Shewanella maritima: EXU30_17940
Help
Entry
EXU30_17940 CDS
T06365
Name
(GenBank) DUF748 domain-containing protein
Organism
smai
Shewanella maritima
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF748
OmpA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBF84342
UniProt:
A0A411PLF3
LinkDB
All DBs
Position
complement(4237133..4240330)
Genome browser
AA seq
1065 aa
AA seq
DB search
MKQTLQSFKQAFLQRPKYQRVAVYLLVSYALYCLILGIVTPALLKQQLPKQLSEITGRDV
SITEIKINPFTLESTITDFAIAADASAADTSTSGDFVLFKQFYANVSFWQSITEFAVVFD
KISLDAPQAKIAQLSEELTSPQFNFDDIITQASAYFAPEQKQQPTTTDDHAQALFPLQIK
QLNITAAALSIEDKATASKINYPNINLAIYDFDTRANLNSEQRDQSQIQANQFSFSLIDD
ASSQLSISGGVQLKPLKLHSRINLTQFDLSYYYQFIDQWLEADLRSAFIGLSGSVNFDQE
SDVLALSNGQLSLDDVRFHAPNSEQAFIELGSFALADISFDSLAQQLTITKLKSDNLKVD
ANISADGSDLQRLLTPELPAYLIQTSQTQEQAKDQAQTPPQDQSKPEAQAGNQVDAADTS
ELVAVINGIEISNYQLNIIESIANQTANQWQIGELALTTGEVRSDLAGELEYKLQFTIQQ
DGQLSLEGKLDIQQQAAQIAYQMQDFPLSALQPYVSPFINVSINNGYIGTAGNVSIEPQT
QDGNITVQGSVNAYQLDIEDNLLQTPLIAWQDMKLNQFDFNLKQNKLAIDQIDFHQMFSR
IVIDEDGTNNIGHLIIEQTDNSGEDGETTNTGKDTQTNIEAQNLAQKQSQSQNNEPSDAN
SLAIDVNAINIHDSSAFFADDSLTPQFASGIEMLNGSIKKLSTTPETRASVDLQGKIDRY
APMSLKGEVNPLLAEPYVDLNLQFNKVELTSVNPYSGTYAGYYIDRGQLSINLNYQLQDN
ALKGSNHVVIDQLELGKPSNSSLATSLPISLAIALLQDRNGVIDLGVDVEGDLDSPSFSF
GGIILKAMTNVITKAVTAPFSLLAGLVAEDDDMENVQFEFGSANITEDDKSKLDSLAKAL
VDRPLLKLNLKGAVEAVSDSQSLKEDAFKQTLSKRAALNYADIMDLSASGLPESGTVIDS
LIALYDEQFGIEQRQTALAAIENDLPGLSPQAQQTRLHISLYNQLVNTIELDENDLGELA
HARATAVKTYLVEQGKIDPSRIFLLESRVNYAQDEAKVVIGLDAD
NT seq
3198 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcaaactttgcaaagctttaaacaagcattcctccagcgcccaaagtatcaacga
gtggcggtctatttattagttagctacgctctgtattgcctaatcttaggtatagtcaca
cctgcactgcttaaacagcaattaccaaagcaactgtctgagattaccggtcgtgacgtt
tcaatcactgaaatcaaaatcaaccccttcactctagaatcgacaattaccgactttgct
atcgctgctgatgccagtgctgctgatactagtacgagtggtgatttcgttctctttaaa
cagttttacgccaacgtaagcttttggcagtcaattaccgagtttgcagtagtatttgat
aagataagcctagatgctccgcaagcaaaaattgctcagctaagtgaagagctgacctcg
cctcaatttaattttgacgacatcatcacacaagcgagcgcctactttgcaccggaacaa
aaacagcagccaactaccacggatgaccatgctcaagcgctgttcccattgcaaattaag
caactgaacataactgctgcagcactatcgattgaagacaaagcaactgctagtaagatt
aattaccccaatatcaatctagcaatttacgactttgacacccgagcaaacctcaatagc
gaacagcgagaccaaagtcagatacaagcaaaccaatttagctttagcttaatcgatgac
gctagcagccaactaagcattagcggcggcgtacaactaaaaccacttaagctgcatagc
cgcattaacctaacccaatttgacttgagttattactatcaatttatcgaccaatggcta
