Shewanella mesophila: K0I73_14280
Help
Entry
K0I73_14280 CDS
T09171
Name
(GenBank) response regulator
Organism
smes
Shewanella mesophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
HisKA
dCache_1
PAS
PAS_9
Hpt
PAS_4
HATPase_c_5
PAS_8
HATPase_c_3
FliG_M
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYJ85359
LinkDB
All DBs
Position
complement(3211369..3214983)
Genome browser
AA seq
1204 aa
AA seq
DB search
MVTKKNSLAYMFNRLGGSLLTLSFIVLFVVATVAVVSFESRLTRSIVSEVHSNLSDVSGQ
IDHQIQEHLSRYLDNLRFLYSTPPVSGLTRAKNNHGVDPVDSSSYLLWRKRLEIIFESFL
DNNSEYEQLRIVSLDGNEIVRVDRRANLVQVIDDPNLQNKSHRDYFATSVKLHPNEVYTS
AISLNREFGRIEYPHRPMLRLSIAIFDESGKRFGFMIANINVEQLLHSFEMMIPSPYQFI
LLDHDGFFLVHPDKGAQFSRDLAPEQRWDKRYFIVDEVEEDFHKAIDKYTDNKPYYIFRD
DVTLSSYSQNGQLQAILLISKNNIDQIMMSRRFSVYSFMLALSLLFAFVVTIVHRNAKNS
HALAAARAQSSAIIGSSKDAIISVSTIGRITSWNRSAQLLFGYDAKYAIGRMLSDLSLLE
EVDLAELVDKLHCDGRSLCLETSFKQGNGTQLYLSVFLSSITNEHHQSCGGAVIISDITI
EKRAAQKIQSINTELEKKVAIRTAELERASHVKSAFISNISHEMRTPLNGIVGTLNLLRR
EPLTASQSRYLNMTEVSVNALAILINDVLDLSKIEAGKLELNIQPFNPRHLVESLCSSMA
VKAQGEGLDFIIDLVDLNCISIVSDMHRVSQILANLINNAIKFTEEGMIKVSVTNLLTNT
GEMQFTCHVSDSGVGIAAENHNKLFQAFTQETMSISSKYGGTGLGLSICKQLSELLNGSI
SFESEKGVGSTFTFTMNLKEGDYRLTSLPPVLAGYRCALRVAKPPQLVCIERALMALGGE
VVSVQSLLDWLIDSQSCPESLPDVIIIEQQDPLLAELDNRWTELVSRFNPPKVLIFQRSG
EPPLRVTHVEVTLINNPLLMSELIKVFGEEEEQLPDSSYYHHSEFDASRTQLTLDKFALN
KVAGARVLLVDDNNINIEVAIGVLSTLPLVFVKAENGQEAIDVLMSCAEDNKPIDCILMD
CQMPIMDGYQCTREIRQGKAGDQYISTPIIAMTASAMMGEREKCINLGMNDYVTKPIVAE
ELQEKVFNWVVSGYFPKKLPTINNEIGLQFDGFNISADSYSVDMQIDSLDSEVDNSACDE
LDVSDDVWNITQSLTRLMDNVPLFIEICQMYLDSTPLQIGELKAAIELGDCEKARQLSHG
LKGLSSSIGAVELQVKLSDLESAAKAHNKHSLINLYDDIVPSYQRIVALIKCYLAQQLDQ
ACNR
NT seq
3615 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaactaaaaaaaacagtcttgcttatatgtttaatagattaggcggctcactatta
actctttcatttattgttctatttgttgtcgctactgttgccgttgtcagtttcgaatct
cggctaactcgctctattgttagcgaggtgcattcaaacttatctgatgtaagtggccaa
attgatcatcaaatacaggagcatttatctcgatatttagataatttacgatttttgtat
tcaacccctcctgtttctggtttaactcgtgctaaaaataatcatggtgtcgatcctgtt
gatagtagtagctatttattatggcgcaagcgattggaaattattttcgagtctttttta
gataacaacagtgagtatgaacaattacgaatagtatcgcttgatggtaacgagatcgtg
cgtgttgatcggcgtgcgaacctagtacaagtcattgatgatcctaatttacaaaataaa
agtcatcgggattattttgctacgagtgtaaagcttcaccctaatgaggtttacacttcg
gctatctcgcttaatagagagtttggccgaatcgagtatcctcatcgaccaatgttgagg
ctatcaattgcgatttttgacgagtcaggtaagcgctttggttttatgattgcaaatatt
aatgttgagcaattactgcactccttcgaaatgatgatcccgtctccctatcaatttata
ttgctcgatcatgatggatttttcttggtacatccagataagggggcgcagtttagccga
gacttagcgcctgaacagcgatgggataagcgttattttatcgttgatgaggttgaggag
gattttcataaagcaattgataaatatacggataacaagccatattatatttttagagac
gatgtaacgctttctagttatagtcaaaatggtcaattgcaagcgattttgcttatctca
aaaaacaacattgatcagattatgatgtctagacgctttagcgtttactcatttatgtta
