Streptomyces malaysiensis: SMALA_0466
Help
Entry
SMALA_0466 CDS
T05189
Name
(GenBank) hygrocin PKS
Organism
smal
Streptomyces malaysiensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
PKS_DH_N
KAsynt_C_assoc
PP-binding
PS-DH
Thiolase_N
adh_short
Epimerase
Docking
Polysacc_synt_2
GDP_Man_Dehyd
3Beta_HSD
HRDC
ACP_syn_III
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATL80709
UniProt:
A0A291SIJ1
LinkDB
All DBs
Position
complement(651153..659723)
Genome browser
AA seq
2856 aa
AA seq
DB search
MSVRNAEAGMTTPEAKVVEALRVTLMENERLERENADIRRGLSEPIAIVGMACRLPGGVT
TPEGLWDLVASGGDAISGFPEDRGWDLENLFDPDPDHPGTSYVREGGFLRDAGEFDAGFF
GISPREALAMDPQQRIMLELSWEAFERAGIDPTALRGKDIGVFSGVTYHSYGSGARVPEE
LEAVMGTGTSASVLSGRVSYALGFEGPSVAVDTACSSSLVALHLAVQALRLGECSMALAG
GVTVMANPGIFVGFSRQRGMSKDGRCRAFAAAADGTGFSEGAGVLLVERLSDAERNGHRV
LAVVRGSAVNQDGASNGLTAPNGPSQQRVIRQALASAGLVASDVDAVEAHGTGTALGDPI
EAQALLDTYGQDRPEGRPLWLGSLKSNIGHAQAAAGVAGVIKMVLALRCGVLPRTLHVDE
PSRQVDWSAGAVELLTEERVWPEVGRPRRAGVSGFGVSGTNAHVILEQAPEPSGDAEPVV
EARGGVVPLVVSGRGGAGLRGQAEKLLEYVQARPELRVGELGAGLAAGRAALSDRAVVVA
GDRGEALVGLGAVAEGTPGGVVGKADVRGRVAFVFPGQGAQWVGMGAELLESSPVFAEVI
GECEVALSAYVDWSLRDVLCGVGGAPGLDRVDVVQPVSFAVMVGLARVWLAAGVVPSVVV
GHSQGEIAAACVAGGLSLEDAVRVVVLRSRAVAAGLSGRGGMMSLAVGVEAAEGLVERWS
GRIEVAAVNGPLSVVVAGEPDALRGLVAECEGAGVRARWVEVDYASHTARVEVVEGELAR
SLAQIRPVSSRIPFFSTVEAGWLDTAELDAGYWYRNLRSTVRFAPSIDRLIEDGFAAFVE
VSAHPVLTMGIEAAAERADVGPVVVTGTLRRDEGDMRRVLTSLAEVYVRGVPVNWTALLG
DIPARAALDLPTYAFQHQHYWLKNATPTDAGAIDDQLPGLVELPAETGALTARLLGESTQ
EQERILLETVRQETASVLGHSSPDAIEPDMVFNQIGFDSATAVQLRNRLNALTDRTLPTT
LLFDYPTPLILADFLRDELIGDTAAPEGVPEATVAPGDVSTEPVAIVGMACRLPGGVSTP
EELWDLVLQGRDGVSDFPVNRGWDLENLFHPDPDHPGTSYAYQGGFLHDAGEFDAGFFGI
SPREALAVDPQQRLMLETSWEALECAGIDPTTLRGKDVGVFSGVTYHNYGSGVEPVPAEL
EGMLGLGASASVLSGRVSYALGFEGPSVAVDTACSSSLVALHLAAQALRAGECSIALAGG
VTVMPTPGIFIAFSRQRGMSVDGRCKSFSASADGTGWAEGVGVLALERLSDAERNGHLVL
AVVRGSAVNQDGASNGLTAPNGPSQQRVIRQALASAGVSAAEVDVVEAHGTGTALGDPIE
AQAVLATYGQDRDRPLLMGSLKSNIGHAQAAAGVAGVIKMVLALRHGIVPRTLHVDEPTS
QVDWSAGAVELLTEERVWPEVGRPRRAGVSAFGVSGTNAHVILEQAAPTATESADPALSW
PKGVPVPLVVSGRGAAALAAQAQRLRTFVADEPHLDLSELGYALGCGRAGLSDRGVVVAG
GREELLVGLGGLVRGEGGVGVVSGSVVRGRLGVLFAGQGCQRVGMGRGLYEVFPVFRDAF
DTVCDALDRELGAGGVVGSVREVVFGDGALLERTVFAQAGLFAVEVGLFRLVESWGVVVD
VVGGHSVGEVTAAYVAGVLSLEDAAVLVAARGRLMEALPEGGAMVAVGAGEEVVRPLLVA
GVDIAAVNGPAAVVLSGDEGPVLRVARDLSDQGCRTRRLAVSHAFHSGRMEPMLEEFREA
IADLSFSAPVIPLVSNVTGRLADAEVVCSPEYWVEHVRSAVRFADGVRALADYGVSTYLE
LAPDAVLSAMVGDCLPGGSAAESVVVPSLRREGDEPRALMTAIAQLHVAGVPIDFGALFG
