Salvia miltiorrhiza (redroot sage): 130992873
Help
Entry
130992873 CDS
T09291
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC130992873 isoform X1
KO
K13144
integrator complex subunit 7
Organism
smil
Salvia miltiorrhiza (redroot sage)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smil00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
smil03041
]
130992873
Spliceosome [BR:
smil03041
]
Other splicing related proteins
Proteins involved in snRNP biogenesis
Integrator complex
130992873
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
INTS7_C_plants
INTS7_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130992873
NCBI-ProteinID:
XP_057773613
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(38816480..38822295)
Genome browser
AA seq
1156 aa
AA seq
DB search
MISRMERTPAACAMDWSIQLQKSLRSKIPGKRIEALEEMGRRLEWWNMEPKLTFAEYRIF
GLIPGEDKLFLNAIFLCLADAFRSGNKQTKECVVRIFVRMKRRKDRDDVGVLSKEKLENY
LELLSRVKEVFDKGDAEERGLALLLLGCWAYLAKDCPDVRYIVLSSLVAGDVLEVKAAYF
AAGCLSEMSDDFANVFLEILRTTILSQEISKDIKLAAGRAFAKLRCSFSVAEKAYKLGLK
LLMDSSEDDFSAIMLISLSRVASRWMLLVPSQIELLTLFQNEDRSLRMQATSLRCFRFLV
AREVCMFPSTTGTVHKLFGMLHRYELHPTLQLESLRILYKFLLIILSITPCMEIPELFQK
LFVVVQKMLISSVRSNRVLAVSVLADLSGKVLGRQDMWSGGSDYTLASQVISFILDQVLS
LVTPIVGNNKADFPVELEVKSLLKILFNLVEKYSKLRCLVLDSACLFICNLMKMIDRERG
SEKTVLSNPMMTEYVSHGKTLVESNIILTLSKIMAACLENIEYTDTETSHTLDLDALKLQ
VETVCHCSSIGSYTRLMNFLLLHLHSIFICMKNLTEHLLSPCNSLSLYCIDSILEFDKST
LSCAKEILERNNNWCAYKAGKNAACQGAWSTAAFIFEQLMKEVESPSCCSWLKSLARFST
SENQIQLFLLSGQGTCIVPGGSGLREMSVSALRTQSCKYIEILLRGCDAILCAEEILGAP
DIGHIFSFQRWFLTLRARALKKVADMMKLLDSVSSIQYGTGSGGEFDRGTLLSPGTSLTL
GPFVNSCIEVSCHMKKLAEEFDMLLTSFMGMDRQSVMSVSALALSCSIMAFTAAFAFLVP
DWCSSEIYRVSESGYLEEPLHALLIEDLLGRFKHIGYETRKNLLFLLKPFGNCNRCSSSR
FITQTCSYETVVLHKLCKYSVREVFNLRNEAARMQQDANALHQIINRGSEVLMNVISNLM
LIPFHAPHHFFQVRSAVSSQLFVMNEDGQVLDGSSILLGSPLSLSLSCQLKNMPAGVPGP
SNKVYCILGCKPHSSVTTKIGDSKRQSQLKKQEDEMDNMKELNEKLLRYVTGSVETEGRH
CRRRDNDCLMVTEYACFELNEHGQGFSTCFLDISILPVGAYRITWHSGYVDSGGSYWSLL
PVNAGPSIVVQDVTTV
NT seq
3471 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattagtcgtatggagcgaaccccagcagcttgtgccatggactggagcattcagctc
caaaaaagccttcgttcaaaaataccaggtaaacgtattgaggccctagaagaaatgggc
aggcggcttgagtggtggaacatggagccaaaattgacgtttgcagagtacagaatattt
ggcttaatccccggggaggataagctgttccttaatgctatttttctgtgcctggctgat
gcatttaggtccggcaacaaacagactaaagaatgtgttgttagaattttcgtgaggatg
aagaggaggaaagatagagatgatgtgggtgttttgagcaaggaaaagttggagaattac
ttggagttgttgagcagagtaaaggaagtgtttgataaaggggatgctgaagaaagagga
ctggctttactgttgcttggttgctgggcttatttagcaaaggattgtccggatgtgcgg
tatattgtgctgtcaagtttggttgctggtgatgttcttgaggtgaaggccgcgtatttt
gctgcaggctgcttatctgagatgtcagatgacttcgctaatgttttcttggagatactt
aggacaacaatcttgtcacaggagatatcaaaagacataaagttagctgcaggacgagca
tttgccaaattgaggtgctcattttcagttgcagagaaggcatacaagttaggtttgaag
ctcctcatggattcttcagaagatgacttctcagctatcatgctaatttcactttccaga
