Spiroplasma mirum ATCC 29335: SMM_0302
Help
Entry
SMM_0302 CDS
T03003
Name
(GenBank) putative ABC-type transport system permease protein
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
smir
Spiroplasma mirum ATCC 29335
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smir00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
smir02000
]
SMM_0302
Transporters [BR:
smir02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
SMM_0302
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
MacB_PCD
Ctr
Peptidase_M17_N_1
DUF7020
Rho_RNA_bind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHF60753
UniProt:
W0GNW3
LinkDB
All DBs
Position
277657..281757
Genome browser
AA seq
1366 aa
AA seq
DB search
MSGFKLLFQNNIKNTIKNKIQFIGLVILVFLTCLIFTIIEVSKQRVENVYHNFISEKMSN
QHDFIVDFSQTSYVENAASGADQFLAISDVEVRQNAILDYLQAATMNSDFQFNFNRVEAR
VFNLGNNKVIKSVTLNPHQTIDKFVVSAGMPLSFYQQYLNSLNNETMHWVYLTPEFAKKN
NIKINDVIRLQADSYGTTIKVKDSELQPVDLSPYQKEDINKWLSKSPYAAQNWLRVVGFG
QSADFITPIIDQFHPFPNMNNEGLAYVDQKLFGLVNDTVRDANNQSYDITRLDITKQVLT
PASQSDREVYYVGKFTNNYRDEVKESLINNTLNTFLNSKWGATIGLHAYYSKTLTGNTPV
LTFRTDKRYPFAKRTTYFLTTLNGFIAGSYILIAVILIISFFVLVLVIKRQIESTGPQNG
ILRALGYRRREIISSYLSYPLLIALAGGIVGYLLGILSQSIIRIIFGAYFNLPYTGFALA
LWALVISFIAVFALLTGVTMISATIMMHSKTPLQLIKKEESFSAGQIKKIVQRICTVRKT
FDNRFQAVQFSNSLGKMFGVSLTMIISTILITISTTILFILQNNIRYSYTGDDYNTLVEY
QSPVYNLPTTFLKTYDPTQQPWDINNSAFSNTNMTRNADEYIKDFEQATINPENYSPTYN
ATEMRSMLYKNISKEFLKSNKLSVPTGDQYLLRAVCMSTWGDYKDYGLGNLTKATLETYL
ANPDKAKQHINELEQYRLFYWKYRETIALDVKRPQYFTNNNLNLDDSLNSELFTRSDYQK
TFGTSSTIIVLDNNHFRPGLEAPLKTSFRKVLDSGNAQDFNANLKKPMYDLYDWIYAFFI
NNVSQCFTQGVYTRSPQAVRTEMAAAFKDNSKSFNLAFGVVPFNPHTDDRGTMFHGQVNN
INVDVYGIDQSFNNQTLSDGKYTLNDKLFANSNNIVINQTLAKRLGLTTGDQITSKVLRQ
ALFKNSVNGYQEDAQQILNSWDESQVTGTDSSGQTVGKLLFNSTNNYQNDVLGEKGNNKV
LDSALNPSDPNATNPTILNNKIVDGSYLLGNDNGNEVFNIVGVNNQYGSARAWINNERAN
AILGYDQTRNHLLRLFMNEWQNSFVKSLPTLSVPYQTALSALETFIKNNQSTPINQLWTA
FVNNFQKQSLAVNWIKVFENEYPLFNYKLSKSVTTDDIQSGLATVQSFGDYSFYGLNGGI
VGTTVYPSYSERSFNNLLPIATAKEILQNLAQAVLGVIAFIIAISFILSFIIIILTSNVV
IAENRTIIATMKVLGYSNRYITKLVIGMYIPVIVIMTIAGFGFGWLFLTIGINVLTNMGM
VFPLMMNAAIPIIVIASGFVLYLIAYLISWFSMNKINPLVAIMSAN
NT seq
4101 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccggttttaagttattgtttcaaaataatattaaaaatacaatcaaaaacaaaatc
caatttattggcttagtaattttagtatttttaacttgtttaattttcacaataattgaa
gtttccaaacaacgtgttgaaaacgtttatcataattttatttctgaaaaaatgagtaac
caacatgattttattgttgatttttcccaaactagttatgttgaaaacgccgctagtgga
gcggatcaattcttagcaatttcagatgttgaagtccgccaaaatgcaattttagattat
ttgcaagcagcaacgatgaattcagattttcaatttaattttaatcgggtggaagcacga
gtttttaacttaggcaataataaagttattaaatcagtgacccttaatccccaccaaaca
attgataaatttgttgtgagtgccggaatgcctctaagtttttaccaacaatatttaaat
tccttaaataatgaaactatgcattgggtttatttaactcctgaatttgccaaaaagaat
aatattaaaattaatgatgtcattcgtttacaagccgatagttacggaacaacaattaaa
gttaaggatagtgaattacaaccagttgatttaagcccttatcaaaaagaagacattaat
aagtggttgtcaaaatcaccatatgctgcacaaaattggttacgggtagttggctttggg
cagtccgccgattttattacaccaatcattgaccagttccatccgtttcctaatatgaat
aatgaagggttggcatatgttgaccaaaaattatttggactagtcaacgatactgtccgg
gatgctaataatcaaagctatgatattacgagactagatattactaaacaagttttaacc
ccagctagtcaatctgatcgtgaagtttattatgttggaaaatttactaataactatcgt
gatgaggtcaaggaaagtttaattaacaataccctgaacacttttttaaatagcaagtgg
