Spiroplasma melliferum: SRED_002962
Help
Entry
SRED_002962 CDS
T07411
Name
(GenBank) putative helicase
Organism
smei
Spiroplasma melliferum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
AAA_30
AAA_19
Viral_helicase1
Intein_splicing
nSTAND3
DEAD
PIF1
nSTAND6
PhoH
ResIII
AAA_25
TsaE
AAA_5
cobW
SRP54
AAA_22
AAA
AAA_16
UvrD_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCO24465
UniProt:
A0ABX5UD54
LinkDB
All DBs
Position
complement(1244516..1248379)
Genome browser
AA seq
1287 aa
AA seq
DB search
MEFTIQGDKFNNKNLLLNLYFLTNPKSKFTDDDVKNLRLKDITTVQGLDTFLKHNICISD
FFVSLINDQAKIKKDKKGSEKKLYDILIRFKSITLLDQMLDSNLSLTILGDIDPEIGIVN
VKNIFLTAMEKEKQEFETLATGVVLEVADNFRLDEAKLRTIFDSNVMANMKFLTSSFAEE
KERWLQYLRFQEQNLEYKRNNSCLYLKRKLTEYIKIPKTVPIGEKMHDTRFLAHNFWYVD
KKNFTNKNLTIGNLFEEIIIVELELLLDNLNKYSILKKLNNLSLANLQINRTYQKDVPLT
LFSFNFSENYVQDGADIYDLAVNIPETKMQQKDNYDFKKELIKIYMLENDIKQESDIDHE
TIKVTINQLEQYQIVNCFYEIKNEDEISFNELNKIIPPYGYLTYIGKGDSTLLRRSNVIL
DKISKNDVANPYLINYIFNIEDIKLKTQSNLITEKQLTFASNNLNGNQQKAIAKALNSQD
IFLLQGPPGTGKTEFIAELVYQYAKLGKKVLISSQNHVAIDNVLTRLAKTPLLVPLRLTG
EEVRKKNRFNDFNPDKLIFNNYRFIYAHLLRQYLTKWTGIGNDYENQKYELQKLKANAKM
LEKEINDYNHYTQKLNTLVAEREIIINQKLQYQTDNRKLTININNIRNLLDFLGNINWDG
IVTSTPDLVQLFNKHFGKLLQAKFGFQIDESYSLIETYKKLLTITTDNKALKDKEIELAE
LKQVSQELRDDDWMERLTVVQSEILELKNQFTLKQENIVFQKEQEAFKNDLEQLLQQYEE
QSAIVQNKISEINENKYEQEISYLEIETGTLNYKINALKVEVENIVNSINTIFNLNLVVK
DISGTINEIDKEINKIEHNLNFMLQEKATKFNFVNNMITFLNKNYKISDFLTQENIETNH
FTSAMERDTISYANQFLQDSVNVVAMTATSNQSYAQSKNKILRDYNISDIDIKKFAFDVV
VIDEVSKLTPMEIFMPLVYGKTVILVGDYRQLPPIMPYQEEDVALINEIYEENYSYHNFL
ELVTNSLFKKIISKCDDSVKEILVNQYRSHEDIMRIVNVFYENQLQLGDKTNQNNEKQHY
ITVENKEGLKIFDSNKAIYWIDSSKDKTNMNFVYEQGESGSTSLFNWLEIDLTIKALELI
EAGYNNLTVKLKKQPKVAVISFYSLHVKKLRKAINSLKFKNIKVEVSTVDDYQGRETEIV
IVNTVRNPHKQLSANKEFIKKYERLNVAFSRAKNMLIIIGAVSFFTNIDVEIPTIANPNI
TKTIKAYYEILRIIDSYGLVWRAKDLL
NT seq
3864 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatttacaattcagggcgataaatttaataataaaaatttattattaaatttgtat
tttttaacaaatccaaaaagtaaatttactgatgatgatgttaaaaaccttcggttaaaa
gatattacaacagttcaaggattagacacttttttaaagcataatatttgtatttctgat
ttttttgtttctttaattaatgatcaggcaaaaattaagaaagataaaaaagggtcagag
aaaaaactttatgatattttaattcgttttaaatcaattactttactggatcaaatgtta
gattcaaacttatcattaacaatactaggcgatattgacccagaaattggcattgttaat
gttaaaaatatttttttaacagcaatggaaaaggaaaagcaagaatttgaaacattagca
acaggagtagtgcttgaagttgctgataattttcgtcttgatgaagcaaaattacgaact
atttttgattcaaatgttatggcaaatatgaaatttttaacttcatcttttgctgaagaa
aaagaacggtggttacaatacttacgctttcaagaacaaaacttagaatacaagcgtaat
aattcttgtttatatttaaaacggaaattaacagaatatattaaaattccaaaaacagtt
ccaatcggggaaaagatgcatgacacaagatttttagctcataatttttgatatgttgat
aagaaaaattttactaataagaatttaacaattggtaatttatttgaagaaataattatt
gtagaattagaactattattagataatttaaataaatattcaatcttaaaaaaattaaat
aatttaagtctcgctaatttacaaattaatcgtacatatcaaaaagatgtgccattaacg
ctattttcttttaattttagtgaaaattatgttcaagatggagcagatatttatgattta
gcggttaatattcctgaaacaaaaatgcaacagaaagataactatgattttaaaaaagag