ATVLPAHISALPTYAFQREHYWLVGDGRGAGDVASAGLAGVGHPLLGAMTEVPGSGEVLF
SSRLSLGSHPWLADHVAAGAVLLPGAAFVELVVRAGDEVGCDEVEELVMEAPLVLAEGAA
AAQVRVSVGEVEKDGRRAVRVYSRAEDAGVGAPWVRHATGTLCPPEGLSAPDAGLSVWPP
TGAVAVDPAEVEGLYDGLEQVGYRYGPVFQGARAAWRLDGAVYAEVALPEEHRVQAAGFG
LHPALLDAAMHTIAFHDRDEADAELVLPFAYREVALHASGASALRVRVTPSGPNTMTLDL
ADDSGAPVASVGSVVSRPVGAEHFGTAATADRMFRVAWEELSIQRDGTTAEPVPVADAED
VHRLVTTPETSPPDVLLLDLGGGAGGGSADVRELTGRALRVVQTWLDEPSLALSRLVVVT
RGAVAVREADPVDPAMAAVWGLMGSAQAENPGRILLLDIDQGSIPTPLLPALLAGDQRQL
ALRDATCFTRHLIRVLDVPQPGPGGLEDAGGTVLVTGGTGALGAVVAWHLVAVHGVRSVV
LASRRGLEAPGAAELEAELVKAGARVRIVACDVADRDAVAGLLDAVPADAPLSAVVHTAG
VLDDGVLTALTPERMHAVLRPKVDGALHLHELTRDLGLSAFVLFSSAAGTLGNAGQGNYA
AANAYLDALAHRRRAQGLPAVSLAWGMWQQAAGTGMTGRLGDAEQRRMTRGGVAPLSPAE
GMELFDTALRMAEPTVLPIKLDLGALRAQAATGAVQPLLHRLVPPVRRATRATAEQGLVT
GRLAGATPEERERILLEMVQQEAARVLGHSAAATLDPDVLFPEIGLDSLMAVELRDRLAK
RTALRLPPSFVFDHPTLRMLARQLWDELEKADTDAPAASAPTPASAETPASAPTAGATPT
SGATPSPGASPSPGATPSPGATLPPAPTPPSGAAQE
NT seq
8571 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcggttcggaatgcggaggccgggatgaccactcccgaagcgaaggtcgtcgaagcg
ctgcgtgtcacgctcatggagaacgagcggctcgagcgggagaacgccgacatacgccgt
ggcctgtcggaaccgatcgcgatcgtcgggatggcgtgccggttgccgggcggggtgacc
acgccggaggggctgtgggacctggtggcgtccggtggcgatgcgatcagtgggtttccg
gaggaccgtggctgggatctggagaacctcttcgacccggatccggatcacccgggcacc
agctatgtccgcgagggtggttttctgcgcgacgcgggggagttcgacgcgggcttcttc
gggatctcgccgcgtgaggcgctggcgatggatccgcagcagcgcatcatgctcgagctc
tcctgggaggcgttcgaacgcgctgggatcgacccgaccgcgctgcgtggcaaggacatc
ggagtcttctccggcgtgacctaccacagctacggctccggggcgcgggtccccgaggag
ctcgaggcggtgatgggcacgggcacctcggcgagcgtcttgtcggggcgggtgtcctac
gcgctcggcttcgagggcccgtcggtcgcggtggacaccgcgtgctcctcgtcactggtg
gccttgcacttggccgtacaggcgctgcggttgggcgaatgctcgatggcgctggccgga
ggtgtgaccgtcatggccaaccccggtatcttcgtcggcttctcgcggcagcgcgggatg
tccaaggacggtcgttgcagggcgttcgcggcagcggcggacggcaccggcttctccgag
ggcgcgggcgtgctgctggtggagcggttgtcggatgctgagcggaatgggcatcgggtg
ttggcggtggtgcggggcagtgcggtgaatcaggatggtgcgtcgaatggtttgacggcg
ccgaatggtccgtcgcagcagcgtgtcatccggcaggcgctggcgagtgcggggctggtg
gcttcggatgtggatgccgtcgaggcgcatgggacgggcacggcactgggtgaccccatc
gaggcgcaggcgctcttggacacgtatggccaggatcggcctgaggggcgtccgctgtgg
ttggggtcgttgaagtcgaatatcggtcatgcgcaggcggccgcgggtgtggctggtgtg
atcaagatggtgttggcgttgcggtgtggggtgttgccgaggacgttgcatgtggatgag
ccttcgcggcaggtggattggtcggcgggtgcggtggaactgctgactgaggagcgggtg
tggccggaggtgggtcgtcctcgtcgggctggtgtgtcggggttcggggtgagcgggacg
