Solanum lycopersicum (tomato): 101258056
Help
Entry
101258056 CDS
T02665
Name
(RefSeq) callose synthase 10
KO
K11000
callose synthase [EC:2.4.1.-]
Organism
sly
Solanum lycopersicum (tomato)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sly00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
sly01003
]
101258056
Glycosyltransferases [BR:
sly01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
101258056
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glucan_synthase
FKS1_dom1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101258056
NCBI-ProteinID:
XP_004236315
LinkDB
All DBs
Position
3:58953142..59007505
Genome browser
AA seq
1908 aa
AA seq
DB search
MARVYENWDRLVRATLRREQLRQTGPGHGRTPSGIAGSVPDSLQRTTNINAILQAADEIQ
DEDPNVARILCEQAYSMAQNLDPNSDGRGVLQFKTGLMSVIKQKLAKKEGARIDRNRDIE
RLWEFYQQYKRRHKVDDIQREEQKWRESGAVSANIGELGLRFFEMRKVFATLRAVVEVME
YLSKDAAPDGVGRLIKEELRRIKKSDATLSGELAPYNIVPLEAASLTNAIGFFPEVQGAI
SAVKYTEQFPQLPAGFDIPGQRHMDMFDLLEYAFGFQKDNVRNQRENVILIVANAQSRLG
IPVEADPKIDEKVITEVFLKVLDNYIKWCRYLRIRLVWNKLEAINRDRKLFLVSLYFCIW
GEAANVRFLPECICYIFHHMARELDAILDHGEARPAPCCLGEDQSVSFLEKIIRPIYDTI
VSEAARNNNGKAAHSKWRNYDDFNEYFWSPACFELGWPFNKESSFLRKPAKKGKRTGKST
FVEHRTFLHLYRSFHRLWIFLVVMFQALTIIAFSNAKINLDTFKKLLSVGPTFAVMNFIE
SFLDVILMFGAYSTARGMAISRIVIRFIWTAVSSAFVIYVYLKLLQERNTNKDPFYFRLY
ILVLGVYAGIRVVFALLTKLPACHKLSEMSDQSFFQFFKWIYQERYFVGRGLVEKTTDYL
RYSLYWLVIFACKFTFAYFLQIKPLVGPSKLIYQMPSLQYSWHDFISKNNNNILTIVSLW
APVVAIYLMDIHIWYTLLSAIVGGVMGARARLGEIRSIEMVHKRFESFPEAFVKNLVSPQ
TKRMPIDRQLSETSPENNKAYAALFSPFWNEIIKSLREEDYVSNREMDLLSMPSNTGSLR
LVQWPLFLLCSKILLAIDLALDCKDTQGDLWTRICKDEYMAYAVQECYYSIEKILYSLND
GEGRLWVERIYREINNSIMEGSLVMTLSLKKLPVVLSRFTALTGLLIRNETPELSKGAAK
AMYDLYDVVTHDLLSSDLREQLDTWNILARARNEGRLFSRVEWPRDPEIKEQVKRLHLLL
TVKDSAANIPKNLEARRRLEFFTNSLFMDMPPAKPVSEMMPFCVFTPYYSETVLYSSSDL
REENEDGISTLFYLQKIFPDEWENFLERIGRGDSGDNDIQEGSSDALDLRFWASYRGQTL
ARTVRGMMYYRRALMLQSYLERRSLGGVDGHSHTNSLTSQGFELSREARAQADLKFTYVI
SCQIYGQQKQRKAPEATDIGLLLRRNEALRVAFIHIEEITGDDGKVSKEFYSKLVKADAH
GKDQEIYSVKLPGDPKLGEGKPENQNHSIIFTRGEAVQTIDMNQDNYLEEAMKVRNLLEE
FHGKHGLRPPTILGVREHVFTGSVSSLAWFMSNQETSFVTLGQRVLAKPLKVRMHYGHPD
IFDRIFHITRGGISKASRVINISEDIYAGFNSTLRQGNITHHEYIQVGKGRDVGLNQIAL
FEGKVAGGNGEQVLSRDVYRIGQLFDFFRMLSFFFTTVGYYVCTMMTVLTVYIFLYGRAY
LAFSGLDEGISRRARFLGNTALNAALNAQFFVQIGIFTAVPMIMGFILELGLLKAVFSFI
TMQLQFCSVFFTFSLGTRTHYFGRTILHGGAKYRATGRGFVVRHIKFAENYRLYSRSHFV
KALEVALLLIVYLAYGYTNGSTTSFILLTLSSWFLVISWLFAPYIFNPSGFEWQKTVEDF
DDWTNWLMYKGGVGVKGDDSWESWWDEEQIHIQTLRGRILETILSLRFFLFQYGIVYKLQ
LTETDTSLAIYGFSWIVLVGVVMIFKIFTFSPKKSTNFQLMLRFIQGVTALGLVTALCLV
VAFTKLSVADLFASVLAFIATGWAVLCLAITWKRVVWSLGLWESVKEFARMYDAGMGIII
FAPVAILSWFPFVSTFQSRILFNQAFSRGLEISLILAGNKANVEPSTF
NT seq
5727 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgagggtttacgagaattgggataggcttgtacgagctacgttacggagggagcag
ctccggcagaccggtcccggacacggaaggacacctagtggtatagcaggttctgttccc
gattcgcttcagcggactaccaacattaatgcgattcttcaagcggctgatgagatacag
