Shewanella mangrovisoli: K0H60_05035
Help
Entry
K0H60_05035 CDS
T09316
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K16088
outer-membrane receptor for ferric coprogen and ferric-rhodotorulic acid
Organism
smay
Shewanella mangrovisoli
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smay00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
smay02000
]
K0H60_05035
Transporters [BR:
smay02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
K0H60_05035
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYK10075
LinkDB
All DBs
Position
1143968..1146157
Genome browser
AA seq
729 aa
AA seq
DB search
MRFNLLPLAAAVTLALNPLALMAEEQTSSKTETQDQNIEKITVMGKYTVSRNIDTATGLG
LTLRETPQSVSIMTADRIEDQALNTVVDVVNNTVGLSSSKTDNVRNGFSARGFTVQNYQI
DGVPLSWSLGGDAGETVSDVSIYERVEVVRGATGLLTGAGDPSASINLVRKHADSSDLKG
YVDVATGSWDKKQVTADVSNGLNEDGSVRGRLVAKYVNSDSYQNLYQDRKTILYGVVDSD
ISANTLLRVGASYNHNDPKGAMWGALPAVFSDGSATDWDTSATTAADWSRWETKNINYFA
NLNHYFSNGWQLVANYNRMEYETTTKMIYMSGLLDKDTGAGLSGQRYHSHGESNSNNFDV
QLKGDYDLFGQTHEFVTGALYSKQKSYADTYEPIRDNMAGWDSQVVDNFYEWQQNQFAEP
EWSTNANRQLNMDTEQKGFYAATRLTITDDFKLIAGGRISSWNREGVSYGTDTNFGDDGV
FVPYVGALYDINEEHRIYASYTGIFNPQNKQDASGDYLDPLEGKAYEIGLKSAYLDDRLH
TSLALFKIEQDNFGKQDPDFVPTEEQIANGQTTAYYAIQGTESKGFELEVVGEFIDGWNI
SAGYSQFKAEDAEGNKLDTTSPRKQFKLFTTYQFVDLLPELTIGGGVNWQSDSYSTGGNV
TITQDAYSLVNLMARYDLAENMDLQVNVENLLDEKYYAYMSTSSYLPEAYSVYHYGAPRN
FTVSFNYRF
NT seq
2190 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgttttaatctacttcctcttgcggctgcggtaacactagcattgaatcctttggcg
ttgatggccgaagaacaaacctcttctaaaacagagacacaagatcaaaatatcgaaaaa
attacagtgatgggtaaatacactgtgagtcgaaatattgatacagcgacaggtctcgga
ctcacgttgcgggaaacgccacagtcggtcagcatcatgacggcggatcggattgaagat
caggcgttaaatactgtggtcgacgtggtgaataacactgtgggcctgtcttcttcaaaa
accgataacgtgcgtaacggtttttcggcccgcggttttaccgtgcaaaactatcaaatt
gatggtgtgcctttatcttggagtttaggcggcgatgctggcgaaacggtatcggatgtg
tctatctacgagcgcgttgaagttgtgcgtggtgctaccggtttattaacgggcgcaggc
gatccttcggcctcgattaacttagtgcgtaagcatgccgacagctcagatcttaaaggt
tatgtggatgtcgcaacgggaagttgggataaaaaacaagtcactgcggatgtgtccaat
ggtttgaatgaagacggcagtgtccgtggccgtttagtcgctaagtatgtgaatagcgat
tcttaccaaaatctgtatcaagaccgtaaaaccattctctatggtgttgtcgatagcgat
atctccgccaacactttactgcgtgtcggtgctagctataaccacaacgatccaaaaggt
gctatgtggggcgcgttgcccgctgtctttagtgatggttctgccacagattgggataca
tcggccaccacagctgccgattggagccgctgggaaaccaaaaacatcaactactttgct
aacctaaatcattacttcagcaatggttggcaactagtcgctaactacaaccgcatggaa
tatgaaaccaccactaagatgatctacatgtcgggtttactcgataaagacacgggtgct
gggctcagtggtcagcgttatcacagccatggtgaaagtaactcgaataactttgatgtt
cagcttaagggcgactatgacctctttggtcaaacccatgagtttgtgacaggcgccttg
tatagtaagcaaaagtcctacgccgatacctatgagcctatccgtgacaatatggcgggt
tgggactcccaagtggtcgataacttctacgaatggcaacaaaatcagtttgccgagcct
gaatggtcgaccaatgcgaaccgtcagctcaatatggataccgagcaaaaaggtttttat
gcggcgactcgcctgaccatcaccgatgatttcaaactgattgccggtggacgtatctca
agctggaaccgtgaaggcgtgagctatggtaccgatactaactttggcgatgatggcgtg
tttgtaccctatgttggtgctttatacgatatcaatgaagagcaccgtatttacgccagc
tataccgggatttttaatccgcagaataaacaggatgcgagtggcgattatcttgaccca
ttagaggggaaagcatatgagattggtttaaaaagtgcgtatttagatgaccgtctgcat
acatcgctagcattgtttaaaatcgagcaggataactttggtaaacaagatccggacttt
gtaccgactgaagagcaaatcgccaacggccaaacgaccgcatactatgctatccaaggt
acggaaagtaagggcttcgagttagaagttgttggggagtttatcgacggttggaatatt
tcagcaggctattcacaatttaaagccgaagatgctgaaggaaataagctggatacaacc
agtccacgtaagcaatttaaactctttactacctatcaatttgtggatttattaccagag
ttaaccattggtggtggagtgaattggcaaagcgacagttattctacaggtggcaatgtc
actatcacgcaggatgcctattctttggtgaatctgatggcgcgctacgatctggctgaa
aatatggatctgcaggttaacgtagagaatttactggatgagaaatattacgcctatatg
tcaacctctagttatttgccagaagcttatagcgtatatcactacggtgcgccacgtaac
tttaccgttagctttaactatcgcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system