gccctatctttactcttcgcttttgtggtaaccattgttcatcgcaatgcgaaaaacagc
catgctcttgctgccgcaagagcacaatcctcggcaattattggtagctcaaaagatgcg
attatatcggtttcaaccataggtcgaattaccagttggaaccgttctgctcagctgctt
tttggctatgatgccaagtatgccataggtagaatgcttagtgatttatcactattggag
gaggttgatctcgcagaactcgttgacaagttacactgcgatggtaggtcactatgtctt
gaaacctcttttaagcagggtaatggaacacaattatatctatcggtttttctgtcatcg
attactaatgaacatcatcagagctgtgggggcgcagtgatcattagcgatatcacgatt
gaaaagcgtgccgctcaaaaaatacaatcaatcaacacagaattagagaaaaaggtcgcg
attagaaccgcagagctagagcgggcaagccatgttaaaagtgcttttatttcaaatata
agccatgagatgagaactcctcttaacggtattgtcggtaccttaaatttgctaaggcga
gagcccttgaccgctagtcaatctcgttacttgaatatgacagaggttagcgtcaatgcg
ctagcgatactcattaatgatgtgttggatctttctaagatagaagctggtaagttagag
cttaatatccagccattcaacccgcgtcatttagttgaaagcttgtgcagcagtatggct
gttaaagcacagggagaagggctggattttattattgacctggttgatttaaattgtatt
tcgatcgtcagtgacatgcatagagtgtcacaaattttggccaatttaattaataatgcc
attaagttcaccgaggaagggatgattaaggtgagcgttactaacctgcttacaaataca
ggagagatgcagtttacgtgtcatgtttctgatagcggggttggaattgcagctgaaaac
cacaacaaactttttcaggcatttactcaggaaaccatgagtatttcatccaaatatggt
ggaacagggcttgggttatcgatatgtaagcagttaagtgagctactgaatggcagtatc
agttttgaatcggaaaagggtgttggtagtacttttacttttaccatgaatcttaaagag
ggagattacaggctaacttctttgcctcctgtgttagcgggatatagatgtgctttaagg
gtggcaaagccaccacagttggtatgtatcgagagagcgttaatggcattaggtggggag
gtggtttcggtgcaatcattattggattggcttattgatagtcaaagttgcccagaatca
cttcccgatgtcattatcattgaacaacaagatccactgctcgccgagttagataatagg
tggaccgaactcgtatctagatttaatcctccaaaggtactgatttttcagagaagtgga
gagcctccattgagagtaactcatgtcgaggtgacattaataaataatcctttactgatg
tctgagttaattaaggtgtttggcgaagaggaggagcaactgcctgactctagttattat
catcatagcgagtttgatgcgagtcgtactcagcttacattagataagtttgcattgaat
aaggttgcaggtgcaagggttttgcttgtcgatgacaataacatcaatatagaggtcgca
ataggcgtgttatcgacattgccccttgtgtttgtaaaagctgaaaatggccaagaggca
atagacgtattaatgagttgtgctgaagacaacaagccaatcgattgtattttaatggat
tgccaaatgccgatcatggatggttatcagtgtactagagagattcgtcaaggtaaggcc
ggagaccagtatatttcgacgccaattatcgctatgaccgctagcgccatgatgggagag
cgcgaaaaatgcattaacttgggtatgaatgattacgtcactaagcccattgtggcggag
gagttacaagaaaaagtgttcaattgggttgtttctggatatttcccgaaaaaacttccc
actatcaacaatgagataggtttgcaatttgacggttttaacattagtgctgatagttat
agtgtggatatgcaaattgatagtcttgatagtgaagttgataacagtgcctgtgatgag
ttagatgtaagtgatgatgtatggaatatcacccagtcgcttactcgattgatggataat
gttccgttgtttattgaaatttgtcagatgtacctagactccactccattacagattggc
gaactaaaagcggcaattgaactaggtgattgtgaaaaggcgcgtcaattgagtcatgga
ttaaaggggctatcaagcagtattggtgcggtagagttacaagtaaaactatccgactta
gaatctgcagcgaaagcacacaacaaacacagcttgatcaacttgtatgatgacatagta
ccttcgtaccagaggattgtcgcgctaataaaatgctatttagcgcaacagcttgatcaa
gcctgcaatagatga
DBGET
integrated database retrieval system