ggcgctacaattggtttacatgcatattatagtaaaacgcttacgggtaataccccagtt
cttactttccgaactgataagcgctatccttttgctaaaagaacaacttatttcttaaca
accttaaatggttttattgctggttcttatattctaattgcggttattttaattatttct
ttcttcgtgttagtcctagttattaaacgtcaaattgaatctactggtccccaaaatggg
attttacgagctttgggttaccgtcgtcgggaaattatcagtagttatctaagttatcca
ctcttaattgccctagcagggggaatagttggatatttattaggaattttaagtcaatca
attattcggattatttttggggcctactttaatcttccgtatactggttttgctttagca
ctctgggcgttagtaatttcttttattgcggtttttgcgttattaacgggggttacaatg
attagcgccacaattatgatgcactcaaaaaccccattgcaactaattaagaaagaagaa
tccttttccgccggacaaattaaaaaaattgtccaaagaatttgtaccgttcgtaaaaca
tttgataatcggttccaagcagtgcagttctctaattcattgggaaaaatgtttggtgtt
tcgttgacaatgattattagtactattctaattacaatttcaacaacaattctgtttatt
ttacaaaataatattcgttattcttatacgggtgatgattacaataccttagttgaatat
caatcaccagtttataatcttcccacaactttcttaaaaacatatgacccaacccaacaa
ccatgagatattaataatagtgcctttagcaatactaacatgacgcggaatgcggacgag
tatatcaaggattttgagcaagcaaccattaatcctgaaaattactcaccaacttataat
gctactgaaatgcggtcaatgttatataaaaacatttcaaaagaatttttaaaaagtaat
aagttaagtgtgcccactggtgatcagtatttattaagagcagtttgtatgagtacctgg
ggtgattataaagactatggattaggaaacttaactaaagcaacgcttgaaacttattta
gctaatcctgataaggcaaaacaacatattaatgaattagaacagtatcgattattttat
tgaaaatatcgtgagacaattgccttagatgtgaaacgaccacaatacttcactaataac
aatttaaatttagatgatagtttaaatagtgaattgtttactagaagtgattaccaaaaa
acatttggtactagttcgaccattattgttttagataataatcattttcgccccgggctc
gaagccccactcaaaacatcatttcgaaaagtgttggatagtgggaatgcccaagatttt
aatgctaatttaaaaaaaccaatgtatgatttatatgattgaatttatgcattctttatc
aataatgttagccaatgttttacccagggagtttatacgcgttctccccaggcagtacga
actgaaatggcggcagcttttaaagataatagtaaaagttttaatttagcattcggagtg
gtaccgtttaatccccacactgatgaccggggaacaatgttccatggccaagttaataat
attaatgttgatgtatatggaattgaccagagttttaacaaccaaactttaagtgatggg
aaatataccttaaatgataaattatttgctaatagcaataatattgttattaaccaaacc
cttgctaaaaggttaggattaacaactggtgatcaaattacgagtaaggttcttcgccaa
gctttatttaagaatagtgttaatggctatcaggaggatgcccaacaaattctaaatagt
tgggatgaatcacaagtaaccggaactgatagtagtggtcaaaccgttggaaaactacta
tttaatagtacaaataattaccaaaatgatgtattaggagagaagggaaataataaagtt
ttagatagtgctttaaatccaagtgatcctaatgcaacaaatcctactattttaaataat
aaaattgttgatggtagttatctcttaggaaatgataatggtaatgaagtctttaatatt
gttggtgtaaataaccagtatggtagtgctcgggcttgaattaacaatgaacgagcaaat
gccattttaggttatgaccagacgcgtaatcatttattacggttatttatgaatgaatgg
caaaattcatttgttaagtcattaccaacgttatcagtaccttatcaaacagcccttagt
gccttagaaacttttattaaaaataaccaaagcaccccaattaatcaattatgaacggct
tttgttaataattttcaaaaacaatcattggctgttaattgaattaaagtttttgaaaat
gaatatccactttttaattataaattatcaaaaagtgtaactaccgatgatattcaaagt
ggtttggcaactgttcaaagttttggtgattatagtttctatggattaaacgggggaata
gttggaacgacagtttatccatcgtattcagaaagatcatttaataatttattgccaatt
gcaacggccaaggaaattttacaaaatttagcccaggcggttcttggggttattgccttt
attattgcaatttccttcattctaagctttataattattatcttaacaagtaatgttgtt
attgccgaaaaccgaacaatcattgccacaatgaaagttctgggttatagtaaccgttat
attacaaaattagtaattggaatgtacattcctgttattgtaataatgaccatcgccggg
tttggttttggctgattattcttaacaattggcattaatgttttaactaatatgggaatg
gtcttccccctaatgatgaatgcagcgatcccaatcattgtgattgcgagtggctttgtt
ttatacctaattgcatatttaatcagttgatttagtatgaataaaattaatccgttagtg
gcaattatgtcagcaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system