Spiroplasma mirum ATCC 29335 SMCA: P344_00025
Help
Entry
P344_00025 CDS
T03382
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
smia
Spiroplasma mirum ATCC 29335 SMCA
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smia00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
smia03032
]
P344_00025
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
smia03400
]
P344_00025
Enzymes [BR:
smia01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
P344_00025
DNA replication proteins [BR:
smia03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
P344_00025
DNA repair and recombination proteins [BR:
smia03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
P344_00025
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHI57385
UniProt:
W0GJY8
LinkDB
All DBs
Position
5406..7847
Genome browser
AA seq
813 aa
AA seq
DB search
MSAEDNKNYDGEIKVIDIADEMKTSFLDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRILYAMWDL
NMTHDKQHKKSARIVGEVIGKYHPHGDTSVYEAMVRMAQDFSYRYPLIDGHGNFGSLDGD
EPAAMRYTEARMSKIAGELIKDIEKETVDFNDNYDGSEREPSYLTGYFPNLLINGASGIA
VGMATNIPPHNLNEIINGVIAITRNKDITTAQLIKIIKGPDFPTGALITAGNSLLKAYET
GNGSIIIRAKINIEEKNNLKNIIISEIPYQVNKARLVEKIAELIREKIINGIADLRDESN
RDGVRIVIELKRDAQETLILNKLYKMTPLQTNFSLNILALHKNQPKIMGLKQILNYFIEH
QVEIIIKRSIYELNKITSRLSILKGLKIALDNIDEVVEIIKKSDSSQTAISALMKRFELV
VEQAKAILEMRLQRLLELEVQKINDEIIEIEKRIIELNSFINSREKQLELMITELEVIKT
KYGDERRSMIIKEELTKIDPEELIKREEILIMLTKDGYVKRVSNDTFKPQNRGGKGVIGL
SNSEDVLSKIISANSIDSLLIFTDTGRVYKLRAYQIESYSRQARGIPIINLILIDKKENI
KSILAINELDESTDNLFFVTKRGIIKKTKLLEFNQIRNTGKVAIELKANDEVVDVILTKG
NDDIIIANSEGKVIRFNETEIRAMNRQSVGVKGISNGPNSEVIGICSGRDAKYILSITTN
GFAKKTLLEEYHITGRGTKGVKSMALTEKKGDLKFVKSVVGDEDILLATKHGNIIRIALD
QIPVSGRTTTGIKIIKLENDDVLEASELIRKND
NT seq
2442 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgcagaagataataaaaattatgatggtgagattaaagtaattgatattgctgat
gaaatgaaaactagttttttagattatgcaatgtctgtcattgtttcacgtgcaattcct
gatgttcgtgatggattaaaaccagttcatcgtcgcattctttatgccatgtgggattta
aatatgacccacgataaacaacataaaaaatcagcgcgaattgtaggggaagttattggt
aaataccacccccatggtgatacttctgtttatgaagcaatggttagaatggcccaggac
ttttcttatcgttaccctttaattgatggacatggtaattttggatcattagatggtgat
gaaccagcggcgatgcgttatacagaagcacggatgagtaaaattgccggggagttaatt
aaagatattgaaaaagaaactgttgatttcaatgataactatgatggtagtgaaagagaa
ccttcttatttaacaggatattttcctaatcttttaataaatggtgcaagtggaattgcg
gttggaatggctactaatattccacctcataacttaaatgaaattattaatggtgttatt
gctattacaagaaataaagatattacaaccgctcaattaattaaaattataaaaggacct
gattttccaacaggagctttaataacagcgggtaatagtttattaaaagcttatgaaact
gggaatggttcaattattattagagctaaaataaatattgaagaaaaaaataatctaaaa
aatataataatatcagaaattccttaccaagttaacaaagcacgattagtagaaaaaatt
gctgaattaattagggaaaaaataattaatggaattgctgatttaagagatgaatcaaac
cgggatggggtgcgcattgttattgaactaaaacgagatgcgcaagaaactttaatttta
aataagttatataagatgaccccgttgcaaactaatttctcattaaatattttagcttta
cataagaatcaaccaaaaattatgggtttaaaacagattctgaattattttattgaacac
caagttgagataataattaaacgaagtatttatgaattaaataaaattactagtcggtta
tcaattttaaaaggtttaaaaatcgcgttagataatattgatgaagttgtggagataatt
aaaaagtccgatagttcacaaacagcaatttctgcgttaatgaaacgttttgaattagtt
gttgaacaagcaaaagcaattttagaaatgcgtttgcaaagattattagaattagaggtt
caaaaaattaatgatgaaataattgaaattgaaaaaagaattattgaacttaatagtttt
attaatagtcgtgaaaaacaattagagttaatgattacagaattagaagttattaaaaca
aaatatggcgatgaacgccgtagtatgattattaaggaagaattaactaaaattgatcct
gaagaattaattaagcgagaagaaattttaattatgttaacaaaagatggttatgtaaaa
agagtctcaaatgatacttttaaaccacagaatcgaggcggtaaaggagtaatcggatta
tctaattcagaagatgtcttaagtaaaattataagtgctaatagtattgactccttatta
atttttactgatacaggaagagtttataaattgcgagcataccaaattgaatcttattct
cgacaagcgagaggaattccaattatcaatttaattttaattgataagaaagaaaatatt
aagtctattttagctattaatgaattagatgaaagtactgataatttattctttgtaact
aaaagaggaattattaaaaaaactaagttattagaatttaaccaaattcgaaatactggg
aaagttgcaattgaattaaaagcaaatgatgaagtagttgatgttatcttaacaaaggga
aatgatgatattattattgcaaatagtgaaggaaaagtaatacgttttaatgaaactgaa
attcgtgctatgaaccgccaatcagttggggtaaaaggaatatcaaatggccctaatagt
gaagttataggaatttgttctggccgtgatgcaaagtatattttatcaattactaccaat
ggttttgcgaaaaaaacattattagaagaatatcacattactggacgtggtactaaaggg
gtcaaatcaatggctttaaccgagaaaaaaggagatttaaaatttgttaaatcagttgtt
ggtgatgaagatattttattagcaacaaaacatggtaatataattagaattgcactagat
cagattccagtttctggacgaactacaactggaattaaaattattaaattagaaaatgat
gatgttttagaagctagtgagttaattagaaaaaatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
