Silurus meridionalis (southern catfish): 124393846
Help
Entry
124393846 CDS
T08004
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
smeo
Silurus meridionalis (southern catfish)
Pathway
smeo04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smeo00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
124393846
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
smeo00536
]
124393846
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
smeo00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
124393846
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124393846
NCBI-ProteinID:
XP_046717842
LinkDB
All DBs
Position
11:18826929..18888107
Genome browser
AA seq
2903 aa
AA seq
DB search
MSWKRNLRCFAGCMALLCALVGNLAGEMPGRSAFQVERSSESRVRRRGKQESLRGPNVCG
SRLHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGEGFCSRPNMCTCPTGQIAASCTAKSSQQCS
IKCMNGGVCEADHCQCQKGYTGNYCGQPVCEKKCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQCERD
YRTGPCFSQVVNKMCQSQVSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEECPAQPQPCRRGFIPNIR
TGACQDVDECQAVPGLCQGGNCINTVGSFECKCPAGHRLNDVSNKCEDVDECSTIPHVCE
GGQCTNSVGSFSCVCPSGSVLSADKTRCFGQHTGSCFAAVLSGRCAQEMSGHQTKAQCCC
DRGRCWARGTVPEICPSRRSDEFHRLCLEGGYPDVDPGIKVDRVPHQPFGHDGQPLYPTN
GNGPIYPELPHIPHVPQIPQIPHVPHVPQIPQIPQIPQIPYIPINGHGNGNGQRPQGPVV
SLNQTTNKCLLMPNLCLNGRCIPVGFGHRCECNIGYKLDSQMECSDVDECASGPCANGDC
VNTAGSYYCKCHTGFHRPPGKQACIDTDECLHNGLLCQNGRCLNMPGSFRCICNAGFQLT
PDGRNCMDHDECSITNMCLNGMCINEDGSFKCVCKPGFTLAPSGRYCTDIDECLNPGICI
NGRCINTDGSYRCECLAGLAVGPDGRSCVDTHMRSTCYGAIKKGVCIHPFHGAVTKSVCC
CVSSDYSFGEPCQPCPALNSAGFNALCPSGIGFSVDGTDINECALDPDICSNGVCENLRG
SYRCICNSGYETDQNNRACLDIDECLVNRLLCDNGLCRNVPGSYTCTCPLGYVFRQDTDT
CEDVNECESSPCINGACKNNAGSFSCVCSPGSVIDRTGLICIDSLKATCWMNIQEGRCEM
NINGATLRSECCATLGAAWGSPCEPCERDLVCQRGFTRPSGTICEDVNECEVFPGVCLNG
RCVNTQGSFKCQCPEGLTLDGSGRLCIDIRSELCYLTYDEDMCGQPVPGRFRIDVCCCTV
GAAWGKECEACPEPGTREYEMLCPRGPGFANRGDIITGRPMYKDINECKVFPSMCTYGIC
RNTIGSFRCRCNSGFTLDMDGRNCTDIEECQISPDLCEHGTCVNTPGSFDCDCSPGYESG
FMMMKNCMDIDECERNPALCRGGSCVNTDGSYQCVCLPGYQLSEDGEACEDVNECELSAT
LCPNGECVNVAGTYHCSCFSGYQSVPDRKGCTDIDECTIENGGCDFHCTNSEGSYTCACV
QGYALMPDQRTCTDVDECEEEPDICDGGQCTNVPGEYHCDCFEGYMSSLITKTCIDVNEC
ELNANICMFGECENTKGSFICHCEVGYSVKKGLSGCTDVDECKINAHDCAIHATCVNTAG
SFQCSCNEGWVGDGVKCVDVDECTNQTHKCSPDANCMNTPGSYHCACSEGFKGDGLRCLD
IDECTENADVCENGQCLNIPGDYRCDCEMGFAATPDSRACQDIDECAFQQLCVFGTCKNL
PGMFRCICEEGYELDRSGGNCTDVDECLDPINCVNGYCVNTPGSYECNCPTDYELNPTGV
GCVDPRVGTCFLDVLNRGRAGLACSVEVGIGVSRSACCCSLGRAWGNPCEFCPPANSSDY
NTLCPGGEGFRPNLVTIILEDIDECQELPGLCQGGDCINTFGSFQCDCPNGYHLNADSRI
CEDIDECLVNPGICGPGTCYNILGNYTCVCPQDYMQVNGGNKCMDMRKSLCFRNYNGTTC
