Spiroplasma melliferum: SRED_001763
Help
Entry
SRED_001763 CDS
T07411
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta
KO
K03043
DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:
2.7.7.6
]
Organism
smei
Spiroplasma melliferum
Pathway
smei03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smei00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
SRED_001763
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
smei03021
]
SRED_001763
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
smei03400
]
SRED_001763
Enzymes [BR:
smei01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
SRED_001763
Transcription machinery [BR:
smei03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
SRED_001763
DNA repair and recombination proteins [BR:
smei03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
SRED_001763
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_45
RNA_pol_Rpb2_1
ATLF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCO23300
UniProt:
A0ABX5U8K3
LinkDB
All DBs
Position
54579..58487
Genome browser
AA seq
1302 aa
AA seq
DB search
MALKEKEFGHYAKRIDYTKVSGNLDLPNLIEIQTETYDWFKKTGISEVFGEVFPIVGHEG
NIVLEMLDWEFREPRRTISQAKDESKIFEAPIYSNLKLTINSKDVEVEKAIVKGEPELIK
AWIEERVGHMITILKKTTDVIYYDIHSGDEIATCTVTIKERLDDKLIVDITIEKEGEVFF
GDFPLMTGKGTFIVNGSEKVVVSQLVRSPGAYYKIDLNRKNGENVYYVDLIPSRGTWLEF
ESDHKKIKVGKEEKFENVFYVKIDKSRKVSVANFLTALGIIKEDALDIFGDNKLVKSTYE
LDPYTGDILYDQSIAVQEIYKKIRSGETATPDGATKYLYGLLFDKRKYDLTKAGRFKLIQ
KLSVENRIYNKILAEDIKDVNGKVVFTEGTLMDKEAINKLKGILKAGACLQEVKFSDEII
CSNKIQKIKVYVDNEVRSRVANIIGIDPNATDEYVTVPDVLATFSYLLNLTDGIGEVDDI
DHLGNRRVRTIGELLQNQFRIGLLRIEKNVKEKMSTSNLFKMKPSNIINNKPLSAIIGEF
FNLSQLSQFMDQTNPLAELTNKRRLTALGPGGLSRERAGLEVRDVHYSHYGRICPIETPE
GPNIGLINNLATYAKINSYGFIETPYRRVIGCKVTMENDYLTADEEKNYVVAQANIRLSD
KGEILDEQVVARFQGENIIAGRNDVDYVDVSPKQIVSIATSCIPFLENDDANRALMGANM
QRQAIPLIAPNSPYVGTGVEYAAARDSGLAIVSQYDGIVDFVDATRIVLKTKEGLKNYNL
DTFVRSNQGTSLTHVPLVRQGQKVEKGQVLADGPSIDKGELALGQNVVVAFTTWNGYNYE
DAIIVSERLVSEDVFTSIHIEEYTIERRQTKQGPEEITREIPNISENARKFLDDDGLVII
GTEVKPGDILVGKVTPKGQTQLSPEDKLLQAIFGEKSKNVKDNSLRVPNGGEGIIQAIKR
FPREKYELSADVLEVIKIYIVQKRKIQEGDKMAGRHGNKGVISKILPLEDMPHMEDGTPV
DIMLNPLGVPSRMNIGQVLEIHLGMAAKKLGQKISTPVFDGMTNEELIEIMDKAGMKNFG
KEVLIDGRTGEKFDNPVSVGVMYMLKLSHMVDDKLHARNVGSYSLITQQPLGGKAQNGGQ
RFGEMEVWALEAYGAAHTLREILTIKSDDIKGRTRAYESIVKDKKIPEPGIPESFNVLTR
EIQGLGFNIHMIDEKGNIKNIKSYDEADYVDEDLLTDCDEFEDEFDIDNFILSTNREPQK
KEHLEDFVKVEDSFDLVDNLDDNELDDIDNEIDEINDQDELD
NT seq
3909 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcattaaaagaaaaagaatttgggcattacgctaaaagaattgattacacaaaagta
agtgggaatttagatttaccaaacttaattgaaattcaaactgaaacatatgattgattc
aaaaaaacagggattagcgaagtgttcggggaggtatttccgattgttgggcatgaagga
aatatcgttttagagatgttagattgagaatttagagagccacgaagaacaatttctcaa
gcaaaagatgagtcaaaaatttttgaagcaccaatttattcaaatttaaaattaacaatt
aattcaaaagatgtagaagttgaaaaagcaattgttaagggagaacccgaattaattaaa
gcgtgaattgaagaacgtgttgggcatatgattacaattttaaaaaaaactactgatgtt
atttattatgatattcattctggcgatgaaatagcaacatgtacagtaacaattaaagaa
agattagatgataaactaattgttgatattacaattgaaaaagaaggtgaagtctttttt
ggtgattttccactaatgacaggaaaaggaacttttattgttaatggttcagaaaaagtt
gttgtttcacaattagttcgctcacccggagcatattataaaattgatttaaatcgtaaa
aatggagaaaatgtttattatgttgatttaattccgtcacgaggaacatggttagaattt
gaatcagatcataaaaaaattaaagttggaaaagaagaaaaatttgagaatgttttttat
