KEGG   Spiroplasma melliferum: SRED_002830
Entry
SRED_002830       CDS       T07411                                 
Name
(GenBank) ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpB
  KO
K03695  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB
Organism
smei  Spiroplasma melliferum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smei00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03110 Chaperones and folding catalysts [BR:smei03110]
    SRED_002830
Chaperones and folding catalysts [BR:smei03110]
 Heat shock proteins
  HSP100
   SRED_002830
SSDB
Motif
Pfam: AAA_2 AAA_lid_9 AAA ClpB_D2-small AAA_5 AAA_16 AAA_22 Sigma54_activat nSTAND3 AAA_7 IstB_IS21 Mg_chelatase TniB bpMoxR ATPase_2 AAA_18 AAA_23 NBD_SMAX1 Zeta_toxin NACHT AAA_3 DNA_pol3_delta2 Torsin AAA_19 DnaB_2 VapE-like_dom ResIII KIF9 Mod_r V-SNARE
Other DBs
NCBI-ProteinID: QCO24336
LinkDB
Position
complement(1120389..1122530)
AA seq 713 aa
MDLTQQYEPGKDPKVLEKFAKNLNKEALAGKLDPIIGREDEINRVIRILSRRTKNNPVLI
GEPGVGKTAIVEGLAQRIVKGDIPSNLKNKTIYELDMGALIAGAKFQGEFEERLKAVLNK
VKESNGDIILFIDELHLIVGAGKTQGSMDASNLLKPMLARGELHCIGATTLDEHRLYIEK
DAALERRFQKVVVSESTIDESISILRGLKERFETFHGVKIHDNALVASVNLSSRYITDRF
LPDKAIDLIDEASATIKTEIASVPTELDNLNRRIVQLEIEKAALQKETDKASNERLVDIE
NELKPLKTKQQKLDIQWNSEKESITKLKNLKSQVEQLKKELDQAQLSGDFNRAGEIQYAL
LPKLEKQLNEQEKQASGSHLLKEDVTERDIAAIVGKWTGIPVDRLVETEKAKLLNLSKIL
RRRVRGQNEAIQVVADAIIRSRSGIKDPNKPIGSFLFLGPTGVGKTEVARSLAYVLFNSE
KQMVRLDMSEYMEKHSVSKLIGAPPGYVGHEQGGQLTEAVRRSPYSIVLFDEIEKAHPDI
LNILLQILEDGRLTDSLGKTVDFKNTIIIMTSNIGSEYLLNENNEGVGLLIQKELARKFK
PEFLNRIDNVVTFNALSKDVIKEIIEKELSELTQRIENSKNIRISYSEKVLEKILNEGYD
REFGARPIKRYIQQNLESLIAHAIISEEVQEGKSYTIDVVKNEMVIKNSTKLN
NT seq 2142 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatttaacacaacaatatgaaccaggtaaagatccaaaagttcttgaaaaatttgcc
aaaaatcttaataaagaagctcttgctggaaaattagatccaattattggacgtgaagat
gaaattaatcgagtaattcgaattttgtcacgaagaacaaaaaataatcctgttttaatt
ggtgaacccggggttgggaaaacagcgattgttgaagggctagcacagcgaattgttaaa
ggtgatattcctagtaatttgaaaaataaaacaatttatgaattagatatgggagcctta
attgctggtgctaaatttcaaggtgaatttgaagaacgtttaaaagctgtcttaaataag
gttaaagaatcaaatggtgatattattttatttattgatgaattacatttaattgtggga
gctgggaagacacaaggcagtatggatgctagtaacttgttaaaaccaatgttagcacgt
ggtgagttgcattgtatcggtgcaacaactttagatgaacatcgtttatatattgaaaaa
gatgctgccttagagcgtcgcttccaaaaagtcgttgttagtgaatcaaccattgatgaa
agtatttcaattttacgtggtttaaaagaacgatttgaaacctttcatggtgttaaaatt
catgataatgctttagttgcatcagttaatttatcatcacgatatattactgatcgattt
ttaccagataaagcaattgacttaattgacgaagcttcagcaacaattaagacagaaatt
gcgtcagttccaacagaattagataatttaaatcgtcggattgttcagttagaaattgaa
aaagcagctttacaaaaagaaactgataaggcatctaatgaacggttagttgatattgaa
aatgaattaaaaccattaaaaacaaaacaacaaaaattagatattcaatgaaattcggaa
aaagaaagtattactaaattaaaaaacctaaagtcacaagttgaacagttaaaaaaagaa
ttagatcaagctcaattaagtggtgattttaatcgtgctggtgaaattcaatatgcttta
ttaccaaaactagaaaaacaattaaatgaacaagaaaaacaagcttcaggttcacacctt
ttgaaagaagatgtaactgaacgtgacattgcagcaattgttggaaaatgaactggtatt
ccagttgatcgtttagtagaaacagaaaaagcaaaattattgaatttaagtaagatttta
cgtcgccgtgttcgagggcaaaatgaggcaattcaagtagttgccgatgcaattattcgt
agtcgaagtggaattaaagatccaaataaaccaattggtagtttcttatttttagggcca
actggagttggaaaaacagaagttgcccgtagtttagcatatgttcttttcaattcagaa
aaacaaatggtacgattagatatgtctgaatatatggaaaaacattcagtaagtaaatta
attggggcgccgccaggctatgttggtcatgaacagggtgggcaattaacagaggctgtt
cgccgaagtccatattcaattgttttatttgacgaaattgaaaaagcacatcctgatatt
ttgaatattttattacaaattttagaagatggtcgtttaactgattcactaggtaaaacc
gttgattttaaaaatacaattattattatgacttctaatattggatcagaatatttatta
aatgaaaataatgaaggagttggtttattaattcaaaaagaattagctagaaaatttaaa
ccagagtttttaaatcgcattgataatgttgtaacctttaatgctttgtcaaaagatgtt
attaaagaaattattgaaaaagaattatctgaattaacacaacgaattgaaaatagtaaa
aacattcgtattagttattctgaaaaagtattagaaaaaattttaaacgaaggatatgat
cgtgaatttggagcacggccaattaaacgatatattcaacaaaatcttgaatctttaatt
gctcatgccattatttcagaagaagttcaagagggtaaatcttatacaattgatgttgtt
aaaaacgaaatggttattaagaatagcacaaaattaaattag

DBGET integrated database retrieval system