Saccharomycodes ludwigii: SCDLUD_004987
Help
Entry
SCDLUD_004987 CDS
T08289
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K13339
peroxin-6
Organism
slud
Saccharomycodes ludwigii
Pathway
slud04146
Peroxisome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
slud00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04146 Peroxisome
SCDLUD_004987
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
slud04131
]
SCDLUD_004987
Membrane trafficking [BR:
slud04131
]
Autophagy
Pexophagy
Other pexophagy associated proteins
SCDLUD_004987
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA
PEX6_4th
AAA_lid_3
Vps4_C
Parvo_NS1
AAA_16
RuvB_N
RNA_helicase
nSTAND3
AAA_22
AAA_28
AAA_2
AAA_7
TIP49
AAA_14
AAA_5
IstB_IS21
Mg_chelatase
ATPase
AAA_25
TsaE
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
70110304
NCBI-ProteinID:
XP_045932598
LinkDB
All DBs
Position
VII:complement(62825..65836)
Genome browser
AA seq
1003 aa
AA seq
DB search
MKKCTLSFVEDTYSFDDDNIQSPFCYVSQNIFQYLKDQETSTNISSPLCHLFFPNFISYD
LSPKLYYYKLNAQLSDNHVEVISHNPGSMTLKVCYISSVNNAPVVLNQININVNSILFTE
LLKLENQQEQLEFIRQKGQLYDGKIIHENSFICNQWCKITKCYPYHQGIFNINNTKIVLL
NGLHENVQLNQFVTSDKEYNIKPLPVKIQKQWLYTKDSEHHDTREDDSILAFADESVFLK
LQISNGSLVELFFGHNSNIDNNYSKICKLIILPKPNELITELDSNTIFVPPHIFIHSIKT
NNNSISVKPLKYLHNLRGNFTKASSIKLSRVASILNSQKLYQSLIQKELTDYFLEKSRLL
SIGDYIPVLFDSRKCLFKYFPTKKLFSGGVEGGEEEEEEEKEEEEKCRDSLVWFQVIESS
VSNNTIGDKFFLVDQYSEIVIENYVSYVSIPRSICNYIEYYKLPKAIKLSDDIFSEYSNL
KKILGTKLNTKILIYSSTNSVGKYTTILTSCLDLGLNILDIDCLELGQGQPTNKIIGMIK
AKIDPVLNYCHKGSSVLVFKHLECIIRDDAHDETAKKFNISFLKLLSDYSKMATIILTTN
KLESMAPIRSSINFEIELGVPNEKQRMEIFKFYLKNLELDYSKIATQSAGLTPIDIKAIA
TRSFSMETDSTTLDLVLKNINKARDEFSESIGAPKIPNVTWEDVGGLDMVKGEIMDTIDM
PLRYPELFGSGMKRRSGILFYGPPGTGKTLLAKAIATNFSLNFFSVKGPELLNMYIGESE
ANVRRVFQKARDAKPCVIFFDELDSVAPKRGNQGDSGGVMDRIVSQLLAELDGANGDGGG
VFVVGATNRPDLLDEALLRPGRFDKLLYLGISDTNEKQCNIIKALTRKFAISEDTDLLEV
AANCPFTYTGADFYALCSDAMLNAMTRVAKDIDLKLDKYNKEENDNVKKPVSLKFWFDNV
ANDYDIKVVVTMEDFIKAQKNLKPSVSAEELEHYLKIRANFEN
NT seq
3012 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatgtacattaagttttgtagaagatacttattcttttgatgatgacaatatt
cagagtcctttttgttacgtatctcagaatatattccaatacttaaaagaccaagagact
tctaccaatattagttctcccctatgccaccttttctttccaaactttatatcatatgat
ttatcacccaaattatactattataaattgaatgcacaactttcagataaccacgtggaa
gttattagccataatcctggttctatgaccttaaaagtctgctatatttcctctgtaaac
aatgcaccggtagttttaaatcaaataaatatcaatgtgaattcgattttattcactgaa
ttattaaaattggaaaatcaacaagaacaattggagtttattaggcaaaaaggtcaatta
tatgatggtaaaattattcatgaaaacagctttatttgtaatcaatggtgtaaaatcaca
aaatgctatccgtatcatcaaggtattttcaacataaacaacactaaaattgttttatta
