGKIDDIKGDNYDEDEYEGTKHVEEYMIKFIANGYYYD
NT seq
4806 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaacagtaacacacacaataattcaccaatactcaacaatattaacagtgactca
tctacaaacgataagaaaaacgatatcgatcttttggcagatttaaaatttcaatatgag
gttttgaccaatgaactatttcacttgtacaactttacaaatatagatgaatttgatcca
cttttcagagaaaaaagggaaagccttgttttttctgattttttaaaggaacacggatta
aacctcgagagtaccgataaggatgctactaatacgaatcacaatattactggtccagat
aatcttatttccgataataatgatttaccagcttctcgcaggataagaagtagaaggaga
agagggagaagaatagacgggggggaaacaaaagcaacggatacactaaccgcaaccaaa
tataacagcgatggaattacttcaaacattaataatactttggacgaacttgtaaatgct
aagtacggacatttaaggaaaatattggatgaaacatataaaaatacaatactgaatact
gatagtttaaagaatgaggaacctaaggagaataatcgtattaatgacagagctaataat
aaaagatcaaatactttggaagataataaaataaaatatcagcaccgaaaccctttgaag
aaacaaaaaaaatcaaatatgctttccgaaccctatttaatgttaaatgtaaatgatgaa
aaacaaaaagtagaagatccattttattttaccccatcgtcatcatcatcatcaccatct
ccttctccttcttcttccgaaagtcaggatgaaaaatataactcttcaaaattaaagttc
aagttttatgttaatttaccgaaaccaacagtaacaaacccagaaaatgtaacaaaacct
aaatttaacaatttatcggcatatctaacttcttttaggtctttagatgaggatgttgac
gagcaagaatatgaaaattttatttccaaacaaaaaaaggtatttcaagacattaggaaa
ggtgtagaaaagggagttttagaagtaaatttggaaaatcaattattaaaggaaatcact
ttaaaagatgttaacagttcgcaaaatactattagtaataacattttaaggaaacccgag
cctattaccttcatatataagcaacaaaatcaatttcccatacaagatcatttaatgaat
caaggtatcaaattaagtaaaatattccacaatagtactagagcgagaattgctagggct
aaaaaagtctcccaaatggttgagcaacatttcaaacatatatctggtgcagaagaacgt
atgaaaaaacaacatgagaaaaatataagggcattagccaggacagctgcacaggcggtt
agaaaaagatggtcgctagccgaaaaggcatatagggttttgaagaaggatgaagaagag
gaattaaagaaaatacaaggtaaaaaacatttaagtgaaatgctagagaaaagtactaaa
ttactaggtgctcaattaaataaaaaaagtctggaactttcagatgatgatctttctttg
tcatccgatttttctacaaacgatgacaagaagttgtcctctgtagatgatatgaatata
gatactaccagtgatgaggatagggaaggtgctggtagccaatatttaactggaactata
aaggatgccaacgtttctctggatgaaaatagagagagaaaaggtgaatatgatgattct
aaacttagtgtcgagcaattgaaagaaaaatacgctaaattagacgaggtaaacatttta
caagacacagatatatcaattggaccacaacctttagtaaacgaaaattctgtaaatata
ggtgctttagtatctaaaagtgcaaaagaagaaataaattacaatgctagtcaaagcgac
gttgacagtgaaagcgattctataactacagaatatagttcttcctcttcttcttcttct
tcttcttctgcttcttcttcttcagagggggaggaggaagaagaagaagaagagaatatt
caagggaaaccaaagacccaattaggcttgttactaaataataatgaacttgaaatagag
gagaaagatacgagttttgatgcagattatgaagaaggtaatgtaacatctaattattca
gatgagaagggagattttatagaaaataaggaggaatatgagggtgaacaattgaaagtt
gttgatgttccggttcccccgttattaaagggaaccctaagaagttatcaaaaacaagga
ttgaattggttagcgtcattgtataacaataacacaaacggtattttagcagatgagatg
ggattaggaaaaaccatacaaacaatatccttattgtgttggttagcatgtgaaaagcaa