aacgcccacgtgattcttgagcaggccccggagccgtcgggggacgcggaaccggtcgtg
gaggcgcggggcggtgtggtgccgttggtggtgtccgggcgtggtggtgcggggttgcgg
ggacaggcggaaaagttgctggagtatgtgcaggctcgtcctgagttgagggttggggag
ttgggggcggggctggctgctggtcgggcggcgttgtcggaccgtgcggtggtggtggcg
ggcgatcgcggcgaggcgttggtggggctgggcgcggtggcggagggtacgccgggtggt
gtggtggggaaggcggatgtccggggtcgggtggcgttcgtcttccctggtcagggggcg
cagtgggtggggatgggggcggagttgttggagtcttcgccggtgtttgcggaggtgatt
ggtgagtgtgaggtggcgttgtcggcatatgtggattggtcgttgagggacgtgttgtgt
ggggttgggggtgcgccgggtttggatcgggtggatgtggtgcagccggtgtcgtttgcg
gtgatggtggggttggcgcgggtgtggttggcggctggtgtggtgccgtcggtggtggtg
ggtcattcgcagggggagattgcggcggcgtgtgtggcgggtgggttgtcgttggaggat
gcggtgcgggtggtggtgttgcggagtcgtgcggtggcggcggggttgtcgggccggggc
gggatgatgtcgctcgcggtgggtgtggaggcggcggaggggttggttgagcggtggtcg
gggcgtatcgaggtggcggcggtgaatggtccgttgtcggtggtggtggccggtgagccg
gatgccttgcgggggttggtggcggagtgtgagggcgcgggggtgcgggcgcggtgggtt
gaggtggattacgcctcgcatacggcgcgggtggaggtggtcgagggggagttggcccgg
tcgttggcgcaaattcgtccggtgtcctcgcgtattccgttcttctccacggtggaagcg
ggttggctggacacggcggagttggacgcggggtattggtatcggaatctgcggagcacg
gtgcgcttcgcgccgtcgatcgaccggttgatcgaggatggctttgcggcgtttgttgag
gtgagcgcgcatccggtgctgacgatgggcatcgaggcggcggcggagcgggcggacgtt
gggccggtcgtggtgaccgggacgctccgccgggacgagggtgatatgcgtcgggtgctc
acttctctggccgaggtgtacgtacgcggcgtccccgtgaactggaccgccctgctgggt
gacatcccggcgcgggccgcgttggatctgccgacctacgccttccagcatcagcactac
tggctgaagaacgccacccccaccgatgcgggagccatcgacgatcagcttccgggcctg
gtcgaactgcccgccgagaccggcgccttgaccgctcgcctccttggggagtccacgcag
gaacaggaacgcatcctgctggagaccgtccgccaggagaccgcgagcgtcttgggccac
tcctcgccggacgccattgaaccggacatggtgttcaaccagatcggcttcgactcggcc
accgcagtacagctgcgaaaccgtctgaacgcgctcaccgaccggactctgccgaccacc
ctgctcttcgactaccccacgcccctgatcctcgccgacttcctgcgtgacgaactcatc
ggggacacggcggccccggagggggtgccggaagcgacagtggcgccgggggatgtgtcg
accgagccggtggcgatcgtgggtatggcgtgccggctgccgggtggcgtctccaccccg
gaagagctatgggacctggtgcttcaggggcgggacggggtcagcgacttccccgtgaac
cgtggctgggatctggagaatctgttccacccggacccggaccaccccggtaccagctat
gcgtaccaaggcggatttctgcacgacgccggggagttcgacgcgggcttcttcgggatc
tcgccacgcgaggcactggccgtggacccgcaacagcgtctgatgctggaaacctcgtgg
gaagcgctggaatgtgccgggatcgacccgaccacgctgcggggcaaggacgtcggtgtc
ttctccggtgtgacgtaccacaactacggctcgggcgtggagccggttcccgccgagctc
gaaggcatgctggggctcggcgcctcggcgagcgtgctgtcagggcgggtgtcgtatgcg
ctgggcttcgagggcccgtcggtcgcggtggacacggcgtgctcctcgtccctggtggcg
ttgcacttggcggcgcaggcattgcgagcaggcgagtgctcgatcgccctcgccggtggg
