Spiroplasma mirum ATCC 29335: SMM_0183
Help
Entry
SMM_0183 CDS
T03003
Name
(GenBank) ABC-type transport system permease protein
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
smir
Spiroplasma mirum ATCC 29335
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smir00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
smir02000
]
SMM_0183
Transporters [BR:
smir02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
SMM_0183
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
TMEM132_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHF60642
LinkDB
All DBs
Position
185207..189691
Genome browser
AA seq
1494 aa
AA seq
DB search
MLLIKQCIISAFKNKAQMIVFTILILLSSLLGTTFYVTSNRLIDGNNYMGYGNFHYDYSF
NYISSGYDANNVQTISPWYTFDADYASTGYGVAELDFPTLTIGKADSALLPINLAATNFT
PGKTPTALVSSLDFQLDKKDVENGVFGSLYCFNFKSPSFLNSTIGQIYQRDIWGKPTSAQ
KTKAITLISNYMDMINNSQITTNLKLTIIDFINQNYKTTGWDLNQAAEFANKFINGSTWD
PLKPTAFVSSTDSWEVKGILNDTQNIPTIEYDKSTNKEIRNDILTYNGSSEKWGLRGNIG
VIAHTINKTVQKSSNFKFYYANSQNPEIIKSNQAILEKGSFRVRNLDTYDFFDTFAPFRG
YKNQDFFNLYYNLIGFLTNFEIATRNQAVVWSVTGKKYRFIAAWSSIIDSEGKFIPIYDD
PDQIKIIQQSNYWDSLKGMRDTVIVSPQYAKATGQSFDSKISVGQSQELYIGAYGGDTQD
IYPTIYDDDVIPSTDSQAILYISHPMFQELFGENNATGYLDGEFQDVSRGLLTHTGNIKN
KDADFLNFKKYLADNVNDLRNVTTAINNNTDNNLNNNSIFKTYADNANVNRRYTLLNSTI
KLYLIIAVVCVILFLLVISFVSFVLLKKIIEKQKTQIGILKANGYTTFEISSAYLLYLLI
PIIISVPIGWALGLVLQIPIMDIFNNYFIIPIKFSSNAFPLLYFFLLFIILIGLIVVLTC
YTMLGKSVLLLVNANQNIKPNLYLSRLVSRIKFKRFTNKFRLILISVSLKNIILFMLTFI
VATAILTLSLLIPTTINNISREYYKNIKYKTEYNLNNVQYNNPLSRYGLYNMTSPLPEFD
ENNPTPDPIGEDMAFAQYVRNSSGDSWQGVNDPEFQQYYSEYVTNMLLYNIAQLKGTNIS
LAMLDYIVKQAPVAKQDDVANLLQTIVCNMLPQVFGQEAIDNIPNDSYLQKWTYCVEKAT
NTILPSEIKEMWSRNSTIKNRFSFGFGSLPFDRQHDELYTGYQAKLMNINGQDVTDNNIL
INSYGYTKGNLNKMNLNNDDIFKYDPNNKTIPVLINQAAVKTYGLGVGDKINFGTMSNAL
QYLGKDNKMNDIKSEWWYFKTDDEMGNQQIYQMDLSKFTYSPQNDNSQQVWGYNVGTTDH
PNIIPYHQMKDIMLKIPKNLIDVSFWNKTPIKINSNTGQTETHLFCNETGDCAENGIVTS
AGDSYLIRVYDLGFDHTLNNLGDLVSSEFPTTWYNSAMTLGLLKSTSLDKIPTYNLSDYQ
YQVIGIQNTYDHPRIFLDQQYANKVLGYPTDVNANSQPYWFNGKYSTNEKAVDQTERYIL
NSTNGNYSMLNFKDNFAPAITNADYVGMKQQILIKLTSITIEIATFFIVLTIISAIIIIF
LMTDAFLAKYTKFIATLRIQGYAVREINSMILGMFIPFVLIGWALGFGLLWVIIKEAVSA
VLLNAGLVIPFTMSYYIIPIVFVIVMFMFAITFLISSKKILAMNVQLLATVNDE
NT seq
4485 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttattgattaaacagtgtattatatctgcttttaaaaataaggcccaaatgattgtc
tttacaattttaattttattatcttcgttattaggaacaacattctatgtaacttccaat
agattaattgatggtaataattatatgggttatggtaattttcattatgattactccttt
aattatatttcttcaggttatgatgctaataatgttcaaacaatatcaccatgatatact
tttgatgctgattatgcttcaacaggttatggggttgcggaacttgattttccaacttta
acaattggaaaagctgactccgccttattaccaattaacttagcagcaactaattttacg
cccggaaaaactcccactgcattagtaagtagtttagattttcagttggataaaaaagat
gtggaaaatggtgtttttggtagtttatattgttttaactttaaaagtccaagtttttta
aattcaacaattggccaaatttaccaacgtgatatttgaggaaaaccaacaagtgcccaa
aaaaccaaagcaatcactttaatttcaaattatatggatatgattaataattcacaaatt
acaacaaatttaaaattaacaattattgattttattaatcaaaattataaaacaactggg
tgagatcttaaccaagctgctgaatttgctaataaatttattaatggttcaacttgagac
cccttaaaaccaacagcctttgttagttcaactgatagttgagaagtgaaaggaatttta
aatgatacgcaaaatattccaacaatagaatatgataaatcaacaaataaagagataaga
aatgatattttaacttataatggtagttcagaaaaatgaggattacgagggaatattggt
gttattgcacatactattaataaaacagtgcaaaaatcatctaattttaaattttattat
gccaatagtcaaaatccagagattatcaaatcaaaccaagcaattttagaaaaaggatca
tttcgtgttcgtaatttagatacttatgatttctttgatacttttgctccatttcgtggt
tataaaaatcaagatttctttaacttatattataacttaattggatttttaacaaatttt
gaaattgcaacaagaaaccaagcggtggtgtgatcagtaaccgggaagaagtatcgtttt
