Parathermosynechococcus lividus: BRW62_10600
Help
Entry
BRW62_10600 CDS
T05303
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
slw
Parathermosynechococcus lividus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHAT
TPS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATS19113
UniProt:
A0A2D2Q3N3
LinkDB
All DBs
Position
complement(2248058..2253265)
Genome browser
AA seq
1735 aa
AA seq
DB search
MFTSTVAGQITPAPNATGTTVTQTGQQFDIGGGTLSGNGRNLFHIFRDFNVGSGQTANFL
SNPQIRNILAGVNGGNASYINGLLQISGGNSNLYLLNPAGIVFGANARLNLPAAFHASTA
QRVHFDGGVFDLNGNNTYSQLNSNPTGFEFLNKGIIINEGHLAVGSGQTLSLMAHHVINT
GSLVAPAGTIHLIAVPESGMVRVSQEGMLLSLEIPQERLPADGIITAIDLPNLLTGGGTY
PTVNSVIQHPDGTISLVHDPAKVPMGSSTAVVGGNVSVTNPNGIGGQITVTGQNTALLNA
NLNASGQFGGGTILIGGDYLGGTTGTHRLDSSFNAQNLFINRGSIIAADALSDGNGGTII
AWADNATQFYGTITARGGQLRGDGGFVETSGRNVLNAFGVVDASAINGKAGTWLLDPFDV
TIVDSNVVNNGGYSGGDPDIFTPIANATVGNQTIESRLSGGTNVEITGSNITVDAPIDAF
SGSSVTLRFNSGNNITLNAPINLEASSGNTTTVSLQGNGLISQSSSGTITADILRLSGNG
TFNLTAANDVSELAGTVGGAISFVNTNSVTINSLTGNLSAGGNITLQSQTGSIFVAPSSS
INYTGSGVGSITLKAETLIGLSNASIQATSGSANILLSSNSSGINIGNSILDSNGGSITI
NGTGGGSAAVLIQLSSLLSQGGNINITGTGSSTGVLISDSTLNAGGGHITLTGQGSDGGW
SSRGIEMTDAIVTTTGSGNIEIFGTGGDPIPEGLSQGIEITDSSITNASGNILLEGRSGT
GNDFFLNRGVSISSEFDGTMLISSSTGNVQILGIAKPDGTGVEISSGLPSTTIIQAGGSG
NLLIDGRSSESGTGIEINSYDDGVARFQVENGTLTFAALGSTSLWADNPANIFIASNGSG
RLVFQPVLASTTVGVGNGATGSLLIDQTLLDRISGGFSLVTIGHPSGTGLMDVRPLSLSY
NLALQTPGAGSAGIQFNGSGVTTLNGRNLTLNSGGGVSQGSHAIAANTLQLLGQGNVTLS
NPNNQLQALSGNVNGGVTLSNQGGLAITSFNNGVNGLTTGLSTNGNPFIVNLATGNLTQT
APLQVGSLGATLQNGSVTLLNPSNQIGTVAAQLNSSSDFQLVNNGTLTVGTVNPTGITGR
TIFLQTLTGNIVLNAPITAFGSGDAIVLVAGNNFINNFGSTVFTNPNGRWLVYSTDPSLD
VKGGLTGAEQFDTTYPGAPLFGGSGFLYRVSAPAPPSEPPAPPSEPPAPPSEPPAPPSQS
EIDEDLGKIFFGEEVQNPEFPETVAQVLYFPGVDIIRQQIANAFDQGDYATAVKLLEQLY
TFEFSEYFGELFNTPGQEGLQNLDIAQIQALLARMAAETGQTPALTYVFWRPGQLDIFIV
TPTGEPIYQAVRVSQEELQRVISAFNREVRDPAKTNTDSYLPFAQQLYQWILGSVDPELQ
ARGITTLVFAMDQGLRGLPIAALHTGSNLVSSTVTDVPMGPNGQFLVERYNLGLIPSINL
VDTRYQPLQNAQILAMGASEFQKQSPLPAVPIELRTVTQLVGRGTEFLNEQFTVLNLETQ
RRRSQFPILHLATHAEFNPGKPDNSYIQFWDSQLSIAQLRQLRLFRPPTELMTLSACRTA
VGSREAELGFAGLALQAGVKTSVASLWYVSDEGTLALMTEFYKHLGSAPIKAEALRQAQI
AMIKGAVVIEGNSLRSTGVRGELAIPLPEGLATNGTRQLSHPYFWAAFTTIGSPW
NT seq
5208 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcacaagcacagtagccggtcaaatcacccctgcccccaatgctaccggcaccacc
gtcacccaaaccggtcaacaatttgatattgggggtggcaccctatccggcaacggcaga
aacctctttcacatctttcgggactttaacgttggcagtggccaaaccgctaacttcctc
tcgaatcctcaaattcgcaatattctggccggagtcaatggcggcaatgccagttacatc
aacggccttctgcaaattagcggtggcaacagcaacctgtacttgctcaaccctgccgga