gatgaagatcccaatgtggccagaattttatgtgagcaggcatattcaatggcacaaaat
ttggatccaaacagcgatggtcgaggtgttcttcaatttaaaactggattaatgtccgtc
attaagcaaaaacttgccaaaaaggaaggggctcggatagaccgtaatcgtgacatcgaa
cgcttatgggaattttatcagcaatacaaaaggcggcacaaagtggatgatattcaaaga
gaggagcaaaaatggcgtgaatctggagcagttagtgctaatataggagagttgggacta
agattttttgaaatgagaaaggtattcgctaccttgagggctgtggttgaagtgatggag
tatctgagcaaagatgcagctcctgatggtgtgggaaggcttataaaggaggagttgaga
aggatcaagaaatctgatgctactttatcaggggaacttgcaccatacaatattgttcct
ctagaggcagcatcattgaccaatgctattggtttctttccagaggttcagggtgccata
tcagcagttaagtacactgagcagttccctcagctacccgctggttttgatattcctgga
cagcggcatatggatatgtttgatcttttagaatatgcctttggctttcagaaagacaat
gtaaggaaccagcgcgagaatgtcatcctcattgttgcaaatgcccagtcacgacttggg
atacctgttgaggcagatccaaaaatagatgagaaggttatcacagaggtgtttctgaag
gtcttggataattacatcaagtggtgtagatacttgcgcattcggcttgtgtggaataaa
ttagaagccattaacagggacagaaagctttttcttgtttcactctacttctgcatatgg
ggtgaagctgcaaatgtccgtttccttcctgaatgcatctgctatatattccaccatatg
gctagagaattagatgcaattttggatcatggagaagccaggccagccccctgttgtttg
ggcgaggatcagtctgtgtcttttttggaaaaaattattcgtccgatatatgatacaata
gtatcggaagctgcaagaaacaataatggaaaagctgcacactcaaagtggcggaattat
gatgattttaatgaatatttctggtcacctgcttgctttgagttgggttggccttttaat
aaggaatcctcattcttgcggaagcctgctaagaaaggcaaaaggactggaaaaagcacg
tttgttgagcatcggactttccttcacctgtaccgaagttttcatcgtttgtggatcttt
ttggttgtcatgttccaggcattaacaatcatagcctttagcaatgcgaaaatcaatctg
gacacttttaagaaactgcttagtgttggccctacatttgctgttatgaatttcatagag
agtttcttggatgtaattctcatgtttggggcctacagtactgcaagaggcatggctata
tcaaggattgttatcaggtttatctggaccgctgtgagctcagcatttgtaatatatgtc
tatctgaaacttctacaagaaaggaatacaaacaaagaccctttttatttccgtctttat
atcctggttctgggtgtttatgctggcatacgagtagtttttgcgctcctgacaaagcta
cctgcctgtcacaaactatcagaaatgtctgatcaatctttttttcaattttttaagtgg
atctatcaggagagatactttgttggccgtggtcttgttgagaaaacaactgattattta
cgatattctctctattggttggtgatatttgcttgcaagttcacctttgcttactttctt
cagatcaaaccgctagttggaccttctaagctcatataccaaatgccttccctgcagtac
tcctggcatgattttatatcaaagaacaacaataatattttgacaattgttagcctgtgg
gctcctgttgtagctatttatctcatggatattcacatatggtacactttattatctgca
attgttggtggtgtaatgggagcgcgggctcgcttaggggagatacgctcaattgagatg
gtgcataaacgttttgagagctttcctgaagcctttgtgaagaaccttgtgtcacctcag
acaaaaaggatgcctattgacagacagttatcagagacttctccagagaacaacaaagca
tatgcagctctcttttcaccattttggaatgagattattaaaagtttgcgtgaagaggat
tacgtcagtaacagggagatggatttgctttcaatgcctagcaacacaggaagtctacga
cttgtacaatggcctctgtttcttctctgcagtaagatattgctggctattgatttggct
ttggattgcaaagatacacaaggagatttgtggaccagaatatgcaaggatgagtacatg
gcctatgctgttcaggagtgctattacagtatcgagaaaatcttatactctctgaatgat
ggagagggaagactttgggttgaaagaatatatcgagaaatcaacaatagcataatggag
ggttcacttgtcatgaccttgtctctgaagaaacttccagtagtgttatcaagatttaca
gctttgactggacttttgattcgcaatgaaactcccgaactttcaaagggtgctgccaaa
gctatgtatgatctgtatgatgttgttactcatgatctgctgtcatctgatttaagggag