attgcggcatggtcatcaattattgatagtgaaggaaaattcattcctatttatgatgac
cctgatcagataaaaattattcaacagtcaaattactgagatagtttaaaaggaatgcgt
gacacggtaattgtgtcgcctcaatatgctaaggctactggtcaatcgtttgattcaaag
attagtgttgggcaaagccaggagttatatattggagcttatgggggggatactcaagat
atttatccaacaatctatgatgatgatgtgataccttctaccgattctcaagcaatttta
tatatttcgcacccaatgtttcaagaattatttggggaaaataatgccactggttatttg
gatggtgaatttcaagatgtttcccggggattattaacccatactggaaatattaaaaat
aaagatgctgactttcttaattttaaaaaatatctagcggataatgttaatgatttaaga
aatgttaccaccgcaattaataacaatactgataataatcttaataataattcaattttt
aaaacctatgcagataatgcaaatgttaaccgtcgttatacgttattaaactcaacaatt
aagttatatttaattattgctgttgtttgtgtaattttattcttattagtaattagtttt
gttagttttgtattattgaaaaaaataattgaaaaacaaaaaacacaaattggaatttta
aaagccaatgggtatactacttttgaaatttcttctgcctatttattatatttattaata
ccaatcattattagcgttccgattgggtgagcgttgggattggtattacaaataccaatt
atggatatctttaataactactttattattccaattaaatttagttctaatgcgttccca
cttctatactttttcttattatttattatattaattggtttaattgtcgtcttgacttgt
tatacaatgttaggaaaaagtgtccttttattagtaaatgctaaccaaaatattaaacca
aacctgtatttgagtagattagttagtcggattaaatttaaacggtttactaacaagttc
cggttaattttaatttcagtatccttaaagaatattattttatttatgctaacttttatt
gtcgcaacggctattttgaccttatcattattaattcccacaacaattaataatatttcc
cgggaatactataaaaatattaagtataaaacggaatacaatctaaataatgtccaatat
aataatccattatctcgttatgggctttataatatgacttcacccttaccagaatttgat
gaaaataacccaacccctgatccgattggcgaagatatggcatttgctcagtatgtaaga
aatagtagtggggattcttggcaaggcgttaatgatcctgagtttcaacaatattatagt
gaatatgtgacaaatatgttattatacaacattgcgcaattaaaagggactaacatttcg
ttagcaatgctagactatattgttaaacaagcaccagtggctaaacaagatgatgttgct
aatttattacaaacaattgtatgtaatatgttaccccaagtatttggccaagaagcaatt
gataatattcccaatgatagttatttacaaaaatgaacttattgtgtagaaaaagcaact
aacacaattttaccttcggaaattaaagaaatgtggtcacgtaatagtaccattaaaaac
cgtttttcatttggttttggttccttaccatttgatcgccagcatgatgaattatatacc
ggttatcaagcaaaactgatgaatattaatgggcaagatgttaccgataataatatttta
attaatagttatggttatactaaaggcaaccttaataaaatgaatcttaataatgatgat
atttttaaatatgatcctaataataaaacaattccggttttaattaaccaagctgctgtc
aaaacttatggacttggagttggggataaaattaattttggaacaatgagtaatgccctt
caatacttaggaaaagataataaaatgaatgatattaaatcagagtggtgatattttaaa
acagatgatgagatggggaaccaacaaatttatcagatggatttaagtaaatttacttat
tcaccccaaaatgacaatagtcaacaagtatgaggttataatgttggaacaacagaccat
ccgaacattataccttatcatcaaatgaaagatattatgttaaaaattccaaagaactta
attgatgttagtttttgaaataaaactccaattaaaattaatagtaatactggtcaaacg
gaaacgcatctcttttgtaatgagaccggggattgtgctgaaaatgggattgtaacaagt
gctggtgattcttatttaattagggtctatgacttagggtttgatcacaccttaaataat
ttaggcgatttagtatcttcggagttcccaaccacatggtataacagtgcaatgactctg
ggattattaaaatcaactagtttagataaaattccaacctataatttgtcagattatcaa
tatcaagttattggaatccaaaatacttatgaccatccgcggatctttttagaccaacaa
tatgctaataaggtgttaggttatccaacggatgttaatgctaatagccagccatattgg
tttaacgggaaatattcaacgaatgaaaaagcagttgatcaaactgaacgctatatctta
aattcaacaaatggtaattattcaatgctgaattttaaagataattttgccccggcaatt
acgaatgctgattatgtggggatgaaacaacaaattttaataaaattaacttcaattact
attgaaattgcaaccttttttattgttttaacaattattagtgctattattattattttc
ttgatgacggatgcctttttagctaagtataccaaatttattgccactcttcggattcaa
ggttatgctgtgcgagaaattaacagtatgattttaggaatgtttattccattcgtgcta
attggatgagcgttaggatttggactattgtgagttattattaaagaagcagttagtgct
gttttattaaatgcgggcttagtaattcccttcacaatgagttattatattattccaatt
gtgtttgtaatcgtcatgtttatgtttgccattacctttttaatttcttcaaaaaaaatc
ttagcaatgaatgttcaattattagcaacagttaatgatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