DSELAFNITHRICCCGYNMGKAWNKPCQKCPIPGTEGFHTLCGNISPGFEINIETGKPVD
IDECQEIPGICTNGVCINHIGSFHCECPRGFSYNDLLLICEDNDECSGSEILCQRNADCI
NSPGSYRCECSDGFKLSPIGACIDRNECLETPNLCSHGKCVDIQGGYMCTCHVGFMATPN
GKMCMDIDECVRQPCRNGTCKNTVGSYNCLCHPGFELTLNNQCTDINECSAAYSQLCRNG
HCLNSIGSFHCLCEDGYDLTNDGKNCIDVNECLMLPGICAPGTCQNLDGSFRCICPPGYI
VQNNQCVDENECEEDPNICLFGSCYNNPGSFHCVCKPGFVLSESGRRCYDTRESFCFTRF
ENGKCTSPQPFNTTKDKCCCSTMSNEGWGYPCELCPKEHDAGFQDLCPFGYGIIPGIGDT
IIDMNECVENPGICHNGHCINTDGSFRCECSTGYTLNYTGIHCIDVDECAVGNPCGNGTC
TNMMGSFECNCEEGFEPGPTMTCEDINECRQNPLLCAFRCINTFGGYECSCPSGYTLRND
GRMCQDLDECAEGLHDCDTWGMNCKNLIGTFMCMCPPGTVRKMDDEVCHDENECRTKPGI
CENGHCVNTIGSYVCECGEGFQPDSTRTQCLDYRQGFCFTEVLQTMCQMSSSSRIPSTKS
QCCCDGGRGWGNQCELCPLPGTLKYRKLCPHGPGYATDGTDIDECKVIPNICKNGQCINT
IGSFKCHCSPGYTATITGTACVDLDECAMSPKPCNFICKNTEGSYMCSCPRGYILQEDGR
TCKDLDECLLKRHNCQFMCINTIGGFACKCPAGFTQHHTACMDNNECAAEPSLCGAKGIC
QNSPGSFSCECQQGFNLDSTGLHCEDVNECDSNHRCQYGCDNFLGGYRCSCPKGYTQHHQ
WNQCVDDNECSTRGTCGTASCYNTLGSFKCACPPGFNFEQLSSSCQDVNECSSFKNPCNY
GCSNTQGGYKCSCPPGYYRVGQGHCVSSLGFGKHPLGSASAAGTVEDNNLSPEGCYNCNV
NRPNNRGIRKRHTIDQSEEEAPVDLDSVDMDQPLLLVINISLCTHNHHILELVPALKPLV
YHVTYNITGGNQDDIFQLRQLEELSYLHCMPEKAFPGFYNLMISSSPLYDHAELLQLEDN
RDRDYLSGELGQNLHMKLHIILQ
NT seq
8712 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttggaagaggaatttgagatgttttgctggttgcatggctctgctttgcgctctg
gtggggaatttagccggagagatgcccgggaggagcgcgtttcaggtggagcgcagctcc
gagagccgagtgaggagacgcggaaagcaggagtccctcagagggccaaatgtgtgtgga
tctcgtttgcactcctactgctgtccaggctggaagactttgcctgggggcaaccagtgt
atcgtgcccatatgccggaacagctgtggagaaggcttctgttctcgacccaacatgtgc
acatgccccactggtcaaattgctgcttcttgtactgccaaatcatctcagcaatgtagc
atcaagtgtatgaatggtggtgtgtgcgaggcagatcactgccagtgtcagaagggttac
acaggaaactactgtgggcagccggtgtgtgaaaagaagtgccagaatggagggcgctgc
attgggcccaaccggtgtgcatgtgtgtatggtttcacaggtccacagtgtgaaagagat
tacagaacaggtccatgcttctcccaggttgtcaacaaaatgtgccagagccaggtcagt
ggcattgtgtgcactaagacgctgtgctgtgccaccgttggccgagcctggggtcacccg
tgcgaggaatgccctgctcaaccacaaccctgccgtagaggcttcatccccaacatccgc
actggagcctgccaagatgttgatgaatgccaggctgtgccaggtctgtgccaaggagga
aactgcatcaacacagtaggatcatttgagtgcaagtgtcccgctgggcatcggttaaat
gacgtctcaaataagtgtgaggatgtggatgaatgttccactattccacatgtgtgcgaa
ggaggacagtgcaccaactcagttgggagtttctcctgtgtgtgtccatctggatctgtg
ctgtctgcagacaagactcgatgctttggccagcacacaggctcctgttttgcagctgtg
ttgagtggacgctgtgctcaggagatgtctgggcaccaaactaaagcacagtgctgttgt
gacagaggccgctgctgggccagagggacagtgccagagatttgtcctagtcgcagatct
gatgaattccacaggttgtgtttagagggaggatatccagatgtggatcctggcattaaa
gtggacagagttcctcaccagccctttggacatgatggccaaccactttatccaacaaat