aatgggctacatgaaaatgtgcagttgaaccagtttgtcacaagtgataaagaatacaat
ataaaacctttaccagtcaaaatacaaaagcaatggctatacacaaaagattctgagcat
catgatacacgtgaagatgactcaattttagcctttgcagacgaatctgtgtttcttaag
ttacaaataagcaatggatcgcttgtagaacttttctttggtcataacagcaatattgat
aataactatagtaaaatttgtaaattgattatactgcccaaacctaatgagttaattaca
gaattagattccaatacaatttttgtcccacctcatatatttatacatagtattaagacc
aacaacaacagtattagcgttaaaccactgaaatatttacacaatttgagaggtaatttt
acaaaagcttcttcaatcaagttatcacgtgtagctagtatattaaattctcaaaaattg
tatcaaagtttaattcagaaggaattgactgattattttttggaaaaatccagattatta
tctattggtgactatattcctgtattatttgattcaagaaaatgtcttttcaaatatttc
cccacaaaaaaacttttttctggaggagtggaaggaggagaagaagaagaagaagaagaa
aaagaggaagaggaaaagtgtcgtgatagtttagtctggttccaagttattgaaagcagt
gttagtaataatactattggtgacaaatttttcttggttgatcaatattccgaaattgtg
atagaaaactatgtttcatacgtatctattccaagatcaatttgtaattacattgaatat
tataagttaccaaaggctattaaactatctgatgatatcttttcagaatactccaactta
aagaaaattttaggcacaaaattaaatacaaaaattttaatatattcaagtactaacagt
gttggtaaatataccacaattttgactagctgtttggatcttggcttaaatatattggat
atagactgtttagaacttggacaagggcaaccaacaaataaaattattggaatgattaag
gccaaaatagaccctgttttaaattattgtcataaaggttcaagtgttttagtttttaaa
catttggaatgtataatcagagacgatgcccatgatgaaaccgccaagaaatttaatatt
tcatttttaaaattgctttccgattatagtaaaatggcaaccatcatattaaccaccaat
aaacttgaatccatggcaccaattagatcgtccattaattttgaaatcgaattaggtgtt
cctaacgaaaaacaaagaatggagatttttaaattttatttaaaaaatcttgagctagat
tatagcaagatagcaacacaatctgccgggttaaccccaattgatatcaaggcaatagca
actagatctttttcaatggaaacggattcaaccactctagatttggtattgaaaaatatc
aacaaagcaagagacgagttttctgagtctattggtgcacccaagattcctaatgtcact
tgggaggatgttggtggattagacatggttaagggtgaaattatggacactattgacatg
ccattaagatatcctgaattatttggttcgggaatgaaaagaagaagtggcattttgttt
tacggtccaccaggcactggcaaaacattattggcaaaagccattgcaaccaatttttca
ttaaattttttcagtgtcaaaggcccagaattattaaatatgtacattggggagagtgaa
gctaatgtcagaagagtttttcaaaaagctagagatgccaaaccatgcgttatatttttt
gacgaactagatagtgttgctcccaaaagaggcaatcagggtgattctggaggtgttatg
gatcgtatcgtttcacaattattagcagagttggatggtgctaatggagacggtggcggt
gtatttgttgttggtgctaccaataggcctgatctattagacgaagccttgttgagaccg
ggaagatttgataaattgttgtatttgggaatcagtgataccaacgaaaaacaatgtaat
attataaaagctttaactagaaaatttgctattagtgaagataccgatttgttggaagta
gctgccaattgcccatttacttacactggtgctgatttttatgcgttatgttctgatgca
atgctaaacgctatgacaagggtagccaaagacattgatttgaaattagataaatataac
aaggaagagaatgataatgttaaaaaacctgtttctttaaaattttggtttgataatgtt
gcaaatgattatgatatcaaagtggtggtcacaatggaggattttataaaggcacagaag
aatttaaagcctagtgtgtctgcagaagagttggaacattatttaaaaataagagcaaat
tttgagaactaa
DBGET
integrated database retrieval system