ctaatcaaaatatatatgcttgaaaatgatattaagcaagaaagtgacattgaccatgaa
acgattaaagtaactattaatcaattagaacagtatcaaattgttaattgtttttatgaa
ataaaaaatgaggatgaaatatcatttaatgaattaaataaaataatacctccttatggt
tatttaacttatattggcaaaggagactcaactttacttcgacgtagtaatgttatttta
gataagattagtaaaaatgatgttgcaaatccctacttaattaattatatcttcaatatt
gaagatattaagttaaagacacaatctaacttaattacggaaaaacaattaacttttgct
tcaaataatttaaatggaaatcaacaaaaagcaatagcaaaagctttaaactcacaagat
atttttctattgcaaggaccaccagggacagggaaaaccgaatttattgcggaattagtt
tatcaatatgctaaattaggaaaaaaagttttaatttcttcacaaaatcatgttgcaatt
gacaatgttttaacaagactagctaaaacacctttgttggttcctttacgcttaacagga
gaagaagttcgtaaaaaaaatcgttttaatgattttaatccggataaattaatttttaat
aattatcgttttatttatgctcatttattacggcaatatttaacaaaatgaactggaatt
ggaaatgattatgaaaatcaaaaatatgaattacaaaaattaaaagcaaatgcgaaaatg
ttagaaaaagaaattaatgattacaatcattatactcaaaagttaaatacattagttgct
gagcgagaaataatcattaatcaaaaattacaatatcaaactgataatcgaaaattaaca
attaatattaataatattcgcaatctattagatttcttaggtaatattaattgagatgga
attgtcacttcaacacctgatcttgtacaactatttaacaaacattttggaaaattattg
caagcgaaatttggatttcaaattgatgagtcatattcattaatagaaacatacaaaaag
ctattaacaattactactgataataaggcactaaaggataaagagatagaattagcagag
ttaaaacaagttagtcaagaattacgcgatgatgattgaatggaaaggttaactgttgtt
caaagtgaaattttagaattaaagaatcaatttacattgaagcaagaaaacattgttttt
caaaaagaacaagaagcatttaaaaatgatcttgagcaattattacagcaatatgaagaa
caaagtgctattgttcaaaacaaaattagtgaaattaatgaaaataaatatgaacaagaa
atttcttatttagaaattgaaacgggaacattaaattataaaattaatgctttaaaagtt
gaagttgaaaatattgttaatagtattaatacaatttttaatttaaatttagtagtaaaa
gatattagtggaacaattaatgaaattgataaagaaattaataaaattgaacacaacctt
aattttatgcttcaagaaaaagcaacaaagtttaattttgtaaataatatgattaccttt
ttaaataaaaattataaaatatcagattttttaacacaagagaatattgaaactaatcat
ttcacgtcggctatggaacgagatacaattagttatgctaatcaatttttacaagatagt
gttaatgttgttgcaatgactgcaacttcaaatcaatcatatgcacaaagtaaaaataaa
attttacgagattataatatttctgatattgatattaaaaaatttgcttttgatgttgtc
gttattgatgaggtaagtaagttgacaccaatggaaatttttatgccattagtatatggt
aaaactgttattttagttggtgattatcggcaattgccaccaattatgccatatcaagaa
gaagatgttgcattaattaatgaaatttatgaggaaaattatagttaccataatttttta
gaattagtaactaattcattatttaaaaaaattatctcaaaatgtgatgattcagtaaaa
gaaattttagttaatcaatatcgtagtcatgaagatattatgcgaattgtaaatgttttt
tatgaaaatcaactacaattaggtgataagactaatcaaaataatgaaaaacaacattat
attactgttgaaaataaagagggattaaaaatttttgatagtaataaagcaatttattga
attgattcatcaaaagataaaactaatatgaattttgtttatgaacaaggtgaaagtggc
agtacgagtctttttaattgattagaaattgacttaacaataaaagcattggaattaatt
gaagcaggatataataatttaactgttaaattaaaaaaacagcctaaagttgcagttatt
agtttttatagtctccatgtcaaaaaattacgaaaagcgattaatagtttaaaatttaaa
aatattaaagtagaagtttcaacagttgatgattatcaagggcgagaaacagaaattgtt
attgttaatacagtccgaaatccgcataagcaattaagtgctaataaagaatttattaaa
aaatatgaacgattaaatgttgcattttcaagagcaaaaaatatgttaattattattggc
gcagttagtttttttactaatattgatgttgaaattccaacaattgctaacccaaatatt
acaaaaacaatcaaagcatattatgaaattttacgaattattgacagttatggtcttgtt
tggagagcaaaagatttattataa
DBGET
integrated database retrieval system
