Spiroplasma melliferum: SRED_002203
Help
Entry
SRED_002203 CDS
T07411
Name
(GenBank) putative exodeoxyribonuclease V alpha subunit
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
smei
Spiroplasma melliferum
Pathway
smei03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smei00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
SRED_002203
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
smei03400
]
SRED_002203
Enzymes [BR:
smei01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
SRED_002203
DNA repair and recombination proteins [BR:
smei03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
SRED_002203
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
SH3_13
UvrD_C_2
Viral_helicase1
HHH_RecD2
OB_YrrC
AAA_11
UvrD-helicase
SLFN-g3_helicase
AAA_22
PhoH
Helicase_RecD
PIF1
RsgA_GTPase
AAA_29
AAA_12
nSTAND3
AAA_5
AAA
AAA_24
DEAD
Mg_chelatase
AAA_28
NPHP3_N
Cac1_C
AAA_16
NACHT
ABC_tran
SMC_N
T2SSE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCO23729
LinkDB
All DBs
Position
494120..496282
Genome browser
AA seq
720 aa
AA seq
DB search
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NGDVGIIIDIKKDKNLNDVILVKYDNVITYTKELYYDITLAYACSVHKLQGSEYDNIIFV
ITKSFWMMLKRNLIYTAITRAKTKLYLIGEPSAFLYGVNNLPQKRRTTLQEKIKTFLKEQ
NT seq
2163 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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tag
DBGET
integrated database retrieval system
