KEGG   Spiroplasma melliferum: SRED_002633
Entry
SRED_002633       CDS       T07411                                 
Name
(GenBank) type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family
  KO
K01153  type I restriction enzyme, R subunit [EC:3.1.21.3]
Organism
smei  Spiroplasma melliferum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smei00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:smei02048]
    SRED_002633
Enzymes [BR:smei01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.21  Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.21.3  type I site-specific deoxyribonuclease
     SRED_002633
Prokaryotic defense system [BR:smei02048]
 Restriction and modification system (R-M system)
  Type I R-M system
   SRED_002633
SSDB
Motif
Pfam: T1R_D3-like T1RH-like_C SWI2_SNF2 Par3_HAL_N_term Helicase_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: QCO24149
LinkDB
Position
complement(921713..923431)
AA seq 572 aa
MGDAINDGTIVDIFYEPRKKELHRNVDEFEKIDQEYEIIKERYKNETFMFDEAIKTLGFK
LNTFEKLIENDDRIAAISADFIEHYKTRINILKGKALFVAFNRKCAIKYYHEIINQAPEL
KENIRVIMTSNKQVDSDETLKLIGRDEDKKIFAKEFKDSESNFKIAIVVDMWLTGFDVPC
LDVIYLDKWLKMHNLMQAIARVNRVYEDEKTSKVKLSGLIVDYIGIWKNLNKALDFYNDN
GDKVSITGKTSEEVKERLLTTIDEILDKYFKEYKKTLWKKEKQQIKVYRLVEELHNLLIK
NNMLKSFIDDTKGLAKMLAISIGILNELEINVSAILIVLRKEIINFELGRLDIETDVTKL
STKINNAIICQGNIEQRDYKPVSLQTLMNYLIHLKEKTVNPEYTTELIKMTAEKMVEELK
KHSFIRAKKLSDKIDQLIDQLKEGHISLQEFKEMLINISQEIMDNSEAEKLNLTEGEYSF
YELISQEVYTKQYVNNQELLEITHEIYDKVKGTVTELWRIRPVEKSKVRTEIKKILIRHK
FPKESYSEDENSLRSQLTRQIEELVENDFKFE
NT seq 1719 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggcgatgctataaatgatgggaccattgttgatattttttatgagccgcgaaaaaaa
gaattacatcggaatgttgatgaatttgaaaaaattgatcaagaatatgaaattattaaa
gaaagatataaaaatgaaacatttatgtttgatgaggcaattaaaacattagggtttaaa
ttaaatacttttgaaaaattaattgaaaatgatgatcgaattgcagcgattagtgctgat
tttattgaacattataagactagaattaatattttaaaaggcaaagcactatttgttgct
tttaatcgcaaatgtgcaattaagtattatcatgaaattattaaccaagcaccagaatta
aaagaaaatattagagttattatgacttctaataaacaagttgactcagatgaaacatta
aaattaattggtcgagatgaagataaaaaaatttttgcaaaagaatttaaagattcagaa
tcaaattttaaaattgcgatagtagtggatatgtgattaactggctttgatgttccttgt
ttggatgtaatttatcttgataagtgattaaaaatgcataatttaatgcaagcaattgca
agagttaatcgagtatatgaagatgaaaaaacaagtaaggttaaattatcgggtttaata
gttgattacattggaatttggaaaaacctaaataaggccctagatttttataatgataat
ggtgataaagtatcaattacggggaaaactagtgaagaagtaaaagaacgattgttaaca
acaattgatgaaatattagataaatattttaaagaatataaaaaaaccttatgaaagaaa
gaaaaacagcaaattaaagtttataggttagttgaagaattacataatttgttaattaaa
aataatatgcttaaatcatttattgatgacacaaaaggtctagcaaaaatgttagcaatt
tcaattgggattttaaatgaactagaaatcaatgttagtgccattttaattgtgctacga
aaagaaattataaattttgaattaggccgattggatattgaaacagatgttacgaaactt
tctactaaaattaataacgcaattatatgtcaaggtaatattgagcaaagagactataaa
ccagtatccttacaaactttaatgaattatcttattcatttgaaagaaaaaactgttaat
ccagaatatacgactgaattgattaaaatgacagcagaaaaaatggttgaagaacttaag
aaacatagttttattagagcaaaaaaattatcagataagattgaccaattaattgaccaa
ttaaaagaggggcatatttcattacaagaatttaaagaaatgttaattaatatatcacaa
gaaataatggataattccgaagctgaaaaattaaatttaactgagggtgaatattcattt
tatgaattaatttcacaagaagtttatacaaaacaatatgttaataatcaagaactactg
gaaataacacatgaaatatatgacaaggttaaagggactgtaactgaattatgacgaatt
agaccggtggaaaaaagtaaagttagaactgaaattaaaaaaattttaattcgtcataag
tttcccaaagaaagttactctgaagatgaaaatagtttaagaagtcaattaactcggcaa
attgaagaactagtagaaaatgatttcaaatttgaatag

DBGET integrated database retrieval system