gtaaaaatagataaatctagaaaagtatcggttgctaatttcttaacagcgttaggaatt
attaaagaagatgccctagatatttttggcgataataaattagtaaaaagtacttacgaa
ttagatccttatacaggtgatattttatatgaccaaagtattgctgttcaagaaatttat
aaaaaaattcgttcaggagaaacggcaacaccagatggtgcgacaaaatatttatatgga
ttattatttgataaacgtaaatatgatttaacaaaagcaggacgttttaaattaattcaa
aaattatcagttgaaaaccgaatttataacaaaatattagctgaagacattaaagatgta
aatggtaaagttgtttttaccgaaggaactttaatggataaagaagctattaacaagtta
aaaggaattttaaaagcaggtgcttgtttacaagaagttaaatttagtgatgaaattatt
tgttctaataaaatccaaaaaattaaagtatatgttgataatgaagttcgttctcgtgtg
gcaaatattattggaattgatcctaatgcaactgatgaatatgtaacagttcctgatgtc
ttggcaacattttcatatttattaaatttaacagatggaattggggaagttgatgatatt
gaccatttaggaaatcgtcgtgtccgaacaattggggaattattacaaaatcaatttcga
attggattactaagaattgaaaaaaatgttaaagaaaaaatgtcaacttcaaatttattt
aaaatgaaaccttcaaatattattaataataaaccattatcagcgattattggggaattt
ttcaatttatcacagttatcacaatttatggatcaaacaaatcctttagctgaattaaca
aataaacgtcgattaacagccctagggccaggaggactatcaagagaacgtgctggatta
gaagtccgagatgttcactactcacattatggccgtatttgtccaattgaaacaccagaa
ggaccaaatattggattaattaataacttagcaacatatgccaaaattaattcatatgga
tttattgaaacaccatatcgtcgtgttattggttgcaaagttaccatggaaaatgattat
ttaacagcggatgaagaaaaaaattatgttgttgcacaagctaatattcgtttaagtgat
aagggtgaaattttagatgaacaagtggttgcacgtttccaaggagaaaatattattgcc
ggacgaaatgatgttgactatgttgatgtttcaccaaaacaaattgtttcaattgcaaca
agttgtattccatttttagaaaatgatgatgccaatcgtgctttgatgggagccaatatg
caacgacaagcaattcctttaattgcgccaaattcaccatatgtaggaacaggagttgaa
tatgctgctgctcgtgactcgggattagcaattgtttcacaatatgatggaattgttgat
tttgttgatgcaacaagaattgttttaaaaacaaaagaagggttaaaaaattataattta
gacacttttgttcgtagtaaccaagggacatcattaacccatgtgccattagtgcgtcaa
ggacaaaaagttgaaaaaggacaggttttagctgatgggccatcaattgataaaggggaa
ctagccttaggacaaaatgtggtagttgcttttacaacatgaaatggttacaactatgaa
gatgctattattgtttcagaacgcttagtatcagaagatgtttttacatcaattcatatt
gaagaatatacaattgaacgtcgtcaaacaaaacaaggaccagaagaaattacgcgtgag
attcctaatatttctgaaaatgcacgcaaatttttagatgatgatggattagttattatt
gggacagaagttaaaccaggtgatattttagttggaaaagtaacaccaaaaggacaaacc
caattatcaccagaagataaattattgcaagcaatttttggtgagaaatcaaaaaatgtt
aaagataattcattacgagttccaaatggtggtgaaggaattattcaagcaattaaacgc
tttccacgagaaaaatatgaattatcagctgatgttttagaagttattaagatttatatt
gttcaaaaacgaaaaatccaagaaggagataaaatggctggtcgtcatggaaacaaaggg
gttatttcgaaaattttaccattggaagatatgccacatatggaagatggaacaccagtt
gatattatgttaaatccattgggggtaccatcacggatgaatattggacaggtgttagaa
attcacttaggaatggcagcgaaaaagttgggacaaaaaatttcaacgcctgtttttgat
ggaatgacaaatgaagaattaattgaaattatggataaagcaggaatgaaaaactttggg
aaagaagttttaattgatggtcgaacaggtgaaaaatttgataatccagtttcggtagga
gtaatgtatatgttgaaattatcacacatggttgatgataaattacatgcgcgaaatgtc
ggatcatattcattaattacgcaacaaccattaggaggaaaagctcaaaatgggggacag
cgttttggagaaatggaagtatgagcattagaagcatatggtgcagcccatacattgcgt
gaaattttaacaattaagtctgatgatattaaaggaagaacacgtgcatatgaatcaatt
gttaaagataaaaagattccagaaccagggattccagaatcatttaatgtgctaactcgt
gaaatccaagggttaggatttaatattcatatgattgatgaaaaaggaaatattaaaaat
attaagagttatgatgaagcagattatgttgatgaagatttattaacagattgtgatgaa
tttgaagatgaatttgatattgataattttattttaagtactaatcgtgaaccacaaaaa
aaagaacatttagaggactttgttaaagttgaagatagttttgatttggtagataactta
gatgataatgaacttgatgacattgacaatgagattgatgaaattaatgatcaagatgaa
ttagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
