Spiroplasma mirum ATCC 29335: SMM_0004 Help Entry SMM_0004          CDS       T03003                                  Symbol gyrA Name (GenBank) DNA gyrase subunit A   KO K02469   DNA gyrase subunit A [EC:5.6.2.2] Organism smir  Spiroplasma mirum ATCC 29335 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:smir00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03032 DNA replication proteins [BR:smir03032]     SMM_0004 (gyrA)    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:smir03400]     SMM_0004 (gyrA) Enzymes [BR:smir01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.2  DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)      SMM_0004 (gyrA) DNA replication proteins [BR:smir03032]  Prokaryotic type   DNA Topoisomerases    SMM_0004 (gyrA) DNA repair and recombination proteins [BR:smir03400]  Prokaryotic type   DSBR (double strand breaks repair)    NHEJ (non-homologous end-joining)     SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)      Facilitator       SMM_0004 (gyrA) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  DNA_topoisoIV DNA_gyraseA_C Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AHF60487 UniProt:  W0GJY8 LinkDB All DBs Position 4767..7208 Genome browser AA seq 813 aa AA seqDB search MSAEDNKNYDGEIKVIDIADEMKTSFLDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRILYAMWDL NMTHDKQHKKSARIVGEVIGKYHPHGDTSVYEAMVRMAQDFSYRYPLIDGHGNFGSLDGD EPAAMRYTEARMSKIAGELIKDIEKETVDFNDNYDGSEREPSYLTGYFPNLLINGASGIA VGMATNIPPHNLNEIINGVIAITRNKDITTAQLIKIIKGPDFPTGALITAGNSLLKAYET GNGSIIIRAKINIEEKNNLKNIIISEIPYQVNKARLVEKIAELIREKIINGIADLRDESN RDGVRIVIELKRDAQETLILNKLYKMTPLQTNFSLNILALHKNQPKIMGLKQILNYFIEH QVEIIIKRSIYELNKITSRLSILKGLKIALDNIDEVVEIIKKSDSSQTAISALMKRFELV VEQAKAILEMRLQRLLELEVQKINDEIIEIEKRIIELNSFINSREKQLELMITELEVIKT KYGDERRSMIIKEELTKIDPEELIKREEILIMLTKDGYVKRVSNDTFKPQNRGGKGVIGL SNSEDVLSKIISANSIDSLLIFTDTGRVYKLRAYQIESYSRQARGIPIINLILIDKKENI KSILAINELDESTDNLFFVTKRGIIKKTKLLEFNQIRNTGKVAIELKANDEVVDVILTKG NDDIIIANSEGKVIRFNETEIRAMNRQSVGVKGISNGPNSEVIGICSGRDAKYILSITTN GFAKKTLLEEYHITGRGTKGVKSMALTEKKGDLKFVKSVVGDEDILLATKHGNIIRIALD QIPVSGRTTTGIKIIKLENDDVLEASELIRKND NT seq 2442 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgagtgcagaagataataaaaattatgatggtgagattaaagtaattgatattgctgat gaaatgaaaactagttttttagattatgcaatgtctgtcattgtttcacgtgcaattcct gatgttcgtgatggattaaaaccagttcatcgtcgcattctttatgccatgtgggattta aatatgacccacgataaacaacataaaaaatcagcgcgaattgtaggggaagttattggt aaataccacccccatggtgatacttctgtttatgaagcaatggttagaatggcccaggac ttttcttatcgttaccctttaattgatggacatggtaattttggatcattagatggtgat gaaccagcggcgatgcgttatacagaagcacggatgagtaaaattgccggggagttaatt aaagatattgaaaaagaaactgttgatttcaatgataactatgatggtagtgaaagagaa ccttcttatttaacaggatattttcctaatcttttaataaatggtgcaagtggaattgcg gttggaatggctactaatattccacctcataacttaaatgaaattattaatggtgttatt gctattacaagaaataaagatattacaaccgctcaattaattaaaattataaaaggacct gattttccaacaggagctttaataacagcgggtaatagtttattaaaagcttatgaaact gggaatggttcaattattattagagctaaaataaatattgaagaaaaaaataatctaaaa aatataataatatcagaaattccttaccaagttaacaaagcacgattagtagaaaaaatt gctgaattaattagggaaaaaataattaatggaattgctgatttaagagatgaatcaaac cgggatggggtgcgcattgttattgaactaaaacgagatgcgcaagaaactttaatttta aataagttatataagatgaccccgttgcaaactaatttctcattaaatattttagcttta cataagaatcaaccaaaaattatgggtttaaaacagattctgaattattttattgaacac caagttgagataataattaaacgaagtatttatgaattaaataaaattactagtcggtta tcaattttaaaaggtttaaaaatcgcgttagataatattgatgaagttgtggagataatt aaaaagtccgatagttcacaaacagcaatttctgcgttaatgaaacgttttgaattagtt gttgaacaagcaaaagcaattttagaaatgcgtttgcaaagattattagaattagaggtt caaaaaattaatgatgaaataattgaaattgaaaaaagaattattgaacttaatagtttt attaatagtcgtgaaaaacaattagagttaatgattacagaattagaagttattaaaaca aaatatggcgatgaacgccgtagtatgattattaaggaagaattaactaaaattgatcct gaagaattaattaagcgagaagaaattttaattatgttaacaaaagatggttatgtaaaa agagtctcaaatgatacttttaaaccacagaatcgaggcggtaaaggagtaatcggatta tctaattcagaagatgtcttaagtaaaattataagtgctaatagtattgactccttatta atttttactgatacaggaagagtttataaattgcgagcataccaaattgaatcttattct cgacaagcgagaggaattccaattatcaatttaattttaattgataagaaagaaaatatt aagtctattttagctattaatgaattagatgaaagtactgataatttattctttgtaact aaaagaggaattattaaaaaaactaagttattagaatttaaccaaattcgaaatactggg aaagttgcaattgaattaaaagcaaatgatgaagtagttgatgttatcttaacaaaggga aatgatgatattattattgcaaatagtgaaggaaaagtaatacgttttaatgaaactgaa attcgtgctatgaaccgccaatcagttggggtaaaaggaatatcaaatggccctaatagt gaagttataggaatttgttctggccgtgatgcaaagtatattttatcaattactaccaat ggttttgcgaaaaaaacattattagaagaatatcacattactggacgtggtactaaaggg gtcaaatcaatggctttaaccgagaaaaaaggagatttaaaatttgttaaatcagttgtt ggtgatgaagatattttattagcaacaaaacatggtaatataattagaattgcactagat cagattccagtttctggacgaactacaactggaattaaaattattaaattagaaaatgat gatgttttagaagctagtgagttaattagaaaaaatgattaa

DBGET integrated database retrieval system