gtcacggtgatgccgactcccggtatcttcatcgccttctcgcggcagcgcggcatgtcg
gtcgatggccggtgcaagtcgttttcggcgtcggcggacggtacggggtgggccgagggt
gtgggtgtgctggcgctggagcggctgtcggacgcagagcgaaacggccatctggtgttg
gcggtggtgcggggtagtgcggtgaatcaggatggtgcgtcgaatggtttgacggcgccg
aatggtccgtcgcagcagcgtgtcattcggcaggcgctggccagtgcgggtgtgtcggct
gccgaggtggatgtggtcgaggcacatggcacgggtacggcgctgggcgatcccattgag
gcgcaggcggtgttggcgacgtatgggcaggatcgtgatcggcctttgttgatggggtcg
ttgaagtcgaatatcggtcatgcgcaggcggccgcgggtgtggccggtgtgatcaagatg
gtgttggcgttgcggcatggcatcgttcctcggacgttgcatgtggacgagccgacctcg
caggtggattggtcggcgggtgcggtggagctgttgaccgaggagcgggtgtggcctgag
gtgggtcgtcctcgccgggctggagtgtccgcgttcggggtcagtggcaccaacgcccac
gtcatcctggaacaggcggcgccgacggcgaccgagtcggccgatccggcgctgtcctgg
ccgaagggcgtccctgtgccgctggtggtatccggccgaggcgccgcggcgctcgccgcc
caggcgcaacggctacggaccttcgtagccgacgagccgcacctcgacttgagcgaactc
ggctacgcgttgggttgtggtcgggcggggttgtcggatcgtggggtggtggtggcgggt
ggtcgtgaggagttgttggtggggttgggtgggttggtgcggggtgaggggggtgtgggt
gtggtgtcgggttcggtggtgcgtggtcggttgggggtgttgtttgctggtcaggggtgt
cagcgggtggggatggggcgtgggttgtatgaggtgttcccggtgttccgggatgccttc
gacacggtgtgcgatgccctggaccgtgagctgggtgcgggtggtgtggtgggttcggtg
cgggaggtggtgttcggggacggggcgttgttggagcggacggtgtttgctcaggcgggg
ttgtttgcggtggaggtggggttgttccggttggtggagtcgtggggtgtggtggtggat
gtggtgggtgggcattcggtgggtgaggtgacggcggcgtatgtggcgggtgtgttgtcg
ttggaggatgcggcggtgttggtggcggcgcggggtcggttgatggaggcgctgccggaa
ggcggggcgatggtggcggtgggtgcgggtgaggaggtggtgcgtcctttgttggtggcg
ggggtggatattgcggcggtgaatggtcctgcggcggtggtgctttccggtgatgagggg
ccggtgctacgggtggcgcgcgatttgtcggatcaggggtgtcggacgaggcgtttggcg
gtgtcgcatgcgttccactcggggcgtatggagccgatgctggaggagttccgggaggcg
atcgctgatctgtcgttctcggcgccggtgattcctttggtgtcgaatgtgactgggcgg
ttggcggatgcggaggtggtgtgttcgccggagtattgggtggagcatgtgcgttcggcg
gtgcggtttgcggatggtgtgcgggcgctcgctgactacggtgtgagtacctatctggag
ttggcgccggacgcggtgttgtcggcgatggtgggtgattgtctgccgggagggtcggct
gctgagagtgtggtggtgccgtcgctgcggagggagggcgacgagccccgcgcgctgatg
accgccatcgctcaactgcatgtggcaggcgtacccatcgacttcggtgccctgttcggt
gccacggttctgcccgcccatatttcggctctgccgacgtatgcgttccagcgggagcat
tactggttggtgggggacgggcgtggagctggcgatgtggcgtcggccgggttggcgggt
gtggggcatccgttgttgggcgcgatgacggaggtgcccgggtcgggtgaggtgttgttc
tcctcgcggttgtcgttggggtctcatccgtggctggctgatcatgtggctgcgggtgcg
gtgttgttgccgggtgcggcgtttgtggagttggtggtgcgggctggtgatgaggttggc
tgcgatgaggtggaggagctggtgatggaggctccgctggtgttggcggagggcgcggca
gcggcacaggtgcgggtgagcgtgggggaggtcgagaaagacggtcggcgcgctgtgcgg