aactgggggccacatttaattgtggtccctacaagtgttttattaaattgggaaatggaa
tttaaaaggtttgcgccaggtttcaaagtattggcatattatgggtcgccccaagaacgt
aaaagaaaaaggaaaggttggaacaatcctaattcttttcatgtttgtattacctcatat
caattggtagttactgaccaacacagttttaaacggaaaacatggcagtatatgatatta
gatgaagcacacaatatcaaaaattttagatctacccgttggcaagctttgctaaacttt
aatacagaaagaagattgcttttaactggtacgccattacaaaacaatttagcagagctt
tggtcactattgtattttttaatgcccaagactattatgacagatggtactgtaaagggg
tttgcagatctagaagctttccaaaattggtttgggaatccagtcaataagatcatggag
cttggaaccaagaacaacgacagtggtgacaaatataatctgctaaacagtactgatgag
gaaacacaaaaaacagtggataagttgcatcaagttttgaggccgtatctattaagaaga
ttgaaggcggacgttgaaaaacaaatgccagctaaatatgagcatataatctattgcaaa
ttatcgaaaagacagcgatatttgtatgatgattttatggctagagcacaaaccaaggaa
actttggccagtggaaattttatgtctattattaattgcttaatgcagttaagaaaggtt
tgtaatcacccagatctatttgaagtaaggccagttgtcacatcgtttgccatttcaaaa
tctatataccatgattatttatatttggcaaataaaatgattatttctgatagcaacaac
aaactggatttgaactttttgaatttaaagtttttagacattaataatgagcaaaagaac
acgtcgctcaagtacgctgaaatatcgaaactatctgtgcttgatagttttgttaaggaa
gtggcgaaattgcggaaagaggctgatagagacaactccatgacaacaatgtttgatttt
caagacattgaagagtactacaaacgttataatcggttgcaaattgtttctgaaatcaat
aaattgcaactattaaattatattaatcaacatagatgtaaacagggcaaaccgaaattc
ggtttgaatttaatcaagttacttaaggttcccagcagctctagtgtattgtcaacaaag
ttggttaaaagttacgatgattttattttaaaagaaaagggtattatcaaaaaatttgcc
tttttgacacccaaaatagtggttttagaaaacaaggaaatatttatgggcattgatcct
atttcagtatatttaaaaggttatgaaaaaaaaattattagagatcaattactattgaac
gataatgtgaacaaaaaccctgttgttgcctttaatcattttgttcaaactaaattaagt
attgaatttccagataaatcattattacaatatgattgtggcaagttgcagaaattgacc
actctattagctgatttgaagaaaaatggacatagagtactaatttttactcaaatgacc
aaagtattggatattttggaacaatttttgaattatcatgggtacttgtatttaagattg
gatggtgctactaagattgaagatagacagatattaacggaaaggtttaacaatgactcg
aagataacagtctttattttgtcaagtaggtctggtgggcttggtataaatttgaccggt
gcagatactgttatattttatgatagtgattggaaccctgcaatggacaaacagtgccaa
gataggtgccatagaattggacaaacaagagatgtccatatctaccgatttgttagtgaa
catacgattgagagtaatattttagacaaggccaaccaaaagagacgattagataatgtt
gttattcaacagggggattttacgacagattatttttctaaattgacagtcaaagatttg
ttggggtcagaagcacccgtggaattgaaagacgataggttactgattgaagatagtagt
gagaataaaaagattaacattagcaatgtgaatgattctggtaacgaaaatgtcaagaag
agtggtaattttagcaaattgttaagccaagtagaggatgaagatgacgctagggcagca
aaaatggcgttgcaagaagaagaaaatgttgatacggaagattttaaggaatattctgtg
gataataatagtggtaaaatagacgatattaaaggagataattatgatgaagatgaatat
gagggtactaaacatgtagaagagtatatgatcaaatttatagccaatggttattattat
gattga
DBGET
integrated database retrieval system