cagctcgatacttggaatatattagcaagggcaaggaatgagggacgactcttttccagg
gtggagtggcctagagatcctgaaattaaagaacaggtgaaaaggctgcatttacttctt
actgtgaaggattcggctgctaacattcctaagaatctcgaagcaagaagaagactggag
ttctttacaaattctttgtttatggacatgccacctgcaaagccagttagtgagatgatg
cctttctgtgtattcaccccatactatagtgagacagttctatatagttcctctgatctg
cgagaagaaaatgaagatggcatatctaccctgttctatctacagaaaatattcccagat
gagtgggagaatttcttggagcggattggtcgaggtgatagtggtgataatgacattcag
gaaggctccagtgatgccttggaccttcgattttgggcatcttaccggggccaaactcta
gctaggacagtgcgtggcatgatgtattacagaagggcattaatgctacaaagttacttg
gaaaggagatctctaggaggagtggatggtcattctcacacaaactctctcacaagtcaa
gggttcgaattatcacgagaagcacgggctcaagctgatttgaagtttacttatgtaatt
tcatgccaaatctatggccagcaaaaacagcgaaaggctcctgaggctacggatattggt
cttttattgcgaaggaatgaagcacttcgtgttgctttcatacacattgaggagatcaca
ggggatgatgggaaagtttcaaaggaattctattcgaagcttgttaaagctgatgcacat
gggaaagatcaggaaatatattcagttaagcttcctggagatccaaaacttggagaaggc
aaaccagaaaaccagaaccattctataatatttacccgtggggaagcagttcaaaccatt
gatatgaatcaggataactaccttgaggaagcaatgaaagtcagaaatcttctggaggaa
ttccatggtaaacatgggctccggccacccactattcttggtgttagggagcatgttttt
actggaagtgtgtcttcgctcgcttggtttatgtccaaccaggaaaccagttttgtcacc
ttgggccaacgtgttttagcaaagcctctcaaggttcgcatgcactatggacatcccgat
atcttcgatcggatctttcatatcacacggggtggcattagtaaagcatcacgtgttatc
aacataagtgaagacatctatgccggttttaattccactttaaggcagggtaatattacc
caccatgagtatattcaggttggaaagggaagagatgttggtttaaatcaaatagcttta
tttgaaggcaaggtagctggtggaaacggagagcaggttctgagcagggatgtgtacaga
attggccaactttttgatttctttaggatgctctcgttcttcttcaccacagttggttat
tatgtttgtacaatgatgacagtccttactgtgtatattttcttatatggaagagcatat
ctggctttctctggactagatgaaggaatatcgaggagagctagatttctgggtaacact
gcactaaatgccgctttgaatgctcaattttttgttcagataggaattttcactgcagtt
cccatgattatgggtttcattcttgaacttggtttgctaaaggccgtcttcagctttatt
acgatgcagcttcagttttgttctgtcttctttactttttcgcttgggaccaggactcac
tattttgggcgcactatccttcacggtggtgcaaagtaccgggcgactggacgaggtttt
gttgttcgtcacatcaagtttgcggagaactataggctttattccagaagtcattttgtt
aaagcgttggaagtggctttacttcttatagtatacttggcttatggttacacgaatgga
agcactacttcctttatcttactaactctcagcagttggttccttgtcatttcatggcta
tttgctccctacatcttcaatccctctggatttgagtggcaaaagaccgttgaggacttt
gatgattggaccaactggcttatgtacaagggtggagtaggtgtcaagggagacgacagc
tgggagtcctggtgggatgaagaacagattcatatccagactttgagaggacggatacta
gagactatattgagtctcagattttttctcttccagtatggcattgtctataaacttcag
ttgacggaaacagacacttcccttgcgatatatggcttttcttggattgtactggtggga
gttgttatgatcttcaagatctttactttcagccctaaaaaatccaccaacttccagctc
atgctgcgatttattcaaggagttacagctttgggacttgttacagctctttgccttgtt
gtggcttttaccaaactgtctgttgctgatttgtttgctagtgtcctcgcctttattgca
actggttgggctgtcctttgcctggcaatcacatggaagagggttgtgtggagtttgggt
ctgtgggaatctgtgaaggaatttgctagaatgtatgatgctgggatgggtatcattatt
tttgctccagtggcaatattatcatggttcccatttgtctctaccttccagtcgcggata
ctctttaaccaagcattcagtcgtggtctggagatctctctcattcttgctgggaacaaa
gcaaatgttgaaccctcgacattttag
DBGET
integrated database retrieval system