Saccharomycodes ludwigii: SCDLUD_005096
Help
Entry
SCDLUD_005096 CDS
T08289
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K08735
DNA mismatch repair protein MSH2
Organism
slud
Saccharomycodes ludwigii
Pathway
slud03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
slud00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
SCDLUD_005096
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
slud03400
]
SCDLUD_005096
DNA repair and recombination proteins [BR:
slud03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
SCDLUD_005096
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_IV
MutS_II
MutS_I
PhoU
AAA_27
ABC_tran_CTD
DUF3410
RhoGAP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
70110413
NCBI-ProteinID:
XP_045932694
LinkDB
All DBs
Position
VII:254299..257148
Genome browser
AA seq
949 aa
AA seq
DB search
MTSIRPELRFTDIAEERGFYKRFLTLPEKPENIIRIADRGEYYTIVGEDAQFAAQQVYHT
SSVLKKANCLSGNENSEPLTYVTMSQQVCLQFLKMCLFEYGYKIEIYDKSWKIIKRASPG
NIEQIDDLLSVSIDSSIVLCSLKFQNNLNEGNSTIGCSFVDSSIYKLGMIELLDNEVYSN
LESLIIQLGAKECLVPDLRENISQKKELEKITRVIDRCGCVVTFVKPSDFTDKDVDQDIV
RLVGDELTLALPKYSKLCLSACNALLIYLNLMGETKNYGKYELIEHSLNQYMKLDASSLR
ALNIFPQGPSQSIATAGSSNHTKINSVFQLLNKCKTHSGVRLLHEWLKQPLLDLDELNKR
HDLVEFLIDQLELRQILRDNYLPHVPDVRRITKKLNMKANLDEVLKLYTFVDKLPMIAST
IKEYVADCGTNHTANIILEEWYGPLEKEIEPLSNFKKMVEDTIDLDHYEKYNEAIINCEA
EEQLSLCKGKLDQHLAEVEDLHSSVAEDLGTDDKRLKLEKHHLYGWCFRLTRNDAKVLRG
KTEHRYYELSTVKAGVYFTTKDLERISKEIEQLEQQYDALQKELVAEVVAVALTYTPVLE
RISMILANVDVLCSFAHVSSYAPIPYVRPTMLSMTEQDTRKLILQNSRHPVLEVQDDVSF
ISNDVKMERGTRDFLIITGPNMGGKSTYIRQIGVIVLMAQVGCFVPCDDAQISIMDSILC
RVGAGDSQFKGVSTFMVEMLETSSILKNSTSNSLVIIDELGRGTSTYDGFGLAWSISEFI
ATKIKCFTLFATHFHELTALAERLPNIKNMQVLAHIDTAVGGESAKNKDDEITLLYKVED
GISDQSFGINVAEVVNFPTKIIQMAKRKASELEELKEATNEDDVSKKHCTKHEIAHGTAS
LKNILREWKKKVEQTENLDNMKAIENLLRDVYKVAEDDKYIRELIRELE
NT seq
2850 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacatccattagacccgagttgagattcactgatatcgctgaagaaagaggattttat
aaaagatttcttactttaccggaaaaaccagaaaatatcattaggattgcagacagaggt
gaatattacaccatcgtgggtgaagatgctcaattcgcagcacaacaggtttatcacacc
agttctgttttaaaaaaagccaactgcttatctggtaacgaaaacagtgaaccattaacc
tatgtaaccatgtcacaacaagtttgtctacaatttttaaaaatgtgtttattcgaatat
ggttacaagattgaaatatatgataaaagctggaaaattattaaacgtgcctcgccaggt
aatattgaacaaatcgatgatttattatcggtttctattgacagttccattgttttatgc
agtttaaaatttcaaaataatttaaatgagggaaattctacgattggctgctcttttgtc
gatagtagcatctataaacttggaatgattgaattactcgacaatgaggtctattctaat
ttagaaagcttgattatccagttaggtgcaaaagaatgtttagtgccagacttaagggaa
aacattagtcaaaaaaaggaactagaaaagattacaagggttatcgatcgctgtgggtgc
gttgttacttttgtcaaaccttccgactttacggataaggatgttgatcaggatatagta
agattagttggtgatgaattgacattggcactacctaaatattccaaattatgtctaagt
gcttgtaatgctctattaatttatttaaatttaatgggagaaactaaaaattacggaaaa
tatgaattaattgaacactctttgaaccaatatatgaaactagatgccagttccctaaga
gctttaaatattttcccacaaggtccttctcaatcaattgccactgcgggaagtagtaac
cacaccaagataaatagtgtatttcaattactaaataagtgtaaaacacattccggagtc
agattgttacacgaatggttaaaacaacccttgttggacctggatgaattgaataaaaga
cacgatttggtcgaatttttaatcgatcaattagaattaagacaaatattacgagacaat
tatttaccacatgtgccggacgttagaagaattaccaaaaaattaaatatgaaggccaat
ttagatgaagtattaaaattgtacacctttgtggataaattacccatgattgcctcaact
atcaaagaatatgtagctgattgtggtaccaatcacactgctaatattattttagaggaa
tggtatggtcccttggaaaaggaaattgagcctctatcaaattttaaaaaaatggtagag
gacactatagacctagatcattatgaaaaatataacgaagctattatcaattgtgaggca
gaagaacagttatccttgtgcaagggaaagttagaccaacatttagccgaggtcgaagac
ctccattcttctgtagctgaagatttgggtacggatgacaagagattgaagctagaaaaa
caccacttgtatggttggtgtttcagattaacccgtaatgatgccaaagttttacgtgga
aaaactgaacatcgctattacgaattatccactgtgaaagcaggtgtctatttcaccacc
aaagacttggaaaggatttctaaagaaattgaacaattagaacagcaatatgatgcttta
caaaaagaattagtcgctgaggttgtcgctgttgctttaacatatacacctgtattggag
agaatatcaatgattttggccaatgtcgatgtgctatgctcttttgcacatgtttcatcc
tatgcgcctatcccctatgtccgccctactatgctatctatgacagagcaagatactaga
aaattgattttgcaaaattcccgccaccctgtgttggaagttcaagatgatgtttcattt
atttccaacgatgttaaaatggaacgcggaaccagagattttttgattattaccggtcca
aatatgggtggtaaatccacgtatattaggcagattggtgtgattgtattaatggcccag
gttggatgttttgttccctgtgatgatgctcaaatctctattatggattccatcctatgc
agagttggtgccggtgattctcaatttaagggggtatctacttttatggttgaaatgtta
gaaacttcatctatcttgaaaaattctacatctaactcgttggttataattgatgaatta
ggtcgtggtaccagtacttatgatggttttggtcttgcttggagtattagtgaatttatt
gccactaaaattaaatgcttcactttatttgcgacacatttccacgagttaacagcatta
gctgaacgattaccgaatatcaaaaacatgcaggttttggcccatattgatactgcagtt
ggaggggaaagcgcaaagaataaagacgatgaaattacgttattatataaagtggaagat
ggtatatcagatcaatcttttggtatcaatgttgccgaggttgtcaattttccaacaaaa
atcattcaaatggcaaaacgaaaagcaagtgagttggaagaattaaaagaggcaacaaat
gaagatgatgtgagtaagaaacattgcactaagcatgagatcgcccatggtactgccagt
ttaaaaaatatattacgagaatggaaaaaaaaagtggaacaaactgaaaatttagataac
atgaaagccattgaaaacttacttcgtgatgtttataaagttgccgaagacgataaatat
atccgtgagttaatacgggaacttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system