gaagccgatttacggtcggcatttattggcctatcgggcagtgtaaacttcgaccaagag
tcagacgtactggcactgagtaatggccaattatcattagatgatgtgcgttttcacgca
ccaaactctgagcaagcctttattgagcttggcagctttgcgctggctgatattagcttc
gactccttagcccagcagcttacgataactaaactcaaatcagataacctcaaagttgac
gccaatattagcgcagacggcagcgatcttcagcgcctattaactcctgaacttcctgct
tacttaattcagacttcacaaacacaagagcaggcaaaagatcaagcacagacaccacca
caagaccaaagcaagccagaagctcaagctggcaaccaagttgatgcagccgatactagt
gagctagtagcggtaatcaacggcattgaaatcagcaattatcagctcaatattattgaa
tcaattgccaatcaaacagctaatcaatggcaaatcggtgagcttgcacttaccacggga
gaagttcgctcagatcttgctggtgagcttgaatacaaattacaatttactatccaacaa
gatgggcaactgagtcttgaaggcaagctagacatacagcagcaagctgcgcaaatcgcc
tatcaaatgcaggacttcccactctcagccttacagccatacgtgtcgccgttcatcaac
gtcagtatcaacaatggttatatcggaactgcaggcaatgtgagcattgagccgcaaact
caagacggtaatattaccgtgcaaggcagcgttaatgcttatcaacttgatattgaagat
aatctgctgcaaacgccgctaatcgcctggcaggacatgaagcttaatcaatttgacttt
aacctaaagcaaaacaaactggctatcgatcaaatcgactttcaccagatgtttagccgc
attgtgattgatgaagacggtaccaacaatattggccatctcatcatcgaacaaactgac
aactcaggtgaagacggtgaaacgacaaacactggcaaagacactcaaactaatatagag
gcgcaaaatctggcacagaaacaaagtcagagtcaaaacaatgagcccagtgacgctaat
tcattagccattgatgtaaatgctatcaatatccacgatagctcagcattttttgcagac
gacagcttaacgccgcagtttgcctcaggaattgaaatgctgaatggcagcattaaaaag
ctatcaacaacacctgaaacccgtgcgagcgtcgacttacaaggcaaaattgaccgttat
gctccaatgagtctaaaaggtgaagttaacccgctgcttgcagagccttatgttgacctt
aacttacagtttaataaggttgagttgacatcagttaatccatattcaggtacctatgca
ggctactatatcgaccgaggccaactgtcgattaacctaaattatcagctgcaagataat
gccttaaaaggaagtaaccacgtggtaattgaccagctagagctaggtaaacccagtaac
agtagcctggcaaccagtttaccaatcagtttggctatcgcactgctgcaagatagaaac
ggggtaatcgatttaggcgtagatgtcgagggtgatttagactcgccaagttttagtttt
ggcggcatcatattaaaagcgatgaccaacgtgataactaaggctgtcaccgcaccgttt
agcttattggctggcctggtcgctgaagacgatgacatggaaaacgtgcagtttgaattt
ggtagtgccaacatcaccgaagatgataagtctaagttagactctctagccaaagcctta
gttgatagaccgcttttaaaactcaaccttaaaggcgcagtagaagcagtatcagatagt
cagtcactaaaagaagatgctttcaagcaaacccttagcaaacgtgctgcactaaactat
gccgacattatggacttaagtgcaagcggcttacccgagtctggaacagtcattgattca
ctgattgcgctatatgacgagcaatttggcattgagcaacgccagactgcactagctgcg
atagaaaacgatctcccgggtttgtcgccacaagcgcagcaaactcgcttgcatatatcg
ctctataatcaattggtcaatacgattgaactggatgaaaacgatttaggagagctcgcc
cacgcgcgagcaacagcagtgaagacctatctggttgagcaaggtaaaatcgatcctagt
cgtattttcctgctagaaagtagagttaactatgcccaggatgaagccaaagtcgtgatt
gggctggatgctgactaa
DBGET
integrated database retrieval system