atcgtctttggcgccaatgcccgcctcaacctgcccgctgcctttcatgccagcacagcg
cagcgggtgcatttcgatggtggtgtgtttgatctcaacggtaataacacttacagtcaa
ctcaacagcaaccccactggctttgaattcctcaacaaaggcatcatcatcaacgaaggt
catctggccgtcggcagtggccaaaccctgagtttaatggcgcaccacgtcattaacacc
ggtagccttgttgcccctgccgggacgattcacctcattgccgttcccgaaagtggcatg
gtgcgggtctcacaagaggggatgctcctcagcctcgaaattcctcaagagcgactcccc
gcagacggcatcattaccgccatagatctacccaatctactcaccggcggtggcacctat
cccaccgtcaacagcgtcatccagcaccctgatggcaccattagtctcgtgcacgaccct
gccaaggtgccaatgggcagcagcaccgccgtggtggggggtaatgtatccgttaccaac
cccaacggcatcggtgggcaaatcaccgtcacggggcaaaacaccgctctcctgaatgcc
aacctcaatgcctccggccagtttggtggtggcacaattctgatcggcggcgactatcta
gggggcacaacaggcacccatcgccttgatagcagcttcaatgctcaaaacctttttatt
aaccgtggcagcatcattgcagcggatgccctcagcgatggcaatggcggtaccatcatt
gcctgggccgataatgccacccagttctatggcaccattacggcgcgtggtggccaactc
cgaggcgatggtggctttgtagaaacctccgggcgcaacgtcctgaatgcctttggcgtt
gtggatgccagcgctatcaatggcaaagctggaacatggctgcttgatccctttgatgtc
accatcgttgatagtaatgtcgttaataatggtggttattctggtggcgatcctgatatt
tttacccccattgccaatgcaacggtcggcaatcaaacaattgaaagtcggctctctggg
ggtacaaatgttgaaatcactggcagcaatattacggtcgatgcacctatagatgcgttc
tcaggctcctctgttacgcttcgctttaattctggcaacaatattaccctcaatgcccca
attaacctagaagcttcgtctggcaacacaacaactgttagtttgcaaggaaatggcctc
atcagtcaaagtagtagcggcacaatcactgcagatattttaaggctctctggcaatgga
acctttaacttaactgcagccaatgatgtgtctgaactagctggaacggttggtggagcc
atctcttttgtaaatacaaatagtgttaccattaactcgctgacaggaaatctatcggca
ggtggcaatattactcttcagtcccaaacaggatctatttttgtcgctccatcgtcatca
attaactacactggctcaggagtcggttcaattactttgaaagcggaaacgttgattgga
cttagcaacgccagtattcaagcaacatcaggatccgccaacattttactttcaagtaac
agtagtggaattaatatcggcaactcgatacttgattcaaacggggggagcattactatt
aatggtactggaggtggttcggcggcggttctgatccaactctccagtcttttatcacaa
ggagggaacattaacatcactggtactggtagtagcaccggtgttttgatttccgattca
accttaaatgctgggggtggtcatattaccctgactggtcagggctctgatggtggatgg
agtagccgtggtattgagatgacggatgccatagtgacaacaacaggcagtggcaatatt
gaaatattcggtacgggtggcgatcccatcccagaaggattgagtcaagggattgagatc
actgattcctccattacaaacgcatcgggaaatattttactagaggggcgctctggaact
ggaaatgatttctttttgaaccgaggggtgtcaatttccagtgaatttgatggaacgatg
ctaattagcagtagcactggcaatgttcagattctgggaatcgctaagccagatggaact
ggagttgaaatttcttctgggctaccctctacaaccattattcaggctggtggctctgga
aaccttttaattgatggccgcagtagcgaatctggaactggcattgaaattaattcctat
gacgatggtgttgctcgctttcaagtagagaatggaaccttaacctttgcggcgttaggt
agtacctctttgtgggctgacaatccagctaatatattcatcgcctctaatggcagcggt
cgtttagtctttcaacccgtgcttgccagtaccacagttggcgtgggaaatggtgcaacg
