KEGG   Spiroplasma melliferum: SRED_001720
Entry
SRED_001720       CDS       T07411                                 
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
  KO
K02469  DNA gyrase subunit A [EC:5.6.2.2]
Organism
smei  Spiroplasma melliferum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smei00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:smei03032]
    SRED_001720
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:smei03400]
    SRED_001720
Enzymes [BR:smei01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.2  DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
     SRED_001720
DNA replication proteins [BR:smei03032]
 Prokaryotic type
  DNA Topoisomerases
   SRED_001720
DNA repair and recombination proteins [BR:smei03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
     Facilitator
      SRED_001720
SSDB
Motif
Pfam: DNA_topoisoIV DNA_gyraseA_C NTase_sub_bind SIS
Other DBs
NCBI-ProteinID: QCO23257
UniProt: A0A4D8RE14
LinkDB
Position
4798..7263
AA seq 821 aa
MMKSENDGYDYDGKIRDIDIADEMKNGFLDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRIIYAMW
DLKMTYEKQHKKSARIVGEVIGKYHPHGDTAVYEAMVRMAQDFSYRYPLIDGHGNFGSMD
GDAPAAMRYTEAKMSKIAGELIKDIEKETTIFIDNYDGSEEEPTFLPGYFPNLLVNGASG
IAVGMATNIPPHNLNEVIDGVIAVTKNPEITTVELMKIIKGPDFPTGALITAGNGLIKAY
ETGNGAITIRSKIDIEENNNKRRIIVSEIPYQINKAKLLERIAELVRDKIINGISDLRDE
SNMEGVRVVLELKRDAQENVILNKLYKLTPLQTNFSLNILALYKNQPRVMGLKQILKYFI
EHQIDIIIKRSQFELKKNRNRLIILEGLKIALDNIDEVIAIIKQSQTTQIASDALINKFN
LVGEQARAILEMRLQRLTGLEIEKINNEIKDIKVAITELEEIINNSEKQIDIMITELTEI
KKKYGDERRSQIIKEELTEIDPEELIRREDILIMLTQDGYVKRVSDDTFKLQNRGGKGII
GLANIEDSLKKIISANSIDSLLIFSNFGKVYKLRAYNIETYSRHARGLPIINLIAIDKTE
SIQTIIAVDESISTEDNLFFVTKKGLIKKTKISEFNQIRQTGKVAIELKDNDELVSVIIT
KGYDDVIIGNNIGKVIRFNEKEIRPMTRQSVGVKGIANDATGETIGVSSGRSAKYVLSVT
ENGYAKKTLIKDYRLTGRNTKGVKSMNLTDKTGYLKFVQTVDGDEDILVGTKKGNIIRVS
LEQIPLFGRTTSGVKIMRLEQDDKLEVIEILKKKINIEGER
NT seq 2466 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatgaaatcagaaaatgatggatatgattatgatggtaaaattcgtgatattgatatt
gctgatgaaatgaaaaatggttttttagattatgcaatgtcagttattgtttcacgtgca
attcctgatgttcgtgatggattaaaaccagttcatcgacgcattatttatgcaatgtga
gatttaaaaatgacttacgaaaaacaacacaagaaatcagcacgaattgttggtgaagta
attgggaaatatcatccccatggtgatactgctgtttatgaagcaatggttcggatggca
caagatttttcttatcgttatcctttaattgatggtcatggaaattttggttcaatggat
ggtgacgctccagcggcaatgcgatacacggaagcaaaaatgagtaaaattgctggtgaa
ctaatcaaagatattgaaaaagaaacaacaatttttattgataattatgatggtagtgaa
gaagaaccgacttttttaccaggatattttccaaatttattagttaatggtgctagtgga
attgctgttggaatggcaactaatattccaccccataatttgaatgaagtaattgatgga
gttattgcggtaacaaaaaatcctgaaataacgaccgttgaattaatgaaaattattaaa
ggacctgattttccaactggggcattaattacggctggaaacggtttaattaaagcttat
gaaacaggtaatggagcaattacaattcgttcaaagattgatattgaagaaaataataat
aaaagacgaattattgtgtcagagattccatatcaaattaataaagcaaaattgttggaa
cgaattgcagaattagttcgcgataaaattattaatggaattagtgaccttcgtgatgaa
tcaaacatggagggggttcgtgttgttttagaattaaaacgtgatgctcaagaaaatgtt
attttaaataaattatataaattaacgccactccaaactaatttttcgttaaatatttta
gcattgtacaaaaaccaaccaagagtaatgggattaaaacaaattttaaaatattttatt
gaacatcaaattgatattattattaaacgtagtcaatttgaattaaagaaaaatcgtaat
cgtttaatcattttagaaggattaaaaattgctcttgataatattgatgaagtaattgca
attattaaacaatcacaaacaacacaaattgcatcagatgccttgattaataaatttaat
ttagtaggtgaacaagcacgggcaattttagaaatgcgcttacaaagattaaccggatta
gaaattgaaaaaattaacaatgaaattaaggatattaaagtggcaataaccgaattagaa
gaaattattaataatagtgaaaaacaaattgacattatgattacggaattaacagaaatt
aagaaaaaatatggtgatgagcgtcgaagtcaaattattaaagaagagctaacagaaatt
gatccagaagaattaattcgccgggaagacattttaattatgttaacacaagatggttat
gttaaacgagtatctgatgatacttttaaattacaaaatcgtggtgggaaagggattatt
ggtttagcaaatattgaagatagtttaaaaaaaattattagtgctaatagtattgactca
ttattaattttttcaaattttgggaaagtgtataaattacgagcttataatattgaaaca
tattcacggcatgcacggggattaccaattattaatttaattgcaattgataaaacagaa
agtattcaaacaattattgctgtagatgaatcaatttcaacagaggataatttatttttc
gtaacaaaaaaaggtcttattaaaaaaacaaaaataagtgaatttaatcaaattcgccaa
acagggaaagtagcaattgaattaaaagataatgatgaattagtaagtgtgattattaca
aaaggatatgatgatgttattattggaaataatattggaaaagtaattcgatttaatgaa
aaggaaattagaccaatgacgcgacaatcagttggggttaaaggaattgctaatgatgct
actggagaaacaattggggtgagttcagggcggtctgcgaaatatgttttatcagtaact
gaaaatggttatgcaaaaaaaacactaattaaagattatcgtttaacaggacgaaatact
aagggtgttaagtcaatgaacttaacagataaaacagggtatttaaaatttgtccaaact
gtagatggtgatgaagacattttagtaggaacaaaaaaaggaaatattattcgtgtttcg
ctagagcaaattccattatttggacgaacaacatcaggtgttaaaattatgcgattagaa
caagatgataaattagaagttattgaaattttaaaaaagaaaattaacattgaaggagaa
agataa

DBGET integrated database retrieval system