gggaatggtccaatatatccagagcttccacacatccctcatgtccctcaaatcccacaa
atccctcatgtccctcatgtccctcaaattcctcaaatcccacaaatccctcaaattcct
tatattcctattaatggacatggcaatggcaatggacaaagacctcaaggacctgttgtt
agtttaaatcagacaacaaacaaatgcctactgatgcctaacttgtgtcttaatggccga
tgcatcccagtggggtttggtcaccgctgtgaatgtaacattggttacaaattggacagt
caaatggagtgttcagatgtagatgaatgtgcttctggaccgtgtgcaaatggagactgt
gtgaacactgctggctcttactactgcaagtgtcataccggctttcacaggcctccaggc
aagcaagcctgcattgacactgatgaatgcctgcataacggattgctttgtcagaacggc
cgctgtctgaacatgccaggtagctttcgatgcatctgcaacgcaggcttccagctaaca
ccagatggcagaaattgtatggaccatgatgaatgttccataacaaacatgtgcttgaac
ggcatgtgcatcaatgaagatggcagctttaaatgtgtctgcaaacctggtttcacactc
gcccctagcgggcgctactgcacagatattgatgagtgcttgaaccctggtatctgcata
aatgggcggtgtataaacacagatgggtcttacaggtgtgagtgtttggcaggattagct
gttgggcctgatggtcgctcatgtgtggacacacatatgcgcagcacctgctacggagct
ataaaaaagggtgtgtgtattcaccctttccatggagcggtcaccaaatcagtgtgctgc
tgtgtgagttcagactacagctttggggagccttgccagccgtgccctgccttgaactcg
gcgggattcaatgccttgtgtccaagtgggatcggattttcagtcgacggaacagacatt
aatgagtgtgcactggatcctgatatttgctctaatggagtatgtgagaatctgagagga
agctaccgctgtatctgcaactcaggctatgagactgaccagaacaaccgtgcctgtctt
gatattgatgaatgcctggtgaacagattgctgtgtgataatggattgtgcagaaatgtt
ccaggtagctacacctgtacatgtccactgggttatgtcttcagacaggacacagacacg
tgcgaagatgtgaatgaatgcgagagcagtccatgtattaatggagcatgtaagaacaat
gcaggctctttctcgtgcgtatgctctcccggcagcgtgatcgatcggaccggcctaatt
tgcatcgactctttgaaggcaacatgctggatgaacatccaagaaggccgctgtgagatg
aatataaatggcgccacattgaggtctgagtgctgtgcaactctgggagctgcatgggga
agtccctgtgagccctgtgagagggatctcgtttgtcaaagaggcttcacacgaccaagt
gggaccatttgtgaagatgtcaatgaatgtgaagtgtttcctggcgtgtgtctgaatgga
cgatgcgtgaacacacaaggctcttttaagtgccagtgtcctgaaggactgacgctggat
ggctccgggcgtctctgtattgacattcgctctgagctttgctatctgacctatgacgag
gacatgtgtggtcagccagtgcctggaagattcaggatagatgtatgctgctgcacagtt
ggagctgcctgggggaaggagtgtgaggcatgtcctgagcctggtacacgcgagtatgaa
atgctgtgtccgagaggacctggctttgcaaaccgtggggacataattacaggcagaccg
atgtataaagacattaacgagtgtaaagtgtttcccagtatgtgtacatacggaatatgc
cggaacacaattgggagcttcagatgtcgctgcaatagcgggtttactctggatatggat
ggacgtaactgcacagacattgaggagtgtcagatctcccctgacctgtgtgaacatggg
acgtgtgtgaatactccaggcagttttgattgtgactgctcgccaggttatgagagcggc
ttcatgatgatgaagaactgtatggatattgacgagtgtgaacggaatcctgcactgtgt
cgtggaggctcctgtgtgaacacagatggtagttaccaatgtgtgtgtttacctggctat
cagttatctgaggatggggaggcttgcgaagatgttaatgagtgtgaactaagtgctact
ctgtgccccaatggggagtgtgtaaatgtggctggcacttaccattgctcttgcttttcc
ggataccagtcagtcccagacagaaaagggtgcacagatatagatgagtgcactattgag
aatggaggctgtgattttcactgcactaactcagagggcagctatacatgtgcctgtgtt
