Shewanella mesophila: K0I73_18915
Help
Entry
K0I73_18915 CDS
T09171
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
smes
Shewanella mesophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smes00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
smes02000
]
K0I73_18915
Transporters [BR:
smes02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
K0I73_18915
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYJ86179
LinkDB
All DBs
Position
complement(4294773..4296908)
Genome browser
AA seq
711 aa
AA seq
DB search
MSVKGSPFAYSTIGLAVLAAIASTIAVADEAANSIVDANIERITVTGRTFNDYKVGAASG
AMRGDINLMDTPQSVSVIPNFVTDEQLATNLSEVLVNDSSVTSGSEKWNRQVFNIRGFEL
SSGSGFLINGQQQWSHYVQPIETLQQVEVLKGPSSMLYGQSGPGGLINMVTKKPTYDTFF
DVGFDTDEHGSTRYQVDVGGCLNEDKTIRYRSVLVKQDTQYFREYQDGSSQERDRWLGYL
NLEFDITDDLLLSLKYDHTQDKTGIDRGGWLNSDGELIGGEDIIWDMPWAFTDNTVSNLG
AELTYHISDDWKVKAGYNDQQFNRQRLDSSPSLAKGSEDPFKDGYTISPFDRYDDWQHKT
GFIDFTGDFSTGSFDHKLLIGANMLDYYYGQLKDSGKRGQPVMPGQPLPKPDLDYHNDPD
GKYESEYKHYGFYIQDLMTLNDQWQLLAGVRYDEQKKEGAGNNSYAVSPKFGVIYSPAVN
GSIYVNYSKSFTPQGMVNDPEDVNDQMNLDPEYGEQYEIGTKWELFDGSLLLTGAVFDIT
VSNVTVRQNLEVPNDDGDKTITNQSGEQRHKGFEMGAQGQVSDSWFVTGSMMYLDAVYNT
GDALDGKTPVDAPEWSANIWTRYEITEALAFNFGAVYVGERFANTQNTISKDSYVRFDMG
AAYSMDVMGSDVSVRLNVKNLFDTDYLAGGTNTDVTVGEGRHFGLALEAKF
NT seq
2136 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgtcaaaggttctccatttgcttattcaactatcggtttagccgttctggcggct
attgctagtaccatagctgttgctgatgaagctgcaaattctattgtagatgccaatatt
gaacgtattacggttactggacgaacctttaacgattataaagtcggtgctgcgtcggga
gcgatgcgcggcgatatcaatttaatggacactccacaatcagtttcagtgatccctaac
tttgttactgacgagcaactagcgactaatttgtcagaagtgctagttaatgattcgagt
gttactagcggcagcgaaaagtggaatcgtcaggtattcaatattcgtggatttgagtta
tcttcaggctctggttttttaatcaatggtcagcaacagtggtctcactacgtacagccg
attgagacgttgcaacaagttgaagtgcttaaaggtccatcaagtatgttgtatggccaa
tctggccctggcggattgattaacatggtgaccaagaagcctacctatgacacatttttc
gatgttggttttgataccgatgagcatggatctacccgttaccaagtcgatgtgggcggc
tgtttaaatgaagataaaacgattcgttatcgcagtgtgttggttaagcaagacactcaa
tactttagggaatatcaagatggttctagtcaagagcgagatcgttggttaggttacttg
aatctagagtttgatattaccgatgatctattactgtcacttaaatacgatcacactcaa
gacaagacggggattgaccgcggtggttggcttaatagcgatggtgagttgatcggtggc
gaagatattatttgggatatgccatgggcctttaccgataatacagtatcaaacttggga
gccgagctaacttatcacatcagtgatgattggaaagtgaaagcgggttacaacgatcag
cagtttaatcgtcagcgtttagattcgtcgccaagtttagctaaaggttctgaagatcca
ttcaaagacggttataccatcagcccattcgaccgctatgatgactggcagcataagaca
ggctttatcgattttaccggtgattttagtacggggagtttcgaccacaaattgttaatc
ggtgccaatatgctggattactactatggccaactaaaagattctggcaaaagaggacaa
ccagtcatgcctggtcaaccgttgccaaaacccgatcttgattaccataatgatcctgat
ggtaaatatgaatccgaatacaaacactacggcttctatattcaagatttaatgacctta
aatgatcagtggcagttgttagcgggtgtacgttatgacgagcagaaaaaagagggcgcg
ggtaataacagctatgccgtatcaccaaagtttggcgtgatctattcgccagccgttaac
ggtagcatttacgttaactattcaaaaagcttcacgccgcaggggatggtgaatgatcct
gaagatgtgaacgatcagatgaacctggatcccgaatatggtgagcagtatgagatcggt
accaagtgggagctatttgatggtagcttgctgttaacgggtgctgtttttgatattacc
gtttctaatgtcaccgtcaggcaaaatcttgaggtgcctaatgacgatggtgataaaact
attactaaccaaagtggtgagcaacgccacaaagggttcgaaatgggcgcgcagggccaa
gtcagcgatagctggtttgtgacaggttctatgatgtatttagatgccgtttataatacg
ggtgacgcattagatggtaagacgccagtagatgcgcctgagtggtctgctaatatctgg
acccgttatgaaatcactgaagcattagcatttaactttggcgccgtgtatgtcggtgag
cgttttgcaaatactcaaaataccattagcaaagatagctatgttcgtttcgacatgggt
gctgcttattccatggatgtgatgggcagcgatgttagcgtgcgtttgaacgttaaaaat
ctattcgacactgactacttagcgggtggcaccaataccgatgtgacagtaggagaaggg
cgacactttggtttagcgttagaagctaagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system