Solanum lycopersicum (tomato): 101262128
Help
Entry
101262128 CDS
T02665
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At4g33170-like
Organism
sly
Solanum lycopersicum (tomato)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_3
MSC6_N
E_motif
TPR_24
PPR_long
MRP-S27
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101262128
NCBI-ProteinID:
XP_004242825
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(5695002..5704941)
Genome browser
AA seq
590 aa
AA seq
DB search
MVPEILGSLLHHCSKTKGFHYGLSLHAAAIKSGLQGDVLISNHILNMYAKCGNINFASQI
FNEMSKRNLVTWSAMIAGYDQDGKHLMAISLYSQMPLEPNEFVLASALSSCANLLALKLG
RQIHSQSIKLGCSSISFVSNSLISMYMKNGQCSDALSVFALTPSLTDVSYNTIIMGLVES
NQREKAFEVYRSMCEQGLVPDRFTFVGLLGTCNTAHDLGKGMQLHSQTIKLKLDGTAFIG
NIIMTMYSNLNLLNEADKIFRSIKEKDVISWNTLIAACSRCDDHSKALVVFREMVEYFDG
GPDEFTYASLLSACAGMGSLQFGRQIHAHLIRKSSSVDIGVVNALVNMYAKCGCIQYAYT
TFRLMTFRNLVSWNSVIAAFANHGHGKKVMKLFKEMMSDGLKPDSVTFLGLLIACNHAGL
VDEGLYYFNTMNEIYGVTPDIEHFSCLIDLLGRAGRLKDAEEHMQRYPFGNDSVVLGCLL
SACRLHGDVVIGERMAKKLLQLQPVSTSPYVLLSNLYASDEKWDSVAEARKMLKSCGLKK
EAGHSLIEVKGSVEKFTIGNFANSRIEEIVNVLGTLGCGWDEEIILLDSA
NT seq
1773 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaccagaaattcttggttcactattgcatcattgttctaagaccaagggattccat
tatggactctctcttcatgcagctgcaatcaagtcaggcttacagggtgatgttctcata
tccaatcacatcctcaacatgtatgccaagtgtggaaatattaactttgccagtcagatt
tttaatgagatgtccaaaagaaatctcgttacctggtcggccatgatcgctggttatgat
caagatgggaaacaccttatggctatcagcctctactcccaaatgccactagagcccaat
gaatttgtccttgctagtgctcttagctcatgtgctaacctcttggccttgaaacttggt
agacaaatacattcccagtctatcaaattagggtgttcgtccatttcgtttgtgtccaac
tctctgatttcaatgtacatgaaaaatggtcaatgtagtgatgctctatcagtttttgca
ttgacacctagtcttactgatgtctcttacaacacaatcataatgggtttggtagaaagt
aatcaaagagagaaagcatttgaagtctacagaagtatgtgcgaacaagggttggttccg
gaccgctttacctttgtcggcttattgggaacctgcaatactgcacatgatttggggaaa
ggaatgcaattgcatagccaaacaatcaagctcaaacttgatgggactgcctttataggc
aatataataatgacaatgtactcaaatttgaacttgctaaatgaagctgacaaaattttc
agatcaatcaaagagaaagatgtcatttcatggaatactcttattgctgcttgttctcgt
tgtgatgatcattctaaggccttggttgtttttagagagatggtggaatattttgatgga
gggcctgatgagtttacctatgctagtctgctttctgcatgtgctggcatgggttcgctg
caatttgggcggcaaatacatgctcatcttattagaaaaagctcaagtgtggatattggt
gttgtcaatgcccttgtcaacatgtatgctaaatgtggctgtatccagtacgcatataca
acttttaggctaatgacttttcgtaaccttgtctcatggaatagtgtcattgctgcattt
gctaaccatggccatgggaaaaaagttatgaaattattcaaggagatgatgagtgatggt
ttaaagcctgattctgtcacatttctcggacttttaatcgcttgcaatcatgcagggctt
gtagatgagggcctatattacttcaatactatgaacgagatttatggggttactcccgac
attgaacatttctcttgcctcattgatttactaggacgagctgggagactgaaagatgct
gaagaacacatgcaaaggtatccctttgggaatgattcagttgttttaggttgcttactt
tcagcttgtcggctgcatggtgatgttgtaattggggaaagaatggctaagaagctccta
cagcttcaaccagtttctacttcgccttatgttttgttatcaaacttatatgcttcagac
gagaagtgggatagtgtagcagaggcaagaaaaatgctgaagagttgtggtttaaagaag
gaggctggtcatagtcttattgaagtgaagggatctgttgagaagttcacaattggcaat
tttgcgaactcgaggatcgaggaaatcgttaatgtgcttggaactttaggctgtggatgg
gatgaagaaattattctccttgattcagcatag
DBGET
integrated database retrieval system