ggcagcttattgatcgatcagacactgctggatcgcattagtggtgggttttccctcgtg
accattggtcatcccagtggtactggcctaatggatgtgcgtcccttgagtttgagctat
aaccttgccttgcaaactcccggtgctggttccgctgggattcagtttaatggctctggg
gtcacaactctgaatgggcgcaacctaaccctcaacagtggcggcggtgtcagccaaggc
agtcatgccattgctgccaacaccctacaactgctcggccaaggcaacgtcaccctcagc
aaccccaataaccaactgcaagcactatcgggcaatgttaatggcggggtcaccctcagc
aaccaaggggggcttgctatcactagctttaataatggggtcaatggcctgacaactggc
ttgagcacgaacggtaaccctttcattgtaaatttagccactggcaaccttacccaaacg
gctccgctgcaagtggggagtttaggggcaaccctacaaaatggcagcgtcaccctccta
aaccccagtaaccaaatcggcacagttgctgctcagttaaacagttccagtgactttcag
ttggtgaacaacggcaccctcaccgttggtaccgtcaatcctacagggattacaggtcgc
actatttttctgcaaaccttgacgggtaacattgttctgaatgcaccgattaccgccttt
ggctctggagatgccattgtgctcgtggctggcaacaattttattaataattttggctca
acggtctttacgaaccccaatgggcgctggttggtctattccacagatcccagtcttgat
gtgaaaggcggccttacgggtgccgagcagtttgatacaacctacccaggtgctcccttg
tttggcggctcaggattcctgtaccgggtctctgctcccgcgccaccgtcagagcctccc
gcaccaccgtcagagcctcccgcaccaccgtcagagcctcccgcgccaccgtcccaatct
gaaatcgatgaagatctaggcaaaattttctttggcgaggaagtgcaaaatccggaattt
ccggaaacagttgcccaagtgctctattttccgggggttgacattattcgccagcaaatt
gccaatgcctttgatcaaggcgattatgcaacggcggttaagcttttggagcagctttat
acttttgagttcagtgagtattttggtgaactgtttaacacccctggtcaggaggggcta
caaaatcttgatattgctcaaattcaagcattgctagctcgaatggcggcagaaaccgga
caaactcccgccctcacgtatgttttttggcgacccggccaactggatatttttattgtg
acaccgacgggggaacccatttatcaggcggtgcgtgtctctcaggaggaactccagcgg
gtgatttctgcctttaaccgagaggtgcgggatccggctaaaacgaatacagactcctat
ttgccctttgcgcagcaactgtaccagtggattttgggcagtgtagatcctgaactgcaa
gctcgggggattactacgcttgtctttgcgatggatcaggggttgcgaggactgccgatc
gccgcgctgcacactggctctaacttagtgtcttctacggtgacggatgtacctatggga
cccaatggccagttcttagtggagcgctacaatctgggtctaattcccagcattaacctt
gtggatacccgctatcagccgctacaaaatgcgcaaattctggcgatgggagcgtctgaa
tttcaaaagcaaagtccactaccggcggttcccatcgagttacgcaccgttacccaactg
gtgggacggggtaccgaattccttaacgaacagtttacagttctaaatctagagacgcag
cgtcgccgtagtcaatttccaattttgcatctggccacccacgctgagtttaatccgggt
aaacccgacaattcctacatccagttttgggatagtcagctttcgatcgcccagctacgg
cagttacgcttgttccggccacctacagagctaatgaccctcagtgcttgtcgcacagcg
gtggggagccgcgaggccgagctagggtttgcagggttggcactgcaagcgggggtaaaa
acctccgtggccagtctgtggtacgtcagtgatgagggcaccctcgctttgatgacggag
ttttataagcacttgggttcggcacccattaaggcagaagccttgcgccaagctcaaatt
gccatgatcaaaggggcagttgtgatcgaaggtaatagtctgcggagtaccggtgtgcgg
ggggagctagccattcccctgccggaagggttagctactaatgggacacgccaactctcg
catccgtacttttgggcggcgtttacgaccattggtagtccttggtag
DBGET
integrated database retrieval system