gttgcttctcggtggatgcttctagttcctagtcagatagaattgcttacactgtttcaa
aatgaagatagatctttgcggatgcaagctacatcattaagatgcttccgctttttagta
gcaagagaagtttgtatgtttccttcaactacaggcacagtccataagttatttggcatg
ctacacagatatgaacttcatccgacactgcagcttgaatctttaagaattttatataag
ttccttctgattattttatccatcactccttgcatggagattcctgagctttttcagaag
ctgtttgtagtagttcaaaaaatgctaatatcatctgtgcggtcaaacagagttttagct
gttagtgtgctagcagatctttcaggaaaagttttgggaagacaagatatgtggtcaggt
ggatctgattacaccctggcatcccaggtgatctctttcatcttagatcaagtcctttcc
ctcgtgacaccaatagttggtaataataaggctgactttcctgtggagcttgaggttaaa
agcttgctcaaaattttattcaacctggttgagaaatactcgaagcttcgttgcctagtg
ctcgatagtgcatgtttatttatatgtaatttgatgaagatgatcgacagagaaaggggc
tcagagaaaactgtcttgtcaaatccaatgatgacagagtatgttagccatggaaaaaca
ctggttgaatcaaatatcattctcactctgtcaaaaatcatggctgcttgtttggaaaac
attgaatacactgatactgaaaccagccacaccttggatttggatgcattgaaacttcaa
gtagaaactgtatgccattgtagcagtattggtagctacactaggctgatgaactttctg
ttattgcacttacattccatctttatctgcatgaagaatttgactgagcacttgttgtca
ccttgtaatagtttgagtttgtactgtattgattccattcttgagtttgataaatctact
ctcagttgtgcaaaggagatattagaaagaaataataactggtgcgcttataaggctgga
aaaaatgctgcctgccagggtgcgtggtccacagctgctttcatatttgagcagcttatg
aaagaggttgaatctccttcctgttgcagctggttaaaatctttggctcggttctctacc
tcagaaaatcagattcagctgtttcttttatctggccaaggcacatgtattgtcccaggt
ggaagtggtttacgtgaaatgagtgtcagtgccttgaggacccaaagttgcaagtatata
gaaattcttctcagaggttgcgatgcaattctttgtgccgaagaaattcttggagcccct
gacataggccatatattcagttttcaaagatggtttttgaccctcagagcaagggctctg
aaaaaagttgctgatatgatgaagctacttgattcagtttcatctatccaatatggcact
gggtctggtggagagtttgacagaggtactcttctttcgcccggtacttctttgacactt
ggccccttcgttaactcttgtattgaggtatcatgccatatgaagaaattagctgaggaa
tttgatatgctcttgacatctttcatgggtatggatagacaaagtgtaatgagtgtttct
gcacttgcattgagttgctctattatggccttcactgctgcttttgcttttctagttcca
gactggtgttcttctgaaatttatagagtttctgaatctggatacctagaggagccttta
catgccttgcttattgaagatcttcttgggcgatttaagcatataggttacgagactaga
aaaaatctccttttccttctgaagcccttcggcaactgtaacaggtgttcttcatctagg
tttataactcaaacttgttcttatgagacagtagtcttacacaaactttgtaagtattcg
gttcgggaggtttttaacttgcgcaatgaggcagccagaatgcaacaagatgctaatgca
ttgcatcaaattattaataggggttcggaagtgctaatgaacgttatctcaaatttgatg
ttaattcctttccacgctcctcatcacttctttcaagtgaggtctgctgtttcctctcag
ctctttgtcatgaatgaagacgggcaagttttagatggatcgtccattttgttagggtct
cctctctcgctgagtttgagttgtcaattgaaaaacatgcccgctggtgtgccaggtcca
tcgaacaaagtgtactgcattcttggttgtaaaccccattcttcggtaacaactaaaatt
ggagattccaaacgacaatcccaattgaagaagcaggaagatgagatggataatatgaag
gagctgaatgagaagctgctgagatatgtgactggctctgtggagactgaaggacgacat
tgcagaagacgagacaatgattgtttgatggtaactgaatatgcgtgtttcgaactgaac
gaacatggtcaaggtttctctacttgctttctcgatatttctattttacctgtaggtgct
tacagaatcacatggcatagtggttatgttgatagtggaggttcttattggagccttctt
cctgttaatgctggcccatcaatcgttgttcaggatgtaacgactgtgtaa
DBGET
integrated database retrieval system