Spiroplasma melliferum: SRED_002110
Help
Entry
SRED_002110 CDS
T07411
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase
KO
K18692
ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:
5.6.2.7
]
Organism
smei
Spiroplasma melliferum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smei00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
smei03019
]
SRED_002110
03009 Ribosome biogenesis [BR:
smei03009
]
SRED_002110
Enzymes [BR:
smei01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
SRED_002110
Messenger RNA biogenesis [BR:
smei03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
SRED_002110
Ribosome biogenesis [BR:
smei03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
SRED_002110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
AAA_19
PhoH
UvrD-helicase
Flavi_DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCO23639
LinkDB
All DBs
Position
395023..396405
Genome browser
AA seq
460 aa
AA seq
DB search
MSNFNQFGFKRFLNFGLAELNFVEPTIVQEKVMPLLLKHQNVICKAHTGTGKTFAFCLPI
LNNINYEQVKIQAIIVTPTRELAKQIYDNIRFFKKFEPNLQVNYFIGGEDIKRQIEQLQR
TQPHIIIATPTRLKDLFEQQSLNLGKLTTFIIDECDMLFDLGFIENVDYILSKVNSNVQV
SVFSATIPHELKPFLIKYLKNPHYLDLNANQLTNQNITHILIPTKHQERETILLKLLKTF
DPYLCLIFVNKKTDINKYYDLLLEHNYSVVQLHAGLEPRLRTQVVKRIRNLEYKYVIASD
IAARGIDFIGVSHVISIDLPNDLEYYIHRSGRTGRANYTGYSYVLYDTKNLTLVQQLISK
GITFKTKKWNQQGELVETVISIDKSKKHSSLVVDNEINKIIHRYKTKDNNKKVKPGYKKK
RKAEIDEFKKQVRRSHIKESIKRIKKEKAKERANKLFDKD
NT seq
1383 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaattttaatcaatttggctttaaacggtttttaaatttcggtcttgctgaatta
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attaaaagaattaaaaaagaaaaagcgaaagaacgggcaaacaaattatttgataaagat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
