Saccharomycodes ludwigii: SCDLUD_005085
Help
Entry
SCDLUD_005085 CDS
T08289
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K17267
coatomer subunit gamma
Organism
slud
Saccharomycodes ludwigii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
slud00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
slud04131
]
SCDLUD_005085
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
slud04147
]
SCDLUD_005085
Membrane trafficking [BR:
slud04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Retrieval pathways
Coat protein complex I (COP-I)
SCDLUD_005085
Exosome [BR:
slud04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of haemopoietic cells (B-cell, T-cell, DC-cell, reticulocyte, and mast cell)
SCDLUD_005085
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Adaptin_N
COP-gamma_platf
Coatomer_g_Cpla
Cnd1
Coatomer_b_Cpla
TPR_IPO5
EVI5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
70110402
NCBI-ProteinID:
XP_045932686
LinkDB
All DBs
Position
VII:<234221..>237106
Genome browser
AA seq
961 aa
AA seq
DB search
MSAYKKKNENDISSSSSGSEVPDKMSIYQDCLKTFNESPISPKKCRLLLAKLLNILTLEG
YKKSFTTSEATTLFFSVSKLFQHQNNDSLRQMVYLVIKELSSISEDTLMVTSSIMKDIQS
GDNLIKPNAVRTLTRVLDETTAFSAERLFKNCIVSPDSSVCSASLVSSYHVLPIAETTVK
RYGTEAMQAIFTPKKVSTYNNNSSSSSSNNNGDEGGSKFYPQSSYMSEYHAFGLTYKLKN
NDKIALMKLIQNDFNSLKNQFLKVEWIKVVGELIYKDSSLFSNFEQLLYNGLYQSYEAVK
LEIAKLITTLIVDNIAPVNDQLFGSVLEVLKQFLVVPRTSTRFASVRLLNKLAMVAPTKI
SVCNPELESLINDKNRNISTFAITTLLKTGNSSNIASLISTINKFTHDVSDDFKIIIVDA
IRTLSIKFPNEWNVILQFLIDSLKNSDGGIKFKNSVVDCLIDLVQFVPSSKESALENLCD
FIEDCEYSEVLVRVLHILGDYGPTASKPSLYVRHIYNRVTLENSIIRSAAVVALSKFVII
NGGNNASADPTLAKNIISLLENIKENDVDDEVRDRSAVALECIKENHPDLIKSSKTFDLS
VLESKLTQYVTNHEFDSPFDISSVPQYSEDERRALELKRKQDEINDKNSGDFSSAGKKSK
KTDASTKNNGSLGASSSNTTFEQRAKIIHEYTEKLYEASIIPSDGSSKFGKLLNSCGPVP
LTEPESEFVISAIKHIFQNYIVLQYNIENTLTDSAVENVQVEVNTNTNKTSNLVFDSSTI
IDQLMPGANEQCYAIFEKTSESIKEEEFSNILTFVTKEIDPATQQPFAGDEGFDDEYEFD
PLLLTCGDYLQPLFTADFRQDLSKLSFGDSCVYNIKENITLQQAVDKIVLNTNCLPLENT
QFIMDESEKHILKLFGKSCLNDDIKIGILIKMIKSSKGIALKAEARSNDQELCSDLVNSL
I
NT seq
2886 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagcatataaaaagaaaaatgaaaatgacatttcatcttcatcttctggatctgaa
gttccagataaaatgtcaatttaccaggattgtttgaaaacattcaacgaatctccaatt
agtcctaaaaaatgtcgtctattactagctaaattacttaatattttgactttagaaggt
tataagaaaagttttactactagtgaagccacaacattatttttttcagtttctaaatta
tttcaacaccaaaataatgacagtttaagacaaatggtttatctagtaattaaagagcta
tcttctattagtgaagacactttaatggtcacctcttccattatgaaagatattcaaagt
ggcgataatttgattaagcctaatgctgtcagaactttaactcgtgttttagacgaaacc