caggggtatgccttaatgcctgatcagagaacctgcacagatgtggatgaatgtgaagaa
gagcctgatatatgtgatggtggtcagtgcactaatgtacccggagagtaccactgtgat
tgctttgaaggatacatgtcttcattaatcacaaaaacttgtatagatgtgaacgagtgc
gagctcaatgccaacatctgcatgtttggagagtgtgagaacaccaagggctcatttatc
tgccattgtgaggttggctactctgtgaagaagggtttgtcaggctgcacagacgttgat
gaatgtaagatcaatgcccatgactgtgccatacatgccacctgtgtcaacaccgctgga
agcttccagtgctcatgtaatgagggttgggtgggcgatggggtaaaatgtgttgatgtg
gatgaatgcaccaatcagacccacaagtgcagtcctgatgctaactgtatgaacacacct
ggctcataccactgtgcctgttcagagggttttaaaggagatggtttaagatgtttagac
atagacgagtgcactgagaatgctgatgtatgtgaaaatggccagtgtctaaacatccct
ggagactatcgctgtgactgtgagatgggctttgctgcaacccctgacagcagagcttgc
caagatatcgatgaatgtgcctttcagcagctctgtgtgtttggtacatgtaaaaacctc
ccgggcatgttccgctgcatctgtgaagaaggctacgagttagaccgatccgggggcaac
tgcacagatgttgatgagtgcttggaccctatcaactgtgtgaatggctactgtgtgaac
acaccaggatcttatgaatgtaactgccctacagactatgaacttaacccaactggggtc
ggctgtgtggacccacgtgtagggacctgcttcctcgatgtgctgaaccgtgggcgcgct
ggcctggcttgtagtgtggaggtgggcattggtgttagtcgctcagcctgctgctgctcc
ctgggcagagcctggggaaacccctgtgaattctgcccccctgctaactcctcggactat
aacaccctgtgtccaggaggagagggattcaggcccaacctagtgacgattatactggag
gacatagatgagtgccaggagcttcctggtctttgccaaggtggagactgcatcaacacg
tttggcagcttccagtgtgactgcccaaatggctaccacctcaatgcagacagccgtatt
tgtgaggatattgatgaatgtttggtgaatcctgggatttgtggtccaggcacgtgctat
aacatactgggcaactacacatgtgtgtgtcctcaggattacatgcaggttaatggaggc
aacaagtgcatggacatgaggaaaagcctctgctttcgcaactacaatggcacgacatgt
gacagtgagctggccttcaacattacacatcgcatctgctgctgtggatataacatgggc
aaagcctggaacaaaccctgtcagaaatgtcccataccaggcactgagggctttcacact
ctttgtggaaatatttcaccagggtttgaaattaacattgaaactggaaaacctgttgat
attgatgagtgtcaggagattccagggatctgtaccaatggtgtatgcatcaaccatatt
ggaagttttcactgtgaatgtccaagaggattcagctacaatgatttgcttcttatttgc
gaagacaacgacgagtgcagtggttcagaaatcttgtgccagaggaatgcagactgtatt
aacagccctggcagctatcgctgtgaatgctcagatggcttcaaactttcacccattgga
gcctgtatagaccgaaatgagtgtttggaaactcccaacctttgcagtcatggcaagtgt
gtggacatccaaggtggctatatgtgtacatgccatgtcggctttatggccacccccaac
ggcaagatgtgcatggacatcgatgagtgtgtgcgtcagccctgtagaaatggcacatgt
aagaatactgtgggatcctacaactgcctatgccatccaggctttgagctcactctaaac
aaccagtgcacagatatcaacgaatgttcagcagcatacagtcagctgtgcagaaacggg
cattgcctaaacagcattggctccttccattgcctgtgtgaggatggatatgatctaacc
aatgatgggaagaactgcattgatgtgaatgagtgtttaatgctaccgggaatatgtgct
cccggaacatgccagaatttggatggctcttttcgctgtatctgtccgcctggttacatt
gtacagaacaatcagtgtgtagatgagaatgagtgtgaggaggaccccaacatctgtctg
tttggctcatgttacaacaaccctggcagcttccactgtgtgtgcaaaccaggctttgtt
