KEGG   Spiroplasma melliferum: SRED_003008
Entry
SRED_003008       CDS       T07411                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase I
  KO
K02335  DNA polymerase I [EC:2.7.7.7]
Organism
smei  Spiroplasma melliferum
Pathway
smei03030  DNA replication
smei03410  Base excision repair
smei03420  Nucleotide excision repair
smei03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smei00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    SRED_003008
   03410 Base excision repair
    SRED_003008
   03420 Nucleotide excision repair
    SRED_003008
   03440 Homologous recombination
    SRED_003008
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:smei03032]
    SRED_003008
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:smei03400]
    SRED_003008
Enzymes [BR:smei01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     SRED_003008
DNA replication proteins [BR:smei03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    Other elongation factors
     SRED_003008
DNA repair and recombination proteins [BR:smei03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    DNA polymerase I
     SRED_003008
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     SRED_003008
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol_A 5_3_exonuc_N DNA_polI_exo1 5_3_exonuc HHH_2 HHH_5 DUF7793 Tcp10_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: QCO24511
LinkDB
Position
complement(1299677..1302286)
AA seq 869 aa
MKKVLLIDGNSLLFRAFYATAYNGEMLKSLDGTPTNAVYAFANMLNKILKANNYYSVVVA
FDKGKKNFRHDLLVDYKDGRSKTPNELIVQFPIVKEFLDSYQIPYLEQEGYEADDLLGCL
AMLAEKEDFYVDIFSSDKDLYQLITNKTNILVPRQGDSADVIDEAALIAKWGIKPLQVPD
LKGLMGDPSDNLKGVPKVGEKTAIKLIKEYHSIENLYDNIEHIKGALQQNLLNHKESALL
CKKIATIFCDINLEHFTFTPFSPNQETLMQFYLKYNMNSFVTKLFNNQDNDIQNSNIKVK
IIEEWRSEFNENNTTVYLELLDENYHTSEIIGFGIVNSKGVFYFDYIHAKHDKLWHQFLN
DNKYQKLTYHAKSLIVALARDNIFVQNIEYDMMLAGYVYNSNAKNSLDTYINLFEKKQIL
TDELFYGKGVKKQIPADVIKLGHFIGEKAAYIHKLRPKIIELLKTNQQYDLYHNIELPTA
FALARMEINGVKVDQYELTTQTLRIEKIVQELNNEINDIAQKEINPNSPKQISELLFQDF
SLPDRKKGSTAQETLEEIKNNHVIIPKILDYRKYQKLYSTYLKGMEKYIFADGKVHTIYK
QTLTNTGRLSSVEPNMQNISIRDDIQKEVRKIFVVSSPDNILLSCDYSQIELRILAHMSK
DQDLIAAFNNNEDIHTNTAMKIFNLSKDEITPNIRRSAKAVNFGIIYGISDFGLATDLNI
SVAKAKAIINNYYQQFPTIKAFIDKQVEFCKQNGYVTTIFNRKRYVPEINDRNYMQREFG
KRIAMNMPIQGSAADIIKIALKNIDQEFLKLNLKAKIIAQIHDELIFEIPQVELIQVQKI
VKTLMEDSTKLDVKLIVDMKTGLSWYDLK
NT seq 2610 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaagtattgttaattgatggaaattctttgctttttagagcattttatgccaca
gcttataatggcgagatgttaaaaagtttggatggaacaccaacaaatgctgtttatgca
tttgccaatatgttaaataaaatattaaaagcaaataactactatagtgttgttgttgct
tttgataaaggaaaaaagaattttcgtcatgatttattagttgactacaaagatggtcgg
agcaaaacaccaaatgaattaattgtacaatttccaattgtaaaggaatttttagatagt
tatcaaattccatatttagagcaagaaggatatgaggctgatgatctattaggatgttta
gcaatgttggctgaaaaagaagatttttatgttgatattttttccagtgataaggattta
taccaactaattactaataaaacaaatattttagtgccacgtcaaggcgatagtgctgat
gttattgatgaagctgctttaatagcaaaatggggaattaaaccattacaagttcctgat
ttaaaagggctaatgggtgacccttccgataatttaaagggtgttccaaaagttggcgaa
aaaacagcaataaaattaattaaggaatatcattcaattgaaaatttatatgataatatt
gaacatattaagggtgctttacaacaaaatttattgaatcataaagaaagtgcattattg
tgcaaaaaaatagctactattttttgtgatattaatttagagcattttactttcactcca
ttttcaccaaatcaggaaacattaatgcaattttatttaaaatataatatgaattcattt
gtaacaaaactatttaataatcaagataatgatatccaaaactcaaatataaaagtaaaa
attattgaagaatgacgttctgaatttaatgaaaacaatactactgtgtatttagaacta
ttagatgaaaattatcatacttcggaaattattggatttggaattgttaattccaaaggc
gttttttattttgattatattcatgcaaagcatgataaactatgacatcaatttttaaat
gataataaatatcaaaagttaacttatcatgcaaaaagtttaattgttgctctagctcgt
gataatatttttgttcaaaatattgagtatgatatgatgttggctggttatgtttataat
tcaaatgcaaaaaatagtttagatacttatattaatttatttgagaaaaaacaaatttta
actgatgaattattttatggaaaaggggttaaaaaacaaattcctgctgatgtaattaaa
ttaggtcactttattggcgaaaaagcagcatatattcataaattaagaccaaaaattatt
gagttattaaaaactaatcaacaatatgatttgtatcataatattgagttaccaactgct
tttgcattagcacgaatggaaattaatggtgttaaagttgaccaatatgaattaacaaca
caaaccttacgaattgaaaaaattgttcaagaattaaataatgaaattaatgatattgca
caaaaagaaattaatcctaattctccaaaacaaatttcagaattattatttcaagatttt
tccttacctgatcggaaaaaaggatcaacagcacaagaaactttagaagaaataaaaaat
aaccatgtaattattccaaagatcttagattatcgaaaatatcaaaaattatattcaact
tatttaaaagggatggaaaaatatatttttgctgatgggaaagttcatacaatttataaa
caaaccttaacaaatactggcagactttcatctgtggaacctaatatgcaaaatattagt
attcgtgatgatatccaaaaagaggtacgaaaaatttttgttgtttcatcaccagataat
attttattatcttgtgattattcacaaattgaattacgaattttggcacatatgtcaaaa
gaccaagatttaattgctgcttttaataataatgaagatattcatactaatactgcaatg
aaaatttttaatttatcaaaagatgaaattactccaaatattcgtcgtagtgcaaaagct
gttaattttggtattatttatggaattagtgactttggtttagcaactgatttaaatatt
tctgttgcaaaagcaaaagcaataatcaataattattatcagcaatttccaacaattaag
gcttttattgataaacaagttgagttttgtaaacaaaatggctatgttacaacaattttt
aatcgaaaacgttatgttccagaaattaatgatcggaattatatgcaacgtgaatttgga
aagcgaattgcaatgaatatgccaattcaaggtagtgcggcagatattattaaaattgct
ttaaaaaatattgaccaagagtttttaaaattaaatttaaaagcaaaaattattgcacaa
attcatgatgaattaatttttgaaattccgcaagttgaattaattcaagtgcaaaaaatt
gttaaaacattaatggaagattctactaaattagatgtaaagttaatagttgatatgaaa
actggtttaagctgatatgatttaaaataa

DBGET integrated database retrieval system