Spiroplasma mirum ATCC 29335 SMCA: P344_04935 Help Entry P344_04935        CDS       T03382                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K03763   DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7] Organism smia  Spiroplasma mirum ATCC 29335 SMCA Pathway smia03030   DNA replication smia03430   Mismatch repair smia03440   Homologous recombination Brite KEGG Orthology (KO) [BR:smia00001]  09120 Genetic Information Processing   09124 Replication and repair    03030 DNA replication     P344_04935    03430 Mismatch repair     P344_04935    03440 Homologous recombination     P344_04935  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03032 DNA replication proteins [BR:smia03032]     P344_04935    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:smia03400]     P344_04935 Enzymes [BR:smia01000]  2. Transferases   2.7  Transferring phosphorus-containing groups    2.7.7  Nucleotidyltransferases     2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase      P344_04935 DNA replication proteins [BR:smia03032]  Prokaryotic type   DNA Replication Elongation Factors    Elongation factors (bacterial)     DNA polymerase III holoenzyme      P344_04935 DNA repair and recombination proteins [BR:smia03400]  Prokaryotic type   SSBR (single strand breaks repair)    MMR (mismatch excision repair)     DNA polymerase III holoenzyme      P344_04935 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP HHH_6 RNase_H_2 DNA_pol3_a_NII tRNA_anti-codon HHH_3 DEDDh_C DNA_pol3_a_NI Rv2179c-like Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AHI58309 UniProt:  W0GRP5 LinkDB All DBs Position complement(779469..783842) Genome browser AA seq 1457 aa AA seqDB search MDQQLIKLFIANDLEVDNAYFQDAKVVKSEYSTTDSIFWIVIAVNELLPINILAHVESTL RHNKKIPTKIALEINNLNYNISNIFEYIEYIRTHKSEVKQSYFNKLSADSFQLDDNNLIV RVTSESERKLVNEHCLYYQNHLRRYGFKDLTLTVKVEVVENDILAINQEEIDKIRENVHR QLSEQPQVLPTDIKKDSNNNWTKPRNFYGKVNLEVPTYNNIKDIDHDEPNVIIHGKIFAK DRIATTTKKFIYVLTITDGSDSISIKYFTRDENPDENLEALNINNWISVYGDIRYDTYAS EQVIFSKKIIKIEKEEITRLDNAPVKRVELHTHTKMSTMDGVVNVPDLFKLLSKWNHQAI AITDHLNIQVFPEVYNTSLKYPDLKVIYGLEADVLDDVVWYVKNPQQHNLWTAKYVIFDL ETTGLSNEYDEIIEFGAVIMDGISGERETVNHLFKPSIKLSSFTTELTGITDDMLQDKPT FLESVDKILGYFQDAILVAHNAEFDIGFIQSWIQKAGHPKINNTIIDTLQLSRALESGLK NYRLGSIARRYNVIYNEEVAHRADYDAIVLVDIYEHQLRKMINKFNVEVDEDLNKIHNNQ VYQKMRAKHLTILAKNQPGILDLFTLVTKSHTDYFYSSPKLLKSVINQHRENLLIGSSCV NGEIFELARNKSNEELEEAMAFYDYIEVQPPSVYKHLVQLGDLTQERLLTVISNIIHIAK KLNKLVVATGDVHYLNPEDKIFREVYIHSKGIGGKPHPLFDYKNRISEYPEQFLRTTNEM LAEFNFLNDEKLAYEIVVENTNKIADQIEKVQIIKDKLYIPSIEGSDQLLKELCYKNAYK KYGNPLPKIVADRLESELTVIIKRGFGVIYWIAHKLVDKSLRDGYLVGSRGSVGSSFVAT MSAITEVNPLQPHYICANCRYSEFITDGSVRCGYDLVDKPCPQCQIIMYGEGHDIPFETF LGFEADKVPDIDLNFSGEYQPVAHDFTKEMFGERSVYRAGTISTVAQKTAFGYVRGYFEA KNILHLKRKSEIERITKACEGVKRTTGQHPGGIVVIPNEYQVEAFTPVNFPADDTTSSWL TTHFDFHAIHDNVLKLDILGHVDPTVLKMLQDLTGVDPKTIPTNDHAVLSLFQNLDSLKI TPEDINNEKTGAIGIPEFGTGFVRKMLLDTKPSSFADLVQVSGLSHGTDVWIGNAQDLIK NHNITISQVIGCRDDIMVNLIYKGLSAKSAFKIMEDVRKGRGLTPEHVALMKEHNVEQWY IDSCNKIKYMFPKAHATAYVLMAWRIAWFKINYPVEYYATYFSTRTDVFDIKTILKGKAT IKNVLRDIQNRLELKDFTMLNKPSQKEKDLIPVYEVVLEMYARGIKMKNIDLQTSDVKNF KVIVENGEKIILPPFAAIDGLGEAVGESIVSARNTKQFISINDLQKRTNITKAHMQAFEE LGILNHLSEDDQITFNF NT seq 4374 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggatcaacaattaattaaactctttattgctaatgatttagaagttgataatgcttat tttcaagatgccaaagtagttaaaagtgaatatagtactactgatagtattttttggatt gttattgctgttaatgagttactaccaattaatattttagcacatgtggaatcaacatta cgacacaataaaaaaatacccactaaaatcgcgttagaaattaataatttaaattataat attagtaatatttttgaatatattgagtatattcgtacccataaatcggaagttaaacaa agttattttaataaactaagtgctgatagttttcagttagatgataataatttaattgtt cgtgttacttcggaaagtgaacgtaaattagttaatgaacattgtttatattaccaaaac catttacgtcgctatggttttaaagatttaactttaactgtcaaagtcgaagtggttgaa aatgatattttagccattaaccaagaagagattgataaaattagagaaaatgttcatcgc 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