ctctcggaaagtggacgtcgctgttatgacacaagagagagcttttgcttcacccgcttt
gagaatggaaagtgcaccagccctcagcctttcaacaccaccaaagacaagtgctgttgt
agcaccatgtccaatgagggctggggctacccctgtgaactctgccccaaagaacatgat
gctggatttcaggacctgtgtccttttggttatggaatcattccagggattggggataca
atcattgatatgaatgaatgcgtggagaacccaggcatttgtcacaacggccactgcatc
aacactgatggctccttccgctgcgagtgttctacaggctacacactcaattacactgga
atacattgtattgacgttgatgagtgtgcagtggggaacccatgtggaaacggtacttgc
actaacatgatgggtagctttgagtgcaactgtgaggaaggattcgagccagggcccact
atgacatgtgaagatataaacgaatgtaggcaaaaccctttgctttgtgccttccgatgc
attaatacattcggaggatacgagtgctcctgtccatctggctacacactccgtaatgat
gggagaatgtgtcaggacctggatgagtgtgcagaaggtttacatgactgtgacacctgg
ggtatgaactgtaaaaacctcattggaaccttcatgtgcatgtgtcctcctggaacggtg
cgcaagatggatgacgaagtgtgtcatgatgagaatgagtgtcgcactaagccaggtatt
tgcgagaatggccactgcgtgaacactataggcagttacgtgtgtgaatgtggagaaggc
ttccagcctgactcaacacgcactcagtgccttgactacagacaaggcttctgtttcact
gaggtgctgcagaccatgtgccagatgtcttccagcagcagaatacccagcaccaaatcc
cagtgctgctgtgatggtgggcgtggctgggggaaccagtgtgaactttgtcctttgcca
ggcacgctcaagtacagaaaactgtgtccacatgggccaggttatgccacagatggcaca
gatatcgatgagtgtaaggtcataccaaacatatgtaagaatggccagtgtatcaacact
attggttcgtttaagtgccactgtagtccaggctacacagccaccattacaggcacagct
tgtgttgacttggatgagtgcgcaatgtctccaaagccatgcaacttcatctgcaagaac
acagagggcagctatatgtgctcctgtccacgtggctatatcttgcaagaggatggcaga
acatgtaaagatttggatgaatgcctgttaaagaggcacaactgccagtttatgtgtatt
aacaccatcggaggcttcgcttgcaaatgtcctgcaggatttacacaacaccacactgcc
tgtatggataataatgagtgtgctgcagagcccagtctgtgtggagctaagggcatttgc
cagaactctccaggcagcttcagctgtgaatgtcagcaggggtttaacctggactctaca
ggcctgcactgtgaagatgttaatgagtgtgacagtaatcacagatgtcagtacggttgt
gacaactttttagggggttaccggtgcagttgccccaaaggctacacccagcaccaccag
tggaaccagtgtgttgatgataatgagtgctccactcgcggcacctgtggcacggcgtcg
tgttacaacacgttgggcagcttcaagtgcgcctgtccacctggattcaacttcgagcag
ctctccagcagctgccaagatgtgaatgagtgctcctcctttaaaaacccctgcaactat
ggctgctccaacacccagggaggctacaaatgcagctgtcctcctgggtactacagagtt
ggccaagggcactgtgtgtccagtctgggctttggaaagcatcctcttggatctgccagt
gcagcaggaacagtggaagataacaatctctctcctgaaggctgttataattgcaatgtg
aacagaccaaataatagaggaatccggaagagacacaccatcgaccagtctgaggaggaa
gctccagtagacctggacagtgtggacatggatcagcctttgctactggtaatcaacata
tccctctgcacccacaaccaccacatcctggagctggtgcctgccctcaaacccctcgtt
tatcacgtcacgtataacatcacagggggcaatcaggacgacatcttccaactcaggcag
ctcgaagagctcagctacctgcactgcatgcctgagaaagcgtttccagggttttataat
ttgatgatcagcagctctccactctatgatcatgcagagctgctgcagttagaggacaac
agggacagagactacctctcaggtgaactagggcagaacctgcacatgaagctgcacatt
atattacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system