gtgtattcgcgggccgaggacgccggtgtgggtgctccatgggtgcgccacgccaccggg
acgttgtgtcccccggagggcctgtccgctcccgacgcggggctgtcggtgtggcctccg
acgggcgcggtcgcggtggatccggcggaggtggagggcctgtacgacggcctggaacag
gtcggctatcggtatgggccggtgttccagggggcgcgggcggcatggcggctggatggt
gcggtgtatgcggaggtggctctgccggaggagcatcgggtccaggcggcggggttcggg
cttcatccggcactcctcgacgcggccatgcacaccatcgccttccacgaccgagacgaa
gccgatgcggagctcgtgctgccgttcgcctatcgagaggtggcgttgcatgcctcgggg
gcctcggcgctgcgagtacgcgtaacaccgtccggcccgaacaccatgaccctcgacctg
gccgatgactccggggccccggttgcctcggtgggctcggtggtgtcccgtccggtcggc
gccgagcacttcggcacggcggcgacggcggaccggatgttccgcgtcgcatgggaagaa
ctgtcgattcagcgggacggcacgaccgcggaacccgtaccggtggccgatgccgaggac
gtacaccgtctggtcacgacgccagagacctcaccgcccgatgtgctgttgctggacctg
ggcggtggcgccggcggcggttcggccgacgtacgcgagctgaccggacgggcgttgcgc
gtcgtacagacgtggctggatgagccctcgttggcgttgagtcggctggtcgtggtgacg
cggggcgccgtggccgtccgggaggccgatccggtcgatccggcgatggcagcggtatgg
gggctgatgggatcggcacaagcggagaaccccgggcgcatcctcctcctcgacatcgat
caagggtcgataccgaccccgctactgcctgcgctgctcgccggtgaccagcgccaactg
gccctacgcgacgccacctgcttcacccgccacctcatccgtgtgctggatgtgccccag
cccggtccgggtggtttggaggacgcgggtgggacggtgctggtgacgggtggtacgggg
gcgttgggtgcggtggtggcgtggcatctggtggcggtgcacggggtgcggagtgtggtg
ttggcgagccggagggggcttgaggcacccggcgccgccgagttggaggcggagctggtg
aaggcgggtgcgcgcgtacgcatcgtcgcgtgtgatgtggcggaccgggacgcggtggcc
gggctgctggacgccgtcccggcagacgctccgttgtcggcggtggtgcacacggccggt
gttctggatgacggtgtgctgaccgcgttgaccccggaacgtatgcacgcggtgctccgg
ccgaaggtggacggagcgctccatctccacgagctgacccgggacctgggcctgtccgcg
ttcgtcctgttttcctccgccgccggcaccctgggcaacgcgggtcagggcaactacgcc
gccgccaacgcctacctcgacgcgctggcccatcgacgccgggcccaggggctgccggca
gtatccctcgcctggggcatgtggcagcaggccgcgggaacggggatgaccggccgtctc
ggcgatgccgagcagcgccggatgacacgcggcggggtggcccccttgtccccggccgag
ggcatggagctcttcgacaccgcgctgcgtatggccgaacccacggtccttcccatcaaa
ctggacctcggtgcgctccgcgcccaggccgccaccggggcggtgcagccgttgctgcac
cggctggtgccgccggtccgccgagccactcgcgccacggccgagcagggcctggtgacc
ggtcggctggcgggcgcgacccccgaggagcgggagcggatcctgctggagatggtccag
caggaggccgcccgggtcctgggacactcggcggccgccacgctcgaccccgatgtgctg
ttccccgagatcggcctggactccctgatggcggtggaactacgcgatcgcctggccaag
cgcaccgcgctgcggttgcctcccagctttgtcttcgaccaccccaccctccggatgctg
gcccggcagctgtgggacgagctggagaaagccgatacggacgctcccgccgcatccgcc
ccgactcccgcatccgccgaaactcccgcatccgccccaaccgccggagccaccccgacg
tccggagccaccccgtcacccggagccagcccgtcgcccggagccaccccgtcacccgga
gccactctgccacccgctcccaccccgccctccggagccgcccaggagtga
DBGET
integrated database retrieval system