Spiroplasma melliferum: SRED_002165
Help
Entry
SRED_002165 CDS
T07411
Name
(GenBank) Recombination factor protein RarA
KO
K07478
putative ATPase
Organism
smei
Spiroplasma melliferum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smei00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99976 Replication and repair
SRED_002165
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MgsA_C
AAA_assoc_2
AAA
RuvB_N
AAA_5
DUF815
AAA_16
DNA_pol3_delta2
Sigma54_activ_2
AAA_18
nSTAND3
AAA_22
Sigma54_activat
RsgA_GTPase
NPHP3_N
RNA_helicase
AAA_2
AAA_14
RCF1-5-like_lid
VapE-like_dom
TIP49
SKI
NB-ARC
AAA_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCO23694
UniProt:
A0ABX5UDA8
LinkDB
All DBs
Position
453165..454409
Genome browser
AA seq
414 aa
AA seq
DB search
MFEPLAFVLRPTTITDIIGQSHLINDQNGVISRMLKYNYASSLIFYGDPGVGKSSIARAL
ANDLQLEYAIFNAEIDKKQDLEKIIKQAANFERFIIIVEEVHRMNKDRQDILLQYLENGH
LIMFACTTENPYFVINPALRSRANIIKLERITVDEMLTGLQKIITKKKLPLTITNDALLL
ICQLASGDLRIAINILELCLNLYPTEEITVTIINNLAPSANLINFAEGDEHHDLKSALQK
SIRGSDVNAALYYFARLLASGDHEALLRRMLIIAYEDIGLANPAIAVHVKTAIDSFRQIG
LPEGRIPLGLAIVEMCLSEKSNSAYLATDQAYEDVLKGNLYPIPHHLRDTSYASAKKLGN
GRGYQYPHDFPNDYVAQQYLPKEMQGMVYYQPKLHSVYEKRINELYGRFTKKTK
NT seq
1245 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgaaccattagcatttgtcttacgaccaactacaataactgatatcattgggcaa
agccaccttattaatgatcaaaatggtgttatttcacgaatgttgaaatataattatgca
agttcattaattttttatggtgatccgggcgttgggaaaagtagtattgctcgagcatta
gccaatgatttacaacttgagtatgcaatttttaatgctgaaattgataaaaaacaagat
ttagagaagattattaagcaagcagcaaattttgaacgatttattattattgtagaagaa
gtacaccggatgaataaagatcggcaagatattttattacagtatttagaaaatggacac
ctaattatgtttgcttgcacaacagaaaatccatattttgtgattaatccagccttacgg
tcacgagctaatattattaaattagaacgaattactgttgatgaaatgctaactggttta
cagaaaataattacaaagaaaaaattgccactaacaattactaatgatgctttactatta
atttgtcaattagcaagtggtgatttacgaattgcaattaatatattagaattatgttta
aatttatatcccacagaagaaattactgtgacaattattaataatcttgctccatcggct
aatttaattaattttgcagagggtgatgaacatcatgatttaaaatcagccttgcaaaag
tcaattcggggtagtgatgttaatgctgctttatattattttgcacgcttattagcaagt
ggtgatcacgaagcattattacgtcgaatgttgattatcgcttatgaagatattgggtta
gctaatccagcaattgcggttcatgttaaaacagcgattgatagttttcgtcaaattgga
ttaccagaggggcgaattccattaggattagcaattgttgaaatgtgtttaagtgaaaag
tcaaatagtgcttatttagcaacagatcaagcttatgaagatgttttaaaaggtaacctt
tatccaattcctcatcatttacgtgatacgagttatgcttccgcaaaaaaattaggaaat
ggtcgtggttatcaatatccacatgattttccaaatgattatgtcgcgcaacaatacctt
ccgaaggaaatgcagggcatggtttattatcaaccgaaattacatagtgtatatgaaaaa
cgaattaatgaattatatggacggtttacaaaaaaaaccaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