actgcttttagcgcagaaagattatttaaaaattgtatcgtgtcacccgattctagtgtt
tgttcagcttctttagtttcatcttaccacgtcttgccaatagccgaaactactgttaaa
agatatggtaccgaagctatgcaagctatttttacccctaaaaaggtatccacctacaac
aacaacagcagcagcagcagtagcaacaacaatggtgatgagggtggctcgaaattctac
ccacaatcttcctatatgtctgaatatcatgcttttgggttaacttataaattgaagaat
aatgataaaattgcattgatgaaattgatccaaaatgatttcaactctttgaaaaatcaa
tttttgaaagtcgaatggattaaagtcgttggtgaattaatttataaagattcaagctta
tttagtaattttgaacagttattatacaacgggctataccaaagttatgaggctgttaag
ttggaaattgctaaattaatcaccacgttaatcgttgataatattgctccagtcaacgat
caattatttggttctgttttggaagttttgaaacagtttttggttgttccacggacttcc
accagatttgcctctgtcagattattgaataaactggctatggttgcaccaactaaaatc
agtgtttgtaatcctgaattggaaagtctaatcaatgataaaaacaggaacatttccact
tttgctatcactactttgttgaaaacaggcaattcctcaaacattgcatctttgatttcc
accatcaataaatttacacatgacgttagcgatgatttcaaaatcattattgttgacgct
atccgtacgttgtcaattaaatttcccaatgagtggaatgttattttacaatttttgatc
gattccttaaagaacagcgatggtggcatcaaatttaaaaacagtgttgtggattgttta
atcgatttggttcaatttgttccaagctccaaagagtctgccctggaaaacttgtgtgat
tttattgaagattgtgaatatagcgaggttttagttcgtgttttacatattttgggtgat
tatggtccaaccgcttccaaaccttctttatacgttagacatatctataacagagtcact
ttagaaaactccattattagatcagctgctgttgttgccttgtctaaatttgttattatc
aacggtggcaacaatgcttcagcagacccaactttggccaagaacattatttccttgttg
gaaaacatcaaggagaatgatgttgatgatgaagttagagatagaagtgctgttgcttta
gaatgtattaaagaaaatcatcctgatttgattaagtcatccaagacttttgatttgagc
gttttggaaagtaaattgactcaatatgttacaaatcacgaatttgattcaccatttgac
atctcttctgttccacaatacagtgaagatgaaagaagagctttggaattgaaacgtaaa
caggacgaaattaatgataaaaacagtggcgatttttcctctgccggcaaaaaatccaaa
aaaacagatgcctccactaagaacaatgggtcattgggtgcctctagttccaacactact
tttgaacagagggcaaaaattattcacgagtacaccgaaaaattatacgaggcttccatt
attccatcagatggttcgtctaaatttggtaaattgttgaactcttgtggccctgtacca
ttaactgaaccagaatctgaatttgttatttctgccatcaagcatatttttcaaaactac
attgtgctacaatataatattgaaaatactttaacggattctgccgtggaaaatgtccaa
gtagaagtcaatacgaacacaaataaaacctcaaatttggtatttgattcctcaactatt
attgatcaattaatgccaggtgctaatgaacaatgttatgctatctttgaaaaaacctct
gaatcaattaaagaggaagaattcagtaatatcctgacctttgtcacgaaggagattgat
ccagcaacccaacaaccatttgctggcgatgagggattcgatgatgaatatgaatttgat
ccattgttgttgacttgtggtgattacttacagccattatttactgctgactttagacaa
gatttaagtaaattgtcctttggagatagttgtgtttataacatcaaggaaaatattacc
ttacaacaagccgtcgataagatcgttttgaataccaattgtctgccattagaaaatacc
cagtttatcatggatgaaagtgaaaagcatattttgaaattgttcggtaaaagttgtttg
aatgatgatattaaaatcggtattttgattaaaatgattaagagcagtaaaggtattgct
ttgaaggctgaggctagatctaacgatcaagaattgtgtagtgatttagttaactctttg
atttga
DBGET
integrated database retrieval system
